基因總覽
SERP1 的正式名稱為 stress associated endoplasmic reticulum protein 1，為蛋白質編碼基因，其產物屬於 RAMP4 family。這是一種長 66 個胺基酸的單次穿膜蛋白，具有一段跨膜區域；其 N 端部分被註記為無序區。來源資料將其定位於內質網膜，並指出它與目標蛋白質的轉位及內質網壓力反應相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000239944 ★ | 150,541,998–150,546,496 | 3 |
| ENST00000479209 | 150,541,998–150,603,174 | 4 |
| ENST00000487153 | 150,541,998–150,546,620 | 2 |
| ENST00000914303 | 150,541,998–150,546,620 | 4 |
| ENST00000981764 | 150,541,998–150,546,620 | 4 |
| ENST00001127059 | 150,541,998–150,546,620 | 3 |
| ENST00001143382 | 150,541,998–150,546,620 | 3 |
| ENST00000491660 | 150,545,397–150,546,620 | 2 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SERP1 參與目標蛋白質轉位至內質網腔的過程，並在此期間與目標蛋白質互作。當內質網承受壓力時，SERP1 可保護尚未摺疊的目標蛋白質，使其免於降解，支持目標蛋白質在壓力條件下的維持。
內質網壓力終止後，SERP1 可能促進目標蛋白質的糖基化；此外，它也可能調節目標蛋白質上 N-糖基化位點的使用。這些作用的描述包含「可能」，因此其作用範圍與具體方式仍應保留此不確定性。
Promoter 與基因調控
>SERP1 ENST00000239944 GRCh38 chr3:150546396-150547496 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAGTTTATTATCTCCTCCAACACTACAGTCTTTAGCTTCAAAATTTCAAGAGTCCTCTAATGTTCTATTT CTAATATGCTCATAACCATTTCAAAATCAAATGTTGCTAGAATATCTCTATCATGCTCACTGCTACACCC TCTCCCAACCACACCTTCATCATTTGAAACCTGCATTACAGCTCCACTCTCCCTATTCAGTCCTACAAAC CTCATTAAGGCAGGAAGGCCAGAATCTGGAATTACTTAAGTCCAGGTGTATTTAAAGTGCGTGATCATTC TAGAGGACTAACTCATGTTTGTCTTTGTTCTTATTGTAGACCTAAATGACTTCACAAGGGCCCGTGTAAC ACCAGTATTGCAGACCCATGTGTCACAAATTCAACTAGCACATTGTTTTTCTCCCCCTTCTTCTATTTCT GTAGAAGATGAATCCGCAGGCAAGAATGATGGATGGGTGAAAGGGAGGGGGAATACGAAAGCCCAGAGGC GGAGACTTCACTTCCGATTGCCACGCTATATCAAGAAAGCCAACAGTCTGGCCTTTCCGCAAGCCACAAG AAAAGGCAGATCAGACTCCCCGGCTCCTCGGGTAGTTCTCAAAGGCAAAGACAAAAATAAGAAACTAGTC TGAAGAAAGAGAGTCCCTCGCTTCTTCAGAACTCACCTGTCAAGAGCGGCGTGGACGGCGCCATGTTGTC CCGGAAAGAGAAACCGCTCGGGTGAGAGTTCACCAGGGCCGAACCCGGCCCCTACACGTCTCCTCATGCG TGGAGACAGCGAATTGGTGTTTCCGGAGCCATCAGCCTCGGGGCCAATTCACTTCCGGTTACGGAGTGAC GCGGAAAAGGCGCCCAAACGCGCACGCGCAAATCTAGGGCGACGCTTGACAGAGCTTGGGAGGGTGCGCC TGCTTTCGCCCTCCTTCTCCAGCGGGAGGGGCGCGCACTTCCGCGGGGCGGAGTCCGTCTAGTGCTGACG TTGGCAGCCGAACCCAAAGTAGATCGAGGCGGCGGGCTGCACATTCCCGTTGTTGCGTTGCGTTTCCTTC CTCTTTCACTCCGCGCTCACGGCGGCGGCCAAAGCGGCGGCGACGGCGGCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SERP1_1 ↗ | 3:150,546,446 | 負股 | 150,546,436–150,546,495 |
| SERP1_2 ↗ | 3:150,603,183 | 負股 | 150,603,173–150,603,232 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_947QC9 · enhancer · 150544162–150544439 · regulatory
ENSR3_947QCX · promoter · 150546486–150546804 · regulatory
ENSR3_B34TNK · enhancer · 150546805–150547654 · regulatory
· motif · 150545705–150545720 · motif
· motif · 150545793–150545803 · motif
· motif · 150545815–150545832 · motif
· motif · 150546148–150546157 · motif
· motif · 150546351–150546360 · motif
· motif · 150546439–150546452 · motif
· motif · 150546534–150546556 · motif
· motif · 150546534–150546556 · motif
· motif · 150546540–150546551 · motif
· motif · 150546540–150546551 · motif
· motif · 150546542–150546551 · motif
· motif · 150546555–150546565 · motif
· motif · 150546581–150546592 · motif
· motif · 150546627–150546638 · motif
