基因總覽
SEMA3F 是蛋白質編碼基因，其產物 semaphorin 3F 屬於 semaphorin family。這項來源提供的基本資訊涵蓋其家族歸屬與可能涉及的細胞活動，並指出其蛋白質含有 Sema 結構域與 Ig-like C2-type 結構域，呈現出可辨識的區域組成。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000002829 ★ | 50,155,324–50,189,075 | 19 |
| ENST00000858140 | 50,155,012–50,189,075 | 19 |
| ENST00000923328 | 50,155,012–50,189,075 | 18 |
| ENST00000414301 | 50,155,045–50,182,766 | 8 |
| ENST00000923330 | 50,155,051–50,189,075 | 19 |
| ENST00001144992 | 50,155,051–50,189,075 | 19 |
| ENST00000450338 | 50,155,059–50,183,563 | 11 |
| ENST00000413852 | 50,155,091–50,189,075 | 18 |
| ENST00000923329 | 50,155,098–50,189,075 | 19 |
| ENST00000961513 | 50,155,098–50,189,075 | 18 |
| ENST00000426511 | 50,155,411–50,173,956 | 3 |
| ENST00000923331 | 50,156,785–50,189,075 | 19 |
顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
現有功能註解指出，SEMA3F 的產物可能參與細胞運動與細胞黏附。這項描述涵蓋兩種不同的細胞層級活動：一是細胞移動，另一是細胞與細胞或周遭環境之間的黏附。來源僅以「可能」表述其角色，並未提供具體作用機制或實驗條件，因此不能據此判定它如何調節這些過程，也不宜將其寫成已確立的直接作用。
細胞運動與黏附是來源所列的功能範圍，但現有資料未進一步說明兩者之間是否存在因果關係，或 semaphorin 3F 是否直接作用於相關分子。也沒有提供特定細胞類型、生物學情境、調控方向或作用強度等細節。因此，對 SEMA3F 功能的說明應限於其可能涉及這兩項細胞活動；目前資料不足以延伸描述分子步驟或更廣泛的生理結果。
Promoter 與基因調控
>SEMA3F ENST00000002829 GRCh38 chr3:50154324-50155424 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATCACCAGGCCATTTGAAAGCAAATGTCCCCTTGAGGAGAGAAGGTGCTAGCTGATCTGGCCTCTCTAAG GTATGGAACTATAAGGAGAGTCTGTGGGAGCTGCTGGCCTGAAATAAGGGCTGGCGATTGAGGCGATCAC GGGGAGTCGTTGAATGGCTGGAGAGAGCTGTGTGGCTGGGCTGCCCCCGACCTGGCCTAGGCTGGAGGCT GAGCCCGCGGGAAGGTCCGGCGGTGCCAGCCGTCCCAGGGGCTGCACCGCCACCTGCTGAGCAGCCCGGG CAGTCAGGGGTCCTGCGCCGCGGGGCCCACGCACGGGACCAGGGGCACGGCCGGCGGCGAGTGGGAATGA GGGACGCGGAAGGGGGTGCTCAGGTGAGCGCAGGCTCGTTGCTCCCTGGCGCTGCAGCCCTTCTCGCCAG GGAGTTGAATGCCCGGGTAAACACCAGGCGCGATGTGTGCGGTGTATTCACAGAGAGACAAAGCCAGGGC GGGGCGGGGGCGCCGCCCGCGAAGCGGGGGCGGGGGCGAGGGGTGCAGACTAGTCTCCCCCGGCGCGGGG TGCCCACCGCCTGGGAACCCTGAGCCCGGCCCACGGACAGGTGGAGCGGGGGCGGGGCGGTGGCTGGGCG GGTCCCGCCCCGGGGGTGGGGCTGGGCGGGCCGGGCGGGGCGGGGCTGCGCTATGCAAATGTCGCCCACG GGCGGCCAATTGCCGGCGCTCCCCGCGCGGCTCTGAGCGCCCCGTCCCGCCGGCGGCCGCGAGACCAGAG CGAGCGAACGAACCGCGGCGGTCCGGAGAGCCCCGAGCGCAGCGCAGGACCTGGGTACGCCGCGAGGAAC CGTGCAGCCCAGCGCGGCCGCCCGGCCCGGGTCCAGCAGCCAGGAGAGCGCAGCGCTTCGAAGCCGAGTG CGCGCCACCGCCCGCGCCCCGCGCTGGGGAATGCGCCCTCGGCGCGCCGGCCAGGGGGCGCCCGCAGCCC ACCCCAGGGGAGGCGGCCCCGAGCGCCCCTGAGCCTTCCCATGGCCCGGGCTGGGGCCCGGGCCCTCGGC TGCTGACGCGCCCGAAGCCCGCGGAACCGGTTAAGCCGCGGCCGCGGCGCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SEMA3F_1 ↗ | 3:50,155,058 | 正股 | 50,155,009–50,155,068 |
| SEMA3F_2 ↗ | 3:50,155,266 | 正股 | 50,155,217–50,155,276 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_9PWG3 · enhancer · 50149929–50150414 · regulatory
