演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SEMG2SGII

semenogelin 2

SEMG2 編碼 semenogelin 2,屬於 semenogelin 家族;其產物參與精液中凝膠基質的形成。

Homo sapiens20q13.12UniProt Q02383
OFFICIAL SYMBOL
SEMG2
CHROMOSOME
20
UNIPROT
Q02383
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SEMG2 是位於人類第 20 號染色體的蛋白質編碼基因,正式名稱為 semenogelin 2。其蛋白質產物屬於 semenogelin 家族,具有富含重複序列的區域,並含有多段預測為無序的區域。序列註解也標示了訊號序列,以及數個重複單元。這些基本特徵構成 semenogelin 2 的分子概貌;其在精液中的具體作用見功能說明。

Official symbol
SEMG2
Gene name
semenogelin 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10743
UniProt
Q02383
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SGII

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2020q13.12
chr20 · 64,444,167 bp · GRCh38chr20p13 · 1–5100000 · gnegchr20p12.3 · 5100001–9200000 · gpos75chr20p12.2 · 9200001–12000000 · gnegchr20p12.1 · 12000001–17900000 · gpos75chr20p11.23 · 17900001–21300000 · gnegchr20p11.22 · 21300001–22300000 · gpos25chr20p11.21 · 22300001–25700000 · gnegchr20p11.1 · 25700001–28100000 · acenchr20q11.1 · 28100001–30400000 · acenchr20q11.21 · 30400001–33500000 · gnegchr20q11.22 · 33500001–35800000 · gpos25chr20q11.23 · 35800001–39000000 · gnegchr20q12 · 39000001–43100000 · gpos75chr20q13.11 · 43100001–43500000 · gnegchr20q13.12 · 43500001–47800000 · gpos25chr20q13.13 · 47800001–51200000 · gnegchr20q13.2 · 51200001–56400000 · gpos75chr20q13.31 · 56400001–57800000 · gnegchr20q13.32 · 57800001–59700000 · gpos50chr20q13.33 · 59700001–64444167 · gnegSEMG2pq1 bp64,444,167 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr20:45,221,373–45,224,462
Gene span
3,090 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000372769 ★45,221,373–45,224,4583
ENST0000113451945,221,373–45,224,4623

顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

semenogelin 2 參與精液凝膠基質的形成。此基質也稱為精子凝塊,會包埋副性腺分泌物與射出的精子。來源描述的是 semenogelin 2 對凝膠基質形成的參與,以及該基質所包埋的成分;未進一步說明其分子作用方式、形成過程的調控條件,或凝膠基質後續變化。因此,現有資訊支持將其功能概括為參與精液中凝膠結構的形成,而不宜延伸推論其他生殖作用。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 45221373 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SEMG2 ENST00000372769 GRCh38 chr20:45220373-45221473 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AATGAACTGAAGTTGGCAAATATTCCTCACAGCCTGTTGGAGGGTTCAGCAGTTTATTACAGAAGTATGA
AATGCTTTTATTTAAAAAATGTATTTTGGTAAATACATTTTTGTTTAGGTAAATATCATCAAATAATCCA
ATTTGGAAACCAACATTCTTACTTCTTTTTCCAACAGTTGTTCCTATCATCATAAAAACATGTTAAATTT
TTCTCATCCTTTCAAAAAATCTCTGGAGCTTACCTCACCCTCCAGATACAGCCTCACCTCTCATTCCACC
ATGAAATCAGACTTCTTGAGATGGTTTCAGCTGGACTCCATCCTTCAACTGACAACCCAACACAACTGTA
TTCATCTCTCGTTAACATTACTAGCAGTGAGTAACATCAGAAAGTTTTTGACACATGTTAGTCTTTTTTG
TGATGAACTTCACAGATACATTTGACATTGGTATGCCTCATTTATTTGTTGAAATTTTTTTCTTTGGCTT
CCATGAAGTTTCTTTCTCTTCTGTATCATTCTACTTCTATGACTGCTCCTTCTCGAGTAAAACAGAATGT
GTCTCAGGATTACTTTAAAACAAGACAAAGTATAGAGTTATACCTAAAATTTAGTATTTAAGTTATTGGA
TCAGAAAGGAAACTCGCATTTAGAGTATGAAGGCATTGTCAGCCACCAATTACTTTTGTAACCTGAAGCT
AGTCTCCTTCCTACTCCGGACTGAATTTCTTCTGTATAATGCAAGCGATCTGGCATGATGATATACAAAG
ACCGATAAAATTTTGCTGGGGATTCTGAAAGTAAAAAAAATTGCCTTTGATATTATGTCCCCATGCTAAG
TCCCTGGGGACTTTGACATTATCCCCCACTGAGCAGGGGTGAGGAAGCTGGCATTTACTAATAAGCTATG
AAAGGGCAGTGCCTTTTGACATTTCAGCTCCACCCATAGCACACCCACTCAAGGAACATATAAATGAAGA
GATCCGCTCAGTTCTCAGACAAGATTTTTCAAGCAAGATGAAGTCCATCATCCTCTTTGTCCTTTCCCTG
CTCCTTATCTTGGAGAAGCAAGCAGCTGTGATGGGACAAAAAGGTGAGTGG
SEMG2 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SEMG2_1 ↗20:45,221,373正股45,221,324–45,221,383

