演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SGK3SGK2

serum/glucocorticoid regulated kinase family member 3

SGK3 是一種絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,參與調節多種離子通道與膜運輸蛋白,也與細胞生長、增殖、存活及移動相關。

Homo sapiens8q13.1UniProt Q96BR1
OFFICIAL SYMBOL
SGK3
CHROMOSOME
8
UNIPROT
Q96BR1
PDB / ALPHAFOLD
6EDX
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SGK3(serum/glucocorticoid regulated kinase family member 3)是蛋白質編碼基因,產物屬於蛋白激酶超家族中的 AGC Ser/Thr protein kinase family。其蛋白質具有 PX 結構域、蛋白激酶結構域及 AGC-kinase C-terminal 區域,並含有核定位訊號與部分無序區段。SGK3 的基本角色是調節多種細胞膜相關蛋白與細胞活動;其作用涵蓋離子通道和運輸蛋白,也涉及細胞生長、增殖、存活及移動。

Official symbol
SGK3
Gene name
serum/glucocorticoid regulated kinase family member 3
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10812
UniProt
Q96BR1
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SGK2SGKL

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 88q13.1
chr8 · 145,138,636 bp · GRCh38chr8p23.3 · 1–2300000 · gnegchr8p23.2 · 2300001–6300000 · gpos75chr8p23.1 · 6300001–12800000 · gnegchr8p22 · 12800001–19200000 · gpos100chr8p21.3 · 19200001–23500000 · gnegchr8p21.2 · 23500001–27500000 · gpos50chr8p21.1 · 27500001–29000000 · gnegchr8p12 · 29000001–36700000 · gpos75chr8p11.23 · 36700001–38500000 · gnegchr8p11.22 · 38500001–39900000 · gpos25chr8p11.21 · 39900001–43200000 · gnegchr8p11.1 · 43200001–45200000 · acenchr8q11.1 · 45200001–47200000 · acenchr8q11.21 · 47200001–51300000 · gnegchr8q11.22 · 51300001–51700000 · gpos75chr8q11.23 · 51700001–54600000 · gnegchr8q12.1 · 54600001–60600000 · gpos50chr8q12.2 · 60600001–61300000 · gnegchr8q12.3 · 61300001–65100000 · gpos50chr8q13.1 · 65100001–67100000 · gnegchr8q13.2 · 67100001–69600000 · gpos50chr8q13.3 · 69600001–72000000 · gnegchr8q21.11 · 72000001–74600000 · gpos100chr8q21.12 · 74600001–74700000 · gnegchr8q21.13 · 74700001–83500000 · gpos75chr8q21.2 · 83500001–85900000 · gnegchr8q21.3 · 85900001–92300000 · gpos100chr8q22.1 · 92300001–97900000 · gnegchr8q22.2 · 97900001–100500000 · gpos25chr8q22.3 · 100500001–105100000 · gnegchr8q23.1 · 105100001–109500000 · gpos75chr8q23.2 · 109500001–111100000 · gnegchr8q23.3 · 111100001–116700000 · gpos100chr8q24.11 · 116700001–118300000 · gnegchr8q24.12 · 118300001–121500000 · gpos50chr8q24.13 · 121500001–126300000 · gnegchr8q24.21 · 126300001–130400000 · gpos50chr8q24.22 · 130400001–135400000 · gnegchr8q24.23 · 135400001–138900000 · gpos75chr8q24.3 · 138900001–145138636 · gnegSGK3pq1 bp145,138,636 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr8:66,712,484–66,862,022
Gene span
149,539 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000521198 ★66,712,781–66,862,02217
ENST0000089404566,712,484–66,862,02218
ENST0000089404666,712,484–66,862,02218
ENST0000089404766,712,484–66,862,02218
ENST0000089404866,712,484–66,862,02215
ENST0000089404966,712,484–66,862,02216
ENST0000089405066,712,484–66,862,02217
ENST0000089405166,712,484–66,862,02216
ENST0000089405266,712,484–66,862,02219
ENST0000095250866,712,484–66,862,02219
ENST0000095250966,712,484–66,862,02219
ENST0000095251066,712,484–66,862,02218

顯示 12/45 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SGK3 是絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶,可將 ATP 的磷酸基轉移至蛋白質上的絲胺酸或蘇胺酸殘基,並參與多種離子通道與膜運輸蛋白的調節。來源列出的受調控對象包括鈉、鉀、鈣及氯離子通道,以及肌酸、二羧酸、磷酸鹽、胺基酸與麩胺酸運輸蛋白、麩胺酸受體、鈉氫交換器和鈉鉀 ATPase。這些例子顯示 SGK3 涉及多類膜蛋白的調節;來源未進一步說明每個對象所受調節的分子步驟。

