演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SFTPA2SP-A2

surfactant protein A2

SFTPA2 編碼 surfactant protein A2,屬於 SFTPA 家族;在有鈣離子時可結合表面活性劑磷脂,參與降低肺泡氣液界面的表面張力。

Homo sapiens10q22.3UniProt Q8IWL1
OFFICIAL SYMBOL
SFTPA2
CHROMOSOME
10
UNIPROT
Q8IWL1
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SFTPA2 是人類的蛋白質編碼基因,其產物 surfactant protein A2 屬於 SFTPA 家族。蛋白質全長為 248 個胺基酸,具有 collagen-like 區域與 C-type lectin 區域,並含有訊號胜肽。來源指出,此蛋白質參與肺泡中的表面活性劑功能,與正常呼吸相關。

Official symbol
SFTPA2
Gene name
surfactant protein A2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10799
UniProt
Q8IWL1
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SP-A2COLEC5

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1010q22.3
chr10 · 133,797,422 bp · GRCh38chr10p15.3 · 1–3000000 · gnegchr10p15.2 · 3000001–3800000 · gpos25chr10p15.1 · 3800001–6600000 · gnegchr10p14 · 6600001–12200000 · gpos75chr10p13 · 12200001–17300000 · gnegchr10p12.33 · 17300001–18300000 · gpos75chr10p12.32 · 18300001–18400000 · gnegchr10p12.31 · 18400001–22300000 · gpos75chr10p12.2 · 22300001–24300000 · gnegchr10p12.1 · 24300001–29300000 · gpos50chr10p11.23 · 29300001–31100000 · gnegchr10p11.22 · 31100001–34200000 · gpos25chr10p11.21 · 34200001–38000000 · gnegchr10p11.1 · 38000001–39800000 · acenchr10q11.1 · 39800001–41600000 · acenchr10q11.21 · 41600001–45500000 · gnegchr10q11.22 · 45500001–48600000 · gpos25chr10q11.23 · 48600001–51100000 · gnegchr10q21.1 · 51100001–59400000 · gpos100chr10q21.2 · 59400001–62800000 · gnegchr10q21.3 · 62800001–68800000 · gpos100chr10q22.1 · 68800001–73100000 · gnegchr10q22.2 · 73100001–75900000 · gpos50chr10q22.3 · 75900001–80300000 · gnegchr10q23.1 · 80300001–86100000 · gpos100chr10q23.2 · 86100001–87700000 · gnegchr10q23.31 · 87700001–91100000 · gpos75chr10q23.32 · 91100001–92300000 · gnegchr10q23.33 · 92300001–95300000 · gpos50chr10q24.1 · 95300001–97500000 · gnegchr10q24.2 · 97500001–100100000 · gpos50chr10q24.31 · 100100001–101200000 · gnegchr10q24.32 · 101200001–103100000 · gpos25chr10q24.33 · 103100001–104000000 · gnegchr10q25.1 · 104000001–110100000 · gpos100chr10q25.2 · 110100001–113100000 · gnegchr10q25.3 · 113100001–117300000 · gpos75chr10q26.11 · 117300001–119900000 · gnegchr10q26.12 · 119900001–121400000 · gpos50chr10q26.13 · 121400001–125700000 · gnegchr10q26.2 · 125700001–128800000 · gpos50chr10q26.3 · 128800001–133797422 · gnegSFTPA2pq1 bp133,797,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr10:79,555,761–79,611,921
Gene span
56,161 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000372325 ★79,555,852–79,560,4076
ENST0000090508579,555,761–79,560,4864
ENST0000090509579,555,863–79,560,4085
ENST0000090508679,555,864–79,560,4926
ENST0000090509179,555,866–79,560,4435
ENST0000095907279,555,866–79,560,4086
ENST0000112312679,555,867–79,611,9206
ENST0000090509279,555,868–79,560,4296
ENST0000090509379,555,868–79,560,4206
ENST0000095907379,555,869–79,560,4027
ENST0000104914179,555,872–79,560,4076
ENST0000090508779,555,881–79,560,4796

顯示 12/69 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

在有鈣離子時,surfactant protein A2 會結合表面活性劑磷脂。這項作用有助於降低哺乳類肺部肺泡氣液界面的表面張力,來源並指出此功能對正常呼吸不可或缺。

