基因總覽
SFN（stratifin）是人類的蛋白質編碼基因，產物 stratifin 屬於 14-3-3 family。這類蛋白可作為適配蛋白，與多種夥伴作用，參與一般及專一性訊號路徑的調節。來源指出，stratifin 通常辨識夥伴上的磷酸絲胺酸或磷酸蘇胺酸基序；結合後常會調節該夥伴的活性。這些特性使 stratifin 能連結不同訊號調控過程，但其具體作用取決於互作對象與生物學情境。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000339276 ★ | 26,863,149–26,864,456 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
stratifin 是訊號適配蛋白，參與多種一般性與專一性訊號路徑的調節。它可與許多夥伴結合，通常藉由辨識對方的磷酸絲胺酸或磷酸蘇胺酸基序；結合後通常會調節夥伴蛋白的活性。因此，stratifin 的作用方向與結果會隨互作對象而異。
在先天免疫調控方面，stratifin 可結合已磷酸化的 GBP1 GTPase，促使 GBP1 留在細胞質，進而抑制先天免疫反應。細胞週期方面，stratifin 也被描述為受 TP53/p53 調控、可抑制 G2/M 進程的因子。
在上皮細胞中，stratifin 與 KRT17 結合時，依相似性資料所述，可藉由刺激 Akt/mTOR pathway 調節蛋白質合成與上皮細胞生長。它也與 PKP3 互作並將 PKP3 留在細胞質，限制 PKP3 移至既有橋粒結構，有助於維持橋粒蛋白質穩態；此外，stratifin 可促進 PKP3 在橋粒斑上的交換，支持角質形成細胞之間的黏附。
其他調控作用包括可能調節 MDM2 的自體泛素化與降解，從而活化 p53/TP53；這項作用以可能性表述。依相似性資料，stratifin 在角質形成細胞中亦可結合並滯留 YAP1 於細胞質，限制 YAP1 依賴的轉錄，並推動 Hippo signaling 與細胞分化。
Promoter 與基因調控
>SFN ENST00000339276 GRCh38 chr1:26862149-26863249 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCTTGGAGAGGGCAGGTGACCTGGCGTGGAGGGCCAGAGGGTAAATCCTCAAACAAGTGGCAACAGGCCA CCAACTTGAAAGGGAAAATTGTGTAGTGATGGGAAATGTGTCCAACAAACCTACTGGGTGACTAATTACA AAGGCTGGGCTGGAGCTTCAGAGGCTGCTTGTTAAACACTTCATTAAGCGGCACTCTGAAAGCTGCCACC TGCGCATTCTGGGAGCTCAGAGGGGACCCTGAGGGGGAATGAGGCCTGGAGGATGGAACCATCTTCAGGT AGACTGAGAAGGAGCCTGGATCTCACTTCCAAACACAGTCTGGAGCTCATAGGTCAGAGGCCTCAATGGG AGAAAAGCTAAAGGAAGAGGGTGCAGAAAGGAGTTTCAGGGAATTGGTGGCTATGTGACTTTGAGCAAAT CTCACCCCTCTCTGAGACTTAGTGTTCCCATCTCTATGGTCCTGTGTGTGTCACAGAGACATGGTGGGGA TTAAATTCGATCGTGAATATGAAAGTGCTTGGGAAACTCCATGGCCCTACCTAAACATGAGTTATCCTCA CCTGAACCAAGGGGGGAAGTTACCTGGCAGGATTAGGAACCCCATCCTCCTGAACCTTTATGGGCTCTGT CGAGGCTGAAGCAGCCAGGGGCTAAAGCCGTCCTTAGCCCCTGGAAGGGCACTGTGAAAGTGGATCTGAT TTGAGAAGCCGTTTCCTGATGTGGGCAGCCATGTGATGCCAGCCCCGAACAAGAGGGGGCAGCCTGGAGC CTGGAAAGGTGCCAGTGCAGGTGGGGCCCACGCCCAGATTTCTCCTGCTGACTGTTCTGATGATTCACCC CCACATCCCAGCCTTTTTACCTTTACTGCAGAGCCGGAAAGGGTGTGGGGAAGAGAGGAGAGGGAGGCAG GTCTTGGGCCCTGGTCCCGCCCCCTGCTCCTCCCCACCCTTCTCTGGGCCTGGCCACCCAGCCAAAAGGC AGGCCAAGAGCAGGAGAGACACAGAGTCCGGCATTGGTCCCAGGCAGCAGTTAGCCCGCCGCCCGCCTGT GTGTCCCCAGAGCCATGGAGAGAGCCAGTCTGATCCAGAAGGCCAAGCTGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SFN_1 ↗ | 1:26,863,161 | 正股 | 26,863,112–26,863,171 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_9DMSJ · enhancer · 26858215–26858535 · regulatory
ENSR1_58BKDD · CTCF_binding_site · 26858597–26858618 · regulatory
ENSR1_9DMTF · enhancer · 26861247–26861658 · regulatory
ENSR1_58BKT5 · CTCF_binding_site · 26861349–26861370 · regulatory
ENSR1_58BL3H · CTCF_binding_site · 26862505–26862526 · regulatory
ENSR1_9DMTS · promoter · 26862659–26863159 · regulatory
ENSR1_58BL59 · CTCF_binding_site · 26862893–26862914 · regulatory
ENSR1_9DMWH · promoter · 26865108–26865388 · regulatory
ENSR1_B7BXS · enhancer · 26865389–26866286 · regulatory
ENSR1_9DMXB · enhancer · 26867783–26868182 · regulatory
· motif · 26858599–26858615 · motif
· motif · 26861351–26861367 · motif
· motif · 26862276–26862284 · motif
· motif · 26862507–26862523 · motif
· motif · 26862895–26862911 · motif
· motif · 26865130–26865140 · motif
· motif · 26865299–26865312 · motif
· motif · 26865326–26865336 · motif
· motif · 26865490–26865501 · motif
· motif · 26865683–26865693 · motif
· motif · 26865686–26865694 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：248 aa
stratifin 屬於 14-3-3 family。來源未提供其胺基酸長度、結構域組成或其他序列特徵，因此不進一步描述蛋白質結構。
