演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SERPINB7

serpin family B member 7

SERPINB7(serpin family B member 7)屬於 serpin 家族的 Ov-serpin 亞家族,可能抑制 Lys 特異性蛋白酶,也可能透過 serpin 活性影響巨核細胞成熟。

Homo sapiens18q21.33UniProt O75635
OFFICIAL SYMBOL
SERPINB7
CHROMOSOME
18
UNIPROT
O75635
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SERPINB7 是一種蛋白質編碼基因,其產物為 serpin 家族 B 成員。依蛋白質家族分類,SERPINB7 屬於 Ov-serpin 亞家族。現有資料指出它可能參與蛋白酶抑制及巨核細胞成熟相關作用,但相關敘述帶有不確定性;其基本特徵是具有 serpin 家族歸屬,而非已確立的作用範圍或機制。

Official symbol
SERPINB7
Gene name
serpin family B member 7
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13902
UniProt
O75635
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1818q21.33
chr18 · 80,373,285 bp · GRCh38chr18p11.32 · 1–2900000 · gnegchr18p11.31 · 2900001–7200000 · gpos50chr18p11.23 · 7200001–8500000 · gnegchr18p11.22 · 8500001–10900000 · gpos25chr18p11.21 · 10900001–15400000 · gnegchr18p11.1 · 15400001–18500000 · acenchr18q11.1 · 18500001–21500000 · acenchr18q11.2 · 21500001–27500000 · gnegchr18q12.1 · 27500001–35100000 · gpos100chr18q12.2 · 35100001–39500000 · gnegchr18q12.3 · 39500001–45900000 · gpos75chr18q21.1 · 45900001–50700000 · gnegchr18q21.2 · 50700001–56200000 · gpos75chr18q21.31 · 56200001–58600000 · gnegchr18q21.32 · 58600001–61300000 · gpos50chr18q21.33 · 61300001–63900000 · gnegchr18q22.1 · 63900001–69100000 · gpos100chr18q22.2 · 69100001–71000000 · gnegchr18q22.3 · 71000001–75400000 · gpos25chr18q23 · 75400001–80373285 · gnegSERPINB7pq1 bp80,373,285 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr18:63,752,935–63,805,376
Gene span
52,442 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000398019 ★63,775,418–63,805,3708
ENST0000042539263,752,935–63,796,3125
ENST0000033642963,753,042–63,805,3768
ENST0000089415663,753,042–63,805,3769
ENST0000089415763,758,720–63,805,3768
ENST0000054067563,775,375–63,805,3767
ENST0000113271763,775,375–63,805,3768
ENST0000044742863,777,777–63,798,6436
ENST0000054602763,777,777–63,805,3768
ENST0000043137063,777,977–63,796,3135

顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SERPINB7 可能具有抑制 Lys 特異性蛋白酶的功能。來源以「可能」描述這項作用,因此目前應視為推測性功能註解,不能據此認定它會抑制所有 Lys 特異性蛋白酶,也無法確定其作用對象或抑制程度。

另一項可能功能與巨核細胞成熟有關。SERPINB7 可能藉由其 serpin 作用影響這一成熟過程;資料未進一步說明它在何種生物條件下發揮作用,也未指出受影響的成熟階段、分子途徑或具體細胞結果,因此這項關聯仍應保留為可能性。

目前可支持的功能範圍,限於可能的 Lys 特異性蛋白酶抑制作用,以及可能透過 serpin 活性影響巨核細胞成熟。兩者的具體機制與彼此是否相關,來源均未交代,不宜延伸為已確立的生理效應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 63775418 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SERPINB7 ENST00000398019 GRCh38 chr18:63774418-63775518 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GAAGGACCAGGCTTGCAGTCATTTCCATGCATAGCAGGTGAAGGTAGGTGCAACATACAGCTCAACCTCA
TGATGCTACGGCCAGAAACTGAAATGTGTTTTTGCCCCTGTGTGGCATGTTCTGATGGCAAAGGTGTAGG
CAACCAACTGGGCCCAACCTACCTTTCCCTACACCTGGTCACTTTTCAAAGTGCAAACCCACTTTAACAA
ACTCTAGCCTGTATTATAGGAGGAAGGATCTGGGTGGTGCAGACGTGGCTTTCCATTGCCAGATCAGAAG
GGTGGAGGAGAGGCTGGCAGGATGACAAGAATGAATGAACACACCAAGTTTCAGCTCCTATCTGAAGCTG
CTCAGTTCAGGTAAGCATTTAGAGAAGCCAGTTGCAATAACTAACAGGGCAAATGTTTCTCTGGAAAATT
CCAAGCCAGAGAAAATTGAGAAAAAGAGGGAAGGATGGAAAGCAGTACAAAGAGAAGCCAGCTCAAAAGG
TTAGAGGTCCAGATGAAAATCTGAGATTGGAGAATGATAAAAAACATTGTGTGAGATTCTATTTTAGGTC
ATTATGCTAGGGAAATTTACACAGGATAGGGTTGAAAGAAATTAGGCTATAAGATGAGTGGCAAGTTGCA
ATAAAATGGCACCCTAAACTCACCAAGTCACTGTTGTCACTGCTATCTTGCCTTAGTTGATTTGATGTCT
AGTTAGTCTATTTGTGTGTTTCTCACAGAAGAGTATGTTTTGACCCAGGCTGACAGATACTGTTGATTCT
GAAATTTGTTTTTATGGTTATGTTAAAACCATTGTCATTATAAGAAACAGAGATGGGAATATTGCCTCCT
GAAATCTGATTCACATACAAACTGAATGAACTACATAACAACCACCTTAGTCAGATACTATTTTGAAACC
TGGTTCAAAACCTAAATGCTTATAAGATTCTTGAGAGACAGTGCTGTGCTCTGAGTCATAGGGAAGCCAT
CCCAGAAGCCAGGTCTACTCATCAATAAGCAGCTGCCTGTGCAGAGTGCAGGCTGCACCTTTGGACAGCC
TTTAAAACTGAATTCTCAGAATTTTAGAACAAATTTTTGTCTAGAAATGCT
SERPINB7 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SERPINB7_3 ↗18:63,753,057正股63,753,008–63,753,067
SERPINB7_1 ↗18:63,775,424正股63,775,375–63,775,434
SERPINB7_2 ↗18:63,777,781正股63,777,732–63,777,791

