基因總覽
SEMG2 是位於人類第 20 號染色體的蛋白質編碼基因,正式名稱為 semenogelin 2。其蛋白質產物屬於 semenogelin 家族,具有富含重複序列的區域,並含有多段預測為無序的區域。序列註解也標示了訊號序列,以及數個重複單元。這些基本特徵構成 semenogelin 2 的分子概貌;其在精液中的具體作用見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000372769 ★ | 45,221,373–45,224,458 | 3 |
| ENST00001134519 | 45,221,373–45,224,462 | 3 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
semenogelin 2 參與精液凝膠基質的形成。此基質也稱為精子凝塊,會包埋副性腺分泌物與射出的精子。來源描述的是 semenogelin 2 對凝膠基質形成的參與,以及該基質所包埋的成分;未進一步說明其分子作用方式、形成過程的調控條件,或凝膠基質後續變化。因此,現有資訊支持將其功能概括為參與精液中凝膠結構的形成,而不宜延伸推論其他生殖作用。
Promoter 與基因調控
>SEMG2 ENST00000372769 GRCh38 chr20:45220373-45221473 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AATGAACTGAAGTTGGCAAATATTCCTCACAGCCTGTTGGAGGGTTCAGCAGTTTATTACAGAAGTATGA AATGCTTTTATTTAAAAAATGTATTTTGGTAAATACATTTTTGTTTAGGTAAATATCATCAAATAATCCA ATTTGGAAACCAACATTCTTACTTCTTTTTCCAACAGTTGTTCCTATCATCATAAAAACATGTTAAATTT TTCTCATCCTTTCAAAAAATCTCTGGAGCTTACCTCACCCTCCAGATACAGCCTCACCTCTCATTCCACC ATGAAATCAGACTTCTTGAGATGGTTTCAGCTGGACTCCATCCTTCAACTGACAACCCAACACAACTGTA TTCATCTCTCGTTAACATTACTAGCAGTGAGTAACATCAGAAAGTTTTTGACACATGTTAGTCTTTTTTG TGATGAACTTCACAGATACATTTGACATTGGTATGCCTCATTTATTTGTTGAAATTTTTTTCTTTGGCTT CCATGAAGTTTCTTTCTCTTCTGTATCATTCTACTTCTATGACTGCTCCTTCTCGAGTAAAACAGAATGT GTCTCAGGATTACTTTAAAACAAGACAAAGTATAGAGTTATACCTAAAATTTAGTATTTAAGTTATTGGA TCAGAAAGGAAACTCGCATTTAGAGTATGAAGGCATTGTCAGCCACCAATTACTTTTGTAACCTGAAGCT AGTCTCCTTCCTACTCCGGACTGAATTTCTTCTGTATAATGCAAGCGATCTGGCATGATGATATACAAAG ACCGATAAAATTTTGCTGGGGATTCTGAAAGTAAAAAAAATTGCCTTTGATATTATGTCCCCATGCTAAG TCCCTGGGGACTTTGACATTATCCCCCACTGAGCAGGGGTGAGGAAGCTGGCATTTACTAATAAGCTATG AAAGGGCAGTGCCTTTTGACATTTCAGCTCCACCCATAGCACACCCACTCAAGGAACATATAAATGAAGA GATCCGCTCAGTTCTCAGACAAGATTTTTCAAGCAAGATGAAGTCCATCATCCTCTTTGTCCTTTCCCTG CTCCTTATCTTGGAGAAGCAAGCAGCTGTGATGGGACAAAAAGGTGAGTGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SEMG2_1 ↗ | 20:45,221,373 | 正股 | 45,221,324–45,221,383 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 45226264–45226273 · motif
· motif · 45226264–45226273 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:582 aa
semenogelin 2 長 582 個胺基酸,屬於 semenogelin 家族。其 N 端有訊號序列(第 1–23 位),第 70–559 位為富含重複序列的區域;其中標註數個重複單元,以及第 261–500 位的四個 60 胺基酸串聯重複。多段序列被註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
semenogelin 2 的定位註解為分泌。 來源未提供其在細胞內運輸或分泌後分布的條件與動態資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
semenogelin 2 與 SERPINA5 有互作註記。此資料支持兩者存在互作關係,但未說明互作是否代表特定複合體,也未提供其功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | semenogelin 2 參與精液凝膠基質(精子凝塊)的形成;此基質會包埋副性腺分泌物及射出的精子。資料未提供形成機制或其他功能細節。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Participates in the formation of a gel matrix (sperm coagulum) entrapping the accessory gland secretions and ejaculated spermatozoa |
| 交互作用 | semenogelin 2 與 SERPINA5 有互作關係;資料未進一步說明互作形式、發生條件或功能意義。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | Secreted | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AAGATTTTTCAAGCAAGATGAAGTCCATCATCCTCTTTGT40CCTTTCCCTGCTCCTTATCTTGGAGAAGCAAGCAGCTGTG80ATGGGACAAAAAGGTGGATCAAAAGGCCAATTGCCAAGCG120GATCTTCCCAATTTCCACATGGACAAAAGGGCCAGCACTA160TTTTGGACAAAAAGACCAACAACATACTAAATCCAAAGGC200AGTTTTTCTATTCAACACACATATCATGTAGACATCAATG240ATCATGACTGGACCCGAAAAAGTCAGCAATATGATTTGAA280TGCCCTACATAAGGCGACAAAATCAAAACAACACCTAGGT320GGAAGTCAACAACTGCTCAATTATAAACAAGAAGGCAGAG360ACCATGATAAATCAAAAGGTCATTTTCACATGATAGTTAT400ACATCATAAAGGAGGCCAAGCTCATCATGGGACACAAAAT440CCTTCTCAAGATCAGGGGAATAGCCCATCTGGAAAGGGAT480TATCCAGTCAATGTTCAAACACAGAAAAAAGGCTATGGGT520TCATGGACTAAGTAAAGAACAAGCTTCAGCCTCTGGTGCA560CAAAAAGGTAGAACACAAGGTGGATCCCAAAGCAGTTATG600TTCTCCAAACTGAAGAACTAGTAGTTAACAAACAACAACG640TGAGACTAAAAATTCTCATCAAAATAAAGGGCATTACCAA680AATGTGGTTGACGTGAGAGAGGAACATTCAAGTAAACTAC720AAACTTCACTCCATCCTGCACATCAAGACAGACTCCAACA760TGGACCCAAAGACATTTTTACTACCCAAGATGAGCTCCTA800GTATATAACAAGAATCAACACCAGACAAAAAATCTCAGTC840AAGATCAAGAGCATGGCCGGAAGGCACATAAAATATCATA880CCCGTCTTCACGTACAGAAGAAAGACAACTTCACCATGGA920GAAAAGAGTGTACAGAAAGATGTATCCAAAGGCAGCATTT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。