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

· motif · 45226264–45226273 · motif

· motif · 45226264–45226273 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:582 aa

1 aa582 aa功能區域重複區訊號胜肽
依 Q02383 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

semenogelin 2 長 582 個胺基酸,屬於 semenogelin 家族。其 N 端有訊號序列(第 1–23 位),第 70–559 位為富含重複序列的區域;其中標註數個重複單元,以及第 261–500 位的四個 60 胺基酸串聯重複。多段序列被註解為無序區域。

訊號胜肽1–23 aa
重複區3-170–129 aa
重複區2-1141–200 aa
重複區2-2201–260 aa
重複區3-2501–559 aa
功能區域Disordered24–59 aa
功能區域Repeat-rich region70–559 aa
功能區域Disordered132–160 aa
功能區域Disordered173–194 aa
功能區域Disordered228–248 aa
功能區域4 X 60 AA tandem repeats, type I261–500 aa
功能區域Disordered269–582 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q02383…

AlphaFold · Q02383

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

semenogelin 2 的定位註解為分泌。 來源未提供其在細胞內運輸或分泌後分布的條件與動態資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SGIISEMG2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

semenogelin 2 與 SERPINA5 有互作註記。此資料支持兩者存在互作關係,但未說明互作是否代表特定複合體,也未提供其功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能semenogelin 2 參與精液凝膠基質(精子凝塊)的形成;此基質會包埋副性腺分泌物及射出的精子。資料未提供形成機制或其他功能細節。資料庫紀錄
證據與來源

Participates in the formation of a gel matrix (sperm coagulum) entrapping the accessory gland secretions and ejaculated spermatozoa

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用semenogelin 2 與 SERPINA5 有互作關係;資料未進一步說明互作形式、發生條件或功能意義。含實驗來源
證據與來源

Interacts with SERPINA5

PMID 8665956 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted資料庫紀錄
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000372769 · 1,978 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AAGATTTTTCAAGCAAGATGAAGTCCATCATCCTCTTTGT40
41CCTTTCCCTGCTCCTTATCTTGGAGAAGCAAGCAGCTGTG80
81ATGGGACAAAAAGGTGGATCAAAAGGCCAATTGCCAAGCG120
121GATCTTCCCAATTTCCACATGGACAAAAGGGCCAGCACTA160
161TTTTGGACAAAAAGACCAACAACATACTAAATCCAAAGGC200
201AGTTTTTCTATTCAACACACATATCATGTAGACATCAATG240
241ATCATGACTGGACCCGAAAAAGTCAGCAATATGATTTGAA280
281TGCCCTACATAAGGCGACAAAATCAAAACAACACCTAGGT320
321GGAAGTCAACAACTGCTCAATTATAAACAAGAAGGCAGAG360
361ACCATGATAAATCAAAAGGTCATTTTCACATGATAGTTAT400
401ACATCATAAAGGAGGCCAAGCTCATCATGGGACACAAAAT440
441CCTTCTCAAGATCAGGGGAATAGCCCATCTGGAAAGGGAT480
481TATCCAGTCAATGTTCAAACACAGAAAAAAGGCTATGGGT520
521TCATGGACTAAGTAAAGAACAAGCTTCAGCCTCTGGTGCA560
561CAAAAAGGTAGAACACAAGGTGGATCCCAAAGCAGTTATG600
601TTCTCCAAACTGAAGAACTAGTAGTTAACAAACAACAACG640
641TGAGACTAAAAATTCTCATCAAAATAAAGGGCATTACCAA680
681AATGTGGTTGACGTGAGAGAGGAACATTCAAGTAAACTAC720
721AAACTTCACTCCATCCTGCACATCAAGACAGACTCCAACA760
761TGGACCCAAAGACATTTTTACTACCCAAGATGAGCTCCTA800
801GTATATAACAAGAATCAACACCAGACAAAAAATCTCAGTC840
841AAGATCAAGAGCATGGCCGGAAGGCACATAAAATATCATA880
881CCCGTCTTCACGTACAGAAGAAAGACAACTTCACCATGGA920
921GAAAAGAGTGTACAGAAAGATGTATCCAAAGGCAGCATTT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。