基因總覽
SEMA5B 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 semaphorin 5B，產物屬於 semaphorin 家族。現有資料將其可能角色概述為軸突導引的正向提示，表示它可能參與引導軸突的過程；此描述帶有推測性，不能視為已確立的作用。來源未提供更多可用於介紹其基本性質或家族特徵的資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000357599 ★ | 122,909,082–123,027,763 | 23 |
| ENST00000648990 | 122,908,722–123,027,878 | 22 |
| ENST00000650207 | 122,908,722–122,993,238 | 22 |
| ENST00000451055 | 122,908,722–122,976,134 | 23 |
| ENST00000616742 | 122,908,722–122,993,273 | 23 |
| ENST00000195173 | 122,908,722–123,027,812 | 22 |
| ENST00000907744 | 122,908,722–123,027,924 | 23 |
| ENST00000907745 | 122,908,722–123,027,903 | 22 |
| ENST00000907746 | 122,908,722–123,027,903 | 22 |
| ENST00000907747 | 122,908,722–122,969,731 | 23 |
| ENST00000936472 | 122,908,722–123,027,785 | 23 |
| ENST00000936473 | 122,908,722–123,027,772 | 23 |
顯示 12/26 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SEMA5B 的功能資料指出，它可能作為促進軸突導引的提示訊號。這項描述將其可能作用連結到軸突導引，但使用「可能」限定，因此目前只能表述為推測性功能，不能寫成已證實的作用。
現有資料沒有進一步說明 SEMA5B 如何產生或傳遞此提示、作用於哪些細胞或分子，也沒有提供實驗系統、調控條件或具體的軸突導引結果。因此，能據此概述的功能範圍僅限於它可能具有促進軸突導引的角色；不宜延伸推論其分子機制、作用位置或對其他生物過程的影響。
Promoter 與基因調控
>SEMA5B ENST00000357599 GRCh38 chr3:123027663-123028763 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CACCTTTTTTTACATTTTCAAATATATTTTTTGTTCAGCAGAGGGCTCCCTTCCCATCCCTCTTGCAGCC CGGGCAGCTAGGATTTGAAGCTTGCCCCTTGAATCTTTCTCTCCCGCCTTCTAGCCATCAGAAACACTAG ATCACTTAAACTTGTAAACAATTCGGCCTCGCTCCTTGTGATTGCGCTAAACCTTCCGTCCTCAGCTGAG AACGCTCCACCACCTCCCCGGATCGCTCATCTCTTGGCTGCCCTCCCACTGTTCCTGATGTTATTTTACT CCCCGTATCCCCTACTCGTTCTTCACAATTCTGTAGGGTGCGTATTACTAACCCCAGTTTACAGCTGAGG AAACTGAGGCTTGGAGAGGTTCGCTCGGTATCGTACAGTTTGCAAGGTTAACCCTAATCCGGCCAGTTCT GGCTTTCCAGCCCAGCCCAGCAGCCTAGCCTCCCTCTCTGCCGCTGCAGGTTATAACGGCTCTCCCCCGT TTTACACGAGGTCCCTTCCCCTTCAAATCCACAGGCAGGAAGATCGTTCCGAACTGACGGGGCTGGGGAA TGTGGGAGTCCGGAGTGGGGTTTGGGGGAGCTTCCTCAGGCCCTGAGTGTTGGGGTGGGCAGGCCGCGCC GATGGCCCTCGGGGATGTCACATTCGAGATGGGGTGACCGAGAACGGCAAGGCGGGATGTGGCAAACGGC GGCAAGTGCTCGGAGTCCTAGGTCTTGCCGCCGGAATGCCGGCCGGGGAAGGGGCTTCGGCCCACCGGGC TGGTCACCACACTCGGCAGGCCCGGGGCGGGAGTCGGCCGAGCAGCCGCGGGATGCAGGGCGCCCCCTCG CGCTCCTCCGCGCGCCTCGAGGCTGGCGGGTGCAGCGCCCGCCGCGGCAGGTCTGCTCCAGCCCCCTCCT CTTTTTCGCTCCCGCTCCCCTCCTTCTCTCCCTTTGCTTGCAACTCCTCCCCCACCGCCCCCTCCCTCCT TCTGCTCCCGCGGTCTCCTCCTCCCTGCTCTCTCCGAGCGCCGGGTCGGGAGCTAGTTGGAGCGCGGGGG TTGGTGCCAGAGCCCAGCTCCGCCGAGCCGGGCGGGTCGGCAGCGCATCCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SEMA5B_2 ↗ | 3:122,997,503 | 負股 | 122,997,493–122,997,552 |
