演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SFRP4frpHE

secreted frizzled related protein 4

SFRP4 編碼 secreted frizzled related protein 4,屬於分泌型 Frizzled-related protein 家族。來源指出其參與骨形態發生,並可能調節 Wnt 訊號及磷酸鹽吸收。

Homo sapiens7p14.1UniProt Q6FHJ7
OFFICIAL SYMBOL
SFRP4
CHROMOSOME
7
UNIPROT
Q6FHJ7
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SFRP4 是蛋白質編碼基因,產物為 secreted frizzled related protein 4,屬於 secreted frizzled-related protein(sFRP)家族。此家族蛋白可透過與 Wnt 配體直接作用調節 Wnt 訊號;SFRP4 的資料亦指出它與骨形態發生有關。其蛋白質序列具有訊號胜肽,以及 FZ 與 NTR 兩個註解結構域;這些特徵與其分泌型家族身分相符。來源另提及 SFRP4 可能參與成人子宮形態與功能調節,以及排卵期間的細胞凋亡調節,但後兩項描述帶有不確定性,部分功能註解標示為相似性推論。

Official symbol
SFRP4
Gene name
secreted frizzled related protein 4
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10778
UniProt
Q6FHJ7
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
frpHEFRP-4FRPHEFRZB-2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 77p14.1
chr7 · 159,345,973 bp · GRCh38chr7p22.3 · 1–2800000 · gnegchr7p22.2 · 2800001–4500000 · gpos25chr7p22.1 · 4500001–7200000 · gnegchr7p21.3 · 7200001–13700000 · gpos100chr7p21.2 · 13700001–16500000 · gnegchr7p21.1 · 16500001–20900000 · gpos100chr7p15.3 · 20900001–25500000 · gnegchr7p15.2 · 25500001–27900000 · gpos50chr7p15.1 · 27900001–28800000 · gnegchr7p14.3 · 28800001–34900000 · gpos75chr7p14.2 · 34900001–37100000 · gnegchr7p14.1 · 37100001–43300000 · gpos75chr7p13 · 43300001–45400000 · gnegchr7p12.3 · 45400001–49000000 · gpos75chr7p12.2 · 49000001–50500000 · gnegchr7p12.1 · 50500001–53900000 · gpos75chr7p11.2 · 53900001–58100000 · gnegchr7p11.1 · 58100001–60100000 · acenchr7q11.1 · 60100001–62100000 · acenchr7q11.21 · 62100001–67500000 · gnegchr7q11.22 · 67500001–72700000 · gpos50chr7q11.23 · 72700001–77900000 · gnegchr7q21.11 · 77900001–86700000 · gpos100chr7q21.12 · 86700001–88500000 · gnegchr7q21.13 · 88500001–91500000 · gpos75chr7q21.2 · 91500001–93300000 · gnegchr7q21.3 · 93300001–98400000 · gpos75chr7q22.1 · 98400001–104200000 · gnegchr7q22.2 · 104200001–104900000 · gpos50chr7q22.3 · 104900001–107800000 · gnegchr7q31.1 · 107800001–115000000 · gpos75chr7q31.2 · 115000001–117700000 · gnegchr7q31.31 · 117700001–121400000 · gpos75chr7q31.32 · 121400001–124100000 · gnegchr7q31.33 · 124100001–127500000 · gpos75chr7q32.1 · 127500001–129600000 · gnegchr7q32.2 · 129600001–130800000 · gpos25chr7q32.3 · 130800001–132900000 · gnegchr7q33 · 132900001–138500000 · gpos50chr7q34 · 138500001–143400000 · gnegchr7q35 · 143400001–148200000 · gpos75chr7q36.1 · 148200001–152800000 · gnegchr7q36.2 · 152800001–155200000 · gpos25chr7q36.3 · 155200001–159345973 · gnegSFRP4pq1 bp159,345,973 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr7:37,903,004–38,025,695
Gene span
122,692 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000436072 ★37,905,932–37,916,8176
ENST0000096068337,903,004–37,917,0265
ENST0000114050537,903,004–37,917,0266
ENST0000096068437,906,802–37,917,0266
ENST0000088188737,906,809–37,917,0266
ENST0000044720037,909,659–38,025,6956
ENST0000111376837,909,698–37,917,0265

