基因總覽
SELPLG 是蛋白質編碼基因，產生的 selectin P ligand 為 SLe(x)-type proteoglycan。其蛋白質具有單次穿膜的第一型膜蛋白架構，包含細胞外區、跨膜區與細胞質區；細胞外區含有串聯重複序列。這些基本特徵構成其與 selectins 及其他分子發生作用的分子背景。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000550948 ★ | 108,621,895–108,633,894 | 2 |
| ENST00000228463 | 108,620,413–108,632,087 | 2 |
| ENST00000884614 | 108,620,413–108,630,677 | 2 |
| ENST00000884615 | 108,620,413–108,630,666 | 2 |
| ENST00000942795 | 108,620,413–108,633,828 | 2 |
| ENST00001137659 | 108,620,413–108,633,894 | 2 |
| ENST00000388962 | 108,622,280–108,624,330 | 2 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SELPLG 的產物是 SLe(x)-type proteoglycan，可透過與 E-selectin、P-selectin 和 L-selectin 的高親和力、鈣離子依賴性相互作用，促進白血球在血管表面的快速滾動。這項作用發生於發炎反應初期，並對白血球最初被捕捉至關重要。
在白血球募集過程中，SELPLG 與 selectins 的作用涉及對方的 lectin/EGF domains。相互作用需要 sialyl Lewis X 糖基修飾；對酪胺酸硫酸化的依賴則因 selectin 類型而異。相關硫酸化位點與結合親和力的差異，進一步區分了 SELPLG 與不同 selectin 的作用方式。
SELPLG 也與感染相關：它可作為 enterovirus 71 的受體。此功能與其促進白血球滾動的作用不同，反映 SELPLG 除參與發炎初期的白血球募集外，也能與特定病毒發生受體關係。
Promoter 與基因調控
>SELPLG ENST00000550948 GRCh38 chr12:108633794-108634894 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCAAGGCAAGATATGAGTATCTTTCTGTGCATGTCCTGAGCCCTTGCCTGGTGCAAAGCCGCAGGGCAGA TCCTGGGAGACCCCCCTATTCCCTCCCTTCTGGAAGTGTCTGGGTATTCTTAGGCCTCCCAGCCTTTGCC TCTGCTGTGCTCTCTGCCTGGGATGCCCACCTGGCTTGTCATCTCAAGTGCCACTTCTTGGAAGCTCCTC CTGTTAACCTCCCTCCCCCACCCAGGATGGAAGGAGAGGCCCCTCCCTTGCTCACCGCAGGATGGCACTC ACTGCGCTGTGTCATTGTGGCATGATGTTCCACCGAATTGTTTACTCGCTGGCCTCCCCATTGGATGGAG GGCTACCAGAGGGCCACAGCCCAGAATTGCTGGCCTTTAGACCTCAGGGCATGCAGTCTGGAGTGCCAGA GTTGGTCAAATGAACAAATTTAGGATGAAGAAATAAGATAAGCAGGACTTGCCCTTGTGGTATCTGTAGT CCAGCTCCCTAGAGAGGCTCTTGGTTGCAGCTGAAAGGGCCTGTGCTGTGCATCTACAGAGAGTGTTTTG AGTCCTGCGAGAAGAAATACACCATATTTGCAAACCCTTTGAAGGTTCATATTTTGTGTTTTTTGCTCCC TGACCACCTCCCACCCCTCCCCACGCCCCACCAATCTTGGGCAAGAAGCGAGACCATTCTCCTTTTTCTC TGGTCACTCCTGTCCTTCAGGGGGCTCCCTCTGGCCCCGACTGTCCATTGCTGCTGAAGTAATGCTGTGG CCTTTCTCAGTTTGGGCCCCACCCAAAACCGAAGAACTTCTCCCCAGAAAGCTTCTACTTGGTTCTCAGT GTTTTCACAGTTATGGGAACCCAAGAACAGTGTCAGACCTAGGAGGTGCCCCACTACCACCCTGTCTTTA TCAATGTTGTCACCAAAGCTGTCACAAACAATGGGGTGTGGGCTGTCACATGGCCCTGCCTAAGTAACCA CATTCTCGCTTCCTCCTTCCACACACAGCCATTGGGGGTTGCTCGGATCCGGGACTGCCGCAGGGGGTGC CACAGCAGTGCCTGGCAGCGTGGGCTGGGACCTTGTCACTAAAGCAGAGAA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SELPLG_1 ↗ | 12:108,633,894 | 負股 | 108,633,884–108,633,943 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR12_5XJTTG · CTCF_binding_site · 108631892–108631913 · regulatory
ENSR12_5XJTTW · CTCF_binding_site · 108631985–108632006 · regulatory
ENSR12_93L56X · promoter · 108632068–108632568 · regulatory
ENSR12_BRK4M · enhancer · 108633106–108633883 · regulatory
ENSR12_93L57G · promoter · 108633884–108634139 · regulatory
ENSR12_8578F3 · enhancer · 108634140–108634357 · regulatory
ENSR12_5XJWC4 · CTCF_binding_site · 108634614–108634635 · regulatory
ENSR12_5XJWG9 · CTCF_binding_site · 108635304–108635325 · regulatory
ENSR12_93L57W · promoter · 108635358–108635859 · regulatory
