演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SELLLSEL

selectin L

SELL 編碼 selectin L(L-selectin),是一種鈣依賴性凝集素,藉由辨識鄰近細胞的糖蛋白參與細胞黏附,並協助白血球與血管內皮接觸。

Homo sapiens1q24.2UniProt P14151
OFFICIAL SYMBOL
SELL
CHROMOSOME
1
UNIPROT
P14151
PDB / ALPHAFOLD
5VC1
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SELL 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 selectin L。其產物 L-selectin 屬於 selectin/LECAM 家族,是一種鈣依賴性凝集素;此類蛋白質可透過辨識鄰近細胞上的糖蛋白參與細胞黏附。L-selectin 的基本角色與白血球和血管內皮細胞之間的黏附有關,特別涉及周邊淋巴結高內皮微靜脈中的淋巴球。其蛋白質結構包含細胞外區域與跨膜區段,並具有 C-type lectin、EGF-like 及兩個 Sushi 結構域。

Official symbol
SELL
Gene name
selectin L
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10720
UniProt
P14151
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
LSELLAM1LAM-1hLHRcLeu-8Lyam-1PLNHRCD62LLYAM1LNHR

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q24.2
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegSELLpq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr1:169,690,665–169,712,202
Gene span
21,538 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000236147 ★169,690,667–169,711,6209
ENST00000650983169,690,665–169,711,7029
ENST00000878074169,690,665–169,712,20210
ENST00000878075169,690,665–169,712,20210
ENST00001099194169,690,665–169,711,7028
ENST00001145748169,690,665–169,711,6209
ENST00000497295169,691,681–169,703,3293
ENST00001099195169,703,113–169,711,7026

顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

L-selectin 是鈣依賴性凝集素,透過結合鄰近細胞表面的糖蛋白介導細胞黏附。這種辨識作用參與白血球與血管內皮的接觸,並支持白血球在內皮表面的初始繫留與滾動。來源亦指出,L-selectin 介導周邊淋巴結高內皮微靜脈內淋巴球對內皮細胞的黏附。

白血球在內皮上的初始繫留與滾動,是其與血管內皮互動的一部分;SELL 所編碼的凝集素藉由辨認細胞表面的糖蛋白,促進這些黏附相關步驟。此功能描述涵蓋細胞間辨識與黏附,不延伸推論至來源未提及的後續白血球遷移機制。