蛋白質三維結構
細胞內定位
stratifin 記錄於細胞質與細胞核，也有分泌的定位註記；來源並指出它可能經由非典型分泌途徑分泌，這項路徑描述保留其不確定性。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 110 個夥伴
- ABL1P00519 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- ABLIM1O14639 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- AJUBAQ96IF1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ANKS1AQ92625 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ARAFP10398 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ARHGAP21Q5T5U3 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ARHGAP32A7KAX9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARHGEF16Q5VV41 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- ARHGEF2Q92974 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- ARHGEF5Q12774 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- BADQ92934 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- BAIAP2Q9UQB8 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- BRAFP15056 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- CBLP22681 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CCDC102BQ68D86 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC125Q86Z20 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCNHP51946 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CDC25BP30305 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- CGNQ9P2M7 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CLASP1Q7Z460 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CLASP2O75122 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- COP1Q8NHY2 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- COPS6Q7L5N1 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- DNAJB1P25685 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- EDC3Q96F86 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
stratifin 可形成同源二聚體，也與 YWHAG、YWHAB 或 YWHAQ 形成異源二聚體；來源另記載其與 XPO7、EIF4A1、ARHGAP1、VPS26A、VPS29 及 VPS35 同處一複合體。其他互作對象包括 KRT17、SAMSN1、GAB2、SRPK2、COPS6、COP1、DAPK2、PI4KB、SLITRK1、LRRK2、PKP3、LCP2、KRT14、KRT15 與 YAP1。部分互作具條件：DAPK2 為 Thr-369 磷酸化形式，LRRK2 互作依賴其磷酸化；與 COP1 的互作會導致蛋白酶體降解。與 PKP3、KRT14 及 YAP1 的互作另涉及其細胞內分布調節。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | stratifin 是參與多種一般與專一性訊號路徑調節的適配蛋白，通常辨識夥伴上的磷酸絲胺酸或磷酸蘇胺酸基序，並調節夥伴活性。它可使磷酸化 GBP1 留在細胞質以抑制先天免疫反應，也與 G2/M 進程、KRT17 相關的蛋白質合成及上皮細胞生長有關；其作用還涵蓋 PKP3、MDM2、p53/TP53 與 YAP1 調控，部分機制標示為依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Adapter protein implicated in the regulation of a large spectrum of both general and specialized signaling pathways. Binds to a large number of partners, usually by recognition of a phosphoserine or phosphothreonine motif. Binding generally results in the modulation of the activity of the binding partner. Promotes cytosolic retention of GBP1 GTPase by binding to phosphorylated GBP1, thereby inhibiting the innate immune response. Also acts as a TP53/p53-regulated inhibitor of G2/M progression. When bound to KRT17, regulates protein synthesis and epithelial cell growth by stimulating Akt/mTOR pathway (By similarity). Acts to maintain desmosome cell junction adhesion in epithelial cells via interacting with and sequestering PKP3 to the cytoplasm, thereby restricting its translocation to existing desmosome structures and therefore maintaining desmosome protein homeostasis. Also acts to facilitate PKP3 exchange at desmosome plaques, thereby maintaining keratinocyte intercellular adhesion. May also regulate MDM2 autoubiquitination and degradation and thereby activate p53/TP53. Upstream regulator of YAP1 localization in keratinocytes: binds and sequester YAP1 in the cytoplasm, limiting YAP1-dependent transcription and driving Hippo signaling and cell differentiation (By similarity) PMID 15731107 ↗ · PMID 18382127 ↗ · PMID 22634725 ↗ · PMID 24124604 ↗ · PMID 28202711 ↗ · PMID 29678907 ↗ · PMID 37797010 ↗ · PMID 9659898 ↗ |
