演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SFRP5SARP3

secreted frizzled related protein 5

SFRP5 編碼 secreted frizzled related protein 5,屬於可溶性 frizzled-related protein 家族,參與調節 Wnt 訊號。

Homo sapiens10q24.2UniProt Q5T4F7
OFFICIAL SYMBOL
SFRP5
CHROMOSOME
10
UNIPROT
Q5T4F7
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SFRP5 是蛋白質編碼基因,其產物 secreted frizzled related protein 5 屬於 secreted frizzled-related protein(sFRP)家族。這類蛋白質為可溶性分子,與 Wnt 訊號調節相關。SFRP5 的基本特性包括其分泌性,以及與家族成員相同的分類;現有資料未提供其基因轉錄本或其他分子形式的細節。

Official symbol
SFRP5
Gene name
secreted frizzled related protein 5
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10779
UniProt
Q5T4F7
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SARP3

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1010q24.2
chr10 · 133,797,422 bp · GRCh38chr10p15.3 · 1–3000000 · gnegchr10p15.2 · 3000001–3800000 · gpos25chr10p15.1 · 3800001–6600000 · gnegchr10p14 · 6600001–12200000 · gpos75chr10p13 · 12200001–17300000 · gnegchr10p12.33 · 17300001–18300000 · gpos75chr10p12.32 · 18300001–18400000 · gnegchr10p12.31 · 18400001–22300000 · gpos75chr10p12.2 · 22300001–24300000 · gnegchr10p12.1 · 24300001–29300000 · gpos50chr10p11.23 · 29300001–31100000 · gnegchr10p11.22 · 31100001–34200000 · gpos25chr10p11.21 · 34200001–38000000 · gnegchr10p11.1 · 38000001–39800000 · acenchr10q11.1 · 39800001–41600000 · acenchr10q11.21 · 41600001–45500000 · gnegchr10q11.22 · 45500001–48600000 · gpos25chr10q11.23 · 48600001–51100000 · gnegchr10q21.1 · 51100001–59400000 · gpos100chr10q21.2 · 59400001–62800000 · gnegchr10q21.3 · 62800001–68800000 · gpos100chr10q22.1 · 68800001–73100000 · gnegchr10q22.2 · 73100001–75900000 · gpos50chr10q22.3 · 75900001–80300000 · gnegchr10q23.1 · 80300001–86100000 · gpos100chr10q23.2 · 86100001–87700000 · gnegchr10q23.31 · 87700001–91100000 · gpos75chr10q23.32 · 91100001–92300000 · gnegchr10q23.33 · 92300001–95300000 · gpos50chr10q24.1 · 95300001–97500000 · gnegchr10q24.2 · 97500001–100100000 · gpos50chr10q24.31 · 100100001–101200000 · gnegchr10q24.32 · 101200001–103100000 · gpos25chr10q24.33 · 103100001–104000000 · gnegchr10q25.1 · 104000001–110100000 · gpos100chr10q25.2 · 110100001–113100000 · gnegchr10q25.3 · 113100001–117300000 · gpos75chr10q26.11 · 117300001–119900000 · gnegchr10q26.12 · 119900001–121400000 · gpos50chr10q26.13 · 121400001–125700000 · gnegchr10q26.2 · 125700001–128800000 · gpos50chr10q26.3 · 128800001–133797422 · gnegSFRP5pq1 bp133,797,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr10:97,766,751–97,772,287
Gene span
5,537 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000266066 ★97,766,751–97,771,9993

顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

可溶性 frizzled-related proteins(sFRP)會直接與 Wnt 配體作用,藉此調節 Wnt 訊號。這項作用使 sFRP 成為訊號調節因子;來源並未進一步說明 SFRP5 與個別 Wnt 分子的結合情形,或其調節訊號的具體分子步驟,因此不宜據此推定更細緻的作用機制。

