演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SFRP2SARP1

secreted frizzled related protein 2

SFRP2 編碼 secreted frizzled related protein 2,屬於分泌型 frizzled-related protein 家族,可調節 Wnt 訊號。

Homo sapiens4q31.3UniProt Q96HF1
OFFICIAL SYMBOL
SFRP2
CHROMOSOME
4
UNIPROT
Q96HF1
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SFRP2 是蛋白質編碼基因,其產物 secreted frizzled related protein 2 屬於 secreted frizzled-related protein(sFRP)家族。這類蛋白質為可溶性分子,具有調節 Wnt 訊號的角色;SFRP2 的資料亦指出,它可能與眼部視網膜發育及肌生成有關。其蛋白質包含 FZ 與 NTR 兩個結構域,並具有 N 端訊號序列。

Official symbol
SFRP2
Gene name
secreted frizzled related protein 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10777
UniProt
Q96HF1
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SARP1SDF-5FRP-2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 44q31.3
chr4 · 190,214,555 bp · GRCh38chr4p16.3 · 1–4500000 · gnegchr4p16.2 · 4500001–6000000 · gpos25chr4p16.1 · 6000001–11300000 · gnegchr4p15.33 · 11300001–15000000 · gpos50chr4p15.32 · 15000001–17700000 · gnegchr4p15.31 · 17700001–21300000 · gpos75chr4p15.2 · 21300001–27700000 · gnegchr4p15.1 · 27700001–35800000 · gpos100chr4p14 · 35800001–41200000 · gnegchr4p13 · 41200001–44600000 · gpos50chr4p12 · 44600001–48200000 · gnegchr4p11 · 48200001–50000000 · acenchr4q11 · 50000001–51800000 · acenchr4q12 · 51800001–58500000 · gnegchr4q13.1 · 58500001–65500000 · gpos100chr4q13.2 · 65500001–69400000 · gnegchr4q13.3 · 69400001–75300000 · gpos75chr4q21.1 · 75300001–78000000 · gnegchr4q21.21 · 78000001–81500000 · gpos50chr4q21.22 · 81500001–83200000 · gnegchr4q21.23 · 83200001–86000000 · gpos25chr4q21.3 · 86000001–87100000 · gnegchr4q22.1 · 87100001–92800000 · gpos75chr4q22.2 · 92800001–94200000 · gnegchr4q22.3 · 94200001–97900000 · gpos75chr4q23 · 97900001–100100000 · gnegchr4q24 · 100100001–106700000 · gpos50chr4q25 · 106700001–113200000 · gnegchr4q26 · 113200001–119900000 · gpos75chr4q27 · 119900001–122800000 · gnegchr4q28.1 · 122800001–127900000 · gpos50chr4q28.2 · 127900001–130100000 · gnegchr4q28.3 · 130100001–138500000 · gpos100chr4q31.1 · 138500001–140600000 · gnegchr4q31.21 · 140600001–145900000 · gpos25chr4q31.22 · 145900001–147500000 · gnegchr4q31.23 · 147500001–150200000 · gpos25chr4q31.3 · 150200001–154600000 · gnegchr4q32.1 · 154600001–160800000 · gpos100chr4q32.2 · 160800001–163600000 · gnegchr4q32.3 · 163600001–169200000 · gpos100chr4q33 · 169200001–171000000 · gnegchr4q34.1 · 171000001–175400000 · gpos75chr4q34.2 · 175400001–176600000 · gnegchr4q34.3 · 176600001–182300000 · gpos100chr4q35.1 · 182300001–186200000 · gnegchr4q35.2 · 186200001–190214555 · gpos25SFRP2pq1 bp190,214,555 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr4:153,780,544–153,791,620
Gene span
11,077 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000274063 ★153,780,591–153,789,0833
ENST00001141411153,780,544–153,791,6203
ENST00000918154153,781,178–153,791,6203