SGK3 也參與腎小管磷酸鹽運輸的調節,並與骨密度調控有關。此處來源描述的是其參與調節的角色,未將 SGK3 定為單獨決定骨密度或磷酸鹽運輸的因素。

在蛋白質磷酸化層面,SGK3 磷酸化 NEDD4L 與 GSK3B。它也透過磷酸化 FLII,正向調節 ER 的轉錄活性;此外,SGK3 對 ITCH/AIP4 的磷酸化會負向調節其功能,並使 CXCR4 不易被有效分選至溶酶體。這些作用涵蓋轉錄活性與蛋白質分選調節,但來源未提供各作用的完整下游機制。

除了上述特定靶點,SGK3 的功能範圍也包括細胞生長、增殖、存活與移動。整體而言,來源支持 SGK3 透過磷酸化調節膜蛋白及其他蛋白質,參與多種細胞過程;但未將這些過程限定於單一細胞類型或生理情境。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 66712781 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SGK3 ENST00000521198 GRCh38 chr8:66711781-66712881 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGGCATGATATGCACATGGGAATCTTTAAGTACTTGTCTGAGTCTATCTTCAAGTGATATCTGATAAGAC
CTAAATTACAGTAGTGTTGTGGGACGAAGAAAACAACCCACTCTACTTCAAAATCTTAACCACTTGACTC
CACATCCATTGAACCATGTAATTCTTAGTTCTCCACTCAGCTTCTCTATCTGTTAAAAGAGATAAACAGA
TCTAAAACGCAGCTTCTGTAATTCAAGAATGAGTAATAAGGAGCTGTAAAGTGTGCACTCAGCTGACTTG
GAGATTAATGGGAATAAAAAAAAGAGTCAGTAGATCTAAAAAGATGTGTGGAAAGGAAATTTCTCTGCAC
ACAGGATCTGCCAATTTGTGAAAGTTCTCGACTGTTTATAAACACAAGGGCCGTAACTCTGCTAATGACA
AAAGTGGAAAACTGTCCAAATAATGCTAAATGAATCACAGTTGTTCTCAATTATTTGGATATTTAATTCA
CTCCTCTGAGTTTCCAGTTTACACCAAGCCAACCCCCCCAACACCACGGGCCCACCCGGGGGGTCCTGAT
CCCTGCACACACCAGGTCATCTCTGTTGGGCCCCGGCGCTCTGGCCCGCGCCGGTCTTGGGCCCCAGGGT
AGCGGCCACTGCGGGCGGAGCAGAGGGAAACACCAGAGTCTGTGACTCCAGACAGGACCCACTGTGTCCT
CTTGAACTTTGCACAGCGCGTGACGGGGGCAGACGGTGCACCGTGGCCCGGCCTTTCGCGGGGGTCCTCG
GGGAAGAGAGAGGAGCGCGGGTTTCCTCGGAGGCCTGAGCGGGACGCAGCCTGCAGCCCCTCCCCGCACG
GGCTGCCCCCGGCCCGCCGCTCGCGCCGCTCTGCTGGGATCCGGCGCCTTCCCCGGCTGTCCTCGGCCTC
CCGCGCGCTCCGCGGGAGGAGCCGCCAGCGGCCGTGACGCGTCAAGGAGGAAACGCCGGCGCCCGGCGGC
CCTGCCGGGAAGGAGGAAGCGCAGTGCGTTCGGCTCCGCGCCCGCCGCGCCGGGAGCAGCACCGCGGGGC
CAGGTAGGTGCGGGGCCGGCGGGAGGGTCCGCGCGCCCGGGACTCCGACGG
SGK3 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SGK3_2 ↗8:66,712,382正股66,712,333–66,712,392
SGK3_3 ↗8:66,712,788正股66,712,739–66,712,798
SGK3_1 ↗8:66,775,205正股66,775,156–66,775,215

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR8_9ZGX2 · enhancer · 66711109–66711442 · regulatory