在特定細胞類型中,sFRP 家族具有調節細胞生長與分化的角色。這表示其對 Wnt 訊號的調節與細胞生物學結果有所關聯,但目前資料未列出受影響的細胞類型,也未指出細胞生長或分化改變的方向與條件。這些描述屬於家族層級的功能資訊,不能據此認定所有細胞中皆有相同作用。

對 SFRP5 而言,來源指出它可能參與決定視網膜感光細胞的極性,也可能涉及視網膜中的其他細胞。此處使用「可能」表達其參與仍具不確定性;資料未說明其作用於哪些視網膜細胞以外的細胞,也未提供極性形成的分子步驟。因此,SFRP5 在視網膜中的角色應限於可能參與細胞極性決定,不宜延伸為已確立的作用機制或其他生理功能。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 97771999 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SFRP5 ENST00000266066 GRCh38 chr10:97771899-97772999 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CATATGAGCTGTGTGGCCAAGGGCCAGTTACTCCACTTCTCTGAACTCCCTATCCCCTTGGTCATTAGGC
CTACAGACTCAGAATCCAGGCCTCCTGGTTGTTTCTGGGCTCTGACTCTCGAAAAAGACTATCTGGGTTC
AAATCCCAGCTCTAATCTGTGCTTAACCTCTCTGCCGCAGGATCTTTATCTGTAAGGTGGGGACAATAAT
AGTACCTACCCACCATCTAGCCTTATTGTGAGAATTAGCTGAGGGAGTTTATGCAATGTGCTCAGATCAG
ACTTGGCACACAATTAGCACCCACTAAGTATTGGCTATCATTAGCAATAGCTGATAAGCTTGGAACGTAC
CTTGCACCGCACCTTGCACCGCACCTTGCACCTTGCACCGTCCCTGGCAGGTAGTAAGAGCTCACTAAAT
AGAAGCTATGATTACCTTCACCCCCACTAGACTATCCTGGCCCTGGAGGTGGGTTCTGGGTCATATCCAT
CTTTGATTCCCCAGCAGCCAGCATGGGGCCTGGCACCAAGCTCAATGAAGACCTGCCAGGAGGACCAGAA
GATCCAGGGTGTGGGGTGGCACGAGCCTCCCACCAGGGAGAAGAGGAACCGAGGTGTCGGGGAAGAGAAA
ACAGAGCAGAGGGAGAAAAGCCAAGGCAGAGAGATAAGCAAGTGAAGTGAGTGAGAAAAGGAACAGGAGA
GGCTGTGGCGGAGAGAGATAAGGAGGAAGGATGGAGAAGGCGAGGGTCGAGGAAAATGCCCAGGGAGGCA
GGGAGCCCTGGGGAGAAACGCTGGGCGAGGCCAGGGCTGCGGCAGGGGAGCCGAGCCGGGAGAGGGGCGC
AAGACCTGGCGCTGGGCGGGACGCTCGGGCAGGGTGCGGGAGGGGCTGAGGGCCGCCCCCACTGCCTCCC
CGCCTTGGAGCTGGGGCCAGGCGGCCGGAGATTGGCTGGGGCGCACGGCGAGGCCCGGGCTGGAGCCCCG
AGGTGGGAGGCGCCAGGATCAGTCGGGGCGCCCGCAGCGCAGGCTGCCACCCACCTGGGCGACCTCCGCG
GCGGCGGCGGCGGCGGCTGGGTAGAGTCAGGGCCGGGGGCGCACGCCGGAA
SFRP5 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SFRP5_1 ↗10:97,771,999負股97,771,989–97,772,048

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR10_5SZWKZ · CTCF_binding_site · 97771087–97771108 · regulatory

ENSR10_5SZWPF · CTCF_binding_site · 97771835–97771856 · regulatory

ENSR10_93FRRK · promoter · 97771989–97772489 · regulatory

· motif · 97771089–97771105 · motif

· motif · 97771837–97771853 · motif

· motif · 97772278–97772284 · motif

· motif · 97772332–97772338 · motif

· motif · 97772610–97772624 · motif

· motif · 97772610–97772625 · motif

· motif · 97772617–97772632 · motif

· motif · 97772617–97772632 · motif

· motif · 97772629–97772644 · motif

· motif · 97772629–97772644 · motif

· motif · 97772641–97772656 · motif

· motif · 97772641–97772656 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:317 aa

