基因總覽
SGTA 是蛋白質編碼基因，產物為 small glutamine rich tetratricopeptide repeat co-chaperone alpha，屬於 SGT family。蛋白質長 313 個胺基酸，名稱反映其富含 glutamine，並含有 tetratricopeptide repeat（TPR）結構。序列註解列出三個相鄰的 TPR repeat，另有兩段被註記為無序區域。作為共伴護蛋白，SGTA 與細胞內蛋白質品質管理及膜蛋白處理相關；其多種互作與功能角色，詳見下方功能與交互作用說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000221566 ★ | 2,754,715–2,783,273 | 12 |
| ENST00000677562 | 2,754,711–2,783,390 | 11 |
| ENST00000897085 | 2,754,711–2,774,417 | 12 |
| ENST00000927740 | 2,754,711–2,783,232 | 12 |
| ENST00001019757 | 2,754,711–2,783,390 | 12 |
| ENST00000927730 | 2,754,712–2,783,390 | 11 |
| ENST00000927731 | 2,754,712–2,783,390 | 13 |
| ENST00000952640 | 2,754,712–2,775,207 | 12 |
| ENST00000897082 | 2,754,713–2,783,390 | 13 |
| ENST00000927735 | 2,754,713–2,783,390 | 11 |
| ENST00000927738 | 2,754,713–2,783,390 | 13 |
| ENST00000897083 | 2,754,715–2,783,390 | 13 |
顯示 12/31 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SGTA 是細胞質中的共伴護蛋白，可辨識並結合錯誤摺疊或帶有疏水區段的客戶蛋白。對這些蛋白，它協助送往內質網；若送往內質網的過程未能成功，也參與調節其轉送至 proteasome 的分流。因此，SGTA 涉及客戶蛋白在不同處理途徑間的選擇，而非只負責單一方向的運送。
在尾端錨定型及 type II 跨膜蛋白插入膜的過程中，SGTA 與 ASNA1 及 BAG6 complex 共同構成一個標靶模組。SGTA 的作用位於 BAG6 complex 與 ASNA1 上游，能較早結合新合成蛋白的跨膜區域。這種先後次序與其處理疏水區段的角色相符，並使其參與新生膜蛋白的後續標靶與膜插入。
SGTA 也參與內質網相關錯誤摺疊蛋白分解代謝的調控。它透過與 BAG6 的互作，和 BAG6 complex 協同，使疏水性受質維持在未泛素化狀態；同時，SGTA 與 RNF126 競爭結合 BAG6，因而阻止與 BAG6 complex 相關的客戶蛋白被泛素化。這些作用連結了客戶蛋白的辨識、運送與後續品質管控。
此外，SGTA 可直接結合 HSC70 與 HSP70，並調節這些伴護蛋白的 ATPase 活性。感染 polyomavirus 時，SGTA 也經由與 DNAJB12、DNAJB14 及 HSPA8/Hsc70 的互作，參與病毒穿越內質網膜及感染的過程；這項功能是在病毒感染情境下描述的。
Promoter 與基因調控
>SGTA ENST00000221566 GRCh38 chr19:2783173-2784273 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCACGGCCGGCCTCACCTCCTTTATTTCTGCAAAAGAAATTAAA ATAATCCACGCCATTAATCGTGCATGTATTTTGAGTAGGACGAAAATGAATTGGGAGAACATTTCTGGCA ACTGTAACTTAGATGGTGATCAGTTTTCTGTCGTCCTTGGAAATGTCTCATCACATGTCTTGAGCAACAC CAAGATTAATTTTACATCGGCGTTCATTTTCGCTGTTCCCTGTGCCTGGGGTCCGTTTGGACTTTCCTAT CCTTGAAATCCAAATGTAAAGGATGATCTTTCCTACCCATCCCATGCGACTTAGCTCCCAGTGACAATCA CACTACCTTCATTTTTTTTTTCTTAGTGTTTGCTGTGAAATTTGTTTCTCTATTTATGTACTAGTTTATT AGTTTATAGTCCGTCTACCCCAATGCAAAATAATGAGAGTAGACACTTTGCTGGTTTTTATGGCTGCTTT GCAATAAATATTGAATGAATATTAGGCACCTGCTGTCTACAAATGGCTCTATACTCACAAACGTCTCACA CTGCATGAAAGAATGCATTTGTGGGTGAGTAGATGGGTGGGTGAATAAATGAACAAAGATAGTAAGCGGG TAACACTGACTCCCATTCATTGCGCAGCTGTGACGCTCTGGAGTCCAGGTGTCCAAACGCGGCTGCACCA CGTGGCCGGCCCAGCACCACGTGGTCAGCTCGGCGACCGGCTGGAGTCAGCCACTGTTCCACCGTGCACC GCTTCATTCCCGCTCTAGAGGGCAAACCAGACCCGATTTCCGGCCTCCATTAGGTCGCAGAGGTCAGTTG CCCTAACAACCAGCTGGTTCCCGCCTCTACGTTGCGTCACTTCCTTCCACGCCCGCCTCCATCATTAACG CGCCTGTGCAGAAGGGAAGCAACTCCGGGCGCCTTTCTTTTGCGCAGGCGTCGCGCCCTGGGGCCGGGGC CGGGCGGCACCGCGGTGCGCAAGCGCAACCGTCGGTGGGTCGGGGATCGGTCGCCTGAGAGGTGAGTGAG GGGCACTGCGCTGAGCCTGGTGGGTCTGGGGTCTGCGGCTCGGGGCCCACG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SGTA_1 ↗ | 19:2,783,273 | 負股 | 2,783,263–2,783,322 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_5MMJ9 · CTCF_binding_site · 2779109–2779130 · regulatory