來源提供的功能描述限於鈣離子存在時與表面活性劑磷脂的結合,以及其對肺泡界面表面張力和呼吸的作用;未進一步說明結合方式或其他細胞過程。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 79560407 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SFTPA2 ENST00000372325 GRCh38 chr10:79560307-79561407 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCAAAACAGCCCTGCCTCCCCACAGCCAAGTTGCTGGAGCTTCGCCCCACCTGCCCCCAACCTGCACTGG
CCTGACTCCCCCATTCCACACCTGGCCCAGCACCCACCACATGGTGTGGCAGACAGCACTGGGGCAGCTG
AAAGACTCCATGCTACAAATTGGCACTGCCCAGCTTCCTGCTCCTGGGAGTGGGGTCCGTTGTCTGAGCT
TCCGCTCCCTGGAAGAGCTCCAAACTCCTCAATGGTTTGGGATTTTTCAAACCAATTCCAAATAAGCCAG
GGGAGATTTTCCTGTCTGGGTTCCCATCATTACCACCTCCACAGTTGGAGATTCCCTCCTAATCCAGATG
CTCAAACCAGGACCCTAACAACTAGGGCTTCATATATCACTGGGACACTTAGCATAATCACCATTGCAGG
TTGCCAGACATCACCCAAAGTGATGTTCTACCAAAGACAGAAACTGCAGCTCTCCCATGACCTTCCAGGT
GCTGCCCTGACTCCTCCAGCTGAACCTGCTAGGGCAGAGGGAAGTGGAACGTGCAGCATATTTGCCTGCC
ACTCTGTCCATGTGCCCACCAACTCGGCTGCAGGCTCCAGAGACACTGGCTGGGGGTCCTGGGGCTCAGA
GCTGAGCAAGGTTACAGGGCAGACAGGTTGGCCTGGATCAACCTGACCAACCTCAGCTGAAGCAGTGACT
TCTTCATTGTCTGAAACTAAACCAGGAACCCAGTGGAGCTCCCTGAGTGCAGAGTGGGTGACCTTAGCCA
GTGAGGCATTTCTCTTCTTACAGACCTGGTATTTTTCTTTACCAGGTTCTGTGCTCCCCTCAAGGGTCCT
AAGTATTCCTGCAGCCTGAGTGTTCTGCAGGGAAATGTGCTGTGTAAACACTATGCCTATTTCCTGCTTG
GAGAACAGGTTTTGTGGTAGAGCTCTCAGGGGTGGGGAAGAAGCCTGGCAGCCCACATGCTATAAATTCT
GTTGTCCACCTTTATGCTCTAACTTGGAGGCAGAGACCCAAGCAGCTGGAGGCTCTGTGTGTGGGTGAGT
TTAGCCACATCCCCTAGGTGTTCTCCAGCTTGAGGATCGCAGGCAGAGAGG
SFTPA2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SFTPA2_1 ↗10:79,560,407負股79,560,397–79,560,456

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR10_BKRBQ · enhancer · 79562037–79562948 · regulatory

ENSR10_5NP9D2 · CTCF_binding_site · 79562299–79562320 · regulatory

· motif · 79562301–79562317 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:248 aa

1 aa248 aa結構域功能區域訊號胜肽
依 Q8IWL1 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

surfactant protein A2 長 248 個胺基酸,含有第 1–20 位的訊號胜肽、第 28–100 位的 collagen-like 區域,以及第 132–248 位的 C-type lectin 區域。第 33–101 位另註記為無序區域;此蛋白質屬於 SFTPA 家族。

訊號胜肽1–20 aa
結構域Collagen-like28–100 aa
結構域C-type lectin132–248 aa
功能區域Disordered33–101 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8IWL1…

AlphaFold · Q8IWL1

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted;Secreted, extracellular space, extracellular matrix;Secreted, extracellular space, surface film

surfactant protein A2 為分泌蛋白,定位資料列出細胞外空間,並包括細胞外基質及表面膜。 來源未提供定位改變的條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SP-A2SFTPA2NCS1UBQLN2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

surfactant protein A2 被描述為由六組同源三聚體構成的寡聚複合體。來源未提供其他結合夥伴或功能關係的細節。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

