演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SELENOWSELW

selenoprotein W

SELENOW 編碼 selenoprotein W,屬於 SelWTH family,可能參與穀胱甘肽依賴的抗氧化作用。

Homo sapiens19q13.33UniProt P63302
OFFICIAL SYMBOL
SELENOW
CHROMOSOME
19
UNIPROT
P63302
PDB / ALPHAFOLD
無模型
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SELENOW 是蛋白質編碼基因,產物為 selenoprotein W,屬於 SelWTH family 的 Selenoprotein W subfamily。現有資料指出,它可能具有穀胱甘肽依賴的抗氧化角色;來源未提供更詳細的蛋白質結構或序列特色。

Official symbol
SELENOW
Gene name
selenoprotein W
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10752
UniProt
P63302
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
SELWSEPW1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1919q13.33
chr19 · 58,617,616 bp · GRCh38chr19p13.3 · 1–6900000 · gnegchr19p13.2 · 6900001–12600000 · gpos25chr19p13.13 · 12600001–13800000 · gnegchr19p13.12 · 13800001–16100000 · gpos25chr19p13.11 · 16100001–19900000 · gnegchr19p12 · 19900001–24200000 · gvarchr19p11 · 24200001–26200000 · acenchr19q11 · 26200001–28100000 · acenchr19q12 · 28100001–31900000 · gvarchr19q13.11 · 31900001–35100000 · gnegchr19q13.12 · 35100001–37800000 · gpos25chr19q13.13 · 37800001–38200000 · gnegchr19q13.2 · 38200001–42900000 · gpos25chr19q13.31 · 42900001–44700000 · gnegchr19q13.32 · 44700001–47500000 · gpos25chr19q13.33 · 47500001–50900000 · gnegchr19q13.41 · 50900001–53100000 · gpos25chr19q13.42 · 53100001–55800000 · gnegchr19q13.43 · 55800001–58617616 · gpos25SELENOWpq1 bp58,617,616 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr19:47,778,508–47,784,686
Gene span
6,179 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000601048 ★47,778,703–47,784,6826
ENST0000059389247,778,508–47,784,5646
ENST0000059561547,778,508–47,781,5565

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

selenoprotein W 被描述為具有穀胱甘肽(GSH)依賴的抗氧化作用,並可能參與氧化還原相關過程。資料未進一步說明其分子作用方式,因此不能據此詳述反應機制或作用對象。

此外,selenoprotein W 可能與硒缺乏相關的肌病有關;此項功能註記標示為 By similarity,屬於相似性推論,不能視為已確立的直接因果關係。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 47778703 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SELENOW ENST00000601048 GRCh38 chr19:47777703-47778803 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTCAAGTAGCCTGGGACTGTAGGCACACACCACCACGCCCGGCTGATTTATTATCTATTTATTTATTTGA
GGTGGAGCCTCGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCATTGGCCTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCGCCT
CCCAGGTTCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGCGCCACCACGCC
CATCTAATTTTTGTATTTTTAATAGAGACGGGGTTCCTCCATGTTGGCCAGGCTGGTCTTGAACTCCTGA
CCTCAAGTGATCCGCCCGCCTCGGCCTTCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCGTGAGCCAACGCACCCAGCC
ACTAATGTATTATTATTATTATTCTGTAGAGACGCAGTCTGGCTATGTTGCCCAGGCTGGTCTTGAATTC
CTGCCTCTGCCTCCCAAAGCGCTGGGGTTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCTGCGGCTGCAGGTCTTTAT
AAGGCAACTGTGGGCCCTGGACCGCTCCCTGAAAACCTCCCCCTCAACTCCCTGTCTCCTCCCTCACCTG
GTCTACCCCGAATCCTTCCCCTCTCGCCCCCTCGCCCTCTCCAGGGGAGGTGAGGGACTCAAGAATCGCG
CCCTGCTTCTGTCCCCACCGCGCCGTCCCCAAGCCCACGCAGTGAAAAGACCACCCTTGAGGCTGATTCC
GGGTCCAGCTGGGAGCGGCCAGCCGTAAATCACCGCCCCCGTGGGCCGTACCATTCTGGCCGGGGGGACC
TGGGAGGGGACGCGCGGAGGGCTTCCCCCGGGGACTGCCTGTATCGAGACTCTCTCCAGCCCAACAGGAG
GATGGGAAGGAGACTTGTGTGGGGGCCTCGGGCTGGCGGGTCGCGGGTTCCTTATCCTCCGCCTTGGCGC
CTCTCCGCCCACCGCCCACCGCCCCTCCCTGGCATTGGTTGGCGCCAGGGGAAGCCGAGGCTCCATCCTT
TCTGCGCAGGTTCCCGCCGCACTCGCGCAGACCTAGCGCGTCCAGGTGGGAGGTTAGTGTGGCCCGGGCG
TCCGCTCCTCAGCGGATGTGGCAGCCCCGAGCCATGGCTCTCGCCGTCCGA
SELENOW 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SEPW1_1 ↗19:47,778,703正股47,778,654–47,778,713