ENSR19_76F94 · enhancer · 2782123–2782223 · regulatory
ENSR19_BJWL · enhancer · 2782413–2783230 · regulatory
ENSR19_BJWP · promoter · 2783231–2783817 · regulatory
ENSR19_934SW · promoter · 2785013–2785513 · regulatory
ENSR19_BJX3 · enhancer · 2785514–2786415 · regulatory
· motif · 2778569–2778582 · motif
· motif · 2778636–2778649 · motif
· motif · 2778636–2778649 · motif
· motif · 2778679–2778692 · motif
· motif · 2778679–2778692 · motif
· motif · 2779111–2779127 · motif
· motif · 2782060–2782075 · motif
· motif · 2782065–2782077 · motif
· motif · 2782068–2782075 · motif
· motif · 2783114–2783129 · motif
· motif · 2783183–2783198 · motif
· motif · 2783267–2783278 · motif
· motif · 2783267–2783278 · motif
· motif · 2783312–2783323 · motif
· motif · 2783312–2783323 · motif
· motif · 2783354–2783365 · motif
· motif · 2783354–2783365 · motif
· motif · 2783394–2783403 · motif
· motif · 2783423–2783438 · motif
· motif · 2783423–2783438 · motif
· motif · 2783434–2783446 · motif
· motif · 2783437–2783444 · motif
· motif · 2783460–2783469 · motif
· motif · 2783549–2783558 · motif
· motif · 2783549–2783558 · motif
· motif · 2783568–2783577 · motif
· motif · 2783568–2783577 · motif
· motif · 2785277–2785294 · motif
· motif · 2785353–2785366 · motif
· motif · 2785464–2785475 · motif
· motif · 2785464–2785475 · motif
· motif · 2785495–2785508 · motif
· motif · 2785556–2785573 · motif
· motif · 2785617–2785626 · motif
· motif · 2785656–2785666 · motif
· motif · 2785898–2785909 · motif
· motif · 2786980–2786992 · motif
· motif · 2786983–2786990 · motif
· motif · 2786983–2786998 · motif
· motif · 2787117–2787132 · motif
· motif · 2787122–2787134 · motif
· motif · 2787125–2787132 · motif
· motif · 2787201–2787216 · motif
· motif · 2787631–2787642 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：313 aa
small glutamine rich tetratricopeptide repeat co-chaperone alpha 長 313 個胺基酸，屬於 SGT family。蛋白質特徵註解列出三個 TPR repeat，位置依序為 91–124、125–158 與 159–192；另有兩段無序區域，分別位於 66–100 與 250–269。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SGTA 位於細胞質與細胞核，並在細胞質中與 HSP90AB1 共定位。 細胞凋亡時可觀察到 SGTA 在細胞核中的累積增加。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 159 個夥伴
- ADAM21Q9UKJ8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ADIPOQA8K660 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ADIPOQQ15848 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- AGR2O95994 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AGR3Q8TD06 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- AOC3Q16853 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BAG2O95816 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BAG6P46379 · UniProt INTERACTION · 6 experiments · 2 筆來源紀錄