SFTPA2 的變異與間質性肺病 2(ILD2)相關;來源將該病描述為由影響此基因的變異所致,遺傳方式為體染色體顯性。間質性肺病是一組影響肺遠端部位的異質性疾病,其特徵包括肺泡間質逐漸重塑;臨床表現可包括呼吸困難、手指杵狀及限制性肺容量。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能有鈣離子存在時,surfactant protein A2 會結合表面活性劑磷脂,並有助於降低哺乳類肺部肺泡氣液界面的表面張力;此作用對正常呼吸不可或缺。資料庫紀錄
證據與來源

In presence of calcium ions, it binds to surfactant phospholipids and contributes to lower the surface tension at the air-liquid interface in the alveoli of the mammalian lung and is essential for normal respiration

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用surfactant protein A2 的寡聚複合體由六組同源三聚體構成。資料庫紀錄
證據與來源

Oligomeric complex of 6 set of homotrimers

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位surfactant protein A2 為分泌蛋白,定位於細胞外空間;資料亦列出細胞外基質與表面膜。含實驗來源
證據與來源

Secreted; Secreted, extracellular space, extracellular matrix; Secreted, extracellular space, surface film

PMID 26792177 ↗ · PMID 32855221 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯SFTPA2 的變異與間質性肺病 2(ILD2)相關,來源指出該病由影響此基因的變異所致,且為體染色體顯性遺傳。間質性肺病是一組影響肺遠端部位、伴隨肺泡間質逐漸重塑的異質性疾病;臨床表現可包括呼吸困難、手指杵狀及限制性肺容量。含實驗來源
證據與來源

Interstitial lung disease 2 ILD2 A form of interstitial lung disease, a heterogeneous group of diseases affecting the distal part of the lung and characterized by a progressive remodeling of the alveolar interstitium. The disease spectrum ranges from idiopathic interstitial pneumonia or pneumonitis to idiopathic pulmonary fibrosis, that is associated with an increased risk of developing lung cancer. Clinical features of interstitial lung disease include dyspnea, clubbing of the fingers, and restrictive lung capacity. ILD2 inheritance is autosomal dominant. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 178500

PMID 19100526 ↗ · PMID 26792177 ↗ · PMID 32855221 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000372325 · 2,201 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AACTTGGAGGCAGAGACCCAAGCAGCTGGAGGCTCTGTGT40
41GTGGGTCGCTGATTTCTTGGAGCCTGAAAAGAAGGAGCAG80
81CGACTGGACCCAGAGCCATGTGGCTGTGCCCTCTGGCCCT120
121CACCCTCATCTTGATGGCAGCCTCTGGTGCTGCGTGCGAA160
161GTGAAGGACGTTTGTGTTGGAAGCCCTGGTATCCCCGGCA200
201CTCCTGGATCCCACGGCCTGCCAGGCAGGGACGGGAGAGA240
241TGGTGTCAAAGGAGACCCTGGCCCTCCAGGCCCCATGGGT280
281CCGCCTGGAGAAACACCATGTCCTCCTGGGAATAATGGGC320
321TGCCTGGAGCCCCTGGTGTCCCTGGAGAGCGTGGAGAGAA360
361GGGGGAGGCTGGCGAGAGAGGCCCTCCAGGGCTTCCAGCT400
401CATCTAGATGAGGAGCTCCAAGCCACACTCCACGACTTCA440
441GACATCAAATCCTGCAGACAAGGGGAGCCCTCAGTCTGCA480
481GGGCTCCATAATGACAGTAGGAGAGAAGGTCTTCTCCAGC520
521AATGGGCAGTCCATCACTTTTGATGCCATTCAGGAGGCAT560
561GTGCCAGAGCAGGCGGCCGCATTGCTGTCCCAAGGAATCC600
601AGAGGAAAATGAGGCCATTGCAAGCTTCGTGAAGAAGTAC640
641AACACATATGCCTATGTAGGCCTGACTGAGGGTCCCAGCC680
681CTGGAGACTTCCGCTACTCAGATGGGACCCCTGTAAACTA720
721CACCAACTGGTACCGAGGGGAGCCTGCAGGTCGGGGAAAA760
761GAGCAGTGTGTGGAGATGTACACAGATGGGCAGTGGAATG800
801ACAGGAACTGCCTGTACTCCCGACTGACCATCTGTGAGTT840
841CTGAGAGGCATTTAGGCCATGGGACAGGGAGGATCCTGTC880
881TGGCCTTCAGTTTCCATCCCCAGGATCCACTTGGTCTGTG920
921AGATGCTAGAACTCCCTTTCAACAGAATTCACTTGTGGCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。