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR18_9XBGG · promoter · 63775016–63775428 · regulatory

ENSR18_83TLX5 · enhancer · 63775429–63775669 · regulatory

ENSR18_75Q8XS · promoter · 63777682–63777787 · regulatory

ENSR18_9XBH9 · enhancer · 63777788–63778113 · regulatory

· motif · 63775510–63775521 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:380 aa

SERPINB7 的蛋白質產物屬於 serpin 家族,並歸入 Ov-serpin 亞家族。現有資料提供的是家族分類,未列出特定結構域、序列區段或其他蛋白質結構註解。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O75635…

AlphaFold · O75635

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

SERPINB7 的細胞內定位註解為細胞質。 此資料未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SERPINB7SERPINB7
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

SERPINB7 相關變異被列為 Nagashima 型掌蹠角化症的致病原因。此病為常染色體隱性、非症候群性、瀰漫型掌蹠角化症,特徵是界線清楚的瀰漫性紅斑角化,病灶可延伸至手掌與足部背側及阿基里斯腱區域;角化程度輕微且不具進行性。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SERPINB7 可能抑制 Lys 特異性蛋白酶,也可能透過其 serpin 作用影響巨核細胞成熟。這兩項均以可能性描述,來源未進一步限定作用條件、機制細節或受影響的成熟階段。資料庫紀錄
證據與來源

Might function as an inhibitor of Lys-specific proteases. Might influence the maturation of megakaryocytes via its action as a serpin

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SERPINB7 的細胞內定位註解為細胞質。推論支持
證據與來源

Cytoplasm

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯SERPINB7 相關變異被列為 Nagashima 型掌蹠角化症的致病原因。此病為常染色體隱性、非症候群性瀰漫型掌蹠角化症,呈現界線清楚的瀰漫性紅斑角化,可延伸至手掌與足部背側及阿基里斯腱區域;角化程度輕微且不具進行性。含實驗來源
證據與來源

Keratoderma, palmoplantar, Nagashima type PPKN An autosomal recessive, non-syndromic, diffuse palmoplantar keratosis characterized by well-demarcated diffuse erythematous hyperkeratosis expanding onto the dorsal surfaces of the palms and feet and the Achilles tendon area. Hyperkeratosis is mild and non-progressive. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 615598

PMID 24207119 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000398019 · 2,195 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATCAATAAGCAGCTGCCTGTGCAGAGTGCAGGCTGCACCT40
41TTGGACAGCCTTTAAAACTGAATTCTCAGAATTTTAGAAC80
81AAATTTTTGTCTAGAAATGCTGACTTTGGTTCATTAGGTA120
121GTGGTAAAACAGGCTCCCTTCGAAGCTCTCCTTCATCACC160
161TTCCTAAGTGCATGGGGGAAAATACCTAGGGCTCAACAGT200
201CTTGAGAAGTGTGGAAACATTTTCTTTGTGAGTGAGAACA240
241GATCACCTAGAGAAAGGAGACCAGATTCCCATCACTGCTT280
281CTGGGTATCAGATGCTAGCGCTGCACTCCATTTTGCAATG320
321GCCTCCCTTGCTGCAGCAAATGCAGAGTTTTGCTTCAACC360
361TGTTCAGAGAGATGGATGACAATCAAGGAAATGGAAATGT400
401GTTCTTTTCCTCTCTGAGCCTCTTCGCTGCCCTGGCCCTG440
441GTCCGCTTGGGCGCTCAAGATGACTCCCTCTCTCAGATTG480
481ATAAGTTGCTTCATGTTAACACTGCCTCAGGATATGGAAA520
521CTCTTCTAATAGTCAGTCAGGGCTCCAGTCTCAACTGAAA560
561AGAGTTTTTTCTGATATAAATGCATCCCACAAGGATTATG600
601ATCTCAGCATTGTGAATGGGCTTTTTGCTGAAAAAGTGTA640
641TGGCTTTCATAAGGACTACATTGAGTGTGCCGAAAAATTA680
681TACGATGCCAAAGTGGAGCGAGTTGACTTTACGAATCATT720
721TAGAAGACACTAGACGTAATATTAATAAGTGGGTTGAAAA760
761TGAAACACATGGCAAAATCAAGAACGTGATTGGTGAAGGT800
801GGCATAAGCTCATCTGCTGTAATGGTGCTGGTGAATGCTG840
841TGTACTTCAAAGGCAAGTGGCAATCAGCCTTCACCAAGAG880
881CGAAACCATAAATTGCCATTTCAAATCTCCCAAGTGCTCT920
921GGGAAGGCAGTCGCCATGATGCATCAGGAACGGAAGTTCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。