基因總覽
SEL1L 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 SEL1L adaptor subunit of SYVN1 ubiquitin ligase。其蛋白質屬於 sel-1 family，為內質網膜上的單次穿膜蛋白；大部分蛋白質位於膜腔側，並帶有多個 Sel1-like 重複序列及一個 Fibronectin type-II 結構域。這些基本特徵界定了 SEL1L 作為膜相關蛋白的性質；其參與的細胞過程與生物學作用另見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000336735 ★ | 81,471,547–81,533,853 | 21 |
| ENST00001133364 | 81,471,547–81,533,871 | 21 |
| ENST00000870905 | 81,472,920–81,533,871 | 20 |
| ENST00000953128 | 81,472,920–81,533,871 | 17 |
| ENST00000953130 | 81,472,920–81,533,871 | 20 |
| ENST00000953131 | 81,472,921–81,533,871 | 20 |
| ENST00000953129 | 81,472,923–81,533,871 | 21 |
| ENST00000953132 | 81,472,923–81,533,871 | 21 |
| ENST00001007902 | 81,472,925–81,533,871 | 21 |
| ENST00000870906 | 81,475,658–81,533,871 | 21 |
| ENST00000953133 | 81,475,659–81,533,871 | 20 |
| ENST00000870907 | 81,476,254–81,533,871 | 22 |
顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SEL1L 參與內質網品質管控（ERQC），亦稱內質網相關降解（ERAD）。此系統涉及以泛素依賴方式降解錯誤摺疊的內質網蛋白；SEL1L 是其中一員，並可增強 SYVN1 的穩定性。來源指出其與此品質管控及降解途徑相關，但未進一步說明 SEL1L 如何辨識底物或各步驟的分子機制。
除內質網蛋白品質管控外，SEL1L 也參與 LPL 的成熟與分泌。其與 LPL 相關的作用，連同上述蛋白品質管控角色，顯示此蛋白參與不同蛋白質處理過程；來源未提供這些作用彼此間的調控關係或具體步驟。
SEL1L 對胰臟上皮的正常分化，以及胰臟細胞正常外分泌功能與存活是必要的。這些描述指出 SEL1L 與胰臟組織發育及細胞功能維持有關，但來源未進一步界定其作用於何種細胞或分子途徑。
此外，SEL1L 可能參與 Notch 訊號傳遞；此處為可能性描述，來源未提供作用方向或機制細節。
Promoter 與基因調控
>SEL1L ENST00000336735 GRCh38 chr14:81533753-81534853 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGTTTGAGAAAAGAAAGGGCAGGCACACCAAGTCACTGCTCTGCTACTCAGTTGGAACATGCCTGGATTT CGTGCTTATTACATAGAGTATTTCCGTGCCTGCGATGCAATCACTATCACCTCTACCTCCACACACGTGA ACCTGGTCTCCTGACTTTAGTTAGGAAAGAAGAGAACAATGCAACTCACAAGAGGAGAAGGATGAGGACA AGTGTTTAAAATAATTTTTCAAAGCTGTTGGCACATTTTCTTTATGATTATTGTCTGGTGAACCTAGTGA AAATAAATACTGTATTGAGATAATCTGTGCCGAGCGGATTTATTTCCTTTTGTTTTGTCGGAGAAAGGAG GACAGGTACTGAGTTGCACCCTGGTTTCCGTACTTCACGGTACTGTTTTATCTAAGTTTTAAAAAACACC TCAAATTCAACTAGCTGTGGCATTTTTCTCAGTGCTCTTATCACTATGCCCAATTTAAATTTTTTAAATA AAACAGGAAAAGATGCTAAACACATTACAAGTTCTTAAAATTATTCCTTAATATTTATTTTGGGTCAATT TAAAAAGGCTTGTGAATCCATAGCCTTGAGTTAATATTTAGCCCAGGTGTTAGTTAAATTCTAACTTCAA CAGTCACCCGCACTTGTAAATCTTGCCCTACGATGGACTACGTTTCCCAAGAGCACCCCCCGAGTTAATC ACATGAAGCGCATTCTGGGAATTGTAGTCTCGGATGAGCCTCTTTCTCCCAGTCTTGGACTCACGCGCTG ATTCCGGTTGAACCCAGGGGCTACCAATTAGCTGGGGCCATGTCCGTGAGTCGTGGTCCAACCGAGAAAG CTGGTGTGGGAGCTTCGTACAATGATTGGCCAATGAATGACCCCCGGGGCGGAGCAATGGGGGTGGGCGG GGAGACCATGGTGATTGGACCAGAAGCCCGCGACGGCGGGCGGGGATTGGCTGCGCGCTGGGTCAGGGAA GCCTGGGAAGGGGCGGAGGAAGGAGACTAGAGCAGGAAGAGCAGCGGCGAGGCGGCGGTGGTGGCTGAGT CCGTGGTGGCAGAGGCGAAGGCGACAGCTCTAGGGGTTGGCACCGGCCCCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SEL1L_1 ↗ | 14:81,533,845 | 負股 | 81,533,835–81,533,894 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR14_84DPGH · enhancer · 81529511–81529754 · regulatory
ENSR14_BL6TW · enhancer · 81533058–81533822 · regulatory
ENSR14_BL6W2 · promoter · 81533823–81534343 · regulatory
ENSR14_937CRH · enhancer · 81535536–81535823 · regulatory
· motif · 81532773–81532784 · motif
· motif · 81533402–81533413 · motif
· motif · 81533439–81533450 · motif
· motif · 81533629–81533639 · motif