ENSR12_BRK53 · enhancer · 108635860–108636689 · regulatory
ENSR12_D7DJB · enhancer · 108637066–108639330 · regulatory
ENSR12_5XJWZ2 · CTCF_binding_site · 108638276–108638297 · regulatory
· motif · 108629803–108629818 · motif
· motif · 108629940–108629953 · motif
· motif · 108629940–108629953 · motif
· motif · 108630734–108630745 · motif
· motif · 108631044–108631057 · motif
· motif · 108631044–108631057 · motif
· motif · 108631045–108631058 · motif
· motif · 108631045–108631058 · motif
· motif · 108631122–108631131 · motif
· motif · 108631122–108631131 · motif
· motif · 108631132–108631144 · motif
· motif · 108631141–108631153 · motif
· motif · 108631271–108631282 · motif
· motif · 108631612–108631620 · motif
· motif · 108631894–108631910 · motif
· motif · 108631987–108632003 · motif
· motif · 108632313–108632333 · motif
· motif · 108633235–108633247 · motif
· motif · 108633558–108633573 · motif
· motif · 108633616–108633625 · motif
· motif · 108633714–108633722 · motif
· motif · 108633817–108633830 · motif
· motif · 108633895–108633908 · motif
· motif · 108633936–108633949 · motif
· motif · 108633960–108633973 · motif
· motif · 108634002–108634024 · motif
· motif · 108634002–108634024 · motif
· motif · 108634388–108634401 · motif
· motif · 108634388–108634401 · motif
· motif · 108634403–108634420 · motif
· motif · 108634433–108634439 · motif
· motif · 108634616–108634632 · motif
· motif · 108635125–108635140 · motif
· motif · 108635243–108635252 · motif
· motif · 108635306–108635322 · motif
· motif · 108635522–108635531 · motif
· motif · 108635522–108635531 · motif
· motif · 108636325–108636333 · motif
· motif · 108636336–108636358 · motif
· motif · 108636336–108636358 · motif
· motif · 108636657–108636668 · motif
· motif · 108637763–108637776 · motif
· motif · 108637763–108637776 · motif
· motif · 108638278–108638294 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：412 aa
SELPLG 蛋白質長 412 個胺基酸，N 端含訊號胜肽（第 1–17 位）；細胞外區位於第 18–320 位，跨膜螺旋位於第 321–341 位，細胞質區為第 342–412 位。細胞外區第 122–261 位包含 12 組、每組 10 個胺基酸的串聯重複；另有多段被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SELPLG 是單次穿膜的第一型膜蛋白，定位於膜。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- SELPP16109 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- SNX20Q7Z614 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
SELPLG 可形成以雙硫鍵連結的同源二聚體，但二聚化似乎不是與 P-selectin 結合所必需。它與 P-selectin、E-selectin、L-selectin 的 lectin/EGF domains 相互作用；這些作用需要 sialyl Lewis X 糖基修飾，但對酪胺酸硫酸化的需求不同：Tyr-51 硫酸化對高親和力 L-selectin 結合最重要，P-selectin 結合則需要 Tyr-48 硫酸化；E-selectin 親和力較低，需 sLe(x) 表位，但似乎不需酪胺酸硫酸化。SELPLG 也與 SNX20、MSN、SYK 及 HAVCR1 相互作用，並可介導 SELPLG 對 SYK 的活化。感染情境下，SELPLG 與 enterovirus 71 衣殼蛋白及 Staphylococcus aureus 蛋白 SSL5、SSL11 相互作用；後兩者的作用會阻止 SELPLG 介導的嗜中性球滾動。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SELPLG 產物為 SLe(x)-type proteoglycan，透過與 E-selectin、P-selectin 和 L-selectin 的高親和力、鈣離子依賴性相互作用，促進發炎初期白血球在血管表面快速滾動，並對白血球最初被捕捉至關重要。 | 含實驗來源 | 證據與來源A SLe(x)-type proteoglycan, which through high affinity, calcium-dependent interactions with E-, P- and L-selectins, mediates rapid rolling of leukocytes over vascular surfaces during the initial steps in inflammation. Critical for the initial leukocyte capture PMID 11566773 ↗ · PMID 12403782 ↗ |