ENSR8_9ZGXD · promoter · 66712291–66712791 · regulatory

ENSR8_C8LPX · enhancer · 66712792–66714516 · regulatory

ENSR8_83XXXQ · enhancer · 66715830–66716020 · regulatory

ENSR8_9ZGZH · enhancer · 66716144–66716540 · regulatory

ENSR8_5KNNPP · CTCF_binding_site · 66716499–66716520 · regulatory

· motif · 66712474–66712489 · motif

· motif · 66712481–66712496 · motif

· motif · 66712482–66712496 · motif

· motif · 66712768–66712781 · motif

· motif · 66712991–66712999 · motif

· motif · 66713634–66713656 · motif

· motif · 66713634–66713656 · motif

· motif · 66715910–66715918 · motif

· motif · 66715962–66715984 · motif

· motif · 66715962–66715984 · motif

· motif · 66715963–66715976 · motif

· motif · 66716051–66716062 · motif

· motif · 66716055–66716069 · motif

· motif · 66716055–66716069 · motif

· motif · 66716245–66716256 · motif

· motif · 66716245–66716256 · motif

· motif · 66716501–66716517 · motif

在乳癌細胞中,SGK3 的表現可受 estrogen/ER 誘導;此調控描述限於來源所述的細胞情境。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:496 aa

1 aa496 aa結構域功能區域基序
依 Q96BR1 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SGK3 蛋白長 496 個胺基酸,屬於 AGC Ser/Thr protein kinase family。其 PX 結構域位於第 12–124 位,蛋白激酶結構域位於第 162–419 位,AGC-kinase C-terminal 區域位於第 420–496 位。序列另註有第 195–205 位的核定位訊號,以及第 1–21 位和第 121–156 位的無序區段。

結構域PX12–124 aa
結構域Protein kinase162–419 aa
結構域AGC-kinase C-terminal420–496 aa
功能區域Disordered1–21 aa
功能區域Disordered121–156 aa
基序Nuclear localization signal195–205 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6EDX…

PDB · 6EDX

X-ray · 2.01 A · A=10-125

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasmic vesicle;Early endosome;Recycling endosome

SGK3 位於囊泡樣結構及早期胞內體,也見於回收胞內體;其與 SLC9A3/NHE3 在回收胞內體共定位。 胞內體定位是 SGK3 完全活化的必要條件,並有助於其與負責磷酸化 Ser-486 的激酶共定位,使 PDPK1 得以磷酸化 Thr-320,完成 SGK3 活化。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SGK2SGK3ITCH
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SGK3 與 GSK3B、FLII 有互作;另與 PDPK1 的互作具有磷酸化依賴性。來源未將這些關係一概描述為同一複合體,也未進一步指定其互作形式。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

6 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 6 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SGK3 是參與多種離子通道、膜運輸蛋白及細胞生長、增殖、存活與移動調節的絲胺酸/蘇胺酸蛋白激酶。它可調節多類離子通道、溶質運輸蛋白、麩胺酸受體及鈉鉀 ATPase,也參與腎小管磷酸鹽運輸與骨密度調控;此外,SGK3 磷酸化 NEDD4L、GSK3B、FLII 和 ITCH/AIP4,分別涉及 ER 轉錄活性及 CXCR4 分選至溶酶體的調控。含實驗來源
證據與來源

Serine/threonine-protein kinase which is involved in the regulation of a wide variety of ion channels, membrane transporters, cell growth, proliferation, survival and migration. Up-regulates Na(+) channels: SCNN1A/ENAC and SCN5A, K(+) channels: KCNA3/KV1.3, KCNE1, KCNQ1 and KCNH2/HERG, epithelial Ca(2+) channels: TRPV5 and TRPV6, chloride channel: BSND, creatine transporter: SLC6A8, Na(+)/dicarboxylate cotransporter: SLC13A2/NADC1, Na(+)-dependent phosphate cotransporter: SLC34A2/NAPI-2B, amino acid transporters: SLC1A5/ASCT2 and SLC6A19, glutamate transporters: SLC1A3/EAAT1, SLC1A6/EAAT4 and SLC1A7/EAAT5, glutamate receptors: GRIA1/GLUR1 and GRIK2/GLUR6, Na(+)/H(+) exchanger: SLC9A3/NHE3, and the Na(+)/K(+) ATPase. Plays a role in the regulation of renal tubular phosphate transport and bone density. Phosphorylates NEDD4L and GSK3B. Positively regulates ER transcription activity through phosphorylation of FLII. Negatively regulates the function of ITCH/AIP4 via its phosphorylation and thereby prevents CXCR4 from being efficiently sorted to lysosomes

