基因總覽
SGK2(serum/glucocorticoid regulated kinase 2)是由蛋白質編碼基因產生的絲胺酸/蘇胺酸蛋白質激酶,屬於蛋白質激酶超家族中的 AGC Ser/Thr protein kinase 家族。其蛋白質全長為 367 個胺基酸,包含蛋白質激酶結構域及位於羧基端的 AGC-kinase C-terminal 結構域;胺基端另有一段被註解為無序區域。蛋白質序列也包含核定位訊號。這些特徵構成 SGK2 的基本分子架構;其調控的分子標的與生物學作用另見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000373100 ★ | 43,559,027–43,585,627 | 13 |
| ENST00000647834 | 43,558,968–43,566,531 | 3 |
| ENST00000648083 | 43,558,994–43,570,998 | 7 |
| ENST00000485914 | 43,558,994–43,570,998 | 7 |
| ENST00000872540 | 43,558,994–43,585,726 | 13 |
| ENST00000872541 | 43,558,994–43,585,726 | 14 |
| ENST00000872542 | 43,558,994–43,585,726 | 13 |
| ENST00000872543 | 43,558,994–43,585,726 | 12 |
| ENST00000872544 | 43,558,994–43,585,726 | 13 |
| ENST00000959623 | 43,558,994–43,585,726 | 13 |
| ENST00001118135 | 43,558,994–43,581,321 | 13 |
| ENST00001122209 | 43,558,994–43,585,632 | 13 |
顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SGK2 是絲胺酸/蘇胺酸蛋白質激酶,參與調節多種離子通道、膜運輸蛋白,並與細胞生長、存活及增殖有關。其酵素反應可將 ATP 的磷酸基轉移至蛋白質中的絲胺酸或蘇胺酸殘基,分別形成磷酸化的蛋白質產物,同時生成 ADP 與氫離子。這項活性提供其調節蛋白質功能的分子方式;來源未進一步說明各標的被修飾的位置或後續訊息傳遞步驟。
在離子通道方面,SGK2 可上調鈉離子通道 SCNN1A/ENAC,以及鉀離子通道 KCNA3/Kv1.3、KCNE1 和 KCNQ1。這些資料指出 SGK2 的調控涵蓋不同類型的通道,但未提供各通道受調節的細節或條件,因此不宜據此推定其具體生理效應。
SGK2 也上調多種跨膜運輸及受體蛋白,包括胺基酸運輸蛋白 SLC6A19、麩胺酸運輸蛋白 SLC1A6/EAAT4、麩胺酸受體 GRIA1/GLUR1 與 GRIK2/GLUR6、鈉/氫離子交換器 SLC9A3/NHE3,以及鈉/鉀 ATPase。這組標的顯示其調控範圍涵蓋離子運輸、胺基酸與麩胺酸相關運輸,以及麩胺酸受體;來源未交代這些標的之間是否存在共同調控機制。
因此,現有資料支持 SGK2 具有廣泛調節通道與膜蛋白的角色,並將其與細胞生長、存活及增殖相連結;但並未詳述這些細胞層級作用如何由個別標的導出,也未提供特定細胞或組織情境。解讀其功能時,應保留來源所列的調節範圍,不延伸為未有支持的機制或因果關係。
Promoter 與基因調控
>SGK2 ENST00000373100 GRCh38 chr20:43558027-43559127 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGGCAGATCACAAGGTCAGGAGATCGATACCGTCCTGGCTAATGCAGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAA TACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGTTGAGGCCGGAGAA TGGCGTGAACCTGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCTGAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACA GAGCGAGACTCTGTCTCAAAGAAAAAAAAAAAAGAACCCAGGGCCTGGGAAGCTTTGGGTCAACCCCCGA GAAAGCCTTCCCTGTTCTCCAGGGTGAACTCATCTCTGGTTCCTGAGCCTCAAATCTCTGAAGGGCAGAG TGGGGCATAGGTTTCAACTCAGCTGTGATTCTCCCAGAACGGTGCCAGGGCAGTGCTTGGTCGGGTAGGC TGTGGGTGGCAGTCTTCGGCTTAACACAAGAAATTGCCAGAGGCTGGCTCAGGGGGAAATGAGCTGCCCA GTCCTGGAAGTTTCCATGAAATGACTGAACATAGGGGCTGGTGGCCCCCATTAGGGAAGGGGTGGAGGAG GGTGTTGTGTGAGACCAACCTTTCAGTTGCTGGTTCACTAGGTTCCAAGCGAAAGGGAAGATGACTCAGC GGAGGGAATCAGGGAAGGCTGTGTAGGAGTCAGCACTTAAGCTGGACCTTGAGAGAGTGCGGCAGTTCCA GTGTTGAAAGGGACTTCAGAAACCGTCCCTCCAGCAGGACACACCATCCGTCACCAATTCACATGAGGCT CAGGGAGCTGAAGTCAGTTGCCCATGGTCACATAACAAGTTGTGCTTTAAAAAATTCAGAGAGTCCCCCA GGCAGGGCCCATCCAGGAGCCAGTGTGTGCAGCCAGCTTGGTAATTCAGGTCCAGTGGTTAATTAGTAAC TGGAAGGCCCCGAAGCCAGCTTCCAGCAGGCAGGGCTGGGAGGTTGAACTTGAGCCGGTTTGGGAGCCAG GAGCGAGTGGGTGACAGGTCATTCCTGACTGGGAAGGTTGCTTGACAAGTCAGGATTGTGCCTCCAGTCA GAAGGACCATGAAGAGAGAGAAGAGGGCAGAGCCGTGCATGGGGCTGCTCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SGK2_2 ↗ | 20:43,559,027 | 正股 | 43,558,978–43,559,037 |
| SGK2_1 ↗ | 20:43,565,224 | 正股 | 43,565,175–43,565,234 |
| SGK2_3 ↗ | 20:43,568,003 | 正股 | 43,567,954–43,568,013 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR20_9M9R7 · enhancer · 43556552–43556855 · regulatory
ENSR20_839KL2 · enhancer · 43557635–43557820 · regulatory
ENSR20_BBMDW · promoter · 43558537–43559086 · regulatory
