基因總覽
SGK3(serum/glucocorticoid regulated kinase family member 3)是蛋白質編碼基因,產物屬於蛋白激酶超家族中的 AGC Ser/Thr protein kinase family。其蛋白質具有 PX 結構域、蛋白激酶結構域及 AGC-kinase C-terminal 區域,並含有核定位訊號與部分無序區段。SGK3 的基本角色是調節多種細胞膜相關蛋白與細胞活動;其作用涵蓋離子通道和運輸蛋白,也涉及細胞生長、增殖、存活及移動。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000521198 ★ | 66,712,781–66,862,022 | 17 |
| ENST00000894045 | 66,712,484–66,862,022 | 18 |
| ENST00000894046 | 66,712,484–66,862,022 | 18 |
| ENST00000894047 | 66,712,484–66,862,022 | 18 |
| ENST00000894048 | 66,712,484–66,862,022 | 15 |
| ENST00000894049 | 66,712,484–66,862,022 | 16 |
| ENST00000894050 | 66,712,484–66,862,022 | 17 |
| ENST00000894051 | 66,712,484–66,862,022 | 16 |
| ENST00000894052 | 66,712,484–66,862,022 | 19 |
| ENST00000952508 | 66,712,484–66,862,022 | 19 |
| ENST00000952509 | 66,712,484–66,862,022 | 19 |
| ENST00000952510 | 66,712,484–66,862,022 | 18 |
顯示 12/45 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SGK3 是絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,可將 ATP 的磷酸基轉移至蛋白質上的絲胺酸或蘇胺酸殘基,並參與多種離子通道與膜運輸蛋白的調節。來源列出的受調控對象包括鈉、鉀、鈣及氯離子通道,以及肌酸、二羧酸、磷酸鹽、胺基酸與麩胺酸運輸蛋白、麩胺酸受體、鈉氫交換器和鈉鉀 ATPase。這些例子顯示 SGK3 涉及多類膜蛋白的調節;來源未進一步說明每個對象所受調節的分子步驟。
SGK3 也參與腎小管磷酸鹽運輸的調節,並與骨密度調控有關。此處來源描述的是其參與調節的角色,未將 SGK3 定為單獨決定骨密度或磷酸鹽運輸的因素。
在蛋白質磷酸化層面,SGK3 磷酸化 NEDD4L 與 GSK3B。它也透過磷酸化 FLII,正向調節 ER 的轉錄活性;此外,SGK3 對 ITCH/AIP4 的磷酸化會負向調節其功能,並使 CXCR4 不易被有效分選至溶酶體。這些作用涵蓋轉錄活性與蛋白質分選調節,但來源未提供各作用的完整下游機制。
除了上述特定靶點,SGK3 的功能範圍也包括細胞生長、增殖、存活與移動。整體而言,來源支持 SGK3 透過磷酸化調節膜蛋白及其他蛋白質,參與多種細胞過程;但未將這些過程限定於單一細胞類型或生理情境。
Promoter 與基因調控
>SGK3 ENST00000521198 GRCh38 chr8:66711781-66712881 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGGCATGATATGCACATGGGAATCTTTAAGTACTTGTCTGAGTCTATCTTCAAGTGATATCTGATAAGAC CTAAATTACAGTAGTGTTGTGGGACGAAGAAAACAACCCACTCTACTTCAAAATCTTAACCACTTGACTC CACATCCATTGAACCATGTAATTCTTAGTTCTCCACTCAGCTTCTCTATCTGTTAAAAGAGATAAACAGA TCTAAAACGCAGCTTCTGTAATTCAAGAATGAGTAATAAGGAGCTGTAAAGTGTGCACTCAGCTGACTTG GAGATTAATGGGAATAAAAAAAAGAGTCAGTAGATCTAAAAAGATGTGTGGAAAGGAAATTTCTCTGCAC ACAGGATCTGCCAATTTGTGAAAGTTCTCGACTGTTTATAAACACAAGGGCCGTAACTCTGCTAATGACA AAAGTGGAAAACTGTCCAAATAATGCTAAATGAATCACAGTTGTTCTCAATTATTTGGATATTTAATTCA CTCCTCTGAGTTTCCAGTTTACACCAAGCCAACCCCCCCAACACCACGGGCCCACCCGGGGGGTCCTGAT CCCTGCACACACCAGGTCATCTCTGTTGGGCCCCGGCGCTCTGGCCCGCGCCGGTCTTGGGCCCCAGGGT AGCGGCCACTGCGGGCGGAGCAGAGGGAAACACCAGAGTCTGTGACTCCAGACAGGACCCACTGTGTCCT CTTGAACTTTGCACAGCGCGTGACGGGGGCAGACGGTGCACCGTGGCCCGGCCTTTCGCGGGGGTCCTCG GGGAAGAGAGAGGAGCGCGGGTTTCCTCGGAGGCCTGAGCGGGACGCAGCCTGCAGCCCCTCCCCGCACG GGCTGCCCCCGGCCCGCCGCTCGCGCCGCTCTGCTGGGATCCGGCGCCTTCCCCGGCTGTCCTCGGCCTC CCGCGCGCTCCGCGGGAGGAGCCGCCAGCGGCCGTGACGCGTCAAGGAGGAAACGCCGGCGCCCGGCGGC CCTGCCGGGAAGGAGGAAGCGCAGTGCGTTCGGCTCCGCGCCCGCCGCGCCGGGAGCAGCACCGCGGGGC CAGGTAGGTGCGGGGCCGGCGGGAGGGTCCGCGCGCCCGGGACTCCGACGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SGK3_2 ↗ | 8:66,712,382 | 正股 | 66,712,333–66,712,392 |