- BTCP35070 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- C1QL4Q86Z23 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C1QTNF1Q9BXJ1 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- C1QTNF5Q9BXJ0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C1QTNF6Q9BXI9 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- C5orf46Q6UWT4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CD79BP40259 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CD99L2Q8TCZ2 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- CDH15P55291 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- CHRNGP07510-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- COL1A2A0A0S2Z3K0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- COL1A2P08123 · UniProt INTERACTION · 11 experiments
- COL8A2Q4VAQ0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CREB3L3Q68CJ9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CSF1P09603 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CST1P01037 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CTAG1BP78358 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SGTA 可形成同源二聚體；同源寡聚體則為相似性推定。其互作對象包括 DNAJC5、DNAJC5B、HSP90AA1、HSP90AB1、SLC2A1、HSPA8/Hsc70 與 BAG6；與 HSP90AA1、HSPA8/Hsc70 的互作涉及 TPR repeats，與 SLC2A1 的互作涉及 Gln-rich region。SGTA 與 BAG6 的結合會妨礙 BAG6 與 RNF126 互作。它也與 DNAJB12、DNAJB14、HSPA8/Hsc70 及 SGTA 本身構成多蛋白複合體，其中與 DNAJB14 和 HSPA8/Hsc70 的互作為直接互作。病毒感染相關互作包括 HIV-1 的 Vpu 與 Gag，以及 SARS-CoV accessory protein 7a。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SGTA 是細胞質共伴護蛋白，會結合錯誤摺疊或含疏水區段的客戶蛋白，協助其送往內質網；若標靶失敗，則參與調節其轉送至 proteasome。它與 ASNA1、BAG6 complex 共同參與尾端錨定型及 type II 跨膜蛋白的膜插入，並較早結合新生蛋白的跨膜區域。SGTA 也透過 BAG6 協助疏水受質維持未泛素化狀態，並競爭 RNF126 的 BAG6 結合，以阻止客戶蛋白泛素化；此外可直接結合 HSC70、HSP70 並調節其 ATPase 活性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Co-chaperone that binds misfolded and hydrophobic patches-containing client proteins in the cytosol. Mediates their targeting to the endoplasmic reticulum but also regulates their sorting to the proteasome when targeting fails. Functions in tail-anchored/type II transmembrane proteins membrane insertion constituting with ASNA1 and the BAG6 complex a targeting module. Functions upstream of the BAG6 complex and ASNA1, binding more rapidly the transmembrane domain of newly synthesized proteins. It is also involved in the regulation of the endoplasmic reticulum-associated misfolded protein catabolic process via its interaction with BAG6: collaborates with the BAG6 complex to maintain hydrophobic substrates in non-ubiquitinated states. Competes with RNF126 for interaction with BAG6, preventing the ubiquitination of client proteins associated with the BAG6 complex. Binds directly to HSC70 and HSP70 and regulates their ATPase activity PMID 18759457 ↗ · PMID 23129660 ↗ · PMID 25179605 ↗ · PMID 25535373 ↗ · PMID 27193484 ↗ · PMID 28104892 ↗ |