· motif · 81533702–81533717 · motif
· motif · 81533898–81533908 · motif
· motif · 81533941–81533951 · motif
· motif · 81533945–81533955 · motif
· motif · 81533947–81533957 · motif
· motif · 81534149–81534165 · motif
· motif · 81534149–81534165 · motif
· motif · 81535524–81535537 · motif
· motif · 81535578–81535591 · motif
· motif · 81535657–81535670 · motif
· motif · 81535740–81535749 · motif
· motif · 81535740–81535751 · motif
· motif · 81535740–81535751 · motif
· motif · 81535740–81535753 · motif
· motif · 81536292–81536305 · motif
· motif · 81536308–81536321 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：794 aa
SEL1L 蛋白長 794 個胺基酸，具有 1–21 位的訊號序列、22–738 位的腔側區域，以及 739–759 位的螺旋型穿膜區；760–794 位位於細胞質側。腔側區域包含 Fibronectin type-II 結構域及多個 Sel1-like 重複序列。註解亦標示與 ERLEC1、OS9、SYVN1 的互作區域、同源二聚與寡聚化相關區域，以及與 SYVN1 互作的區域；另有一段與內質網滯留相關的區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SEL1L 位於內質網膜，為單次穿膜的第一型膜蛋白。 來源未提供條件性定位變化或異構型差異；此處描述的是 SEL1L 本身，而非其互作夥伴的定位。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- EGFRP00533 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ERN1O75460-1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- FOXRED2Q8IWF2 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- NTRK3Q16288 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- OS9Q13438 · UniProt INTERACTION · 14 experiments
- SYVN1Q86TM6 · UniProt INTERACTION · 21 experiments
SEL1L 可形成同源二聚體及同源寡聚體（依序列相似性推定）。它可能與 ERLEC1、HSPA5、OS9 和 SYVN1 形成複合體，也與 FOXRED2、EDEM1 及 LPL 互作；與 LMF1 的關係則可能有助穩定 LPL–LMF1 複合體，並促進 LPL 二聚體輸出。SEL1L 是 HRD1 複合體的組成部分，與 SYVN1/HRD1 的互作為直接互作。另在微生物感染情境下，SEL1L 與 human cytomegalovirus 蛋白 UL148 互作。
疾病與遺傳關聯
影響 SEL1L 的變異與兩種嚴重的常染色體隱性神經發育疾病相關。其一通常於嬰兒期發病，特徵包括發育遲緩、無語言、智能障礙、身材矮小、小頭症、顏面異常、肌張力低下及／或共濟失調。另一種通常於嬰兒早期發病，除發育遲緩、智能障礙、無語言、嚴重軸向肌張力低下、身材矮小及小頭症外，也有無丙種球蛋白血症且缺乏成熟 B 細胞，可能伴隨反覆上下呼吸道感染及早逝。來源將兩種疾病歸因於影響 SEL1L 的變異。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 6 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SEL1L 參與內質網品質管控（ERQC），亦稱內質網相關降解（ERAD），該系統以泛素依賴方式降解錯誤摺疊的內質網蛋白。SEL1L 可增強 SYVN1 穩定性，也參與 LPL 成熟與分泌；它對胰臟上皮正常分化、胰臟細胞外分泌功能及存活是必要的，並可能參與 Notch 訊號傳遞。 | 含實驗來源 | 證據與來源Plays a role in the endoplasmic reticulum quality control (ERQC) system also called ER-associated degradation (ERAD) involved in ubiquitin-dependent degradation of misfolded endoplasmic reticulum proteins. Enhances SYVN1 stability. Plays a role in LPL maturation and secretion. Required for normal differentiation of the pancreas epithelium, and for normal exocrine function and survival of pancreatic cells. May play a role in Notch signaling PMID 16186509 ↗ · PMID 29997207 ↗ · PMID 37943610 ↗ · PMID 37943617 ↗ |
| 交互作用 | SEL1L 可形成同源二聚體與寡聚體（依相似性推定），可能和 ERLEC1、HSPA5、OS9、SYVN1 形成複合體，並與 FOXRED2、EDEM1、LPL 互作；也與 LMF1 互作，可能穩定 LPL–LMF1 複合體並促進 LPL 二聚體輸出。SEL1L 是 HRD1 複合體成員，與 SYVN1/HRD1 直接互作；SYVN1 的穿膜區參與與 SEL1L、FAM8A1 組裝，其細胞質區則有助維持 FAM8A1 穩定並增強 HERPUD1 招募。