基因總覽
SFRP1 是蛋白質編碼基因，其產物 secreted frizzled related protein 1 屬於 secreted frizzled-related protein（sFRP）家族。此類蛋白質為可溶性 frizzled-related proteins，與 Wnt 訊號調節有關。來源指出，SFRP1 參與特定細胞類型的生長與分化調控；其具體作用與相關生物學過程如下方功能說明所述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000220772 ★ | 41,261,962–41,309,473 | 3 |
| ENST00000379845 | 41,261,956–41,306,990 | 3 |
| ENST00000923189 | 41,261,956–41,309,511 | 2 |
| ENST00001133619 | 41,261,956–41,309,511 | 3 |
| ENST00001112360 | 41,299,842–41,309,511 | 3 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SFRP1 是 Wnt 訊號的調節因子。可溶性 frizzled-related proteins（sFRPs）會直接與 Wnts 作用；來源亦指出，SFRP1 會抑制 WNT1 或 WNT4 所介導、依賴 TCF 的轉錄。這些作用支持其參與特定細胞類型的生長與分化調控，但來源未進一步界定不同細胞類型中的作用差異。
在細胞內訊號方面，SFRP1 會降低細胞內 beta-catenin 的含量，此項敘述標示為依相似性推定。該結果與其調節 Wnt 訊號的角色相符，但來源沒有提供更多機制細節，因此不宜據此延伸為其他未載明的分子作用。
在血管細胞中，SFRP1 於體外與體內均具有抑制細胞增殖的作用；另一方面，體內研究也顯示它可誘發血管新生反應。來源並指出，在血管細胞週期中，SFRP1 會延緩 G1 期及進入 S 期的時間，這項週期影響標示為依相似性推定。上述觀察分別涉及細胞增殖、細胞週期與血管新生，來源未說明它們之間的因果關係。
在腎臟發育方面，SFRP1 被描述為可抑制後腎中的腎小管形成與芽生長；此項功能同樣標示為依相似性推定。這些結果顯示 SFRP1 涉及多種發育及細胞調控過程，但各項作用的證據條件與推論性質應依來源分別理解。
Promoter 與基因調控
>SFRP1 ENST00000220772 GRCh38 chr8:41309373-41310473 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTTGAGTAGGGTTTTTCTATTTAAATATATATTATATATTTAAAAAAGTGTCCTCCCAGAGCTAATACCG TTGCTAGCAGCTCTTCCTGCCGCCACACCGGGCAAAGTCCACCCACTGCCCCAGTGTTGAGGGCCACCAT GGGCGGCCCCACCTGGAGAGGTGCTGCTCACAGCAAACAGCTCCAACTGCGCCTTCGCCTCGCCTTCCAG GGAGCCCAGCCAGGCCCACTGGGTATTTACAAGCAGACCTCCCTCGCTTCAGCCTTCCTGAACCCCTGTT AGTTGGGAAACCACCTGTCTGCACCGCAGCTAGAGAACCGAGGAGAGGAGCCGCTAGTCTAAAGGGCTGT TGGTTGAAATTAGGAAGCAGTGTAAAGAAAAAGAAAAAAAAAGTTTGGGAGGCCAAGGCAGGAGCATCAC CTGAGGTCAGGAGTTCGAGACCAGCCTGGCTAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA TTAGCGGGGGCATGGTGGCACGCGGCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTG AACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTCAGCGGAGATAGCGCCATTGCACTCCAGCTTAGGCAACAAGAGCGA AACTGTCTCAAAAAAAAAAAGTCTTCATAATTTCATGGGTTTGCAAGTATGATCCAGGCTCCCCGCTTCT CTGCAAGCCAATGCGAGTTAATTACAGCGTCCGCCCTGGTCTCTCTCCACCCCACGCCGTGATCCATTCC CCTTCTTTTTCTCCCCTTGTCTCTTTCCTCCTCCCCCTTTTATTTATGTATTTTTGGTTTTGTTTTTTAA GGGGTGTTGAGCCGCGTCTGGTTCTAGTAAACCGAACCCGCTCGCGAGGGAGGCGATTGGCTCCCGCGCC GGTGACGGACGTGGTAACGAGTGCGGCTCGCCCCGCCGGGAGCTGATTGGCTGCGCGGGGCGGCTCCGAG GGCTCGGCCGTAGGAGCCCCGCGCACTCCAGCCCTGCAGCCTCCGGAGTCAGTGCCGCGCGCCCGCCGCC CCGCGCCTTCCTGCTCGCCGCACCTCCGGGAGCCGGGGCGCACCCAGCCCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SFRP1_1 ↗ | 8:41,309,471 | 負股 | 41,309,461–41,309,520 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR8_5CPBR5 · CTCF_binding_site · 41306779–41306800 · regulatory
ENSR8_9LDN9 · promoter · 41306980–41307256 · regulatory
ENSR8_5CPBZF · CTCF_binding_site · 41307923–41307944 · regulatory
ENSR8_9LDP2 · promoter · 41309463–41309856 · regulatory
ENSR8_C64NC · enhancer · 41310108–41311810 · regulatory
ENSR8_5CPCM8 · CTCF_binding_site · 41311773–41311794 · regulatory
· motif · 41306542–41306551 · motif
· motif · 41306542–41306551 · motif
· motif · 41306781–41306797 · motif
· motif · 41307925–41307941 · motif
· motif · 41308465–41308474 · motif
· motif · 41308465–41308474 · motif
· motif · 41308467–41308483 · motif
· motif · 41308467–41308483 · motif
· motif · 41311775–41311791 · motif
SFRP1 表現量在大腸直腸癌與乳癌中降低；在高雌激素條件下，子宮肌瘤中的表現量升高。子宮肌瘤細胞在缺氧或血清剝奪條件下，SFRP1 表現量也會增加。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：314 aa