| 功能 | 在 polyomavirus 感染情境下，SGTA 透過與 DNAJB12、DNAJB14 及 HSPA8/Hsc70 互作，參與病毒穿越內質網膜及感染的過程。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) In case of infection by polyomavirus, involved in the virus endoplasmic reticulum membrane penetration and infection via interaction with DNAJB12, DNAJB14 and HSPA8/Hsc70 PMID 24675744 ↗ |
| 交互作用 | SGTA 可形成同源二聚體；同源寡聚體為相似性推定。它與 DNAJC5、DNAJC5B、HSP90AA1、SLC2A1、HSP90AB1、HSPA8/Hsc70 及 BAG6 互作，其中 HSP90AA1、HSPA8/Hsc70 的互作涉及 TPR repeats，SLC2A1 的互作涉及 Gln-rich region；HSPA8/Hsc70 的互作為直接互作。SGTA 與 BAG6 結合會阻止 BAG6 與 RNF126 互作。SGTA 也與 DNAJB12、DNAJB14、HSPA8/Hsc70 組成多蛋白複合體，且與 DNAJB14、HSPA8/Hsc70 的互作為直接互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Homooligomer (By similarity). Interacts with DNAJC5 and DNAJC5B. Interacts (via TPR repeats) with HSP90AA1. Interacts (via Gln-rich region) with SLC2A1. Interacts with HSP90AB1. Interacts (via TPR repeats) with HSPA8/Hsc70; the interaction is direct. Interacts with BAG6 (via ubiquitin-like domain); interaction prevents interaction between BAG6 and RNF126. Forms a multiprotein complex, at least composed of DNAJB12, DNAJB14, HSPA8/Hsc70 and SGTA; interaction with DNAJB14 and HSPA8/Hsc70 is direct PMID 15708368 ↗ · PMID 16580629 ↗ · PMID 17034881 ↗ · PMID 18759457 ↗ · PMID 23129660 ↗ · PMID 24675744 ↗ · PMID 25179605 ↗ · PMID 27193484 ↗ |
| 交互作用 | 在感染相關情境下，SGTA 與 HIV-1 的 Vpu 及 Gag 蛋白互作。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 在感染相關情境下，SGTA 與 SARS-CoV accessory protein 7a 互作。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | SGTA 位於細胞質與細胞核，並在細胞質中與 HSP90AB1 共定位；細胞凋亡時觀察到 SGTA 的細胞核累積增加。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Nucleus; Co-localizes with HSP90AB1 in the cytoplasm. Increased nuclear accumulation seen during cell apoptosis PMID 16580629 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AAGCGCAACCGTCGGTGGGTCGGGGATCGGTCGCCTGAGA40GGTATCACCTCTTCTGGGCTCAAGATGGACAACAAGAAGC80GCCTGGCCTACGCCATCATCCAGTTCCTGCATGACCAGCT120CCGGCACGGGGGCCTCTCGTCCGATGCTCAGGAGAGCTTG160GAAGTCGCCATCCAGTGCCTGGAGACTGCGTTTGGGGTGA200CGGTAGAAGACAGTGACCTTGCGCTCCCTCAGACTCTGCC240GGAGATATTTGAAGCGGCTGCCACGGGCAAGGAGATGCCG280CAGGACCTGAGGAGCCCCGCGCGAACCCCGCCTTCCGAGG320AGGACTCAGCAGAGGCAGAGCGCCTCAAAACCGAAGGAAA360CGAGCAGATGAAAGTGGAAAACTTTGAAGCTGCCGTGCAT400TTCTACGGAAAAGCCATCGAGCTCAACCCAGCCAACGCCG440TCTATTTCTGCAACAGAGCCGCAGCCTACAGCAAACTCGG480CAACTACGCAGGCGCGGTGCAGGACTGTGAGCGGGCCATC520TGCATTGACCCGGCCTACAGCAAGGCCTACGGCAGGATGG560GCCTGGCGCTCTCCAGCCTCAACAAGCACGTGGAGGCCGT600GGCTTACTACAAGAAGGCTCTGGAGCTGGACCCCGACAAC640GAGACATACAAGTCCAACCTCAAGATAGCGGAGCTGAAGC680TGCGGGAGGCCCCCAGCCCCACGGGAGGCGTGGGCAGCTT720CGACATCGCCGGCCTGCTGAACAACCCTGGCTTCATGAGC760ATGGCTTCGAACCTAATGAACAATCCCCAGATTCAGCAGC800TCATGTCCGGCATGATTTCGGGTGGCAACAACCCCTTGGG840AACTCCCGGCACCAGCCCCTCGCAGAACGACCTGGCCAGC880CTCATCCAGGCGGGCCAGCAGTTTGCCCAGCAGATGCAGC920AGCAGAACCCAGAGTTGATAGAGCAGCTCAGGAGCCAGAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。