ENSR20_74K6FT · enhancer · 43563562–43563671 · regulatory
ENSR20_5D8MQH · CTCF_binding_site · 43563623–43563644 · regulatory
· motif · 43556552–43556567 · motif
· motif · 43556576–43556586 · motif
· motif · 43557650–43557663 · motif
· motif · 43557650–43557663 · motif
· motif · 43558644–43558658 · motif
· motif · 43558644–43558658 · motif
· motif · 43558685–43558696 · motif
· motif · 43559014–43559027 · motif
· motif · 43560552–43560565 · motif
· motif · 43560552–43560565 · motif
· motif · 43561603–43561613 · motif
· motif · 43561603–43561617 · motif
· motif · 43563625–43563641 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:367 aa
SGK2 蛋白質長 367 個胺基酸,屬於 AGC Ser/Thr protein kinase 家族。第 35–292 位胺基酸為 Protein kinase 結構域,第 293–367 位為 AGC-kinase C-terminal 結構域;第 1–26 位被註解為無序區域。第 68–78 位另有核定位訊號註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SGK2 被註記位於細胞質與細胞核。 來源未提供定位變化的條件、時間動態或異構型差異,因此無法進一步描述其在兩處之間的轉移情形。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- HSP90AB1P08238 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HIRIP3Q9BW71 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- PMM2O15305 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SGK2 是絲胺酸/蘇胺酸蛋白質激酶,參與調節多種離子通道與膜運輸蛋白,也與細胞生長、存活及增殖有關。它可上調鈉離子通道 SCNN1A/ENAC、鉀離子通道 KCNA3/Kv1.3、KCNE1 和 KCNQ1、胺基酸運輸蛋白 SLC6A19、麩胺酸運輸蛋白 SLC1A6/EAAT4、麩胺酸受體 GRIA1/GLUR1 和 GRIK2/GLUR6、鈉/氫離子交換器 SLC9A3/NHE3,以及鈉/鉀 ATPase。 | 含實驗來源 | 證據與來源Serine/threonine-protein kinase which is involved in the regulation of a wide variety of ion channels, membrane transporters, cell growth, survival and proliferation. Up-regulates Na(+) channels: SCNN1A/ENAC, K(+) channels: KCNA3/Kv1.3, KCNE1 and KCNQ1, amino acid transporter: SLC6A19, glutamate transporter: SLC1A6/EAAT4, glutamate receptors: GRIA1/GLUR1 and GRIK2/GLUR6, Na(+)/H(+) exchanger: SLC9A3/NHE3, and the Na(+)/K(+) ATPase PMID 12397388 ↗ · PMID 12590200 ↗ · PMID 12632189 ↗ · PMID 12634932 ↗ · PMID 15040001 ↗ · PMID 20511718 ↗ · PMID 21865597 ↗ |
| 分子活性 | L-seryl-[protein] + ATP = O-phospho-L-seryl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | L-threonyl-[protein] + ATP = O-phospho-L-threonyl-[protein] + ADP + H(+) | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | SGK2 的定位註記包括細胞質與細胞核。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ATTCCTGACTGGGAAGGTTGCTTGACAAGTCAGGATTGTG40CCTCCAGTCAGAAGGACCATGAAGAGAGAGAAGAGGGCAG80AGCCGTGCATGGGGCTGCTCCCCAGGACCTGAGCAGGAAC120CTGGAGTTTTCAGAGCTGCCTGATCATTGCTACAGAATGA160ACTCTAGCCCAGCTGGGACCCCAAGTCCACAGCCCTCCAG200GGCCAATGGGAACATCAACCTGGGGCCTTCAGCCAACCCA240AATGCCCAGCCCACGGACTTCGACTTCCTCAAAGTCATCG280GCAAAGGGAACTACGGGAAGGTCCTACTGGCCAAGCGCAA320GTCTGATGGGGCGTTCTATGCAGTGAAGGTACTACAGAAA360AAGTCCATCTTAAAGAAGAAAGAGCAGAGCCACATCATGG400CAGAGCGCAGTGTGCTTCTGAAGAACGTGCGGCACCCCTT440CCTCGTGGGCCTGCGCTACTCCTTCCAGACACCTGAGAAG480CTCTACTTCGTGCTCGACTATGTCAACGGGGGAGAGCTCT520TCTTCCACCTGCAGCGGGAGCGCCGGTTCCTGGAGCCCCG560GGCCAGGTTCTACGCTGCTGAGGTGGCCAGCGCCATTGGC600TACCTGCACTCCCTCAACATCATTTACAGGGATCTGAAAC640CAGAGAACATTCTCTTGGACTGCCAGGGACACGTGGTGCT680GACGGATTTTGGCCTCTGCAAGGAAGGTGTAGAGCCTGAA720GACACCACATCCACATTCTGTGGTACCCCTGAGTACTTGG760CACCTGAAGTGCTTCGGAAAGAGCCTTATGATCGAGCAGT800GGACTGGTGGTGCTTGGGGGCAGTCCTCTACGAGATGCTC840CATGGCCTGCCGCCCTTCTACAGCCAAGATGTATCCCAGA880TGTATGAGAACATTCTGCACCAGCCGCTACAGATCCCCGG920AGGCCGGACAGTGGCCGCCTGTGACCTCCTGCAAAGCCTT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。