演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SELPCD62

selectin P

SELP 編碼 selectin P,屬於 selectin/LECAM 家族,是參與白血球與血管表面互動及細胞黏附的鈣離子依賴性受體。

Homo sapiens1q24.2UniProt P16109
OFFICIAL SYMBOL
SELP
CHROMOSOME
1
UNIPROT
P16109
PDB / ALPHAFOLD
1G1Q
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SELP 是蛋白質編碼基因,產物 selectin P 屬於 selectin/LECAM 家族。它是鈣離子依賴性受體,可辨識特定醣類配體,並參與白血球與活化內皮細胞或血小板之間的互動。其蛋白質具有細胞外區域、單次穿膜區段及細胞質區域,細胞外部分含有 C-type lectin、EGF-like 與多個 Sushi 結構域。

Official symbol
SELP
Gene name
selectin P
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10721
UniProt
P16109
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CD62PSELPADGEMGMP140CD62PGMP-140GRMP

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q24.2
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegSELPpq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr1:169,588,421–169,630,193
Gene span
41,773 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000263686 ★169,588,849–169,630,12417
ENST00000909597169,588,421–169,630,19317
ENST00000909599169,588,421–169,630,19316
ENST00000909604169,588,421–169,630,19317
ENST00000958027169,588,421–169,630,19315
ENST00000909598169,588,426–169,630,19316
ENST00000909600169,588,426–169,630,19316
ENST00000909609169,588,426–169,630,19317
ENST00000958024169,588,426–169,630,19315
ENST00000958028169,588,426–169,630,19316
ENST00001143984169,588,426–169,630,19317
ENST00000426706169,588,849–169,619,21915

顯示 12/30 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

selectin P 是髓系細胞的鈣離子依賴性受體,可辨識嗜中性球與單核球表面的醣類;其辨識的配體包括 sialyl-Lewis X。這項分子辨識使活化內皮細胞或血小板能與白血球互動,參與發炎初期的細胞接觸過程。

在發炎初期,selectin P 與 SELPLG 作用,促成白血球沿血管表面快速滾動。這種滾動是白血球與血管表面互動的一環;來源指出其發生於發炎的初始步驟,並未將此描述為白血球黏附的全部過程。

selectin P 也透過與整合素的互動介導細胞間作用及細胞黏附,包括 integrin alpha-IIb/beta3(ITGA2B:ITGB3)與 integrin alpha-V/beta-3(ITGAV:ITGB3)。因此,來源所述功能涵蓋醣類配體辨識所參與的白血球滾動,以及與特定整合素互動所介導的細胞黏附;這些作用共同涉及血管表面與白血球之間的接觸,但來源未進一步說明其下游分子機制。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 169630124 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SELP ENST00000263686 GRCh38 chr1:169630024-169631124 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
AAGAATAATACCTACTACTGTACAATAGAATTCCAAGAGTATAAATAGGAGTTATGGCTTTCTGACTTGA
AACTAAATACTTGATACTTGATTTTGCTGTCTGAGATCAATCTGAAAAGTAATAATAATCACTAACATTT
GTTGAGCATCAATTGTGGGCCAAGTGTCATTTCAATCACTCTGTACATATTAACTCATTTCATCCTACAA
CAACCCGGTGAGGCAAGTTCTGTTATTCTGTTTTACAGTTGAGGAAACAGAGGCATAGAGAGCTTAAGTA
GTTTGCCCAGTAGATAGCCAGAAGAGGAGCCAGGATGGGTCTCGGGCAGTTTAACAGCACAGCTGAAGTC
TTAACCACTATGCCAACAGCTTTTTGGTCCTACACATCCCATGGGAAGAGGAAAATAAAAAGGTATCTAT
TTGTATACCTTTTTATTTCTGATATAAGAAGCAGAATTCCTTTCACATGACCTATGTCTATTTAATACGT
CATTTTGAAACTTACCAATAAAATTTCCCAAGCGCCAGAAAACTGTTAGTGGCTTTTTCCATTTCTCTCT
ATTTTTTTTTGTGCTACTAATTTTGCTTCTTTCCCTCAGAAGGCTGCCGGAATAGTAAACATTCACTGAC
ATGTCATAATTACTGGAAAATGGGCACTGGAAAATCACATTGTAATTAATTCAAAGCATGTTTTCCAAAT
GTACTACTTTAAATTGGAGCTTATATCATAATCCAAGGAAACCTTTGTGTGTGTACTGTTCCCACATTGC
TCAGCCTGGGATATCCAGGAGTAATTCACCTTGCGCCTGCCTCCAGACCATCTTCCATGGAAGGGGGTGA
CCCCTTGCCTCTTGGCAACCACTATTTCTAAGCTGCCAACATTACTCTTGCATTATCAACATTCTAACTT
CATGGGAAGGGCTGTGGTGAGTTTCTGGAATGTGAATAGGAAGTTGTTTTTCTAAACAGCCTGACACTGA
GGGGAGGCAGTGAGACTGTAAGCAGTCTGGGTTGGGCAGAAGGCAGAAAACCAGCAGAGTCACAGAGGAG
ATGGTGAGTTTATTTTTTTCTGCATGGGAAGTGGTTGAAGTGAGTTGGAGT
SELP 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SELP_1 ↗1:169,630,121負股169,630,111–169,630,170