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SFRP2 所屬的可溶性 frizzled-related proteins(sFRPs)可調節 Wnt 訊號。來源指出,這種調節涉及 sFRPs 與 Wnt 的直接交互作用;但未進一步說明交互作用如何改變訊號,也未限定其方向或具體分子步驟,因此不宜將其描述為促進或抑制 Wnt 訊號。

sFRPs 也參與特定細胞類型的細胞生長與分化調控。這項功能是以家族層級描述,來源沒有指出哪些細胞類型受到影響,也未提供細胞生長或分化如何受調節的細節。

對 SFRP2 而言,來源提出它可能對眼部視網膜發育及肌生成具有重要性。此處使用「可能」表達推測,資料未進一步交代相關發育或肌生成過程中的作用方式,因此只能將這兩者視為 SFRP2 可能涉及的生物學過程。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 153789083 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SFRP2 ENST00000274063 GRCh38 chr4:153788983-153790083 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AGGACTCCTTCCTCTACCTCGCTCCCTCCCAGCCTGCCCATCTTTTGTGCCCGTCTTTTGTGCCGGCCAC
CAGTCTTTACAAACAGTGCCCTGGGGGCCCATACTCCAGCTTTCCAGAGCGCACAGCTGCAAGGGCGGCT
GTGTGTTAGAGCCCGTGATGCCTTCGAGTATTGAGTCATGCCATTCATTTAAGAAGGAAAAATCTCTCCA
AAACGGGGAAATGGTGGGCAGTCCTGTGTGACTGGTGAGACTCTTGTAGGGGCGTTTCTACAACGACGAA
ACCCTTCCTAGGCACTCACTCCAACAGAATAACAAGCCCATTTTATTAGTATTTCGTTTTCCATGTAAAG
TTCTGCTCATACGAATATATTTATAATTCTGATTTTTTTACGGCATTGGGGAGCACACCGACAGGCTGCT
GAACGGTGGCTGGAGATTCGAGGGAAAACGAAGTTCGCCGAGGCGGCCTCGGGCGGGCAGGTCCCGGGCT
CCATCACAGGGCACACGCGGCTACCAGGGACGCAGCCCCCCAACACACACACACACACACACACACACAC
ACACACACACACACACACCCTCTCCCACTCATGCCTGGCAACCCAGCAGAAACTTCGGACTGGGGCAAAA
CAAGCCCGGGCCCCGGCGGCACGCGGGGCTAGGCGCGTTCCCGCCAGTACCTGGTCGCGAGGCCGCTCGC
GGGGTGCCCTGCGTGCCCCCCACTCCCGCAGCCCGCGCCCTGCTCGCTCACTGTGGGGGCGCAGCGGCCA
GGCTTCTCTGTTTGTTGTTTAAAGAAATCCTAGGGCGGGCGAGCGGCGGCATCTAGGGGAGGGGGCGCAG
CCAGAATTCCCTTCCAGCAAGCGCGTGAGGGGCATTCTCAACGCAAAACCAGACCCAGAAAGTAGTGACC
AGCCCTCCTCGGATTACCCTTCATTGGCTCCTCCCTTGCTCCCCCCACCCTCCAGATTTGCATAAAAAAG
GCCAAGAAAACTCTGGCTGTGCCCCAGCAACGGCTCATTCTGCTCCCCCGGGTCGGAGCCCCCCGGAGCT
GCGCGCGGGCTTGCAGCGCCTCGCCCGCGCTGTCCTCCCGGTGTCCCGCTT
SFRP2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SFRP2_1 ↗4:153,789,083負股153,789,073–153,789,132

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR4_B35J36 · enhancer · 153785875–153786679 · regulatory

ENSR4_53C6MC7 · CTCF_binding_site · 153785986–153786007 · regulatory

ENSR4_53C6MFZ · CTCF_binding_site · 153786583–153786604 · regulatory

ENSR4_86J47C · enhancer · 153787354–153787531 · regulatory

ENSR4_949358 · promoter · 153789073–153789573 · regulatory

ENSR4_CK92Z · enhancer · 153790574–153792418 · regulatory

ENSR4_53C6N79 · CTCF_binding_site · 153790973–153790994 · regulatory

ENSR4_53C6N84 · CTCF_binding_site · 153791147–153791168 · regulatory

ENSR4_53C6NGH · CTCF_binding_site · 153792526–153792547 · regulatory

ENSR4_B35J45 · enhancer · 153792617–153793199 · regulatory

ENSR4_53C6NJQ · CTCF_binding_site · 153793021–153793042 · regulatory

· motif · 153785988–153786004 · motif

· motif · 153786585–153786601 · motif

· motif · 153790245–153790255 · motif

· motif · 153790246–153790256 · motif

· motif · 153790247–153790257 · motif

· motif · 153790975–153790991 · motif

· motif · 153791075–153791086 · motif

· motif · 153791075–153791086 · motif

· motif · 153791077–153791086 · motif

· motif · 153791149–153791165 · motif

· motif · 153792453–153792466 · motif

· motif · 153792453–153792466 · motif

· motif · 153792528–153792544 · motif

· motif · 153792649–153792662 · motif

· motif · 153792649–153792662 · motif

· motif · 153793023–153793039 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:295 aa

