基因總覽
SERINC3（serine incorporator 3）是人類的蛋白質編碼基因，其產物為一種參與膜脂運輸的蛋白質。現有資料將 SERINC3 描述為不依賴 ATP 的非專一性脂質轉運蛋白，作用對象包括 phosphatidylserine、phosphatidylcholine 與 phosphatidylethanolamine。來源並指出，這種膜脂運輸特性與限制 HIV-1 等慢病毒感染力有關；具體作用方式與感染條件見下方功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000342374 ★ | 44,497,441–44,522,070 | 10 |
| ENST00001103309 | 44,496,219–44,522,094 | 10 |
| ENST00000411544 | 44,496,221–44,504,891 | 5 |
| ENST00000255175 | 44,496,224–44,522,094 | 11 |
| ENST00000885443 | 44,497,441–44,522,094 | 9 |
| ENST00000885444 | 44,497,441–44,522,094 | 10 |
| ENST00001132300 | 44,497,441–44,522,094 | 10 |
| ENST00000885445 | 44,497,445–44,522,094 | 9 |
| ENST00000930100 | 44,497,468–44,522,094 | 10 |
| ENST00000967986 | 44,498,768–44,522,094 | 8 |
| ENST00000885446 | 44,499,480–44,522,094 | 10 |
| ENST00000967987 | 44,499,482–44,522,094 | 8 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SERINC3 可作為限制因子，抑制 HIV-1 等慢病毒的感染力。資料指出，它作用於病毒感染的早期階段，會妨礙病毒粒子進入細胞質；因此其抗病毒作用發生在感染初期，而非僅由感染後的細胞反應所描述。
SERINC3 也具有不依賴 ATP 的非專一性磷脂轉運活性，能以 scramblase 的方式使脂質在膜的兩側雙向翻轉。其所轉運的磷脂包括 phosphatidylserine、phosphatidylcholine 和 phosphatidylethanolamine；相關活性資料分別記錄這些脂質可由膜的一側移至另一側，並未指定單一轉運方向。
在 HIV-1 上，磷脂翻轉會使 phosphatidylserine 暴露於病毒表面，並造成膜不對稱性喪失。這些變化與 HIV-1 Env 構形改變及病毒感染力下降相關。資料未將此作用限定為唯一抗病毒途徑，因此可將其視為所述磷脂轉運功能對病毒感染力的影響之一。
Promoter 與基因調控
>SERINC3 ENST00000342374 GRCh38 chr20:44521970-44523070 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACAATCCAGAAGGAATTCAATTATGAATCCCCTTCCAGAGAGTTTTATCTATCAGGGAAGATTAACACAC CACAGGAGAAGATATTGAAGTGTGACACCTTGTTGTCCGGACATCATCATTGTTTGCCACATTCCACCTA AACTATTATATGTGTAAGTAAAAAATGTTTTCATTTTCTTCTTTAAGTGAACTCTCAAATTTGACATGTA TTTTGAAAGGAATATTTACATCACTGCTTAAATGGGAAATCAGCATTGCTCGGAAGAAATGAAAAGGTTA TTGCTAACACACACCTCAAAACAAAACAATATTTTAAAACTGCAGGCATGGTTGCCTGTTTGAGAGATCT GGAAAATGAAGGCTTTACTCTGTTAGAAAGGGAGATAAATACTAGAAAAATGTTAAATACCATACTGGCC TCAAACAACTAGCCTGTTGGTTTGAAATGGGACGTTCTCACTCTGCTGTTTAATATCGCTTAATGTCCTT CATGCACCCTTAGAGCCATTCATTTTTCCCAAATGGGGTGCATCCCACATTTTAGGATACGATTTCCATC GTTTCTAGGTTAATTTGGACTCATCCTTTAGTTCGCAGATTAAAAAATAAATCCTTCAGAGAAGCCTTCC AAGACTACTGCCCAGCTAAATTACTTTCCCCTTACAATAGGAGGCACTAAATACACCTTTATTGAAAGCC TATTCCCCCATACTACTTCATCGTATTCATTACATTGGGGCACGGTGCATTTATGTTGTCAGATCTCCTA TTAACTAGAGAATAAATTCTGAGCGTACTGTGCCTCTCTGTACACTTCTGTAACTTCCAGATCTTTGCAC AATGAATACAAATGATGTAAGGAATGACACCTTCACAGTTCCTGCAACCCCAGGATGGTTTAGCCCCACC TTCCCCCTCAGCCAATGACAGGCGCCCCCCTCTGCCGCTCCGGTCGCGGACGGTGGGCGGGGCCACGCCG TGACGCATCCGTGCGTCTGTGGAAGGCTGCGTTTCCGGCCTGAGAAACCGTCATGTTTCTGGGGAGTCAC CTCAGCTGGCAGTTACCACCGTGTTAGAAAGCAGCCTCAGGACCGGCCACC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SERINC3_1 ↗ | 20:44,522,049 | 負股 | 44,522,039–44,522,098 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR20_BBSK7 · enhancer · 44521351–44522059 · regulatory
