演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SERPINB12

serpin family B member 12

SERPINB12 編碼 serpin family B member 12,屬於 serpin 家族的 Ov-serpin 亞家族;此蛋白質可抑制特定蛋白酶。

Homo sapiens18q21.33UniProt Q96P63
OFFICIAL SYMBOL
SERPINB12
CHROMOSOME
18
UNIPROT
Q96P63
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SERPINB12 是蛋白質編碼基因,其產物 serpin family B member 12 屬於 serpin 家族的 Ov-serpin 亞家族。現有資料指出,這種蛋白質具有選擇性抑制蛋白酶的能力,並可能與細胞分化有關;關於其基本身分與家族歸屬,資料未提供更多可支持的結構或生物學背景。

Official symbol
SERPINB12
Gene name
serpin family B member 12
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14220
UniProt
Q96P63
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1818q21.33
chr18 · 80,373,285 bp · GRCh38chr18p11.32 · 1–2900000 · gnegchr18p11.31 · 2900001–7200000 · gpos50chr18p11.23 · 7200001–8500000 · gnegchr18p11.22 · 8500001–10900000 · gpos25chr18p11.21 · 10900001–15400000 · gnegchr18p11.1 · 15400001–18500000 · acenchr18q11.1 · 18500001–21500000 · acenchr18q11.2 · 21500001–27500000 · gnegchr18q12.1 · 27500001–35100000 · gpos100chr18q12.2 · 35100001–39500000 · gnegchr18q12.3 · 39500001–45900000 · gpos75chr18q21.1 · 45900001–50700000 · gnegchr18q21.2 · 50700001–56200000 · gpos75chr18q21.31 · 56200001–58600000 · gnegchr18q21.32 · 58600001–61300000 · gpos50chr18q21.33 · 61300001–63900000 · gnegchr18q22.1 · 63900001–69100000 · gpos100chr18q22.2 · 69100001–71000000 · gnegchr18q22.3 · 71000001–75400000 · gpos25chr18q23 · 75400001–80373285 · gnegSERPINB12pq1 bp80,373,285 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr18:63,542,369–63,569,329
Gene span
26,961 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000382768 ★63,542,369–63,569,3298
ENST0000026949163,542,369–63,569,3298

顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

serpin family B member 12 可抑制 trypsin 與 plasmin。這項抑制作用具有選擇性:資料指出它不抑制 thrombin、凝血因子 Xa(coagulation factor Xa),也不抑制 urokinase-type plasminogen activator。因此,不能將其描述為對所有蛋白酶或凝血相關蛋白酶皆有抑制作用;現有資訊僅支持上述特定的抑制對象與非對象。

除了蛋白酶抑制特性外,SERPINB12 也可能參與細胞分化。來源以「可能」描述這項功能關聯,並未提供足以界定其作用方式、發生條件或對分化結果影響方向的細節。因此,這項角色應保留為可能性,不宜延伸解讀為已確立的分化機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 63542369 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SERPINB12 ENST00000382768 GRCh38 chr18:63541369-63542469 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AATCATGATGCAGGATGGGTTTTTGTAGATTTTGAGTGTACTGTCCTAAAGTTACACTTAGAGACAGGAC
CCTCAAGAGGAGGAGGCTTTTTGTGGAAATCCAAGGGCATGGCTTTGCTTTAAGACTGCAAATTGAACTA
AATGCCCTCAAAATATCTCAGAAAACCTCCAAGCATGCATTATTTTTCTTAACCAAATATGAACCACGTT
TTGAAAAAGAGCTGATGTTGTTCTATGATGATAGGTAATATCTAGTGAGTTTTGCAGGTGAATGAAGTCT
TCTGAGGTATTTGTACTGAGAGAAGTAGAGGGAGAAAGAGACAAGGAAATGGGATGGGGTGGGACAGAGG
CAAATGGGGATGGAGGAGATGAGGAAGACAGAGGTGAAGAGAAGGAACAGAGACAGAAGGGAAGAGGGGA
GAGACACCTTTTGTTTATTTGCTAGGTACAGTCTGAGATGCCAGAAGAAAAAATAACTGGTGAGGATGCT
CAGGAAATTATCCTAGACAGCTGTGGAGTTGCAGTCATGATAGAGTAGCTAATAACAGTTGATAATACCT
GAAAAGTCTAGCTTCACACTTGACTGAGAACCTCACAGTTTTGTCACTACTCAATTTATTTGATGGTGTG
CATTGGGATAGGCGATGAAAAATATTCCGCTTGGGTTTTGTGTATTCTGTTATAAATTATGAACTCATGT
GTTACACAGTGGCTGGAGGGCTCTGTAAGTTGTTTAGGGAGAATAAGGGACAGAGATATGACACTTCCTC
TTTACTAAGGCTCTAACCCCTAACCTGTGTTTTTCCCACTGTTCCCCTCTAAAGGAGAGGCCCTCATGGT
GGAACGGTTTGTTCTAAAGGAGTGATAATGTAGAGATAATCACTTTAACTTAAAATTCATTGAATTGATG
GCCATAAATGCATGTCTTATTTTCCCCTTCATATGTTAATTGTCCTGATTCACAAACCTGTATTTAAAGT
GACAGAATAGCTTGCTCAATGCCTCTCCTTATAAGTTTTCACAGGCTGTAGGACTTGCCTGGTTCCTCCT
CTGCTAGATTGATTTTTGAATTGACTTTATCAGAGCACAGACCTTAGCTGG
SERPINB12 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SERPINB12_2 ↗18:63,542,407正股63,542,358–63,542,417
SERPINB12_1 ↗18:63,546,901正股63,546,852–63,546,911