secreted frizzled related protein 1 長 314 個胺基酸，N 端第 1–31 位為訊號胜肽。蛋白質含有 FZ domain（第 53–169 位）與 NTR domain（第 186–306 位），並屬於 secreted frizzled-related protein（sFRP）家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SFRP1 可被分泌，並可與細胞膜或細胞外基質相關聯；其釋放與 heparin 結合有關。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- FZD6O60353 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TMEM86BQ8N661 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SFRP1 與 WNT1、WNT2 及 FRZD6 有交互作用；來源另列出與 WNT4、WNT8 及 MYOC 的交互作用，並將後一組關係標示為依相似性推定。來源未指出這些分子共同形成複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | sFRPs 透過直接與 Wnts 作用調節 Wnt 訊號，並參與特定細胞類型的生長與分化調控。SFRP1 可降低細胞內 beta-catenin；此項及其延緩血管細胞 G1 期、進入 S 期，以及抑制後腎腎小管形成與芽生長的敘述，均標示為依相似性推定。SFRP1 在體外與體內抑制血管細胞增殖，也可在體內誘發血管新生，並抑制 WNT1/WNT4 介導的 TCF 依賴性轉錄。 | 推論支持 | 證據與來源Soluble frizzled-related proteins (sFRPS) function as modulators of Wnt signaling through direct interaction with Wnts. They have a role in regulating cell growth and differentiation in specific cell types. SFRP1 decreases intracellular beta-catenin levels (By similarity). Has antiproliferative effects on vascular cells, in vitro and in vivo, and can induce, in vivo, an angiogenic response. In vascular cell cycle, delays the G1 phase and entry into the S phase (By similarity). In kidney development, inhibits tubule formation and bud growth in metanephroi (By similarity). Inhibits WNT1/WNT4-mediated TCF-dependent transcription |
| 交互作用 | SFRP1 與 WNT1、WNT2 及 FRZD6 有交互作用；來源另指出它與 WNT4、WNT8 及 MYOC 交互作用，並將後一組交互作用標示為依相似性推定。 | 推論支持 | 證據與來源Interacts with WNT1, WNT2 and FRZD6. Interacts with WNT4, WNT8 and MYOC (By similarity) |
| 細胞定位 | SFRP1 可被分泌，並與細胞膜或細胞外基質相關；來源指出其釋放與 heparin 結合有關。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Secreted; Cell membrane or extracellular matrix-associated. Released by heparin-binding |
| 調控 | SFRP1 在大腸直腸癌與乳癌中表現下調；在高雌激素條件下，子宮肌瘤中的表現上調。子宮肌瘤細胞的 SFRP1 表現也會在缺氧及血清剝奪條件下增加。 | 含實驗來源 | 證據與來源Down-regulated in colorectal and breast tumors. Up-regulated in uterine leiomyomas under high estrogenic conditions. Expression, in leiomyomal cells, also increased both under hypoxic and serum deprivation conditions PMID 11932307 ↗ · PMID 9724099 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCGCACTCCAGCCCTGCAGCCTCCGGAGTCAGTGCCGCGC40GCCCGCCGCCCCGCGCCTTCCTGCTCGCCGCACCTCCGGG80AGCCGGGGCGCACCCAGCCCGCAGCGCCGCCTCCCCGCCC120GCGCCGCCTCCGACCGCAGGCCGAGGGCCGCCACTGGCCG160GGGGGACCGGGCAGCAGCTTGCGGCCGCGGAGCCGGGCAA200CGCTGGGGACTGCGCCTTTTGTCCCCGGAGGTCCCTGGAA240GTTTGCGGCAGGACGCGCGCGGGGAGGCGGCGGAGGCAGC280CCCGACGTCGCGGAGAACAGGGCGCAGAGCCGGCATGGGC320ATCGGGCGCAGCGAGGGGGGCCGCCGCGGGGCAGCCCTGG360GCGTGCTGCTGGCGCTGGGCGCGGCGCTTCTGGCCGTGGG400CTCGGCCAGCGAGTACGACTACGTGAGCTTCCAGTCGGAC440ATCGGCCCGTACCAGAGCGGGCGCTTCTACACCAAGCCAC480CTCAGTGCGTGGACATCCCCGCGGACCTGCGGCTGTGCCA520CAACGTGGGCTACAAGAAGATGGTGCTGCCCAACCTGCTG560GAGCACGAGACCATGGCGGAGGTGAAGCAGCAGGCCAGCA600GCTGGGTGCCCCTGCTCAACAAGAACTGCCACGCCGGCAC640CCAGGTCTTCCTCTGCTCGCTCTTCGCGCCCGTCTGCCTG680GACCGGCCCATCTACCCGTGTCGCTGGCTCTGCGAGGCCG720TGCGCGACTCGTGCGAGCCGGTCATGCAGTTCTTCGGCTT760CTACTGGCCCGAGATGCTTAAGTGTGACAAGTTCCCCGAG800GGGGACGTCTGCATCGCCATGACGCCGCCCAATGCCACCG840AAGCCTCCAAGCCCCAAGGCACAACGGTGTGTCCTCCCTG880TGACAACGAGTTGAAATCTGAGGCCATCATTGAACATCTC920TGTGCCAGCGAGTTTGCACTGAGGATGAAAATAAAAGAAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。