ENSR3_C6ZCS · enhancer · 50150595–50152080 · regulatory
ENSR3_5FRH9H · CTCF_binding_site · 50150978–50150999 · regulatory
ENSR3_5FRHT4 · CTCF_binding_site · 50154344–50154365 · regulatory
ENSR3_5FRHW6 · CTCF_binding_site · 50154577–50154598 · regulatory
ENSR3_BCXQ7 · promoter · 50154601–50155334 · regulatory
ENSR3_BCXQB · enhancer · 50155335–50156074 · regulatory
ENSR3_9PWHS · promoter · 50156075–50156575 · regulatory
ENSR3_BCXQM · enhancer · 50157576–50158573 · regulatory
ENSR3_5FRJM5 · CTCF_binding_site · 50158893–50158914 · regulatory
· motif · 50150980–50150996 · motif
· motif · 50154346–50154362 · motif
· motif · 50154579–50154595 · motif
· motif · 50154814–50154827 · motif
· motif · 50154834–50154847 · motif
· motif · 50154840–50154853 · motif
· motif · 50154926–50154939 · motif
· motif · 50155014–50155027 · motif
· motif · 50155607–50155622 · motif
· motif · 50155800–50155807 · motif
· motif · 50156744–50156755 · motif
· motif · 50156744–50156755 · motif
· motif · 50156746–50156755 · motif
· motif · 50156934–50156945 · motif
· motif · 50158895–50158911 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：785 aa
semaphorin 3F 長 785 個胺基酸，屬於 semaphorin family。其第 1–18 位胺基酸為訊號序列；第 31–545 位構成 Sema 結構域，第 605–690 位為 Ig-like C2-type 結構域。第 752–785 位則註解為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源將 semaphorin 3F 註記為分泌型蛋白質，表示其定位資訊指向分泌，而非提供細胞內特定胞器的位置。 資料未說明分泌的條件或動態變化。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GAGCGCCCCTGAGCCTTCCCATGGCCCGGGCTGGGGCCCG40GGCCCTCGGCTGCTGACGCGCCCGAAGCCCGCGGAACCGG80TTAAGCCGCGGCCGCGGCGCCGATCCCGGCTGAGGCGCAG120CGGCGAGAGGTCGCGGGCAGGGCCATGGCCCCGGGGGGCC160GCTAGCGCGGACCGGCCCAACGGGAGCCGCTCCGTGCCGC200CGCCGCCGCCCGGGCGCCCAGGCCCCGCCGCTGCGGAAGA240GGTTTCTAGAGAGTGGAGCCTGCTTCCTGGGCCCTAGGCC280CCTCCCACAATGCTTGTCGCCGGTCTTCTTCTCTGGGCTT320CCCTACTGACCGGGGCCTGGCCATCCTTCCCCACCCAGGA360CCACCTCCCGGCCACGCCCCGGGTCCGGCTCTCATTCAAA400GAGCTGAAGGCCACAGGCACCGCCCACTTCTTCAACTTCC440TGCTCAACACAACCGACTACCGAATCTTGCTCAAGGACGA480GGACCACGACCGCATGTACGTGGGCAGCAAGGACTACGTG520CTGTCCCTGGACCTGCACGACATCAACCGCGAGCCCCTCA560TTATACACTGGGCAGCCTCCCCACAGCGCATCGAGGAATG600CGTGCTCTCAGGCAAGGATGTCAACGGCGAGTGTGGGAAC640TTCGTCAGGCTCATCCAGCCCTGGAACCGAACACACCTGT680ATGTGTGCGGGACAGGTGCCTACAACCCCATGTGCACCTA720TGTGAACCGCGGACGCCGCGCCCAGGCCACACCATGGACC760CAGACTCAGGCGGTCAGAGGCCGCGGCAGCAGAGCCACGG800ATGGTGCCCTCCGCCCGATGCCCACAGCCCCACGCCAGGA840TTACATCTTCTACCTGGAGCCTGAGCGACTCGAGTCAGGG880AAGGGCAAGTGTCCGTACGATCCCAAGCTGGACACAGCAT920CGGCCCTCATCAATGAGGAGCTCTATGCTGGTGTGTACAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。