演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SERPINB4PI11

serpin family B member 4

SERPINB4 編碼 serpin 家族 B 成員,屬於 Ov-serpin 子家族;它可能藉由抑制蛋白酶,調節宿主對腫瘤細胞的免疫反應。

Homo sapiens18q21.33UniProt P48594
OFFICIAL SYMBOL
SERPINB4
CHROMOSOME
18
UNIPROT
P48594
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SERPINB4 是一個蛋白質編碼基因,正式名稱為 serpin family B member 4。其產物屬於 serpin 家族的 Ov-serpin 子家族;這項家族歸屬提供了認識此蛋白質的基本分類,但現有資料未進一步說明其序列長度、結構域或其他結構特徵。

Official symbol
SERPINB4
Gene name
serpin family B member 4
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10570
UniProt
P48594
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
PI11LEUPINSCCA-2SCCA1SCCA2

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1818q21.33
chr18 · 80,373,285 bp · GRCh38chr18p11.32 · 1–2900000 · gnegchr18p11.31 · 2900001–7200000 · gpos50chr18p11.23 · 7200001–8500000 · gnegchr18p11.22 · 8500001–10900000 · gpos25chr18p11.21 · 10900001–15400000 · gnegchr18p11.1 · 15400001–18500000 · acenchr18q11.1 · 18500001–21500000 · acenchr18q11.2 · 21500001–27500000 · gnegchr18q12.1 · 27500001–35100000 · gpos100chr18q12.2 · 35100001–39500000 · gnegchr18q12.3 · 39500001–45900000 · gpos75chr18q21.1 · 45900001–50700000 · gnegchr18q21.2 · 50700001–56200000 · gpos75chr18q21.31 · 56200001–58600000 · gnegchr18q21.32 · 58600001–61300000 · gpos50chr18q21.33 · 61300001–63900000 · gnegchr18q22.1 · 63900001–69100000 · gpos100chr18q22.2 · 69100001–71000000 · gnegchr18q22.3 · 71000001–75400000 · gpos25chr18q23 · 75400001–80373285 · gnegSERPINB4pq1 bp80,373,285 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr18:63,637,259–63,644,263
Gene span
7,005 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000341074 ★63,637,259–63,644,2568
ENST0000110495163,637,259–63,644,2638
ENST0000113161163,637,259–63,644,2638
ENST0000041367363,637,718–63,643,5827
ENST0000043626463,639,189–63,644,2566

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SERPINB4 可能具有蛋白酶抑制作用,並藉此調節宿主對腫瘤細胞的免疫反應。這項描述將蛋白酶抑制與免疫反應調節連結起來,但使用「可能」表達推論性質;資料未指出受抑制的蛋白酶種類,也未說明免疫反應如何受到調節。

目前可支持的功能範圍僅限於上述概括性角色。來源沒有提供特定腫瘤類型、細胞或物種背景,也未說明此作用是否依賴特定條件。因此,不能據此推定 SERPINB4 對腫瘤細胞的免疫反應具有何種方向或程度的影響,亦無法進一步描述其分子機制或生物學後果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 63644256 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SERPINB4 ENST00000341074 GRCh38 chr18:63644156-63645256 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTTAGAGTTCCACGTGATTGGGGAGGCCTCAGAATCACAGTAGGAGGCAAAAGTTATTCTTACATGGTGG
CTGCAAGAGAAGATGAGGAAGAAGCAAAAGAAGAAACCCCTGATAAACCCATCGGATCTCCTGAGGCTTA
TTAACTATCATGAGAATAGCACAAGAAAGACCGGCCCCCATGATTCAATTACCTCTACCTGGGTCCCTCC
AATAACATGTGGAAATTCTGGTAGATACAATTCAAGTTGAGATTTGGGTGGGAACACAGCCAAACCATAT
CACTCAGCAAGGCAGATAACTTTCTCACTGAGCCTATGCAACAGAAAACCATCTGGGATGGTTGTAAGGG
GCACAGGAAGTGACTGGTAGGATCACTGCCAAAGCTGAGCACTCAGGAGAAGGCAATAGAATCCTATTCT
CCATAGTATGCTATAAGATACTGAAGTACACTTCTTCACTATCTCTTTGGACTTAGAATTAGCACTACAT
TCCTTGTTATACAGAAAAATTACTAAGGAAATTCATAGGATGACAAAAACTTTCAGAACTGAAAAACAGG
AAATGTAAGCTTTTTAGTTCTTTGGTATTCGAAGTATGCCTAAAAGACAATGCAAAATCCAAGAAAAGAA
TGGTGGGGTTTTTGTTTGTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTACAGCTGGAGTAGAATACAAAGGGATGGAGTT
GAAACAAATGAGAGGAAATTGGAATTCTAAACTTATTCTCATTGGCATTAGAAAGGCACCTACATGTATT
TCACATGAGCCGGTGACTGCTGACTTGCATTCTTATTTTTTCCCTATAGATTAAAAAGGAGGTACAATGG
TAGAACTGTAATCCTGTCCTTTGTCATAAATTTTCATATTCATAAAGGTGAGTGTTAGCCCGCTTGTGAA
ATCTGAAGTTGAGTAACTTCAAATACTAACCACAGAGGGAAAGGCAGCAAGAGGAGAGGCATAAATTTAG
GATCTCACCCTTCATTCCACAGACACACACAGCCTCTCTGCCCACCTCTGCTTCCTCTAGGAACACAGGT
AAGAGCTTCAAGCCTCTCCAGCTTAATAACATGAATTATTTTTGAGAATAA
SERPINB4 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SERPINB4_1 ↗18:63,644,256負股63,644,246–63,644,305