PMID 12054501 ↗ · PMID 12397388 ↗ · PMID 12590200 ↗ · PMID 12632189 ↗ · PMID 12634932 ↗ · PMID 12650886 ↗ · PMID 12911626 ↗ · PMID 14706641 ↗ · PMID 15040001 ↗ · PMID 15044175 ↗ · PMID 15319523 ↗ · PMID 15496163 ↗ · PMID 15737648 ↗ · PMID 15845389 ↗ · PMID 16036218 ↗ · PMID 16888620 ↗ · PMID 17167223 ↗ · PMID 18005662 ↗ · PMID 19293151 ↗ · PMID 20511718 ↗ · PMID 21865597 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)資料庫紀錄
證據與來源

L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)資料庫紀錄
證據與來源

L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SGK3 與 GSK3B 及 FLII 有互作,並以磷酸化依賴的方式與 PDPK1 互作;來源未進一步說明這些互作的具體形式。含實驗來源
證據與來源

Interacts with GSK3B and FLII. Interacts with PDPK1 in a phosphorylation-dependent manner

PMID 12054501 ↗ · PMID 14604990 ↗ · PMID 16888620 ↗ · PMID 19293151 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SGK3 位於細胞質囊泡、早期胞內體及回收胞內體,並在回收胞內體與 SLC9A3/NHE3 共定位。胞內體定位是其完全激酶活性的必要條件;這使 SGK3 能與負責磷酸化 Ser-486 的激酶共定位,進而允許 PDPK1 磷酸化 Thr-320,完成 SGK3 活化。推論支持
證據與來源

Cytoplasmic vesicle; Early endosome; Recycling endosome; Endosomal localization is a prerequisite for complete kinase activity. It is essential for its colocalization with the kinase responsible for phosphorylating Ser-486 thus allowing PDPK1 phosphorylation of Thr-320 resulting in complete activation of SGK3. Localized in vesicle-like structures and in the early endosome. Colocalizes with SLC9A3/NHE3 in the recycling endosomes

開啟資料庫紀錄 ↗

調控在乳癌細胞中,estrogen/ER 可誘導 SGK3;此敘述限定於乳癌細胞情境。含實驗來源
證據與來源

Induced by estrogen/ER in breast cancer cells

PMID 21084382 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 6 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000521198 · 4,106 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCAGTGCGTTCGGCTCCGCGCCCGCCGCGCCGGGAGCAGC40
41ACCGCGGGGCCAGGTTGCATGATGGAATTTGAACATTACT80
81TCAAGAGGTTTTGTATTTTGGATTAGTTAATTGGGTTTGT120
121CCTCTGCTGACTGTTTCTTCGGATGCATTTTTTGGTGTGC160
161TCTTGAGGGATTAAATGCAAAGAGATCACACCATGGACTA200
201CAAGGAAAGCTGCCCAAGTGTAAGCATTCCCAGCTCCGAT240
241GAACACAGAGAGAAAAAGAAGAGGTTTACTGTTTATAAAG280
281TTCTGGTTTCAGTGGGAAGAAGTGAATGGTTTGTCTTCAG320
321GAGATATGCAGAGTTTGATAAACTTTATAACACTTTAAAA360
361AAACAGTTTCCTGCTATGGCCCTGAAGATTCCTGCCAAGA400
401GAATATTTGGTGATAATTTTGATCCAGATTTTATTAAACA440
441AAGACGAGCAGGACTAAACGAATTCATTCAGAACCTAGTT480
481AGGTATCCAGAACTTTATAACCATCCAGATGTCAGAGCAT520
521TCCTTCAAATGGACAGTCCAAAACACCAGTCAGATCCATC560
561TGAAGATGAGGATGAAAGAAGTTCTCAGAAGCTACACTCT600
601ACCTCACAGAACATCAACCTGGGACCGTCTGGAAATCCTC640
641ATGCCAAACCAACTGACTTTGATTTCTTAAAAGTTATTGG680
681AAAAGGCAGCTTTGGCAAGGTTCTTCTTGCAAAACGGAAA720
721CTGGATGGAAAATTTTATGCTGTCAAAGTGTTACAGAAAA760
761AAATAGTTCTCAACAGAAAAGAGCAAAAACATATTATGGC800
801TGAACGTAATGTGCTCTTGAAAAATGTGAAACATCCGTTT840
841TTGGTTGGATTGCATTATTCCTTCCAAACAACTGAAAAGC880
881TTTATTTTGTTCTGGATTTTGTTAATGGAGGGGAGCTTTT920
921TTTCCACTTACAAAGAGAACGGTCCTTTCCTGAGCACAGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。