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer and homooligomer (By similarity). May form a complex with ERLEC1, HSPA5, OS9, and SYVN1. Interacts with FOXRED2 and EDEM1. Interacts with LPL. Interacts with LMF1; may stabilize the complex formed by LPL and LMF1 and thereby promote the export of LPL dimers (By similarity). Component of the HRD1 complex, which comprises at least SYNV1/HRD1, DERL1/2, FAM8A1, HERPUD1/HERP, OS9, SEL1L and UBE2J1. SYNV1 assembles with SEL1L and FAM8A1 through its transmembrane domains, but interaction with its cytoplasmic domain is required to confer stability to FAM8A1 and enhance recruitment of HERPUD1. The interaction with SYNV1/HRD1 is direct PMID 16186509 ↗ · PMID 18264092 ↗ · PMID 18502753 ↗ · PMID 19524542 ↗ · PMID 19706418 ↗ · PMID 25066055 ↗ · PMID 26471130 ↗ · PMID 28827405 ↗ · PMID 37943610 ↗ |
| 交互作用 | 在微生物感染情境下，SEL1L 與 human cytomegalovirus 蛋白 UL148 互作。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | SEL1L 是位於內質網膜的單次穿膜第一型膜蛋白。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | 影響 SEL1L 變異與一種嚴重的常染色體隱性神經發育疾病相關，通常於嬰兒期發病。疾病表現包括發育遲緩、無語言、智能障礙、身材矮小、小頭症、顏面異常、肌張力低下及／或共濟失調。 | 含實驗來源 | 證據與來源Neurodevelopmental disorder with poor growth, absent speech, progressive ataxia, and dysmorphic facies NEDGSAF A severe, autosomal recessive disorder with onset in infancy and characterized by developmental delay, absent speech, intellectual disability, short stature, microcephaly, facial dysmorphism, hypotonia, and/or ataxia. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 621067 PMID 37943610 ↗ |
| 疾病關聯 | 影響 SEL1L 變異與一種嚴重的常染色體隱性神經發育疾病相關，通常於嬰兒早期發病，具有發育遲緩、智能障礙、無語言、嚴重軸向肌張力低下、身材矮小及小頭症。患者有無丙種球蛋白血症且缺乏成熟 B 細胞，造成反覆上下呼吸道感染，並可能早逝。 | 含實驗來源 | 證據與來源Neurodevelopmental disorder with hypotonia, poor growth, dysmorphic facies, and agammaglobulinemia NEDHGFA A severe, autosomal recessive disorder with onset in early infancy and characterized by general developmental delay, intellectual disability, absent speech, severe axial hypotonia, short stature, and microcephaly. Patients exhibit agammaglobulinemia with no mature B cells, resulting in recurrent upper and lower respiratory infections and early death. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 621068 PMID 37943617 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGGAGACTAGAGCAGGAAGAGCAGCGGCGAGGCGGCGGTG40GTGGCTGAGTCCGTGGTGGCAGAGGCGAAGGCGACAGCTC80TAGGGGTTGGCACCGGCCCCGAGAGGAGGATGCGGGTCCG120GATAGGGCTGACGCTGCTGCTGTGTGCGGTGCTGCTGAGC160TTGGCCTCGGCGTCCTCGGATGAAGAAGGCAGCCAGGATG200AATCCTTAGATTCCAAGACTACTTTGACATCAGATGAGTC240AGTAAAGGACCATACTACTGCAGGCAGAGTAGTTGCTGGT280CAAATATTTCTTGATTCAGAAGAATCTGAATTAGAATCCT320CTATTCAAGAAGAGGAAGACAGCCTCAAGAGCCAAGAGGG360GGAAAGTGTCACAGAAGATATCAGCTTTCTAGAGTCTCCA400AATCCAGAAAACAAGGACTATGAAGAGCCAAAGAAAGTAC440GGAAACCAGCTTTGACCGCCATTGAAGGCACAGCACATGG480GGAGCCCTGCCACTTCCCTTTTCTTTTCCTAGATAAGGAG520TATGATGAATGTACATCAGATGGGAGGGAAGATGGCAGAC560TGTGGTGTGCTACAACCTATGACTACAAAGCAGATGAAAA600GTGGGGCTTTTGTGAAACTGAAGAAGAGGCTGCTAAGAGA640CGGCAGATGCAGGAAGCAGAAATGATGTATCAAACTGGAA680TGAAAATCCTTAATGGAAGCAATAAGAAAAGCCAAAAAAG720AGAAGCATATCGGTATCTCCAAAAGGCAGCAAGCATGAAC760CATACCAAAGCCCTGGAGAGAGTGTCATATGCTCTTTTAT800TTGGTGATTACTTGCCACAGAATATCCAGGCAGCGAGAGA840GATGTTTGAGAAGCTGACTGAGGAAGGCTCTCCCAAGGGA880CAGACTGCTCTTGGCTTTCTGTATGCCTCTGGACTTGGTG920TTAATTCAAGTCAGGCAAAGGCTCTTGTATATTATACATT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。