演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SECTM1K12

secreted and transmembrane 1

SECTM1(secreted and transmembrane 1)是屬於 SECTM 家族的蛋白質,具有分泌與單次跨膜特性,可能參與胸腺細胞訊號傳遞,並與 CD7 互作。

Homo sapiens17q25.3UniProt Q8WVN6
OFFICIAL SYMBOL
SECTM1
CHROMOSOME
17
UNIPROT
Q8WVN6
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SECTM1(secreted and transmembrane 1)是人類的蛋白質編碼基因,產物屬於 SECTM 家族。其蛋白質名稱為 Secreted and transmembrane protein 1,具有分泌與跨膜兩種特性,屬單次跨膜蛋白。這些基本特徵反映其結構可同時包含細胞外區域與膜內、膜外部分;來源並未提供更進一步的家族功能或結構細節。

Official symbol
SECTM1
Gene name
secreted and transmembrane 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10707
UniProt
Q8WVN6
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
K12

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q25.3
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegSECTM1pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr17:82,321,024–82,335,518
Gene span
14,495 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000269389 ★82,321,024–82,333,7665
ENST0000058043782,321,024–82,333,9705
ENST0000085678982,321,024–82,335,5185
ENST0000085679082,321,024–82,333,9705
ENST0000085679182,321,024–82,333,9705
ENST0000085679382,321,024–82,330,3426
ENST0000085679482,321,024–82,330,3425
ENST0000085679582,321,024–82,328,5354
ENST0000085679682,321,024–82,328,5105
ENST0000085679782,321,024–82,328,5355
ENST0000092783182,321,024–82,327,4665
ENST0000095822682,321,024–82,333,7395

顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SECTM1 的功能註解指出,它可能參與胸腺細胞的訊號傳遞。此描述具有不確定性,表示目前資料支持的是可能參與,而非已確立其在該訊號過程中的確切作用。來源未進一步說明訊號的方向、分子機制或對胸腺細胞活動的具體影響,因此不宜將其延伸解讀為特定的調控或細胞反應。

SECTM1 也被註記為與 CD7 互作。這項資訊提供了其可能與胸腺細胞訊號相關的互作線索,但來源沒有說明互作的分子方式、發生條件或是否形成特定複合體,也沒有提供足以判定此互作如何影響訊號傳遞的細節。因此,互作本身不應被直接等同於已知的功能結果。

綜合現有註解,SECTM1 的主要功能線索是可能參與胸腺細胞訊號傳遞,以及與 CD7 互作;兩者共同指出其可能與細胞訊號相關,但目前資料不足以界定其具體作用步驟或生物學後果。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 82333766 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SECTM1 ENST00000269389 GRCh38 chr17:82333666-82334766 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CTGGGTCTGATGGCTGAGCTGCAGGCTCCAAGGTTCAGCGTCCAGTCTGGCCCTGCTCCGTCCATTCCCC
ACATTTGAGGGTTTCCCGGAGTTTGGTTCTGCTTCTTCCTCTCTTCCATGAAACTGGGGGCATTGCCCAC
GCCCCAGTGTCCCCCATCATCTGCCCGGTGGGGACTTGCCCACTCACGTGACTGCAGCCTGTGGGGCCTC
CTCCTAGTGTCCCGAAGATACCTGGTCATCCTTGACCCCGCCCGCACCTGCCCGCGTGCCCCCTCGGGTT
CTAGTGGAGGACGTGGCCCGCCTGCCACCCCGCCAGGCGCCGGGTCCTCCAGGCCTCCTCGAGCCACCTC
CTGCCCACCTGGGATGTCTGTGGGTTCCCGGCCCGGATGCGTCTTGGAGCCTTCTACCCGCACCCCAATC
TCCTGCCCCAACAGGCTGGGCCCCTCCTCCCGGGCTGGCCAGGCCAGCACCTCCGCAGGGGCCGCAGGAC
GCCTGAAGGCCCAGGCCGCAGGTGCAGGACCCTCTGCGGGGGAGCTGGGGGACATCACTCCTCTGCTCTG
CGCGCTTTTATGAAAGGGCCTCTGACCCTCCGGGGGTCCAGCTCACTCTGCCCGCGCACTCCCAGGCATC
TGGGGGCCGCCCCCCGCCCTCCCTCCCCGCGGCCCACTCGGCCCGCCCAGCTCGCCCCGTGCACAGACTC
GAGGCCTCCAGGAGCGGAGCCAAACAGCCCCGCGGGGAACGCGCGCCGCACGCGAGCTGGACCCGCCCAG
GCACGAACTCTCCTGGAAAAATGCTCCCGGCGGCTTTCCTGCTTCCTTTAGCGTGAACCGCGGGTGCGGT
GCCTCCCGTGAAAATAATAAATTCACCGTCACGCTTGTTGTGAACGCGGGTGGTTCCCGAAACTTGGAGG
CTTCCCGTAAACCCAGCTCCTTCCTCATCTGGGAGGTGGGTCCCGCGCGGGTCCGCCGCCTCCTCCCTGG
CCCCTCCCTCTCGTGTCTTTCATTTTCCTGGGGCTCCGGGGCGCGGAGAAGCTGCATCCCAGAGGAGCGC
GTCCAGGAGCGGACCCGGTGAGGCGCGGAGAGGGGCGGGCGGGGGAACCAG
SECTM1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SECTM1_1 ↗17:82,333,766負股82,333,756–82,333,815
SECTM1_3 ↗17:82,333,998負股82,333,988–82,334,047
SECTM1_2 ↗17:82,334,133負股82,334,123–82,334,182