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR18_9X92Q · enhancer · 63641162–63641637 · regulatory

· motif · 63641522–63641531 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:390 aa

SERPINB4 的蛋白質產物屬於 serpin 家族中的 Ov-serpin 子家族。現有資料未提供其結構域、功能區域或序列特徵的詳細註解。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P48594…

AlphaFold · P48594

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

另有描述指出,癌細胞似乎也會將其少量分泌至血漿;此處的分泌情形限於癌細胞,且以低量表述。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
PI11SERPINB4HOXD10IL18SERPINB3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SERPINB4 可能作為蛋白酶抑制劑,調節宿主對腫瘤細胞的免疫反應。此描述保留了「可能」的不確定性,但未指明受抑制的蛋白酶、免疫反應的變化方向或作用機制。資料庫紀錄
證據與來源

May act as a protease inhibitor to modulate the host immune response against tumor cells

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SERPINB4 位於細胞質;癌細胞似乎也會將其少量分泌至血漿。分泌的描述限於癌細胞,且指出其程度偏低。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Seems to also be secreted in plasma by cancerous cells but at a low level

PMID 10956412 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000341074 · 1,707 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGACACACACAGCCTCTCTGCCCACCTCTGCTTCCTCTAG40
41GAACACAGGAGTTCCAGATCACATCGAGTTCACCATGAAT80
81TCACTCAGTGAAGCCAACACCAAGTTCATGTTCGATCTGT120
121TCCAACAGTTCAGAAAATCAAAAGAGAACAACATCTTCTA160
161TTCCCCTATCAGCATCACATCAGCATTAGGGATGGTCCTC200
201TTAGGAGCCAAAGACAACACTGCACAACAAATTAGCAAGG240
241TTCTTCACTTTGATCAAGTCACAGAGAACACCACAGAAAA280
281AGCTGCAACATATCATGTTGATAGGTCAGGAAATGTTCAT320
321CACCAGTTTCAAAAGCTTCTGACTGAATTCAACAAATCCA360
361CTGATGCATATGAGCTGAAGATCGCCAACAAGCTCTTCGG400
401AGAAAAGACGTATCAATTTTTACAGGAATATTTAGATGCC440
441ATCAAGAAATTTTACCAGACCAGTGTGGAATCTACTGATT480
481TTGCAAATGCTCCAGAAGAAAGTCGAAAGAAGATTAACTC520
521CTGGGTGGAAAGTCAAACGAATGAAAAAATTAAAAACCTA560
561TTTCCTGATGGGACTATTGGCAATGATACGACACTGGTTC600
601TTGTGAACGCAATCTATTTCAAAGGGCAGTGGGAGAATAA640
641ATTTAAAAAAGAAAACACTAAAGAGGAAAAATTTTGGCCA680
681AACAAGAATACATACAAATCTGTACAGATGATGAGGCAAT720
721ACAATTCCTTTAATTTTGCCTTGCTGGAGGATGTACAGGC760
761CAAGGTCCTGGAAATACCATACAAAGGCAAAGATCTAAGC800
801ATGATTGTGCTGCTGCCAAATGAAATCGATGGTCTGCAGA840
841AGCTTGAAGAGAAACTCACTGCTGAGAAATTGATGGAATG880
881GACAAGTTTGCAGAATATGAGAGAGACATGTGTCGATTTA920
921CACTTACCTCGGTTCAAAATGGAAGAGAGCTATGACCTCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。