演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SERPINB11

serpin family B member 11

SERPINB11 編碼 serpin family B member 11;現有資料指出,該蛋白質不具絲胺酸蛋白酶抑制活性。

Homo sapiens18q21.33UniProt Q96P15
OFFICIAL SYMBOL
SERPINB11
CHROMOSOME
18
UNIPROT
Q96P15
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SERPINB11 是位於人類第 18 號染色體的蛋白質編碼基因,正式名稱為 serpin family B member 11。其蛋白質產物的功能資料指出,雖與絲胺酸蛋白酶抑制相關,但並未觀察到相應的抑制活性;可能原因涉及支架上的變異及構形改變受阻。

Official symbol
SERPINB11
Gene name
serpin family B member 11
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14221
UniProt
Q96P15
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1818q21.33
chr18 · 80,373,285 bp · GRCh38chr18p11.32 · 1–2900000 · gnegchr18p11.31 · 2900001–7200000 · gpos50chr18p11.23 · 7200001–8500000 · gnegchr18p11.22 · 8500001–10900000 · gpos25chr18p11.21 · 10900001–15400000 · gnegchr18p11.1 · 15400001–18500000 · acenchr18q11.1 · 18500001–21500000 · acenchr18q11.2 · 21500001–27500000 · gnegchr18q12.1 · 27500001–35100000 · gpos100chr18q12.2 · 35100001–39500000 · gnegchr18q12.3 · 39500001–45900000 · gpos75chr18q21.1 · 45900001–50700000 · gnegchr18q21.2 · 50700001–56200000 · gpos75chr18q21.31 · 56200001–58600000 · gnegchr18q21.32 · 58600001–61300000 · gpos50chr18q21.33 · 61300001–63900000 · gnegchr18q22.1 · 63900001–69100000 · gpos100chr18q22.2 · 69100001–71000000 · gnegchr18q22.3 · 71000001–75400000 · gpos25chr18q23 · 75400001–80373285 · gnegSERPINB11pq1 bp80,373,285 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr18:63,647,579–63,726,432
Gene span
78,854 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000544088 ★63,702,960–63,723,8938
ENST0000048974863,647,579–63,720,0807
ENST0000038274963,702,304–63,723,8939
ENST0000062326263,710,194–63,723,3995
ENST0000062451863,710,194–63,723,3992

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

現有資料指出,SERPINB11 的蛋白質產物不具絲胺酸蛋白酶抑制活性。這項功能特徵與典型的抑制作用不同,來源提出的可能解釋是:蛋白質支架中的變異妨礙構形改變,因此可能無法完成抑制蛋白酶所需的結構轉換。此處的原因屬於可能性說明,並非確定的機制結論。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 63702960 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SERPINB11 ENST00000544088 GRCh38 chr18:63701960-63703060 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTATTACTAACTCGATAACTCTTGTGTTTTTTTGTGGGACAGGATTTACCTGCTAGTAGTTTGCTGAAAC
TCCACATAAAAACATATGCTGCATGCAAGAGAGCCCAGAAGATCTTGGGATGAGTGTTCCTCAGGCCAGG
AAGCATCTGCCACAGCTGGGATCTTTCCTACTGAGTAGCTTTGCACCATGTGCACTGACACTGGAGATCC
CTGGAATTTTGCATAGGGCACTGCTAACTTGTTGGGTTGATGGCAATCTCTTTGACAGACAGCGTATTTT
TCTTGAATAGAGGCCAGGCTTGTTAATGTTTTCCCTTAGTAAAACAGAAGGAGGTTAAGAACTGGGTGCA
GGGCCGGGCATGGTCGTTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTAGGAGGCTGAGGCAGGTGGATCACGAGGT
CAGGAGTTTGAGACCAGCCTGACCAACATGATGAAACCCTGTCTCCACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG
GTGTGGTGGTGCACACCTATAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAACTGCTTAAACCCAGGA
GGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCACACCACTGCACTCCAGCCTGTGAGACTCCATCTCAAAATAAAT
AAATAGAAAAAGAACTGAGCACTTCTCTGAAAAGCACTGGTCATCTTGGGAGTCTCTGGGGATCTCATTA
CAAATTTTATTTTTATTTTTTAATTTTTAAAATAGAGATCAGGGTCTCACTATGTTGCCCAGGCTGGCCT
CAAACTCCTAGCCTCAAGTAACCCTCCCACCTCAGCCTTCCAAAGTGCTGGGATTACAGGAATGAGCCAC
CATGCTGGGCTCTGGGGATTTAAAGAAGCTCTTGATGGACTTCATTTTCAGGGCTGTACTTTCCAACCAG
CAGGTGAAGAGCTGAATCACTAAGGGCACAAATGAAAAGGGAGGGGCAAAATATGAAGGCTTTATATTTC
CTTTTGAGGGACGCAGCTCCAGTCTAACTTGCCACTCTGTGAACTTCACTACTGGAAAGCAACAAAGGTA
AGAGAAATGTTTCTGTACGTTATTATCTCAGCTGTGCTTGTTGTCAAAGGG
SERPINB11 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SERPINB11_1 ↗18:63,702,960正股63,702,911–63,702,970

