基因總覽
SEMA4B 是位於人類第 15 號染色體的蛋白質編碼基因，正式名稱為 semaphorin 4B。其產物 Semaphorin-4B 屬於 semaphorin 家族，來源資料指出它能提供局部訊號，與界定生長中軸突不能進入的區域相關。現有資料未提供更多關於其一般生物學角色或不同形式的資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000411539 ★ | 90,201,330–90,229,660 | 14 |
| ENST00000559322 | 90,160,604–90,217,786 | 4 |
| ENST00000864015 | 90,184,410–90,229,670 | 15 |
| ENST00000864016 | 90,184,454–90,229,670 | 15 |
| ENST00000332496 | 90,184,895–90,229,670 | 15 |
| ENST00000864017 | 90,184,895–90,229,670 | 14 |
| ENST00000864018 | 90,184,895–90,229,670 | 15 |
| ENST00000947039 | 90,184,895–90,229,670 | 14 |
| ENST00001029050 | 90,184,895–90,229,670 | 14 |
| ENST00001029051 | 90,184,895–90,229,670 | 11 |
| ENST00001110215 | 90,184,895–90,229,670 | 15 |
| ENST00001112639 | 90,184,895–90,206,987 | 2 |
顯示 12/24 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Semaphorin-4B 的已註記作用與軸突生長有關：它可抑制軸突延伸，並透過局部訊號指定生長中軸突無法進入的區域。這表示其功能描述著重於在局部環境中界定軸突可延伸的範圍，而非單純指出軸突延伸受到抑制。
來源資料未進一步說明此訊號如何被接收、由哪些分子步驟傳遞，或在何種實驗與生物情境中觀察到這項作用。因此，能確定的功能範圍限於軸突延伸抑制，以及局部訊號對軸突不可進入區域的指定；不宜據此推定其他調控機制或生物學結果。
Promoter 與基因調控
>SEMA4B ENST00000411539 GRCh38 chr15:90200330-90201430 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCTTTCACTCTTTTGGACTCTTAACTACAGGAGGAACTACTACATTTTTCTGTAATCCTGTGCACACTTA GGAAAAGTTGAAGTAGCTTTCCCAAAATTACTTATCCTTTGAGATTATTGCTTAGATAGTTTCTATGTTT TGTTTGTTTCTTAATGCTGTTGGGATCCACTAAATTGATTTCAGAATCTGCTAATGGTCCAGGCTGCAGT TGGAAACCCCTGGTCTCAGCAGAGCTGAACTCCACCCGTGGAGATGTTAGGAGCCAGGAGGATTAGGGGT GGGTGCCTCTGGGCTTCCACTCCAGTCTTAGGGGTTCCCTTCCCCTGCCGGGTCACGTGCAGGTTGTGAA GGTTTTACCTCCTCAGCAGTACATTAAATCCTATTATCCCACTTAAGCTAATCTTGCCCTTCCCCCACCC GAGGGCTTCGCGTGGACAGAATATTAAGCGGACAAGCCCGCAGGGTGCCTAGACTAAGTGCTGAGCTTGT AGTGAATGCCCAGCCATGACTTGCAGTGGATTGACCTGTGCAAAAATTGGACTCTCAAGCTGCTAGCCCC AGTGTCAGCACGAGCTCGGCCGAGTTCATTTGGTCGCAGGAACAAGGGGGTCGCCAGGAGCAAGAGCGGA GGGGGCGCCTAAAGGGAGGAGACCAAGGCCTAATCACCATCCGCCCCCTAACTCCCTAGGCGCATAGCGG GGACGCAGCGTGTCCCCAAACCAACGCCACTAGCAGAGGGTCCCAGAGGAGCCGGAAGGGGCCAGGGCCT GGGCGGCGGTGGGAGGGTCTGAGCAGTGGGGGCGGGGAGCTGGGGGTCGGCTTTCGTCCGCGTCCCAGCG CTCCGGCGGCCGCCGGGGCTACTGATCCCGGGCTTGGCCCCTGCGGCAGCGCCCCGAGCTGCCGCCCCTC GCGCTGCCAGCGCCCGGGAAGGAGGAAGGGGGAAGGGGGCGGGCCGGCCGGGCTCACGGCCGACTTCCTC CTTCAGCCCCGCCCTCCGCCGCTTGCGGGTGAGCTCTGCCCAAGCCGAGGCTGCGGGGCCGGCGCCGGCG GGAGGACTGCGGTGCCCCGCGGAGGGGCTGAGTTTGCCAGGGCCCACTTGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SEMA4B_2 ↗ | 15:90,184,920 | 正股 | 90,184,871–90,184,930 |
| SEMA4B_1 ↗ | 15:90,201,330 | 正股 | 90,201,281–90,201,340 |
| SEMA4B_3 ↗ | 15:90,201,558 | 正股 | 90,201,509–90,201,568 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR15_93BRM3 · enhancer · 90198180–90198449 · regulatory
ENSR15_93BRMT · promoter · 90200840–90201340 · regulatory