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR18_5JXHXX · CTCF_binding_site · 63539403–63539424 · regulatory

ENSR18_9X7XH · enhancer · 63540051–63540560 · regulatory

· motif · 63539405–63539421 · motif

· motif · 63540291–63540300 · motif

· motif · 63542130–63542143 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:405 aa

1 aa405 aa功能區域
依 Q96P63 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

serpin family B member 12 長 405 個胺基酸,屬於 serpin 家族的 Ov-serpin 亞家族。序列第 64 至 83 位被註記為無序區域(Disordered);資料未提供其他功能區域的細節。

功能區域Disordered64–83 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q96P63…

AlphaFold · Q96P63

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

serpin family B member 12 定位於細胞質。 資料未指出定位會因條件或異構型而改變。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SERPINB12SERPINB12
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SERPINB12 與 SLFN12 有交互作用,兩者被描述為細胞分化調控路徑的一部分。資料另指出 SERPINB12 可能與 USP14 交互作用;此項關係帶有不確定性,不能視為已確認的結合。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SERPINB12 可抑制 trypsin 與 plasmin,但不抑制 thrombin、凝血因子 Xa(coagulation factor Xa)或 urokinase-type plasminogen activator。它也可能參與細胞分化;此項分化角色以可能性描述。含實驗來源
證據與來源

Inhibits trypsin and plasmin, but not thrombin, coagulation factor Xa, or urokinase-type plasminogen activator. May play a role in cell differentiation

PMID 11604408 ↗ · PMID 30045019 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SERPINB12 與 SLFN12 有交互作用,並被描述為調控細胞分化路徑的一部分。此外,SERPINB12 可能與 USP14 交互作用;該交互作用仍屬可能性。含實驗來源
證據與來源

Interacts with SLFN12; as part of a pathway regulating cell differentiation. May interact with USP14

PMID 30045019 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SERPINB12 的細胞內定位為細胞質。推論支持
證據與來源

Cytoplasm

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000382768 · 3,738 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1GCCTCTCCTTATAAGTTTTCACAGGCTGTAGGACTTGCCT40
41GGTTCCTCCTCTGCTAGATTGATTTTTGAATTGACTTTAT80
81CAGAGCACAGACCTTAGCTGGGGACAGCCCTCACTGGCTT120
121CCAGATCGTTATAAGTTTTACAATGGACTCTCTTGTTACA160
161GCAAACACCAAATTTTGCTTTGATCTTTTTCAAGAGATAG200
201GCAAAGATGATCGTCATAAAAACATATTTTTCTCTCCCCT240
241GAGCCTCTCAGCTGCCCTTGGTATGGTACGCTTGGGTGCT280
281AGAAGTGACAGTGCACATCAGATTGATGAGGTACTACACT320
321TCAACGAATTTTCCCAGAATGAAAGCAAAGAACCTGACCC360
361TTGTCTGAAAAGCAACAAACAAAAAGTGCTGGCTGACAGC400
401TCTCTGGAGGGGCAGAAAAAAACGACAGAGCCTCTGGATC440
441AGCAGGCTGGGTCCTTAAACAATGAGAGCGGACTGGTCAG480
481CTGCTACTTTGGGCAGCTTCTCTCCAAATTAGACAGGATC520
521AAGACTGATTACACACTGAGTATTGCCAACAGGCTTTATG560
561GAGAGCAGGAATTCCCAATCTGTCAGGAATACTTAGATGG600
601TGTGATTCAATTTTACCACACGACGATTGAAAGTGTTGAT640
641TTCCAAAAAAACCCTGAAAAATCCAGACAAGAGATTAACT680
681TCTGGGTTGAATGTCAATCCCAAGGTAAAATCAAGGAACT720
721CTTCAGCAAGGACGCTATTAATGCTGAGACTGTGCTGGTA760
761CTGGTGAATGCTGTTTACTTCAAGGCCAAATGGGAAACAT800
801ACTTTGACCATGAAAACACGGTGGATGCACCTTTCTGTCT840
841AAATGCGAATGAAAACAAGAGTGTGAAGATGATGACGCAA880
881AAAGGCCTCTACAGAATTGGCTTCATAGAGGAGGTGAAGG920
921CACAGATCCTGGAAATGAGGTACACCAAGGGGAAGCTCAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。