L-selectin 與 SELPLG/PSGL1 及 PODXL2 的互作,對促進白血球募集與滾動是必要的。這些互作依賴 SELPLG 與 PODXL2 上的 sialyl Lewis X 醣基修飾;SELPLG 的酪胺酸硫酸化也會影響互作,其中 SELPLG 的 Tyr-51 硫酸化對 L-selectin 結合具有重要性。這些條件說明,白血球募集與滾動相關的辨識不只涉及蛋白質本身,也受特定醣基及硫酸化修飾影響。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 169711620 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SELL ENST00000236147 GRCh38 chr1:169711520-169712620 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTCTTGTCTTTCGCTAGTTTTTGAATTTGTTTCTTAACCTCTTTGAGACTCTTTAGAATGGGGATAATAA
TCATATCTATAGCAGAGAGCTGTTATAAAGATTAAACAATATAATAAATATGGGGCGCTGAGCTTCAGAG
TTTTTGTTGTTGTTATTATTATTTTCCTAAAAATGCAAATCTGATTTGCATTTGACTCATTGACTCACAT
CAGTGGGTCTTCCTTTTTATTGTCCTTCATCATATGGGTCCTAATTTCACATGCAGTCTTATAAAACCAT
CTCATTTTATAGTCCAAGAATATTAAAGGTACTTGTAGGCTCCCAAACCTACACGGTGAAAAGCTAGAGA
GCATGGGCTCTCTTCAGGGGTTAACTTCAGGAAGTGCCACTAACAAGGACGTCCACTAGGTGGTGAGCAA
GGAAAGACGGAGGTGAAGGAACCGAAACGAGTCAAGTCCACTGCTTAGCTCTACTGAAGTTTTGCAAACA
TCATAAATATGTCTGAAATGCAGTTTTGATTTGTAGTATTTGCAATTTCCAAGGGCCATTTACCACAGGT
AGCCAAGAGTTAGTTTAGCATTTATGAAAAAGATAGGGGAGGGTGGTGGAAAAGAAGGAGGAGGAGGAGA
GAGAGAAGGAGGAAGAGGAGAACAAGAACCAAACAAAAACAAGAACAAGAACAAGTAGAAGAAGAGGAGC
AGGAGGAAAAAGAAGAGGAAGAAGAACAGCAACAACAATGAGTGAAGGAGGAGGAGGGTAAGGAAAGATG
CATAGGAGAATGGAAGGAAGGATAGAAAGGAGGGAAGGAAGAGAGAATCTAGTCACATTACTTTCTGATC
AGCAGTTCATTTTTGTCTCAGTGGGAGGCAATAGAGGCCAGTCTAGGAAAGGGGTGGGGAAAGAGGAAAG
AGAAGTGCAGGAGGAAGGGGAGGGAAAAGGGGAGGAGGAGGAGGATGTGAGACTGGGTTAGAGAAATGAA
AGAAAGCAAGGCTTTCTGTTGACATTCAGTGCAGTCTACCTGCAGCACAGCACACTCCCTTTGGGCAAGG
ACCTGAGACCCTTGTGCTAAGTCAAGAGGCTCAATGGGCTGCAGAAGAACT
SELL 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SELL_1 ↗1:169,711,620負股169,711,610–169,711,669

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_B38ND8 · promoter · 169711610–169712192 · regulatory

ENSR1_53GWR6N · CTCF_binding_site · 169712202–169712223 · regulatory

· motif · 169708608–169708619 · motif

· motif · 169708608–169708619 · motif

· motif · 169708670–169708681 · motif

· motif · 169708670–169708681 · motif

· motif · 169711134–169711146 · motif

· motif · 169711283–169711296 · motif

· motif · 169711283–169711296 · motif

· motif · 169711974–169711987 · motif

· motif · 169712204–169712220 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:372 aa

1 aa372 aa結構域訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 P14151 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

L-selectin 長 372 個胺基酸,屬於 selectin/LECAM 家族。其細胞外區域位於胺基酸 39–332,包含 C-type lectin、EGF-like 與兩個 Sushi 結構域;胺基酸 333–355 為螺旋型跨膜區段,356–372 為細胞質區域。N 端訊號區位於胺基酸 1–28。

訊號胜肽1–28 aa
拓樸區域Extracellular39–332 aa
跨膜區Helical333–355 aa
拓樸區域Cytoplasmic356–372 aa
結構域C-type lectin55–155 aa
結構域EGF-like156–192 aa
結構域Sushi 1195–256 aa
結構域Sushi 2257–318 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 5VC1…

PDB · 5VC1

X-ray · 1.94 A · A=39-195

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

L-selectin 是單次穿膜的第一型膜蛋白,定位於細胞膜。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間差異的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
LSELSELLSLC30A2
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

L-selectin 與 SELPLG/PSGL1 及 PODXL2 的互作,對促進白血球募集與滾動是必要的。此互作依賴 SELPLG 和 PODXL2 上的 sialyl Lewis X 醣基修飾,也受 SELPLG 酪胺酸硫酸化影響;特別是 SELPLG 的 Tyr-51 硫酸化對 L-selectin 結合具有重要性。來源描述的是這些分子間的互作及其功能關係,未指出它們組成同一複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能L-selectin 是鈣依賴性凝集素,藉由結合鄰近細胞上的糖蛋白介導細胞黏附。它促進周邊淋巴結高內皮微靜脈中的淋巴球黏附於內皮細胞,也參與白血球在內皮上的初始繫留與滾動。含實驗來源
證據與來源

