基因總覽
SEZ6L 的正式名稱為 seizure related 6 homolog like,屬於蛋白質編碼基因;其產物 Seizure 6-like protein 歸於 SEZ6 family。現有資料指出,這種蛋白質可能參與神經元內質網的特殊功能,但未進一步說明其具體作用方式。此處可確認的基本資訊以基因類型、家族歸屬及可能涉及的細胞功能為主。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000248933 ★ | 26,169,462–26,383,596 | 17 |
| ENST00000404234 | 26,169,120–26,383,597 | 17 |
| ENST00000529632 | 26,169,120–26,383,597 | 16 |
| ENST00000360929 | 26,169,120–26,383,597 | 15 |
| ENST00000629590 | 26,169,120–26,383,597 | 16 |
| ENST00000343706 | 26,169,120–26,383,597 | 15 |
| ENST00000867853 | 26,169,120–26,383,597 | 14 |
| ENST00000940334 | 26,169,120–26,383,597 | 16 |
| ENST00000940335 | 26,169,120–26,383,597 | 16 |
| ENST00000957709 | 26,169,120–26,383,597 | 16 |
| ENST00001131969 | 26,169,120–26,383,597 | 17 |
| ENST00000402979 | 26,292,251–26,383,597 | 16 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SEZ6L 的產物可能參與神經元內質網的特殊功能。現有註解以「可能」描述這項角色,未提供更具體的分子作用方式、相關生物學過程或功能結果,因此目前只能將其定位為一項可能的神經元內質網功能貢獻,不能據此進一步界定其作用機制。
Promoter 與基因調控
>SEZ6L ENST00000248933 GRCh38 chr22:26168462-26169562 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGGTAGGGGGAGGAGGACAGCTTCTAAATTGGGTGAGAGGCCTGTAAAGCCTGACCGGTCTGCCAAGGCT ACGCAGGGAGAGACAGTCAGTCTCCAGGACTGTGCATAAGCTTGTCCCCACCTAGCTCTCTGCCAATGTC TGTCCCCAAGTATCTGTTTATCTCCCTCATTGATTGTCCCTCACTACCTCTATTTGTGGAGAAAAGACTT TGCTTGAGAATCAGGCCTGGGCAAGAATGCTGCAGAGGTGGGCCTTGTAGTCCTGCTCAGATAGGGAAGC GGGTACAGGAAGAGGCAAGCGGCTGACCTGAGAGGAAGCCTCGCAGCGCTAGTGCCCTGCCGGCAGTGGG GTTATGGGAGACAGGGCTCAGATTAAAAAGTGGAGGTGGATCTTAATTTAGAGTTCGTGATTGGGCTTCA GAGGGGTCCAGACCCCCTCGTGTTAGATGCACGATTTTGTGGCTATGTGTAGTGTTCTAGTAGATTCACA GCTGTCACCAGATCCACAGAGTTACAGACTTTCTAGGTTATGGGGACTCACTTTGGAAGCAGTGAGGCCC TGGCGGGGAAGCAGGCTGGCTGGATCCCAGAGGGCTCTGGAAAGAACTGGAACTGGGATGTATCTGGAAG GCTGGGCAGGCAATGGAAAGCTCCGGGCTGCTCATAAGCTCGGTTTCCAGGGCTCCATCTCACCGTCTGG AAAATGGTCCGGGTGCTCTCCAGCCTGGCCTGGCCAGGCAGAGCTGCTGGGAGCGTCAGCAGGGAGAGAA AACGCTCGGCTCCCAGGACGCAAGGGGAATTGGCGTTAAACTTTGCAGGGCCGACGGGCCGGCGGCCAGA GGAGGCGGCTGGCACCCCCGGCGCCGCCGCGGCCCCTCCAGCTCACTGCCCGCTCGCCCGCCCCCTCCCT CCCTGCACTCGCTCGGCACAGACTCGGCCCCAGCCCCCTCCCTCCTCCCGCTCGCTCCACGCTCGTTCGC TCGCTCGCCGGCTCCTCCTCACTCGCCCGCCCGCGCCCGGCGCAGCTCGGCCAGAGCGACCGCGGGGCTG AGCGCGCGTCCGCCCAGGGGGCTCCGGAAGCTGCCCCGGCCCGCGGCCTCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SEZ6L_1 ↗ | 22:26,169,462 | 正股 | 26,169,413–26,169,472 |
| SEZ6L_2 ↗ | 22:26,169,602 | 正股 | 26,169,553–26,169,612 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:1024 aa
Seizure 6-like protein 長 1,024 個胺基酸,屬於 SEZ6 family。蛋白質具有 N 端訊號肽,並預測含有多個 CUB 與 Sushi 結構域;其 C 端包含跨膜螺旋,並連接短胞質區。資料另標示數段無序區,以及兩處 O-醣基化區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SEZ6L 被註記為內質網膜上的單次穿膜 I 型膜蛋白。 現有定位資料未描述定位隨條件或異構型而變化的情形。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- GPRASP2Q96D09 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN1Q9UMX0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN2Q9UHD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SEZ6L 可能參與神經元內質網的特殊功能。此註記以可能性描述其作用,沒有指出具體的分子機制、涉及的生物學過程或功能結果。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | SEZ6L 被註記為內質網膜上的單次穿膜 I 型膜蛋白;此定位描述未提供其他條件或異構型差異。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACTCGCCCGCCCGCGCCCGGCGCAGCTCGGCCAGAGCGAC40CGCGGGGCTGAGCGCGCGTCCGCCCAGGGGGCTCCGGAAG80CTGCCCCGGCCCGCGGCCTCCTCCCTCGCTCCCGCTTCCC120CTTTCTCGCTCACCGCCGCCCTCCTTCCCCAGCTCCCTCG160CCGTCCGCCCGCCCCACAGCCAGCGGCTCCGCGCCCCCTG200CAGCCACGATGCCCGCGGCCCGGCCGCCCGCCGCGGGACT240CCGCGGGATCTCGCTGTTCCTCGCTCTGCTCCTGGGGAGC280CCGGCGGCAGCGCTGGAGCGAGATGCTCTTCCCGAGGGAG320ATGCTAGCCCTTTGGGTCCTTACCTCCTGCCCTCAGGAGC360CCCGGAGAGAGGCAGTCCTGGCAAAGAGCACCCTGAAGAG400AGAGTGGTAACAGCGCCCCCCAGTTCCTCACAGTCGGCGG440AAGTGCTGGGCGAGCTGGTGCTGGATGGGACCGCACCCTC480TGCACATCACGACATCCCAGCCCTGTCACCGCTGCTTCCA520GAGGAGGCCCGCCCCAAGCACGCCTTGCCCCCCAAGAAGA560AACTGCCTTCGCTCAAGCAGGTGAACTCTGCCAGGAAGCA600GCTGAGGCCCAAGGCCACCTCCGCAGCCACTGTCCAAAGG640GCAGGGTCCCAGCCAGCGTCCCAGGGCCTAGATCTCCTCT680CCTCCTCCACGGAGAAGCCTGGCCCACCGGGGGACCCGGA720CCCCATCGTGGCCTCCGAGGAGGCATCAGAAGTGCCCCTT760TGGCTGGACCGAAAGGAGAGTGCGGTCCCTACAACACCCG800CACCCCTGCAAATCTCCCCCTTCACTTCGCAGCCCTATGT840GGCCCACACACTCCCCCAGAGGCCAGAACCCGGGGAGCCT880GGGCCTGACATGGCCCAGGAGGCCCCCCAGGAGGACACCA920GCCCCATGGCCCTGATGGACAAAGGTGAGAATGAGCTGAC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。