演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SERPING1C1IN

serpin family G member 1

SERPING1 編碼 serpin family G member 1,屬於 serpin 家族的絲胺酸蛋白酶抑制劑,參與調節 classical complement pathway,並可抑制多種蛋白酶。

Homo sapiens11q12.1UniProt P05155
OFFICIAL SYMBOL
SERPING1
CHROMOSOME
11
UNIPROT
P05155
PDB / ALPHAFOLD
7AKV
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SERPING1 是蛋白質編碼基因,其產物 serpin family G member 1 屬於 serpin 家族。這種蛋白質是絲胺酸蛋白酶抑制劑,主要角色是調節 classical complement pathway。其胺基端具有訊號序列,另有一段由七個四胺基酸單位構成的串聯重複區;部分區域被註記為無序區。這些特徵概述了蛋白質的家族歸屬與序列組成;其抑制蛋白酶的作用方式及相關生物學過程見功能說明。

Official symbol
SERPING1
Gene name
serpin family G member 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1228
UniProt
P05155
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
C1INC1-INHHAE1HAE2C1INHC1NH

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q12.1
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegSERPING1pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr11:57,597,387–57,619,246
Gene span
21,860 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000278407 ★57,597,685–57,614,8488
ENST0000040549657,597,387–57,600,3083
ENST0000040355857,597,483–57,614,8147
ENST0000067762557,597,483–57,614,8317
ENST0000067667057,597,483–57,619,1598
ENST0000087946857,597,483–57,614,8537
ENST0000087948757,597,483–57,614,8483
ENST0000087948857,597,483–57,614,8527
ENST0000061943057,597,563–57,614,8487
ENST0000034068757,597,563–57,614,8468
ENST0000037832357,597,563–57,614,7398
ENST0000087946757,597,563–57,619,2469

顯示 12/39 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SERPING1 的產物是絲胺酸蛋白酶抑制劑,可調節 classical complement pathway。其主要作用之一,是與 C1r 或 C1s 蛋白酶形成化學計量比例的複合體;形成後,這些蛋白酶處於無蛋白水解活性的狀態。此作用將 SERPING1 的抑制功能連結至補體路徑調節。

除補體調節外,來源也指出 SERPING1 可能參與血液凝固、纖維蛋白溶解及激肽生成的調節,但此處以「可能」描述,不能視為確定的調節效果。這些過程均列為其可能涉及的生理範圍,來源未進一步說明各過程中的作用步驟。

在蛋白酶抑制方面,SERPING1 是 FXIIa 的高效抑制劑,也會抑制 chymotrypsin 與 kallikrein。這些作用顯示其靶標不只限於補體相關蛋白酶;不過,現有描述未提供這些抑制作用的詳細反應機制,也未說明各靶標在不同生理情境中的相對貢獻。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 57597685 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SERPING1 ENST00000278407 GRCh38 chr11:57596685-57597785 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCTATTGTGGAGCCCTAGTCGCAAACACATACACCCCAGCTTTCAAGTTTTTAAATATTTATTTAGTTAG
TTATTTGTTTTTTGAGACAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCAATTTCAGCTCACT
GCAACCTCTGCCTCCCAGATTCAAGTGATTGTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACATGTGCGCG
CCTGCACTGCCCAGCTAATTTTTGTACTTTTAGCGGAAACGGGGTTTCCCCATATTGGCCAGAGTGGTCT
CAAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAC
CGTGCCCGGCTAGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAGGTTGAATGCTTGTTGAGCTGGGTGCCTCA
CATCCGTTGTCTGTTATACAAAGAACTACTGATTATGGGTCTCTACGAGCAAAAATGGCAGAACACCTAC
AGGGCACAGGGGAGATGGGAGCAGGGATTAGGCTTCAGAATACTTCTCCAAATGAGGGTGATCAGGGCCC
GACATTTCACTGCTCTAAGGCTCAGTATCTTAACTATCAAATGGGTACAATGGGGCACAAAGGGTTACTT
TGAGGAATAACGGAGGTGAGCAATTTCCAAAAAGTTCATTCCTTTAAAAACTGCGGAGCACATTTTGTGT
ACATGCTGTTTTTATTGTTACTCATGAAGACGCGGGGGAAGCTTTGGTTGTGTAAAGCTGAGAACTGCAC
CCAAGCTTCCCCGTTCACCCCACCTACCAGGGGATTTGGGCTAAATTCCTGGCCTGGCCCACAAAGAAGA
CCAAGCGGTCAGTCCCATTCCGTCCCATCCTGATTTACAGGAACTCACACCAGCGATCAATCTTCCTTAA
TTTGTAACTGGGCAGTGTCCCGGGCCAGCCAATAGCTAAGACTGCCCCCCCCGCACCCCACCCTCCCTGA
CCCTGGGGGACTCTCTACTCAGTCTGCACTGGAGCTGCCTGGTGACCAGAAGTTTGGAGTAGGTTTGGTG
CTGGGCAGGGGTGGGGAGTAGGGTGGAAAGCATGGAGTGAAGAGGTCTAGG
SERPING1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SERPING1_1 ↗11:57,597,685正股57,597,636–57,597,695
SERPING1_2 ↗11:57,598,229正股57,598,180–57,598,239