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR19_9NZ29 · enhancer · 47776500–47776957 · regulatory

ENSR19_BCH2C · enhancer · 47777820–47778391 · regulatory

ENSR19_9NZ2R · promoter · 47778392–47778713 · regulatory

ENSR19_C6Q29 · enhancer · 47778714–47780165 · regulatory

ENSR19_5F8FJZ · CTCF_binding_site · 47778967–47778988 · regulatory

ENSR19_83DX5N · enhancer · 47782000–47782206 · regulatory

· motif · 47778166–47778181 · motif

· motif · 47778184–47778199 · motif

· motif · 47778227–47778240 · motif

· motif · 47778360–47778370 · motif

· motif · 47778362–47778375 · motif

· motif · 47778434–47778447 · motif

· motif · 47778576–47778591 · motif

· motif · 47778723–47778732 · motif

· motif · 47778725–47778738 · motif

· motif · 47778876–47778883 · motif

· motif · 47778969–47778985 · motif

· motif · 47779854–47779866 · motif

· motif · 47780793–47780806 · motif

· motif · 47780829–47780836 · motif

· motif · 47780838–47780850 · motif

· motif · 47780842–47780855 · motif

· motif · 47781649–47781662 · motif

· motif · 47781649–47781662 · motif

· motif · 47781687–47781700 · motif

· motif · 47781687–47781700 · motif

· motif · 47781781–47781789 · motif

· motif · 47781877–47781890 · motif

· motif · 47781877–47781890 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:87 aa

selenoprotein W 歸屬於 SelWTH family,並被分類在 Selenoprotein W subfamily。現有資料未提供其結構域、功能區域或序列註解細節。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
目前沒有可用的 PDB 或 AlphaFold DB 模型。
08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm

selenoprotein W 的定位資料為細胞質;來源未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
SELWSELENOW
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

資料列出 selenoprotein W 與 DPYSL2、PRDX1、YWHAB、YWHAG、HSP70 及 HSP90 有互作關係;未進一步說明這些關係是否代表直接結合或共同組成複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能selenoprotein W 具有穀胱甘肽(GSH)依賴的抗氧化作用,並可能參與氧化還原相關過程;它也可能與硒缺乏相關的肌病有關。肌病關聯註記為 By similarity,保留其推論性質。推論支持
證據與來源

Plays a role as a glutathione (GSH)-dependent antioxidant. May be involved in a redox-related process. May play a role in the myopathies of selenium deficiency (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用selenoprotein W 與 DPYSL2、PRDX1、YWHAB、YWHAG、HSP70 及 HSP90 有互作關係;此註記未區分互作是否為直接結合,也未說明是否共同形成複合體。推論支持
證據與來源

Interacts with DPYSL2, PRDX1, YWHAB, YWHAG, HSP70 and HSP90

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位selenoprotein W 的細胞內定位記錄為細胞質;此項資料未提供定位變化的條件、動態或異構型差異。資料庫紀錄
證據與來源

Cytoplasm

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000601048 · 758 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTCGCGCAGACCTAGCGCGTCCAGGTGGGAGGTTAGTGT40
41GGCCCGGGCGTCCGCTCCTCAGCGGATGTGGCAGCCCCGA80
81GCCATGGCTCTCGCCGTCCGAGTCGTTTATTGTGGCGCTT120
121GAGGCTACAAGTCCAAGTATCTTCAGCTCAAGAAGAAGTT160
161AGAAGATGAGTTCCCCGGCCGCCTGGACATCTGCGGCGAG200
201GGAACTCCCCAGGCCACCGGGTTCTTTGAAGTGATGGTAG240
241CCGGGAAGTTGATTCACTCTAAGAAGAAAGGCGATGGCTA280
281CGTGGACACAGAAAGCAAGTTTCTGAAGTTGGTGGCCGCC320
321ATCAAAGCCGCCTTGGCTCAGGGCTAATGCGCCCTGAAGG360
361CAGAGTCCAGGGACCTTGACCCAGCCCCTCTCAGCAGACG400
401CTTCATGATAGGAAGGACTGAAAAGTCTTGTGGACACCTG440
441GTCTTTCCCTGATGTTCTCGTGGCTGCTGTTGGGGGCAGA480
481GATTGACGCCCCCGGTCTTTGCCTCTGAGCGGGAGAGTCT520
521GTGTGTATGTGTCTTCCCCGGAATCCACACCACCCCACCC560
561TCCTCCTGTCCCGTGGTTTCATCATATCTCTTTGCATACC600
601CCATGTCTTCCCCAGTTGTCCCCTGGAGTTTGGGGGGACA640
641TCCCGCCTCAGGCATCCTTCTCAAGGGGAAGCCAAGAGAG680
681GCATCAGGATGGGTGGGTTTCTGATTGTGGCAACGTTTGC720
721AACCGTTCACGATTCAATAAATATTGGATGAATTTAAC758

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。