| SGK3_3 ↗ | 8:66,712,788 | 正股 | 66,712,739–66,712,798 |
| SGK3_1 ↗ | 8:66,775,205 | 正股 | 66,775,156–66,775,215 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR8_9ZGX2 · enhancer · 66711109–66711442 · regulatory
ENSR8_9ZGXD · promoter · 66712291–66712791 · regulatory
ENSR8_C8LPX · enhancer · 66712792–66714516 · regulatory
ENSR8_83XXXQ · enhancer · 66715830–66716020 · regulatory
ENSR8_9ZGZH · enhancer · 66716144–66716540 · regulatory
ENSR8_5KNNPP · CTCF_binding_site · 66716499–66716520 · regulatory
· motif · 66712474–66712489 · motif
· motif · 66712481–66712496 · motif
· motif · 66712482–66712496 · motif
· motif · 66712768–66712781 · motif
· motif · 66712991–66712999 · motif
· motif · 66713634–66713656 · motif
· motif · 66713634–66713656 · motif
· motif · 66715910–66715918 · motif
· motif · 66715962–66715984 · motif
· motif · 66715962–66715984 · motif
· motif · 66715963–66715976 · motif
· motif · 66716051–66716062 · motif
· motif · 66716055–66716069 · motif
· motif · 66716055–66716069 · motif
· motif · 66716245–66716256 · motif
· motif · 66716245–66716256 · motif
· motif · 66716501–66716517 · motif
在乳癌細胞中,SGK3 的表現可受 estrogen/ER 誘導;此調控描述限於來源所述的細胞情境。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:496 aa
SGK3 蛋白長 496 個胺基酸,屬於 AGC Ser/Thr protein kinase family。其 PX 結構域位於第 12–124 位,蛋白激酶結構域位於第 162–419 位,AGC-kinase C-terminal 區域位於第 420–496 位。序列另註有第 195–205 位的核定位訊號,以及第 1–21 位和第 121–156 位的無序區段。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SGK3 位於囊泡樣結構及早期胞內體,也見於回收胞內體;其與 SLC9A3/NHE3 在回收胞內體共定位。 胞內體定位是 SGK3 完全活化的必要條件,並有助於其與負責磷酸化 Ser-486 的激酶共定位,使 PDPK1 得以磷酸化 Thr-320,完成 SGK3 活化。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- ITCHQ96J02 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
SGK3 與 GSK3B、FLII 有互作;另與 PDPK1 的互作具有磷酸化依賴性。來源未將這些關係一概描述為同一複合體,也未進一步指定其互作形式。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SGK3 是參與多種離子通道、膜運輸蛋白及細胞生長、增殖、存活與移動調節的絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶。它可調節多類離子通道、溶質運輸蛋白、麩胺酸受體及鈉鉀 ATPase,也參與腎小管磷酸鹽運輸與骨密度調控;此外,SGK3 磷酸化 NEDD4L、GSK3B、FLII 和 ITCH/AIP4,分別涉及 ER 轉錄活性及 CXCR4 分選至溶酶體的調控。 | 含實驗來源 | 證據與來源Serine/threonine-protein kinase which is involved in the regulation of a wide variety of ion channels, membrane transporters, cell growth, proliferation, survival and migration. Up-regulates Na(+) channels: SCNN1A/ENAC and SCN5A, K(+) channels: KCNA3/KV1.3, KCNE1, KCNQ1 and KCNH2/HERG, epithelial Ca(2+) channels: TRPV5 and TRPV6, chloride channel: BSND, creatine transporter: SLC6A8, Na(+)/dicarboxylate cotransporter: SLC13A2/NADC1, Na(+)-dependent phosphate cotransporter: SLC34A2/NAPI-2B, amino acid transporters: SLC1A5/ASCT2 and SLC6A19, glutamate transporters: SLC1A3/EAAT1, SLC1A6/EAAT4 and SLC1A7/EAAT5, glutamate receptors: GRIA1/GLUR1 and GRIK2/GLUR6, Na(+)/H(+) exchanger: SLC9A3/NHE3, and the