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_C7PBH · promoter · 57597135–57598194 · regulatory

· motif · 57597471–57597481 · motif

· motif · 57597649–57597659 · motif

· motif · 57597741–57597751 · motif

· motif · 57597877–57597887 · motif

· motif · 57597882–57597892 · motif

· motif · 57597925–57597935 · motif

· motif · 57597933–57597943 · motif

· motif · 57597970–57597980 · motif

· motif · 57597976–57597986 · motif

· motif · 57598171–57598181 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:500 aa

1 aa500 aa功能區域重複區訊號胜肽
依 P05155 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SERPING1 產物長 500 個胺基酸,屬於 serpin 家族。其第 1–22 位為訊號序列。第 85–119 位註記有七個四胺基酸串聯重複單位,序列模式為 [QE]-P-T-[TQ];第 20–43 位及第 65–118 位則被註記為無序區。

訊號胜肽1–22 aa
重複區185–88 aa
重複區289–92 aa
重複區393–96 aa
重複區497–100 aa
重複區5101–104 aa
重複區6105–108 aa
重複區7116–119 aa
功能區域Disordered20–43 aa
功能區域Disordered65–118 aa
功能區域7 X 4 AA tandem repeats of [QE]-P-T-[TQ]85–119 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7AKV…

PDB · 7AKV

EM · 3.60 A · A=98-500

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

SERPING1 產物被註記為分泌型蛋白質。 來源未提供其他定位位置、特定條件下的定位變化或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 9 個夥伴 · 最多顯示 50 個
C1INSERPING1C1RC1SCREB3MASP2PLATMSP-3repstcEvag8
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 9 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SERPING1 與 MASP1 有交互作用;來源未進一步界定此關係是否涉及特定複合體。感染期間,SERPING1 會結合大腸桿菌 E.coli 的 StcE,並因此定位至細菌細胞膜,使細菌受到補體媒介溶解的保護。這項描述指向感染情境中的結合與定位結果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

SERPING1 基因變異與遺傳性血管性水腫第 1 型相關。此病為自體顯性疾病,患者可能在皮下或黏膜下組織反覆出現局部腫脹,涉及上呼吸道、胃腸道、臉部、四肢及生殖器。因 C1 esterase inhibitor 缺乏所致的遺傳性血管性水腫有兩種臨床上無法區分的形式:第 1 型患者血清中的 C1 esterase inhibitor 濃度降低;第 2 型濃度正常或升高,但蛋白質沒有功能。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

5 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 5 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SERPING1 產物是絲胺酸蛋白酶抑制劑,能調節 classical complement pathway,並與 C1r 或 C1s 蛋白酶形成化學計量比例的複合體,使其失去蛋白水解活性。它也可能調節血液凝固、纖維蛋白溶解與激肽生成,並能高效抑制 FXIIa,以及抑制 chymotrypsin 和 kallikrein。含實驗來源
證據與來源

Serine protease inhibitor, which acrs as a regulator of the classical complement pathway. Forms a proteolytically inactive stoichiometric complex with the C1r or C1s proteases. May also regulate blood coagulation, fibrinolysis and the generation of kinins. Very efficient inhibitor of FXIIa. Inhibits chymotrypsin and kallikrein

PMID 10946292 ↗ · PMID 11527969 ↗ · PMID 3458172 ↗ · PMID 6416294 ↗ · PMID 8495195 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SERPING1 與 MASP1 有交互作用;來源未進一步描述互作的條件或性質。含實驗來源
證據與來源

