基因總覽
SERPINA7 是人類的蛋白質編碼基因,其產物 serpin family A member 7 屬於 serpin 家族。來源將此蛋白描述為血清中的主要甲狀腺激素運輸蛋白,指出它在血液中負責運輸甲狀腺激素。現有資料未提供更詳細的結構或分子作用方式。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000372563 ★ | 106,032,435–106,038,727 | 5 |
| ENST00001127623 | 106,015,189–106,038,778 | 5 |
| ENST00000907820 | 106,032,425–106,038,778 | 5 |
| ENST00001132385 | 106,032,435–106,038,778 | 5 |
| ENST00000907821 | 106,032,439–106,038,778 | 5 |
| ENST00000327674 | 106,032,442–106,037,394 | 4 |
| ENST00000998639 | 106,032,442–106,038,778 | 5 |
| ENST00000907822 | 106,033,206–106,038,778 | 5 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
serpin family A member 7 是血清中的主要甲狀腺激素運輸蛋白。現有資料支持其參與甲狀腺激素在血清中的運輸,但未進一步說明其運輸機制、作用條件或對其他生物學過程的影響。
Promoter 與基因調控
>SERPINA7 ENST00000372563 GRCh38 chrX:106038627-106039727 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGTCAGTACTATTTGTCCTGGATTATAAGTCCTACCATAGACTGCATCTAGGCTTAGTTCGAACTAGCTC CTCATTCCCTGCCTCCCCTCCCACTACAAATTAACACATAGATTCTTAATGTAGTACTGAAGCTGGCAGG GTCTGGAATCTGATGCTTCACAAAATGTCTGTAGTAAAATGCTTCACATGCCTGTAGTAAATACTCAGAA GCAGGAGTTGCTGTTGCTGCTACTGCTACTGCTACTACTGCTACTACTACTACTACTAGAGCTGGAAACT TTCAGAAGCAGGTTGAACTCAAGTCTCCTGACTGAGTCCAGTTCTTTTTGTTCCCATTGCTTCTTTGCAT ATAATCAGTACACAATTAATACTGGACAGTGGAATCTTTAATTTCAGTCTCCTTGACTCCTTCTGCATCC TCTTTTGGAGTCCTGTGGCCAGGGGACGGTACAGGGAATTTTAATGACGAGAAGACAGGGCTGGTTTCCC CCTTAGCAGACATATATGTTTGCAGCATCAGAAGTCTAGGGCTGGAAGCTACCTTTGACATCATTTCCTC TGCGAATGCATGTATAATTTCTACAGAACCTATTAGAAAGGATCACCCAGCCTCTGCTTTTGTACAACTT TCCCTTAAAAAACTGCCAATTCCACTGCTGTTTGGCCCAATAGTGAGAACTTTTTCCTGCTGCCTCTTGG TGCTTTTGCCTATGGCCCCTATTCTGCCTGCTGAAGACACTCTTGCCAGCATGGACTTAAACCCCTCCAG CTCTGACAATCCTCTTTCTCTTTTGTTTTACATGAAGGGTCTGGCAGCCAAAGCAATCACTCAAAGTTCA AACCTTATCATTTTTTGCTTTGTTCCTCTTGGCCTTGGTTTTGTACATCAGCTTTGAAAATACCATCCCA GGGTTAATGCTGGGGTTAATTTATAACTAAGAGTGCTCTAGTTTTGCAATACAGGACATGCTATAAAAAT GGAAAGATGTTGCTTTCTGAGAGATGCAGGTGGATTCTTGGGCATTTGCTGTAAGTACTTTTTTTCTCTT TGGAAACTTTGAACATCTCTATCAGCAAGTCAGAGTCCCAAATAACCAAGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SERPINA7_1 ↗ | X:106,038,727 | 負股 | 106,038,717–106,038,776 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSRX_5WXDM5 · CTCF_binding_site · 106035278–106035299 · regulatory
ENSRX_8556RR · open_chromatin_region · 106040020–106040234 · regulatory
ENSRX_5WXFGH · CTCF_binding_site · 106040113–106040134 · regulatory
· motif · 106035280–106035296 · motif
· motif · 106036908–106036922 · motif
· motif · 106036908–106036922 · motif
· motif · 106036915–106036926 · motif
· motif · 106038574–106038589 · motif
· motif · 106038963–106038978 · motif
· motif · 106040115–106040131 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:415 aa
serpin family A member 7 長 415 個胺基酸,屬於 serpin 家族。序列註解指出其第 1 至第 20 個胺基酸為訊號序列。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 serpin family A member 7 標註為分泌型蛋白,未提供更細的細胞內定位資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GAGATGCAGGTGGATTCTTGGGCATTTGCTATTAACTTCC40TTCCAAAATGTCACCATTCCTGTATCTGGTTCTCTTGGTA80CTTGGGCTTCATGCTACAATCCACTGTGCATCACCTGAAG120GCAAAGTAACAGCCTGCCATTCATCCCAACCAAATGCCAC160TCTCTACAAGATGTCATCCATTAATGCTGACTTTGCATTC200AATCTGTACCGGAGGTTCACTGTGGAGACCCCAGATAAGA240ACATCTTCTTTTCCCCTGTGAGCATTTCTGCAGCTTTGGT280TATGCTTTCCTTTGGGGCCTGCTGCAGCACCCAAACTGAG320ATTGTGGAGACCTTGGGGTTCAACCTCACAGACACTCCAA360TGGTAGAGATCCAGCATGGCTTCCAGCATCTGATCTGTTC400ACTGAATTTTCCAAAGAAGGAACTGGAATTGCAGATAGGA440AATGCCCTCTTCATTGGCAAGCATCTGAAACCACTGGCAA480AGTTCTTGAATGATGTCAAGACCCTCTATGAGACTGAAGT520CTTTTCTACCGACTTCTCCAACATTTCTGCAGCCAAGCAG560GAGATTAACAGTCATGTGGAGATGCAAACCAAAGGGAAAG600TTGTGGGTCTAATTCAAGACCTCAAGCCAAACACCATCAT640GGTCTTAGTGAACTATATTCACTTTAAAGCCCAGTGGGCA680AATCCTTTTGATCCATCCAAGACAGAAGACAGTTCCAGCT720TCTTAATAGACAAGACCACCACTGTTCAAGTGCCCATGAT760GCACCAGATGGAACAATACTATCACCTAGTGGATATGGAA800TTGAACTGCACAGTTCTGCAAATGGACTACAGCAAGAATG840CTCTGGCACTCTTTGTTCTTCCCAAGGAGGGACAGATGGA880GTCAGTGGAAGCTGCCATGTCATCTAAAACACTGAAGAAG920TGGAACCGCTTACTACAGAAGGGATGGGTTGACTTGTTTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。