ENSR20_BBSKB · promoter · 44522060–44522575 · regulatory
ENSR20_5DGQ4Z · CTCF_binding_site · 44522122–44522143 · regulatory
ENSR20_5DGQ68 · CTCF_binding_site · 44522391–44522412 · regulatory
ENSR20_9MN6R · enhancer · 44526218–44526532 · regulatory
· motif · 44518441–44518447 · motif
· motif · 44521065–44521076 · motif
· motif · 44521066–44521077 · motif
· motif · 44521096–44521108 · motif
· motif · 44521197–44521219 · motif
· motif · 44521197–44521219 · motif
· motif · 44521600–44521613 · motif
· motif · 44521687–44521697 · motif
· motif · 44521750–44521767 · motif
· motif · 44521864–44521875 · motif
· motif · 44521866–44521881 · motif
· motif · 44521873–44521881 · motif
· motif · 44521873–44521890 · motif
· motif · 44522052–44522061 · motif
· motif · 44522124–44522140 · motif
· motif · 44522393–44522409 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：473 aa
SERINC3 蛋白長 473 個胺基酸，屬於 TDE1 family。序列註解標示七段螺旋型跨膜區，並在其間分布胞外與細胞質區段；其中較長的胞質區段位於第 261–329 位胺基酸。這些拓樸註解描述的是序列區域預測。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SERINC3 被標示為多次穿膜蛋白，位於細胞膜與 Golgi apparatus 膜；另有資料記載其位於細胞質的核周區域。 HIV-1 感染時，SERINC3 與 HIV-1 Nef 互作後可能被重新導向核周區域，因而被排除於病毒粒子之外，並妨礙其後續抗病毒防禦作用；此描述標示為可能性。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- GRNP28799 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PEX1O43933 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- WFS1O76024 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SERINC3 是限制因子，可抑制 HIV-1 等慢病毒的感染力，作用於感染早期並妨礙病毒粒子進入細胞質。它是不依賴 ATP 的非專一性脂質轉運蛋白，以 scramblase 方式雙向翻轉 phosphatidylserine、phosphatidylcholine 與 phosphatidylethanolamine。磷脂翻轉會使 HIV-1 表面暴露 phosphatidylserine、喪失膜不對稱性，並伴隨 Env 構形改變及感染力下降。 | 含實驗來源 | 證據與來源Restriction factor required to restrict infectivity of lentiviruses, such as HIV-1: acts by inhibiting an early step of viral infection. Impairs the penetration of the viral particle into the cytoplasm. Non-ATP-dependent, non-specific lipid transporter for phosphatidylserine, phosphatidylcholine, and phosphatidylethanolamine. Functions as a scramblase that flips lipids in both directions across the membrane. Phospholipid scrambling results in HIV-1 surface exposure of phosphatidylserine and loss of membrane asymmetry, which leads to changes in HIV-1 Env conformation and loss of infectivity PMID 26416733 ↗ · PMID 26416734 ↗ · PMID 37474505 ↗ |