| SEMA5B_1 ↗ | 3:123,027,729 | 負股 | 123,027,719–123,027,778 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_CG7LH · enhancer · 123025977–123027752 · regulatory
ENSR3_BWF87 · promoter · 123027753–123028368 · regulatory
ENSR3_533XBBP · CTCF_binding_site · 123027917–123027938 · regulatory
· motif · 123026304–123026314 · motif
· motif · 123026390–123026400 · motif
· motif · 123026448–123026458 · motif
· motif · 123026454–123026464 · motif
· motif · 123026462–123026472 · motif
· motif · 123027919–123027935 · motif
· motif · 123032206–123032220 · motif
· motif · 123032207–123032220 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1151 aa
semaphorin 5B 為 1151 個胺基酸的蛋白質，屬於 semaphorin 家族。其胞外區含有 Sema、PSI 與五個 TSP type-1 結構域；另有一段跨膜螺旋，以及位於膜內側的細胞質區。這些區域與結構域為序列註解所預測。
蛋白質三維結構
細胞內定位
semaphorin 5B 被註記為膜蛋白，屬於單次穿膜的 type III 膜蛋白。 其拓樸註解為大部分區段位於細胞外，並由跨膜區連接細胞質區。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
CTCCCTGCTCTCTCCGAGCGCCGGGTCGGGAGCTAGTTGG40AGCGCGGGGGTTGGTGCCAGAGCCCAGCTCCGCCGAGCCG80GGCGGGTCGGCAGCGCATCCAGCGGCTGCTGGGAGCCCGA120GCGCAGCGGGCGCGGGCCCGGGTGGGGACTGCACCGGAGC160GCTGAGAGCTGGAGGCCGTTCCTGCGCGGCCGCCCCATTC200CCAGACCGGCCGCCAGCCCATCTGGTTAGCTCCCGCCGCT240CCGCGCCGCCCGGGAGTCGGGAGCCGCGGGGAACCGGGCA280CCTGCACCCGCCTCTGGGAGTGAGTGGTTCCAGCTGGTGC320CTGGCCTGTGTCTCTTGGATGCCCTGTGGCTTCAGTCCGT360CTCCTGTTGCCCACCACCTCGTCCCTGGGCCGCCTGATAC400CCCAGCCCAACAGCTAAGGTGTGGATGGACAGTAGGGGGC440TGGCTTCTCTCACTGGTCAGGGGTCTTCTCCCCTGTCTGC480CTCCCGGAGCTAGGACTGCAGAGGGGCCTATCATGGTGCT520TGCAGGCCCCCTGGCTGTCTCGCTGTTGCTGCCCAGCCTC560ACACTGCTGGTGTCCCACCTCTCCAGCTCCCAGGATGTCT600CCAGTGAGCCCAGCAGTGAGCAGCAGCTGTGCGCCCTTAG640CAAGCACCCCACCGTGGCCTTTGAAGACCTGCAGCCGTGG680GTCTCTAACTTCACCTACCCTGGAGCCCGGGATTTCTCCC720AGCTGGCTTTGGACCCCTCCGGGAACCAGCTCATCGTGGG760AGCCAGGAACTACCTCTTCAGACTCAGCCTTGCCAATGTC800TCTCTTCTTCAGGCCACAGAGTGGGCCTCCAGTGAGGACA840CGCGCCGCTCCTGCCAAAGCAAAGGGAAGACTGAGGAGGA880GTGTCAGAACTACGTGCGAGTCCTGATCGTCGCCGGCCGG920AAGGTGTTCATGTGTGGAACCAATGCCTTTTCCCCCATGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。