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SFRP4 的功能資料涵蓋 Wnt 訊號調節、骨形態發生及磷酸鹽吸收。作為 sFRP 家族成員,它可藉由與 Wnt 配體直接作用調節 Wnt 訊號;此類蛋白亦在特定細胞類型中參與細胞生長與分化調控。這些細胞生長與分化相關描述依相似性推論,來源未進一步界定適用的細胞類型或作用條件。

在骨骼相關過程中,SFRP4 被註明參與骨形態發生。來源沒有詳述其作用階段或分子機制,因此不宜將這項描述延伸為特定骨細胞或訊號路徑的作用。另有資料指出,SFRP4 可能調節成年子宮的形態與功能;這項作用以「可能」表述,來源未提供更具體的調控方式。

排卵期間,SFRP4 可能增加細胞凋亡,且可能透過調節 FZ1/FZ4/WNT4 訊號達成。這項說法同樣帶有推論性,並未在來源中被描述為已確立的因果機制。來源也未提供此過程中的細胞或實驗條件細節。

此外,SFRP4 具有促進磷酸鹽排出的作用,具體而言是選擇性抑制鈉依賴型磷酸鹽攝取。這項功能提供了較明確的作用方向與運輸過程描述;來源未補充其發生部位或生理條件。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 37916817 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SFRP4 ENST00000436072 GRCh38 chr7:37916717-37917817 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTCCCTTTTCTGTAGATAGCTGAGCCAGCAATTGGACTACCTTTTCCTAATGCAAGTAAGATAAAAGAGA
AAGCAAAACATACATACTTGCATCCCATAGTACACAGCTTCTTACTCAACTCAAGCAACAGTCTCTGAGC
ACATCAAAAATCAAGATTTTAGGCTGCTGAGGTGGAAATCCTTTGGCATGAAGGATCAGAGCAGGGGAGA
CCTTTCAGATTGTGGTGCCCAATGTTTTCTCCTGGGTTCCACTAATGCTGCAGAGGGGAACAGGGAGTTA
GAAGGAAGAGGAAATGTTAGAAGACATTTCTGAAGCTGGAAGATGCTAGCACACCTTCCCCCAGTTCTGT
TAACTTCCTGGAGCAGAAACAAACCAAGTGTTATACTGGAAAAATTTCGGCCCAAACTGTCTACTAGCAA
CAACAACAACAAACCACACTCCACACAACTAAGGGCGGAGTGGGAGTGATTTATACAACGTGACCCTCCT
GTTCTGACATTCACTGCACTCTCGCCTGCCTTGCAGGACATTGTCCCAACTGTCCTCAGCGCTCCTCATG
CCCCCTACCGGAGAAAGCAAATATATTTCAGAATTAGAGGGCAGCAGAAGCTCCTATTTTCCCCCAACTC
TATACTTGGAAAAACTCTAAGGCAGAGGGAGCAAAGTTCAGTTTTCAGCCAAAGAGTGTCTTTCTCTCTC
TTGAAATTCTCTCCCGCACCCTCTTGTATCCGGTGTCGAAAACAACTGCCAGAGGTTCTTTTTCTTGGTC
CGAAGAAAAAAGACTGGCCAGACTAAAAAGGAGGGACTTTAGGGGGAAAGCAGGCTTCCAGCCCTGGGCT
GCGGCCCAGAGGGGGTGATGTCACCGCTTCTGCACCGACGGGCCTGGGGGTGGGGCGGCCGAGGGGGAGC
CCGCGCCGCGGCTGCAGCTGCCAAGGGAGCGTTCCGAGCCCACGTCAGGGGAGGTGTCGGGATAAATAGG
GTCCCGCAATGGCCGTGGCTGGCTGCGCTCCGAGCTGCGGAGTCCGGGACTGGAGCTGCCCGGGCGGGTT
CGCGCCCCGAAGGCTGAGAGCTGGCGCTGCTCGTGCCCTGTGTGCCAGACG
SFRP4 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SFRP4_1 ↗7:37,916,817負股37,916,807–37,916,866