| 分子活性 | a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine(in) = a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine(out) | 含實驗來源 | 證據與來源a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine(in) = a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phospho-L-serine(out) PMID 37474505 ↗ |
| 分子活性 | a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine(in) = a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine(out) | 含實驗來源 | 證據與來源a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine(in) = a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphocholine(out) PMID 37474505 ↗ |
| 分子活性 | a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine(in) = a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine(out) | 含實驗來源 | 證據與來源a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine(in) = a 1,2-diacyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine(out) PMID 37474505 ↗ |
| 細胞定位 | SERINC3 被標示為多次穿膜蛋白，定位於細胞膜及 Golgi apparatus 膜。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Golgi apparatus membrane / Multi-pass membrane protein PMID 37474505 ↗ |
| 細胞定位 | SERINC3 位於細胞質核周區域。HIV-1 感染時，與 HIV-1 Nef 互作後可能被重新導向核周區域，並因此被排除於病毒粒子之外，使後續抗病毒防禦作用受到阻止；此定位改變與效果為可能性描述。 | 推論支持 | 證據與來源Cytoplasm, perinuclear region; (Microbial infection) Upon HIV-1 infection, it is redirected to perinuclear region following interaction with HIV-1 Nef, excluding it from virions particles, thereby preventing subsequent antiviral defense activity (Probable) PMID 26416734 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GGAAGGCTGCGTTTCCGGCCTGAGAAACCGTCATGTTTCT40GGGGAGTCACCTCAGCTGGCAGTTACCACCGTGTTAGAAA80GCAGCCTCAGGACCGGCCACCTCCATCACTGGCGTCACCA120TGGGGGCTGTGCTGGGTGTCTTCTCCCTCGCCAGCTGGGT160TCCATGCCTCTGCAGCGGTGCCTCATGTTTGCTGTGTAGT200TGCTGTCCTAACAGTAAGAATTCCACGGTGACTCGCCTCA240TTTATGCTTTCATTCTCCTCCTGAGCACTGTCGTATCCTA280TATCATGCAGAGAAAAGAGATGGAAACTTACTTGAAGAAG320ATTCCTGGATTTTGTGAAGGGGGATTTAAAATCCATGAGG360CTGATATAAATGCAGATAAAGATTGTGATGTGCTGGTTGG400TTATAAAGCTGTGTATCGGATCAGCTTTGCCATGGCCATC440TTTTTCTTTGTCTTTTCTCTGCTCATGTTCAAAGTAAAAA480CAAGTAAAGATCTCCGAGCGGCAGTACACAATGGGTTTTG520GTTCTTCAAAATTGCTGCCCTTATTGGAATCATGGTTGGC560TCTTTCTACATCCCTGGGGGCTATTTCAGCTCAGTCTGGT600TTGTTGTTGGCATGATAGGGGCCGCCCTCTTCATCCTCAT640TCAGCTGGTGCTGCTGGTAGATTTTGCTCATTCTTGGAAT680GAATCATGGGTAAATCGAATGGAAGAAGGAAACCCAAGGT720TGTGGTATGCTGCTTTACTGTCTTTCACAAGCGCCTTTTA760TATCCTGTCAATCATCTGTGTCGGGCTGCTCTATACATAT800TACACCAAACCAGATGGCTGCACAGAAAACAAGTTCTTCA840TCAGTATTAACCTGATCCTTTGCGTTGTGGCTTCTATTAT880ATCGATCCACCCAAAAATTCAGGAACACCAGCCTCGCTCC920GGCCTCTTGCAGTCCTCCCTCATCACCCTCTACACTATGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。