| 交互作用 | stratifin 可形成同源二聚體，並與 YWHAG、YWHAB 或 YWHAQ 形成異源二聚體；另有與多種蛋白同處複合體或互作的紀錄。LRRK2 的互作依賴其磷酸化，DAPK2 則以 Thr-369 磷酸化形式互作；COP1 互作會導致蛋白酶體降解。與 PKP3 的互作涉及其在細胞質及橋粒間的分布，與 KRT14 互作可穩定細胞質中的 stratifin，與 YAP1 互作則促進 YAP1 留在細胞質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Interacts with KRT17 and SAMSN1 (By similarity). Forms heterodimers with YWHAG, YWHAB or YWHAQ (By similarity). Found in a complex with XPO7, EIF4A1, ARHGAP1, VPS26A, VPS29 and VPS35. Interacts with GAB2. Interacts with SRPK2. Interacts with COPS6. Interacts with COP1; this interaction leads to proteasomal degradation. Interacts with the 'Thr-369' phosphorylated form of DAPK2. Interacts with PI4KB. Interacts with SLITRK1. Interacts with LRRK2; this interaction is dependent on LRRK2 phosphorylation. Interacts with PKP3 (via N-terminus); the interaction maintains the cytoplasmic pool of PKP3, facilitates PKP3 exchange at desmosomes and restricts PKP3 localization to existing desmosome cell junctions. Interacts with LCP2. Interacts with KRT14; the interaction stabilizes SFN in the cytoplasm. Interacts with KRT15. Interacts with YAP1; the interaction promotes sequestration of YAP1 to the cytoplasm (By similarity) PMID 15282546 ↗ · PMID 15731107 ↗ · PMID 19172738 ↗ · PMID 19592491 ↗ · PMID 19640509 ↗ · PMID 21625211 ↗ · PMID 22634725 ↗ · PMID 23572552 ↗ · PMID 24124604 ↗ · PMID 26047703 ↗ · PMID 28202711 ↗ · PMID 29678907 ↗ · PMID 33159816 ↗ · PMID 36512409 ↗ · PMID 41511042 ↗ |
| 細胞定位 | stratifin 記錄於細胞質與細胞核，也有分泌的定位註記；來源指出它可能經由非典型分泌途徑分泌，因此此分泌路徑仍屬可能性描述。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Nucleus; Secreted; May be secreted by a non-classical secretory pathway PMID 24124604 ↗ · PMID 37797010 ↗ · PMID 41511042 ↗ · PMID 8515476 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACAGAGTCCGGCATTGGTCCCAGGCAGCAGTTAGCCCGCC40GCCCGCCTGTGTGTCCCCAGAGCCATGGAGAGAGCCAGTC80TGATCCAGAAGGCCAAGCTGGCAGAGCAGGCCGAACGCTA120TGAGGACATGGCAGCCTTCATGAAAGGCGCCGTGGAGAAG160GGCGAGGAGCTCTCCTGCGAAGAGCGAAACCTGCTCTCAG200TAGCCTATAAGAACGTGGTGGGCGGCCAGAGGGCTGCCTG240GAGGGTGCTGTCCAGTATTGAGCAGAAAAGCAACGAGGAG280GGCTCGGAGGAGAAGGGGCCCGAGGTGCGTGAGTACCGGG320AGAAGGTGGAGACTGAGCTCCAGGGCGTGTGCGACACCGT360GCTGGGCCTGCTGGACAGCCACCTCATCAAGGAGGCCGGG400GACGCCGAGAGCCGGGTCTTCTACCTGAAGATGAAGGGTG440ACTACTACCGCTACCTGGCCGAGGTGGCCACCGGTGACGA480CAAGAAGCGCATCATTGACTCAGCCCGGTCAGCCTACCAG520GAGGCCATGGACATCAGCAAGAAGGAGATGCCGCCCACCA560ACCCCATCCGCCTGGGCCTGGCCCTGAACTTTTCCGTCTT600CCACTACGAGATCGCCAACAGCCCCGAGGAGGCCATCTCT640CTGGCCAAGACCACTTTCGACGAGGCCATGGCTGATCTGC680ACACCCTCAGCGAGGACTCCTACAAAGACAGCACCCTCAT720CATGCAGCTGCTGCGAGACAACCTGACACTGTGGACGGCC760GACAACGCCGGGGAAGAGGGGGGCGAGGCTCCCCAGGAGC800CCCAGAGCTGAGTGTTGCCCGCCACCGCCCCGCCCTGCCC840CCTCCAGTCCCCCACCCTGCCGAGAGGACTAGTATGGGGT880GGGAGGCCCCACCCTTCTCCCCTAGGCGCTGTTCTTGCTC920CAAAGGGCTCCGTGGAGAGGGACTGGCAGAGCTGAGGCCA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。