1 aa317 aa結構域訊號胜肽
依 Q5T4F7 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

secreted frizzled related protein 5 長 317 個胺基酸。其序列包含第 1–29 位的訊號序列、第 48–165 位的 FZ 結構域,以及第 181–303 位的 NTR 結構域;此外,該蛋白質歸屬於 secreted frizzled-related protein(sFRP)家族。

訊號胜肽1–29 aa
結構域FZ48–165 aa
結構域NTR181–303 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q5T4F7…

AlphaFold · Q5T4F7

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

SFRP5 的定位註記為分泌性,表示資料將其描述為分泌蛋白。 現有資訊未提供其在不同條件下的定位變化、異構型差異或細胞內動態。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SARP3SFRP5
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能可溶性 frizzled-related proteins(sFRP)透過直接與 Wnt 作用調節 Wnt 訊號,並在特定細胞類型中參與調節細胞生長與分化。SFRP5 可能參與決定視網膜感光細胞的極性,也可能涉及視網膜中的其他細胞。資料庫紀錄
證據與來源

Soluble frizzled-related proteins (sFRPS) function as modulators of Wnt signaling through direct interaction with Wnts. They have a role in regulating cell growth and differentiation in specific cell types. SFRP5 may be involved in determining the polarity of photoreceptor, and perhaps, other cells in the retina

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted推論支持
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000266066 · 1,883 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTCGGGGCGCCCGCAGCGCAGGCTGCCACCCACCTGGGC40
41GACCTCCGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCTGGGTAGAGTCAG80
81GGCCGGGGGCGCACGCCGGAACACCTGGGCCGCCGGGCAC120
121CGAGCGTCGGGGGGCTGCGCGGCGCGCACCTGGAGAGGGC160
161GCAGCCATGCGGGCGGCGGCGGCGGGGGGGGGCGTGCGGA200
201CGGCCGCGCTGGCGCTGCTGCTGGGGGCGCTGCACTGGGC240
241GCCGGCGCGCTGCGAGGAGTACGACTACTATGGCTGGCAG280
281GCCGAGCCGCTGCACGGCCGCTCCTACTCCAAGCCGCCGC320
321AGTGCCTTGACATCCCTGCCGACCTGCCGCTCTGCCACAC360
361GGTGGGCTACAAGCGCATGCGGCTGCCCAACCTGCTGGAG400
401CACGAGAGCCTGGCCGAAGTGAAGCAGCAGGCGAGCAGCT440
441GGCTGCCGCTGCTGGCCAAGCGCTGCCACTCGGATACGCA480
481GGTCTTCCTGTGCTCGCTCTTTGCGCCCGTCTGTCTCGAC520
521CGGCCCATCTACCCGTGCCGCTCGCTGTGCGAGGCCGTGC560
561GCGCCGGCTGCGCGCCGCTCATGGAGGCCTACGGCTTCCC600
601CTGGCCTGAGATGCTGCACTGCCACAAGTTCCCCCTGGAC640
641AACGACCTCTGCATCGCCGTGCAGTTCGGGCACCTGCCCG680
681CCACCGCGCCTCCAGTGACCAAGATCTGCGCCCAGTGTGA720
721GATGGAGCACAGTGCTGACGGCCTCATGGAGCAGATGTGC760
761TCCAGTGACTTTGTGGTCAAAATGCGCATCAAGGAGATCA800
801AGATAGAGAATGGGGACCGGAAGCTGATTGGAGCCCAGAA840
841AAAGAAGAAGCTGCTCAAGCCGGGCCCCCTGAAGCGCAAG880
881GACACCAAGCGGCTGGTGCTGCACATGAAGAATGGCGCGG920
921GCTGCCCCTGCCCACAGCTGGACAGCCTGGCGGGCAGCTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。