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:830 aa

1 aa830 aa結構域功能區域基序訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 P16109 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

selectin P 的序列長度為 830 個胺基酸。其 N 端有訊號胜肽,細胞外區域為第 42–771 位,包含 C-type lectin、EGF-like 與九個 Sushi 結構域;其後為第 772–795 位的穿膜螺旋,並連接第 796–830 位的細胞質區域。細胞質端另註記有內吞訊號及與 SNX17 互動的區域。

訊號胜肽1–41 aa
拓樸區域Extracellular42–771 aa
跨膜區Helical772–795 aa
拓樸區域Cytoplasmic796–830 aa
結構域C-type lectin58–158 aa
結構域EGF-like159–195 aa
結構域Sushi 1198–259 aa
結構域Sushi 2260–321 aa
結構域Sushi 3322–383 aa
結構域Sushi 4384–445 aa
結構域Sushi 5446–507 aa
結構域Sushi 6508–569 aa
結構域Sushi 7570–631 aa
結構域Sushi 8640–701 aa
結構域Sushi 9702–763 aa
功能區域Interaction with SNX17821–830 aa
基序Endocytosis signal818–821 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 1G1Q…

PDB · 1G1Q

X-ray · 2.40 A · A/B/C/D=42-199

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

selectin P 是細胞膜上的單次穿膜 I 型膜蛋白。 來源未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CD62SELPSELPLG
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

selectin P 與 SELPLG/PSGL1、PODXL2 及 SNX17 有互動;與 SELPLG、PODXL2 的互動涉及嗜中性球黏附及白血球滾動,並要求 SELPLG 與 PODXL2 具有 sialyl-Lewis X 表位,且 SELPLG 有特定酪胺酸硫酸化。selectin P 透過 C-type lectin domain 與 ITGA2B:ITGB3、ITGAV:ITGB3 互動,也與 ITGA5:ITGB1、ITGA4:ITGB 互動。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能selectin P 是髓系細胞的鈣離子依賴性受體,可結合嗜中性球與單核球上的醣類配體,辨識 sialyl-Lewis X。它介導活化內皮細胞或血小板與白血球互動,並透過和 SELPLG 作用,促成發炎初期白血球沿血管表面快速滾動;也透過與 ITGA2B:ITGB3、ITGAV:ITGB3 互動,參與細胞間作用與黏附。含實驗來源
證據與來源

Ca(2+)-dependent receptor for myeloid cells that binds to carbohydrates on neutrophils and monocytes. Mediates the interaction of activated endothelial cells or platelets with leukocytes. The ligand recognized is sialyl-Lewis X. Mediates rapid rolling of leukocyte rolling over vascular surfaces during the initial steps in inflammation through interaction with SELPLG. Mediates cell-cell interactions and cell adhesion via the interaction with integrin alpha-IIb/beta3 (ITGA2B:ITGB3) and integrin alpha-V/beta-3 (ITGAV:ITGB3)