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:392 aa

1 aa392 aa功能區域
依 Q96P15 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SERPINB11 蛋白質長 392 個胺基酸,屬於 serpin 家族的 Ov-serpin 亞家族。其反應中心環(RCL)區域位於第 341 至 365 個胺基酸。

功能區域RCL341–365 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q96P15…

AlphaFold · Q96P15

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SERPINB11SERPINB11
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SERPINB11 蛋白質不具絲胺酸蛋白酶抑制活性;來源推測,蛋白質支架中的變異可能妨礙構形改變,進而解釋其缺乏此抑制活性的情形。含實驗來源
證據與來源

Has no serine protease inhibitory activity, probably due to variants in the scaffold impairing conformational change

PMID 17562709 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SERPINB11 蛋白質定位於細胞質;此筆定位資料未提供其他條件、細胞系統或定位變化的說明。推論支持
證據與來源

Cytoplasm

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000544088 · 1,735 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1AGTCTAACTTGCCACTCTGTGAACTTCACTACTGGAAAGC40
41AACAAAGGCAGTCGGCATAAAAATGGGTTCTCTCAGCACA80
81GCTAACGTTGAATTTTGCCTTGATGTGTTCAAAGAGCTGA120
121ACAGTAACAACATAGGAGATAACATCTTCTTTTCTTCGCT160
161GAGTCTGCTTTATGCTCTAAGCATGGTCCTCCTTGGTGCC200
201AGGGGAGAGACTGAAGAGCAATTGGAGAAGGTGCTTCATT240
241TTAGTCATACTGTAGACTCATTAAAACCAGGGTTCAAGGA280
281CTCACCTAAGTGCAGCCAAGCTGGAAGAATTCATTCCGAG320
321TTTGGTGTCGAATTCTCTCAAATCAACCAGCCAGACTCTA360
361ACTGTACCCTCAGCATTGCCAACAGGCTCTACGGGACAAA400
401GACGATGGCATTTCATCAGCAATATTTAAGCTGTTCTGAG440
441AAATGGTATCAAGCCAGGTTGCAAACTGTGGATTTTGAAC480
481AGTCTACAGAAGAAACGAGGAAAACGATTAATGCTTGGGT520
521TGAAAATAAAACTAATGGAAAAGTCGCAAATCTCTTTGGA560
561AAGAGCACAATTGACCCTTCATCTGTAATGGTCCTGGTGA600
601ATGCCATATATTTCAAAGGACAATGGCAAAATAAATTTCA640
641AGTAAGAGAGACAGTTAAAAGTCCTTTTCAGCTAAGTGAG680
681GGTAAAAATGTAACTGTGGAAATGATGTATCAAATTGGAA720
721CATTTAAACTGGCCTTTGTAAAGGAGCCGCAGATGCAAGT760
761TCTTGAGCTGCCCTACGTTAACAACAAATTAAGCATGATT800
801ATTCTGCTTCCAGTAGGCATAGCTAATCTGAAACAGATAG840
841AAAAGCAGCTGAATTCGGGGACGTTTCATGAGTGGACAAG880
881CTCTTCTAACATGATGGAAAGAGAAGTTGAAGTACACCTC920
921CCCCGATTCAAACTTGAAACTAAGTATGAGCTAAATTCCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。