Na(+)/K(+) ATPase. Plays a role in the regulation of renal tubular phosphate transport and bone density. Phosphorylates NEDD4L and GSK3B. Positively regulates ER transcription activity through phosphorylation of FLII. Negatively regulates the function of ITCH/AIP4 via its phosphorylation and thereby prevents CXCR4 from being efficiently sorted to lysosomes PMID 12054501 ↗ · PMID 12397388 ↗ · PMID 12590200 ↗ · PMID 12632189 ↗ · PMID 12634932 ↗ · PMID 12650886 ↗ · PMID 12911626 ↗ · PMID 14706641 ↗ · PMID 15040001 ↗ · PMID 15044175 ↗ · PMID 15319523 ↗ · PMID 15496163 ↗ · PMID 15737648 ↗ · PMID 15845389 ↗ · PMID 16036218 ↗ · PMID 16888620 ↗ · PMID 17167223 ↗ · PMID 18005662 ↗ · PMID 19293151 ↗ · PMID 20511718 ↗ · PMID 21865597 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | SGK3 與 GSK3B 及 FLII 有互作,並以磷酸化依賴的方式與 PDPK1 互作;來源未進一步說明這些互作的具體形式。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with GSK3B and FLII. Interacts with PDPK1 in a phosphorylation-dependent manner PMID 12054501 ↗ · PMID 14604990 ↗ · PMID 16888620 ↗ · PMID 19293151 ↗ |
| 細胞定位 | SGK3 位於細胞質囊泡、早期胞內體及回收胞內體,並在回收胞內體與 SLC9A3/NHE3 共定位。胞內體定位是其完全激酶活性的必要條件;這使 SGK3 能與負責磷酸化 Ser-486 的激酶共定位,進而允許 PDPK1 磷酸化 Thr-320,完成 SGK3 活化。 | 推論支持 | 證據與來源Cytoplasmic vesicle; Early endosome; Recycling endosome; Endosomal localization is a prerequisite for complete kinase activity. It is essential for its colocalization with the kinase responsible for phosphorylating Ser-486 thus allowing PDPK1 phosphorylation of Thr-320 resulting in complete activation of SGK3. Localized in vesicle-like structures and in the early endosome. Colocalizes with SLC9A3/NHE3 in the recycling endosomes |
| 調控 | 在乳癌細胞中,estrogen/ER 可誘導 SGK3;此敘述限定於乳癌細胞情境。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCAGTGCGTTCGGCTCCGCGCCCGCCGCGCCGGGAGCAGC40ACCGCGGGGCCAGGTTGCATGATGGAATTTGAACATTACT80TCAAGAGGTTTTGTATTTTGGATTAGTTAATTGGGTTTGT120CCTCTGCTGACTGTTTCTTCGGATGCATTTTTTGGTGTGC160TCTTGAGGGATTAAATGCAAAGAGATCACACCATGGACTA200CAAGGAAAGCTGCCCAAGTGTAAGCATTCCCAGCTCCGAT240GAACACAGAGAGAAAAAGAAGAGGTTTACTGTTTATAAAG280TTCTGGTTTCAGTGGGAAGAAGTGAATGGTTTGTCTTCAG320GAGATATGCAGAGTTTGATAAACTTTATAACACTTTAAAA360AAACAGTTTCCTGCTATGGCCCTGAAGATTCCTGCCAAGA400GAATATTTGGTGATAATTTTGATCCAGATTTTATTAAACA440AAGACGAGCAGGACTAAACGAATTCATTCAGAACCTAGTT480AGGTATCCAGAACTTTATAACCATCCAGATGTCAGAGCAT520TCCTTCAAATGGACAGTCCAAAACACCAGTCAGATCCATC560TGAAGATGAGGATGAAAGAAGTTCTCAGAAGCTACACTCT600ACCTCACAGAACATCAACCTGGGACCGTCTGGAAATCCTC640ATGCCAAACCAACTGACTTTGATTTCTTAAAAGTTATTGG680AAAAGGCAGCTTTGGCAAGGTTCTTCTTGCAAAACGGAAA720CTGGATGGAAAATTTTATGCTGTCAAAGTGTTACAGAAAA760AAATAGTTCTCAACAGAAAAGAGCAAAAACATATTATGGC800TGAACGTAATGTGCTCTTGAAAAATGTGAAACATCCGTTT840TTGGTTGGATTGCATTATTCCTTCCAAACAACTGAAAAGC880TTTATTTTGTTCTGGATTTTGTTAATGGAGGGGAGCTTTT920TTTCCACTTACAAAGAGAACGGTCCTTTCCTGAGCACAGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。