· motif · 150546627–150546638 · motif
· motif · 150546664–150546677 · motif
· motif · 150546666–150546677 · motif
· motif · 150546666–150546677 · motif
· motif · 150546668–150546677 · motif
· motif · 150546722–150546738 · motif
· motif · 150546765–150546778 · motif
· motif · 150546938–150546953 · motif
· motif · 150546989–150546998 · motif
· motif · 150547558–150547567 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：66 aa
SERP1 長 66 個胺基酸，屬於 RAMP4 family。其第 39 至 59 位胺基酸構成螺旋型跨膜區；第 1 至 31 位則被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SERP1 是單次穿膜蛋白，定位於內質網膜。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 43 個夥伴
- ALG3Q92685 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- APH1AQ96BI3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
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- HSD17B13Q7Z5P4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- IL3RAP26951 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- JAGN1Q8N5M9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KCNF1Q9H3M0 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- KIR3DL3Q8N743 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SERP1 與 SEC61B、SEC61A1 及 SEC61 complex 互作，也與 CANX 互作。來源僅指出這些互作關係，未進一步說明其結合方式或是否同屬特定複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SERP1 在目標蛋白質轉位至內質網腔時與其互作，並可在內質網壓力期間保護未摺疊的目標蛋白質，使其免於降解。內質網壓力終止後，SERP1 可能促進目標蛋白質糖基化，也可能調節其 N-糖基化位點的使用。 | 推論支持 | 證據與來源Interacts with target proteins during their translocation into the lumen of the endoplasmic reticulum. Protects unfolded target proteins against degradation during ER stress. May facilitate glycosylation of target proteins after termination of ER stress. May modulate the use of N-glycosylation sites on target proteins |
| 交互作用 | SERP1 與 SEC61B、SEC61A1 及 SEC61 complex 互作，並與 CANX 互作。 | 推論支持 | |
| 細胞定位 | SERP1 定位於膜，屬單次穿膜蛋白；其定位位置包括內質網膜。 | 推論支持 | 證據與來源Membrane / Single-pass membrane protein; Endoplasmic reticulum membrane / Single-pass membrane protein |
核酸與蛋白質序列
AGATCGAGGCGGCGGGCTGCACATTCCCGTTGTTGCGTTG40CGTTTCCTTCCTCTTTCACTCCGCGCTCACGGCGGCGGCC80AAAGCGGCGGCGACGGCGGCGCGAGAACGACCCGGCGGCC120AGTTCTCTTCCTCCTGCGCACCTGCCCCGCTCGGTCAGTC160AGTCGGCGGCCGGCGCCCGGCTTGTGCTCAGACCTCGCGC200TTGCGGCGCCCAGGCCCAGCGGCCGTAGCTAGCGTCTGGC240CTGAGAACCTCGGCGCTCCGGCGGCGCGGGCACCACGAGC280CGAGCCTCGCAGCGGCTCCAGAGGAGGCAGGCGAGTGAGC320GAGTCCGAGGGGTGGCCGGGGCAGGTGGTGGCGCCGCGAA360GATGGTCGCCAAGCAAAGGATCCGTATGGCCAACGAGAAG400CACAGCAAGAACATCACCCAGCGCGGCAACGTCGCCAAGA440CCTCGAGAAATGCCCCCGAAGAGAAGGCGTCTGTAGGACC480CTGGTTATTGGCTCTCTTCATTTTTGTTGTCTGTGGTTCT520GCAATTTTCCAGATTATTCAAAGTATCAGGATGGGCATGT560GAAGTGACTGACCTTAAGATGTTTCCATTCTCCTGTGAAT600TTTAACTTGAACTCATTCCTGATGTTTGATACCCTGGTTG640AAAACAATTCAGTAAAGCATCCTGCCTCAGAATGACTTTC680CTATCATGCTTCATGTGTCATTCCAAGGTTTCTTCATGAG720TCATTCCAAGTTTTCTAGTCCATACCACAGTGCCTTGCAA760AAAACACCACATGAATAAAGCAATAAAATTTGATTGTTAA800GATACAGTAGTGGACCCTACTTATTCAGTCAATTAAGAGT840AAGTTTTTTTATGTGGTTATTAAAACAGTATGAACAATTA880GTCTAACTCTGCATAGACAGGGTCTAGATTTTGTTAACCC920AAATGTATAACTGCAGTTAGCTTAAATTACAATTTGAAGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。