ENSR15_93BRNP · enhancer · 90203966–90204255 · regulatory
ENSR15_84MLFK · enhancer · 90205949–90206128 · regulatory
· motif · 90196406–90196415 · motif
· motif · 90198275–90198289 · motif
· motif · 90198282–90198293 · motif
· motif · 90198431–90198442 · motif
· motif · 90200661–90200670 · motif
· motif · 90200661–90200670 · motif
· motif · 90201078–90201089 · motif
· motif · 90201080–90201089 · motif
· motif · 90201301–90201312 · motif
· motif · 90201301–90201312 · motif
· motif · 90201301–90201314 · motif
· motif · 90201325–90201340 · motif
· motif · 90201424–90201436 · motif
· motif · 90201427–90201434 · motif
· motif · 90201931–90201951 · motif
· motif · 90202876–90202887 · motif
· motif · 90202966–90202980 · motif
· motif · 90204102–90204115 · motif
· motif · 90204102–90204115 · motif
· motif · 90206047–90206056 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：837 aa
Semaphorin-4B 長 837 個胺基酸，具有 N 端訊號胜肽（第 1–43 位）及胞外區（第 44–717 位）。胞外區包含 Sema 結構域（第 47–523 位）、PSI 結構域（第 525–579 位）與 Ig-like C2-type 結構域（第 604–663 位）。其單一螺旋跨膜區位於第 718–738 位，後接胞質區（第 739–837 位）；胞質區第 767–805 位註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Semaphorin-4B 被註記為膜蛋白，具有單次穿膜的第一型膜蛋白拓撲。 資料未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- 7bP0DTD8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | Semaphorin-4B 可抑制軸突延伸，並以局部訊號指定生長中軸突無法進入的區域。這項描述指出其作用同時涉及限制軸突延伸與界定軸突不可進入的局部範圍；來源未說明具體訊號傳遞機制或其他實驗條件。 | 推論支持 | 證據與來源Inhibits axonal extension by providing local signals to specify territories inaccessible for growing axons |
| 細胞定位 | Semaphorin-4B 位於膜上，並被分類為單次穿膜的第一型膜蛋白。此註記描述其膜拓撲；來源未提供定位變化條件、異構型差異或其他細胞內定位資訊。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
GCTTGCGGGTGAGCTCTGCCCAAGCCGAGGCTGCGGGGCC40GGCGCCGGCGGGAGGACTGCGGTGCCCCGCGGAGGGGCTG80AGTTTGCCAGGGCCCACTTGACCCTGTTTCCCACCTCCCG120CCCCCCAGGTCCGGAGGCGGGGGCCCCCGGGGCGACTCGG160GGGCGGACCGCGGGGCGGAGCTGCCGCCCGTGAGTCCGGC200CGAGCCACCTGAGCCCGAGCCGCGGGACACCGTCGCTCCT240GCTCTCCGAATGCTGCGCACCGCGATGGGCCTGAGGAGCT280GGCTCGCCGCCCCATGGGGCGCGCTGCCGCCTCGGCCACC320GCTGCTGCTGCTCCTGCTGCTGCTGCTCCTGCTGCAGCCG360CCGCCTCCGACCTGGGCGCTCAGCCCCCGGATCAGCCTGC400CTCTGGGCTCTGAAGAGCGGCCATTCCTCAGATTCGAAGC440TGAACACATCTCCAACTACACAGCCCTTCTGCTGAGCAGG480GATGGCAGGACCCTGTACGTGGGTGCTCGAGAGGCCCTCT520TTGCACTCAGTAGCAACCTCAGCTTCCTGCCAGGCGGGGA560GTACCAGGAGCTGCTTTGGGGTGCAGACGCAGAGAAGAAA600CAGCAGTGCAGCTTCAAGGGCAAGGACCCACAGCGCGACT640GTCAAAACTACATCAAGATCCTCCTGCCGCTCAGCGGCAG680TCACCTGTTCACCTGTGGCACAGCAGCCTTCAGCCCCATG720TGTACCTACATCAACATGGAGAACTTCACCCTGGCAAGGG760ACGAGAAGGGGAATGTCCTCCTGGAAGATGGCAAGGGCCG800TTGTCCCTTCGACCCGAATTTCAAGTCCACTGCCCTGGTG840GTTGATGGCGAGCTCTACACTGGAACAGTCAGCAGCTTCC880AAGGGAATGACCCGGCCATCTCGCGGAGCCAAAGCCTTCG920CCCCACCAAGACCGAGAGCTCCCTCAACTGGCTGCAAGAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。