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR7_8354LC · enhancer · 37912794–37913021 · regulatory

ENSR7_5BWRGK · CTCF_binding_site · 37916539–37916560 · regulatory

ENSR7_9K3CD · promoter · 37916807–37917307 · regulatory

ENSR7_5BWRKS · CTCF_binding_site · 37917243–37917264 · regulatory

ENSR7_5BWRPM · CTCF_binding_site · 37918066–37918087 · regulatory

ENSR7_5BWRSM · CTCF_binding_site · 37918713–37918734 · regulatory

ENSR7_5BWRTH · CTCF_binding_site · 37918895–37918916 · regulatory

ENSR7_9K3DC · promoter · 37920168–37920668 · regulatory

ENSR7_9K3DJ · promoter · 37920830–37921330 · regulatory

ENSR7_5BWS8C · CTCF_binding_site · 37921028–37921049 · regulatory

· motif · 37912698–37912720 · motif

· motif · 37912698–37912720 · motif

· motif · 37915507–37915520 · motif

· motif · 37916541–37916557 · motif

· motif · 37916952–37916965 · motif

· motif · 37916952–37916965 · motif

· motif · 37917146–37917161 · motif

· motif · 37917146–37917161 · motif

· motif · 37917147–37917161 · motif

· motif · 37917148–37917161 · motif

· motif · 37917245–37917261 · motif

· motif · 37918068–37918084 · motif

· motif · 37918715–37918731 · motif

· motif · 37918897–37918913 · motif

· motif · 37920059–37920081 · motif

· motif · 37920059–37920081 · motif

· motif · 37920469–37920481 · motif

· motif · 37920472–37920479 · motif

· motif · 37921030–37921046 · motif

· motif · 37921210–37921222 · motif

· motif · 37921349–37921362 · motif

· motif · 37921349–37921362 · motif

· motif · 37921526–37921540 · motif

· motif · 37921526–37921540 · motif

SFRP4 水準在衰竭心肌中升高;在多種腫瘤類型中也有上調紀錄,包括與 osteomalacia 相關的腫瘤,以及子宮內膜癌與乳癌。來源未說明這些表現變化的調控機制。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:346 aa

1 aa346 aa結構域功能區域訊號胜肽
依 Q6FHJ7 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

secreted frizzled related protein 4 長 346 個胺基酸,N 端第 1–18 位為訊號胜肽。蛋白質含 FZ 結構域(第 19–139 位)及 NTR 結構域(第 178–307 位);第 292–346 位另被註解為無序區。這些區域描述來自序列註解。

訊號胜肽1–18 aa
結構域FZ19–139 aa
結構域NTR178–307 aa
功能區域Disordered292–346 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q6FHJ7…

AlphaFold · Q6FHJ7

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

SFRP4 被註記為分泌蛋白;另有資料記錄其在卵巢腫瘤細胞的細胞質中。 後者是特定細胞情境下的定位描述。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
frpHESFRP4AQP6HSD17B11JPH3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

SFRP4 與 Pyle disease 有關。此疾病的特徵包括皮質骨變薄、肢體變形、骨脆弱及骨折;資料指出,影響 SFRP4 的變異可致病。來源未提供變異類型或更詳細的機制。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能sFRP 蛋白可透過與 Wnt 直接作用調節 Wnt 訊號,並在特定細胞類型中參與細胞生長與分化調控;此部分依相似性推論。SFRP4 參與骨形態發生,可能調節成年子宮形態與功能,也可能在排卵期間透過調節 FZ1/FZ4/WNT4 訊號增加細胞凋亡。它亦會特異性抑制鈉依賴型磷酸鹽攝取。含實驗來源
證據與來源