Calcium-dependent lectin that mediates cell adhesion by binding to glycoproteins on neighboring cells. Mediates the adherence of lymphocytes to endothelial cells of high endothelial venules in peripheral lymph nodes. Promotes initial tethering and rolling of leukocytes in endothelia

PMID 12403782 ↗ · PMID 28011641 ↗ · PMID 28489325 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用L-selectin 與 SELPLG/PSGL1 及 PODXL2 的互作,對促進白血球募集與滾動是必要的。互作依賴 SELPLG 和 PODXL2 上的 sialyl Lewis X 醣基修飾,也依賴 SELPLG 的酪胺酸硫酸化;其中 SELPLG Tyr-51 的硫酸化對 L-selectin 結合具有重要性。含實驗來源
證據與來源

Interaction with SELPLG/PSGL1 and PODXL2 is required for promoting recruitment and rolling of leukocytes. This interaction is dependent on the sialyl Lewis X glycan modification of SELPLG and PODXL2, and tyrosine sulfation modifications of SELPLG. Sulfation on 'Tyr-51' of SELPLG is important for L-selectin binding

PMID 12403782 ↗ · PMID 12736247 ↗ · PMID 18606703 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位L-selectin 定位於細胞膜,是單次穿膜的第一型膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Cell membrane / Single-pass type I membrane protein

PMID 2509939 ↗ · PMID 2663882 ↗ · PMID 28011641 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000236147 · 2,358 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GACATTCAGTGCAGTCTACCTGCAGCACAGCACACTCCCT40
41TTGGGCAAGGACCTGAGACCCTTGTGCTAAGTCAAGAGGC80
81TCAATGGGCTGCAGAAGAACTAGAGAAGGACCAAGCAAAG120
121CCATGATATTTCCATGGAAATGTCAGAGCACCCAGAGGGA160
161CTTATGGAACATCTTCAAGTTGTGGGGGTGGACAATGCTC200
201TGTTGTGATTTCCTGGCACATCATGGAACCGACTGCTGGA240
241CTTACCATTATTCTGAAAAACCCATGAACTGGCAAAGGGC280
281TAGAAGATTCTGCCGAGACAATTACACAGATTTAGTTGCC320
321ATACAAAACAAGGCGGAAATTGAGTATCTGGAGAAGACTC360
361TGCCTTTCAGTCGTTCTTACTACTGGATAGGAATCCGGAA400
401GATAGGAGGAATATGGACGTGGGTGGGAACCAACAAATCT440
441CTTACTGAAGAAGCAGAGAACTGGGGAGATGGTGAGCCCA480
481ACAACAAGAAGAACAAGGAGGACTGCGTGGAGATCTATAT520
521CAAGAGAAACAAAGATGCAGGCAAATGGAACGATGACGCC560
561TGCCACAAACTAAAGGCAGCCCTCTGTTACACAGCTTCTT600
601GCCAGCCCTGGTCATGCAGTGGCCATGGAGAATGTGTAGA640
641AATCATCAATAATTACACCTGCAACTGTGATGTGGGGTAC680
681TATGGGCCCCAGTGTCAGTTTGTGATTCAGTGTGAGCCTT720
721TGGAGGCCCCAGAGCTGGGTACCATGGACTGTACTCACCC760
761TTTGGGAAACTTCAGCTTCAGCTCACAGTGTGCCTTCAGC800
801TGCTCTGAAGGAACAAACTTAACTGGGATTGAAGAAACCA840
841CCTGTGGACCATTTGGAAACTGGTCATCTCCAGAACCAAC880
881CTGTCAAGTGATTCAGTGTGAGCCTCTATCAGCACCAGAT920
921TTGGGGATCATGAACTGTAGCCATCCCCTGGCCAGCTTCA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。