| 功能 | 在微生物感染情境中，SELPLG 可作為 enterovirus 71 的受體。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | SELPLG 可形成雙硫鍵連結的同源二聚體，並與 selectins、SNX20、MSN、SYK 及 HAVCR1 相互作用；selectin 結合需要 sialyl Lewis X 修飾，但對酪胺酸硫酸化的需求依類型不同，且 SELPLG 可介導 SYK 活化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer; disulfide-linked. Interaction with P-, E- and L-selectins, through their lectin/EGF domains, is required for promoting recruitment and rolling of leukocytes. These interactions require sialyl Lewis X glycan modification but there is a differing dependence for tyrosine sulfations. Sulfation on Tyr-51 of PSGL1 is most important for high affinity L-selectin/SELL binding while P-selectin/SELP requires sulfation on Tyr-48. E-selectin/SELE binds with much lower affinity and requires the sLe(x) epitope, but apparently not tyrosine sulfation. Dimerization appears not to be required for P-selectin/SELP binding. Interacts with SNX20. Interacts with MSN and SYK; mediates the activation of SYK by SELPLG. Interacts with HAVCR1 PMID 10713099 ↗ · PMID 11081633 ↗ · PMID 11566773 ↗ · PMID 12387735 ↗ · PMID 12403782 ↗ · PMID 12736247 ↗ · PMID 18196517 ↗ · PMID 24703780 ↗ · PMID 7521878 ↗ · PMID 7559387 ↗ · PMID 7585949 ↗ · PMID 7585950 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中，SELPLG 與 enterovirus 71 的衣殼蛋白相互作用。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | 在微生物感染情境中，SELPLG 與 Staphylococcus aureus 蛋白 SSL5 和 SSL11 相互作用；這些作用會阻止 SELPLG 介導的嗜中性球滾動。 | 含實驗來源 | 證據與來源(Microbial infection) Interacts with Staphylococcus aureus proteins SSL5 and SSL11; these interactions prevent SELPLG-mediated neutrophil rolling PMID 18045383 ↗ · PMID 19543284 ↗ |
| 細胞定位 | SELPLG 定位於膜，屬於單次穿膜的第一型膜蛋白。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ACACACAGCCATTGGGGGTTGCTCGGATCCGGGACTGCCG40CAGGGGGTGCCACAGCAGTGCCTGGCAGCGTGGGCTGGGA80CCTTGTCACTAAAGCAGAGAAGCCACTTCTTCTGGGCCCA120CGAGGCAGCTGTCCCATGCTCTGCTGAGCACGGTGGTGCC160ATGCCTCTGCAACTCCTCCTGTTGCTGATCCTACTGGGCC200CTGGCAACAGCTTGCAGCTGTGGGACACCTGGGCAGATGA240AGCCGAGAAAGCCTTGGGTCCCCTGCTTGCCCGGGACCGG280AGACAGGCCACCGAATATGAGTACCTAGATTATGATTTCC320TGCCAGAAACGGAGCCTCCAGAAATGCTGAGGAACAGCAC360TGACACCACTCCTCTGACTGGGCCTGGAACCCCTGAGTCT400ACCACTGTGGAGCCTGCTGCAAGGCGTTCTACTGGCCTGG440ATGCAGGAGGGGCAGTCACAGAGCTGACCACGGAGCTGGC480CAACATGGGGAACCTGTCCACGGATTCAGCAGCTATGGAG520ATACAGACCACTCAACCAGCAGCCACGGAGGCACAGACCA560CTCAACCAGTGCCCACGGAGGCACAGACCACTCCACTGGC600AGCCACAGAGGCACAGACAACTCGACTGACGGCCACGGAG640GCACAGACCACTCCACTGGCAGCCACAGAGGCACAGACCA680CTCCACCAGCAGCCACGGAAGCACAGACCACTCAACCCAC720AGGCCTGGAGGCACAGACCACTGCACCAGCAGCCATGGAG760GCACAGACCACTGCACCAGCAGCCATGGAAGCACAGACCA800CTCCACCAGCAGCCATGGAGGCACAGACCACTCAAACCAC840AGCCATGGAGGCACAGACCACTGCACCAGAAGCCACGGAG880GCACAGACCACTCAACCCACAGCCACGGAGGCACAGACCA920CTCCACTGGCAGCCATGGAGGCCCTGTCCACAGAACCCAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。