PMID 11081633 ↗ · PMID 28011641 ↗ · PMID 37184585 ↗ · PMID 7585950 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用selectin P 與 SNX17、SELPLG/PSGL1、PODXL2 及多種整合素互動。與 SELPLG、PODXL2 的互動介導嗜中性球黏附及白血球滾動,且要求兩者具有 sialyl-Lewis X 表位,並要求 SELPLG 有特定酪胺酸硫酸化。selectin P 經 C-type lectin domain 與 ITGA2B:ITGB3、ITGAV:ITGB3 互動,另與 ITGA5:ITGB1、ITGA4:ITGB 互動。含實驗來源
證據與來源

Interacts with SNX17. Interacts with SELPLG/PSGL1 and PODXL2 and mediates neutrophil adhesion and leukocyte rolling. This interaction requires the sialyl-Lewis X epitope of SELPLG and PODXL2, and specific tyrosine sulfation on SELPLG. Interacts (via C-type lectin domain) with alpha-IIb/beta3 integrin ITGA2B:ITGB3 and alpha-V/beta-3 integrin ITGAV:ITGB3. Interacts with alpha5/beta1 integrin ITGA5:ITGB1 and alpha4/beta1 integrin ITGA4:ITGB

PMID 11081633 ↗ · PMID 11237770 ↗ · PMID 15769472 ↗ · PMID 18606703 ↗ · PMID 37184585 ↗ · PMID 7559387 ↗ · PMID 7585949 ↗ · PMID 7585950 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位selectin P 位於細胞膜,是單次穿膜的 I 型膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Single-pass type I membrane protein

PMID 28011641 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000263686 · 3,157 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGCAGTCTGGGTTGGGCAGAAGGCAGAAAACCAGCAGAGT40
41CACAGAGGAGATGGCCAACTGCCAAATAGCCATCTTGTAC80
81CAGAGATTCCAGAGAGTGGTCTTTGGAATTTCCCAACTCC120
121TTTGCTTCAGTGCCCTGATCTCTGAACTAACAAACCAGAA160
161AGAAGTGGCAGCATGGACTTATCATTACAGCACAAAAGCA200
201TACTCATGGAATATTTCCCGTAAATACTGCCAGAATCGCT240
241ACACAGACTTAGTGGCCATCCAGAATAAAAATGAAATTGA280
281TTACCTCAATAAGGTCCTACCCTACTACAGCTCCTACTAC320
321TGGATTGGGATCCGAAAGAACAATAAGACATGGACATGGG360
361TGGGAACCAAAAAGGCTCTCACCAACGAGGCTGAGAACTG400
401GGCTGATAATGAACCTAACAACAAAAGGAACAACGAGGAC440
441TGCGTGGAGATATACATCAAGAGTCCGTCAGCCCCTGGCA480
481AGTGGAATGATGAGCACTGCTTGAAGAAAAAGCACGCATT520
521GTGTTACACAGCCTCCTGCCAGGACATGTCCTGCAGCAAA560
561CAAGGAGAGTGCCTCGAGACCATCGGGAACTACACCTGCT600
601CCTGTTACCCTGGATTCTATGGGCCAGAATGTGAATACGT640
641GAGAGAGTGTGGAGAACTTGAGCTCCCTCAACACGTGCTC680
681ATGAACTGCAGCCACCCTCTGGGAAACTTCTCTTTTAACT720
721CGCAGTGCAGCTTCCACTGCACTGACGGGTACCAAGTAAA760
761TGGGCCCAGCAAGCTGGAATGCTTGGCTTCTGGAATCTGG800
801ACAAATAAGCCTCCACAGTGTTTAGCTGCCCAGTGCCCAC840
841CCCTGAAGATTCCTGAACGAGGAAACATGACCTGCCTTCA880
881TTCTGCAAAAGCATTCCAGCATCAGTCTAGCTGCAGCTTC920
921AGTTGTGAAGAGGGATTTGCATTAGTTGGACCGGAAGTGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。