Interacts with MASP1

PMID 10946292 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用在微生物感染情境中,SERPING1 結合大腸桿菌 E.coli 的 StcE,因而定位至細菌細胞膜,並保護細菌免受補體媒介的溶解。含實驗來源
證據與來源

(Microbial infection) Binds to E.coli stcE which allows localization of SERPING1 to cell membranes thus protecting the bacteria against complement-mediated lysis

PMID 12123444 ↗ · PMID 15096536 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted含實驗來源
證據與來源

Secreted

PMID 3756141 ↗ · PMID 6416294 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯SERPING1 基因變異可造成自體顯性的遺傳性血管性水腫。此病表現為皮下或黏膜下組織反覆局部腫脹,可涉及上呼吸道、胃腸道、臉部、四肢及生殖器。C1 esterase inhibitor 缺乏相關疾病有臨床上無法區分的第 1 型與第 2 型:第 1 型血清蛋白質濃度降低,第 2 型濃度正常或升高但蛋白質無功能。含實驗來源
證據與來源

Angioedema, hereditary, 1 HAE1 An autosomal dominant disorder characterized by episodic local swelling involving subcutaneous or submucous tissue of the upper respiratory and gastrointestinal tracts, face, extremities, and genitalia. Hereditary angioedema due to C1 esterase inhibitor deficiency is comprised of two clinically indistinguishable forms. In hereditary angioedema type 1, serum levels of C1 esterase inhibitor are decreased, while in type 2, the levels are normal or elevated, but the protein is non-functional. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 106100

PMID 12773530 ↗ · PMID 1363816 ↗ · PMID 1451784 ↗ · PMID 14635117 ↗ · PMID 16409206 ↗ · PMID 2118657 ↗ · PMID 2296585 ↗ · PMID 22994404 ↗ · PMID 2365061 ↗ · PMID 24456027 ↗ · PMID 3178731 ↗ · PMID 7814636 ↗ · PMID 7883978 ↗ · PMID 8172583 ↗ · PMID 8529136 ↗ · PMID 8755917 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 5 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000278407 · 1,830 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTCTGCACTGGAGCTGCCTGGTGACCAGAAGTTTGGAGT40
41CCGCTGACGTCGCCGCCCAGATGGCCTCCAGGCTGACCCT80
81GCTGACCCTCCTGCTGCTGCTGCTGGCTGGGGATAGAGCC120
121TCCTCAAATCCAAATGCTACCAGCTCCAGCTCCCAGGATC160
161CAGAGAGTTTGCAAGACAGAGGCGAAGGGAAGGTCGCAAC200
201AACAGTTATCTCCAAGATGCTATTCGTTGAACCCATCCTG240
241GAGGTTTCCAGCTTGCCGACAACCAACTCAACAACCAATT280
281CAGCCACCAAAATAACAGCTAATACCACTGATGAACCCAC320
321CACACAACCCACCACAGAGCCCACCACCCAACCCACCATC360
361CAACCCACCCAACCAACTACCCAGCTCCCAACAGATTCTC400
401CTACCCAGCCCACTACTGGGTCCTTCTGCCCAGGACCTGT440
441TACTCTCTGCTCTGACTTGGAGAGTCATTCAACAGAGGCC480
481GTGTTGGGGGATGCTTTGGTAGATTTCTCCCTGAAGCTCT520
521ACCACGCCTTCTCAGCAATGAAGAAGGTGGAGACCAACAT560
561GGCCTTTTCCCCATTCAGCATCGCCAGCCTCCTTACCCAG600
601GTCCTGCTCGGGGCTGGGGAGAACACCAAAACAAACCTGG640
641AGAGCATCCTCTCTTACCCCAAGGACTTCACCTGTGTCCA680
681CCAGGCCCTGAAGGGCTTCACGACCAAAGGTGTCACCTCA720
721GTCTCTCAGATCTTCCACAGCCCAGACCTGGCCATAAGGG760
761ACACCTTTGTGAATGCCTCTCGGACCCTGTACAGCAGCAG800
801CCCCAGAGTCCTAAGCAACAACAGTGACGCCAACTTGGAG840
841CTCATCAACACCTGGGTGGCCAAGAACACCAACAACAAGA880
881TCAGCCGGCTGCTAGACAGTCTGCCCTCCGATACCCGCCT920
921TGTCCTCCTCAATGCTATCTACCTGAGTGCCAAGTGGAAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。