1 aa295 aa結構域訊號胜肽
依 Q96HF1 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

secreted frizzled related protein 2 長 295 個胺基酸,屬於 secreted frizzled-related protein(sFRP)家族。蛋白質 N 端第 1–24 位為訊號序列;第 35–155 位為 FZ 結構域,第 172–295 位為 NTR 結構域。

訊號胜肽1–24 aa
結構域FZ35–155 aa
結構域NTR172–295 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q96HF1…

AlphaFold · Q96HF1

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

SFRP2 的定位註記為分泌型,表示其被描述為分泌蛋白。 來源未提供定位改變的條件、異構型差異或細胞內動態資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SARP1SFRP2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能可溶性 frizzled-related proteins(sFRPs)會透過與 Wnt 直接交互作用來調節 Wnt 訊號,並參與特定細胞類型的細胞生長與分化調控。SFRP2 可能對眼部視網膜發育及肌生成具有重要性;來源未進一步說明其作用方式。資料庫紀錄
證據與來源

Soluble frizzled-related proteins (sFRPS) function as modulators of Wnt signaling through direct interaction with Wnts. They have a role in regulating cell growth and differentiation in specific cell types. SFRP2 may be important for eye retinal development and for myogenesis

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted推論支持
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000274063 · 1,996 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GCCCCAGCAACGGCTCATTCTGCTCCCCCGGGTCGGAGCC40
41CCCCGGAGCTGCGCGCGGGCTTGCAGCGCCTCGCCCGCGC80
81TGTCCTCCCGGTGTCCCGCTTCTCCGCGCCCCAGCCGCCG120
121GCTGCCAGCTTTTCGGGGCCCCGAGTCGCACCCAGCGAAG160
161AGAGCGGGCCCGGGACAAGCTCGAACTCCGGCCGCCTCGC200
201CCTTCCCCGGCTCCGCTCCCTCTGCCCCCTCGGGGTCGCG240
241CGCCCACGATGCTGCAGGGCCCTGGCTCGCTGCTGCTGCT280
281CTTCCTCGCCTCGCACTGCTGCCTGGGCTCGGCGCGCGGG320
321CTCTTCCTCTTTGGCCAGCCCGACTTCTCCTACAAGCGCA360
361GCAATTGCAAGCCCATCCCTGCCAACCTGCAGCTGTGCCA400
401CGGCATCGAATACCAGAACATGCGGCTGCCCAACCTGCTG440
441GGCCACGAGACCATGAAGGAGGTGCTGGAGCAGGCCGGCG480
481CTTGGATCCCGCTGGTCATGAAGCAGTGCCACCCGGACAC520
521CAAGAAGTTCCTGTGCTCGCTCTTCGCCCCCGTCTGCCTC560
561GATGACCTAGACGAGACCATCCAGCCATGCCACTCGCTCT600
601GCGTGCAGGTGAAGGACCGCTGCGCCCCGGTCATGTCCGC640
641CTTCGGCTTCCCCTGGCCCGACATGCTTGAGTGCGACCGT680
681TTCCCCCAGGACAACGACCTTTGCATCCCCCTCGCTAGCA720
721GCGACCACCTCCTGCCAGCCACCGAGGAAGCTCCAAAGGT760
761ATGTGAAGCCTGCAAAAATAAAAATGATGATGACAACGAC800
801ATAATGGAAACGCTTTGTAAAAATGATTTTGCACTGAAAA840
841TAAAAGTGAAGGAGATAACCTACATCAACCGAGATACCAA880
881AATCATCCTGGAGACCAAGAGCAAGACCATTTACAAGCTG920
921AACGGTGTGTCCGAAAGGGACCTGAAGAAATCGGTGCTGT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。