Soluble frizzled-related proteins (sFRPS) function as modulators of Wnt signaling through direct interaction with Wnts. They have a role in regulating cell growth and differentiation in specific cell types (By similarity). SFRP4 plays a role in bone morphogenesis. May also act as a regulator of adult uterine morphology and function. May also increase apoptosis during ovulation possibly through modulation of FZ1/FZ4/WNT4 signaling (By similarity). Has phosphaturic effects by specifically inhibiting sodium-dependent phosphate uptake

PMID 12952927 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SFRP4 被註記為分泌蛋白;在卵巢腫瘤細胞中另有細胞質定位的紀錄。含實驗來源
證據與來源

Secreted; Cytoplasmic in ovarian tumor cells

PMID 19480240 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控SFRP4 水準在衰竭心肌中升高,並在多種腫瘤類型中上調;列出的腫瘤包括與 osteomalacia 相關的腫瘤、子宮內膜癌及乳癌。資料庫紀錄
證據與來源

Increased levels in failing myocardium. Up-regulated in several tumor types including ostomalacia-associated tumors and endometrial and breast carcinomas

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯影響 SFRP4 的變異可導致 Pyle disease。此病的臨床特徵包括皮質骨變薄、肢體變形、骨脆弱及骨折;來源未進一步描述相關變異或致病機制。含實驗來源
證據與來源

Pyle disease PYL A disorder characterized by cortical-bone thinning, limb deformity, bone fragility and fractures. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 265900

PMID 27355534 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000436072 · 2,868 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGCTGCGCTCCGAGCTGCGGAGTCCGGGACTGGAGCTGCC40
41CGGGCGGGTTCGCGCCCCGAAGGCTGAGAGCTGGCGCTGC80
81TCGTGCCCTGTGTGCCAGACGGCGGAGCTCCGCGGCCGGA120
121CCCCGCGGCCCCGCTTTGCTGCCGACTGGAGTTTGGGGGA160
161AGAAACTCTCCTGCGCCCCAGAGGATTTCTTCCTCGGCGA200
201AGGGACAGCGAAAGATGAGGGTGGCAGGAAGAGAAGGGCG240
241CTTTCTGTCTGCCGGGGTCGCAGCGCGAGAGGGCAGTGCC280
281ATGTTCCTCTCCATCCTAGTGGCGCTGTGCCTGTGGCTGC320
321ACCTGGCGCTGGGCGTGCGCGGCGCGCCCTGCGAGGCGGT360
361GCGCATCCCTATGTGCCGGCACATGCCCTGGAACATCACG400
401CGGATGCCCAACCACCTGCACCACAGCACGCAGGAGAACG440
441CCATCCTGGCCATCGAGCAGTACGAGGAGCTGGTGGACGT480
481GAACTGCAGCGCCGTGCTGCGCTTCTTCCTCTGTGCCATG520
521TACGCGCCCATTTGCACCCTGGAGTTCCTGCACGACCCTA560
561TCAAGCCGTGCAAGTCGGTGTGCCAACGCGCGCGCGACGA600
601CTGCGAGCCCCTCATGAAGATGTACAACCACAGCTGGCCC640
641GAAAGCCTGGCCTGCGACGAGCTGCCTGTCTATGACCGTG680
681GCGTGTGCATCTCGCCTGAAGCCATCGTCACGGACCTCCC720
721GGAGGATGTTAAGTGGATAGACATCACACCAGACATGATG760
761GTACAGGAAAGGCCTCTTGATGTTGACTGTAAACGCCTAA800
801GCCCCGATCGGTGCAAGTGTAAAAAGGTGAAGCCAACTTT840
841GGCAACGTATCTCAGCAAAAACTACAGCTATGTTATTCAT880
881GCCAAAATAAAAGCTGTGCAGAGGAGTGGCTGCAATGAGG920
921TCACAACGGTGGTGGATGTAAAAGAGATCTTCAAGTCCTC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。