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_BLC5X · enhancer · 82328053–82328989 · regulatory

ENSR17_BLC69 · enhancer · 82330204–82331080 · regulatory

ENSR17_CB6KR · enhancer · 82332031–82333751 · regulatory

ENSR17_5PCTG7 · CTCF_binding_site · 82332973–82332994 · regulatory

ENSR17_937NCH · promoter · 82333752–82334256 · regulatory

ENSR17_5PCTPH · CTCF_binding_site · 82334543–82334564 · regulatory

ENSR17_937NCW · enhancer · 82335257–82335574 · regulatory

ENSR17_CB6L3 · enhancer · 82335794–82337116 · regulatory

ENSR17_CB6L8 · enhancer · 82338598–82339875 · regulatory

· motif · 82330392–82330404 · motif

· motif · 82330403–82330416 · motif

· motif · 82330403–82330416 · motif

· motif · 82330437–82330446 · motif

· motif · 82330449–82330458 · motif

· motif · 82330567–82330576 · motif

· motif · 82332788–82332803 · motif

· motif · 82332975–82332991 · motif

· motif · 82333011–82333025 · motif

· motif · 82333011–82333025 · motif

· motif · 82333018–82333029 · motif

· motif · 82334518–82334525 · motif

· motif · 82334518–82334531 · motif

· motif · 82334545–82334561 · motif

· motif · 82334728–82334743 · motif

· motif · 82334729–82334743 · motif

· motif · 82334765–82334780 · motif

· motif · 82334766–82334780 · motif

· motif · 82334786–82334801 · motif

· motif · 82334786–82334801 · motif

· motif · 82334886–82334900 · motif

· motif · 82334891–82334903 · motif

· motif · 82334893–82334900 · motif

· motif · 82334904–82334914 · motif

· motif · 82334910–82334920 · motif

· motif · 82336141–82336154 · motif

IFNG(IFN-gamma)與 SECTM1 蛋白質層級的調控相關。來源未提供調控方向或詳細條件,因此無法進一步判定 IFNG 對 SECTM1 蛋白質的具體影響。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:248 aa

1 aa248 aa訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 Q8WVN6 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SECTM1 蛋白質長 248 個胺基酸,屬於 SECTM 家族。序列註解預測其第 1–28 個胺基酸為訊號序列,第 29–145 個胺基酸位於細胞外,第 146–166 個胺基酸為螺旋型跨膜區,而第 167–248 個胺基酸位於細胞質側。這些區域描述屬於序列特徵註解。

訊號胜肽1–28 aa
拓樸區域Extracellular29–145 aa
跨膜區Helical146–166 aa
拓樸區域Cytoplasmic167–248 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8WVN6…

AlphaFold · Q8WVN6

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane;Secreted

SECTM1 被註記為位於細胞膜,並具有單次跨膜的第一型膜蛋白特性;同時也被註記為可分泌。 來源未說明分泌與膜定位的條件、動態或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
K12SECTM1ANKRD46EMP3
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SECTM1 被註記為與 CD7 互作。來源未進一步說明這是直接結合或複合體關係,也未提供互作條件與功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SECTM1 可能參與胸腺細胞的訊號傳遞;原始註記以可能性描述其作用,未進一步交代具體機制或影響。含實驗來源
證據與來源

May be involved in thymocyte signaling

PMID 15742156 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SECTM1 與 CD7 互作;此註記未說明互作方式、發生條件或功能結果。含實驗來源
證據與來源

Interacts with CD7

PMID 10652336 ↗ · PMID 15742156 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SECTM1 被註記為位於細胞膜,具有單次跨膜第一型膜蛋白特性,並可分泌;來源未交代定位改變或相關條件。推論支持
證據與來源

Cell membrane / Single-pass type I membrane protein; Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

調控IFNG(IFN-gamma)與 SECTM1 蛋白質層級的調控相關;來源未說明調控方向或具體影響。含實驗來源
證據與來源

By IFNG/IFN-gamma (at protein level)

PMID 15742156 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000269389 · 2,003 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CATTTTCCTGGGGCTCCGGGGCGCGGAGAAGCTGCATCCC40
41AGAGGAGCGCGTCCAGGAGCGGACCCGGGAGTGTTTCAAG80
81AGCCAGTGACAAGGACCAGGGGCCCAAGTCCCACCAGCCA120
121TGCAGACCTGCCCCCTGGCATTCCCTGGCCACGTTTCCCA160
161GGCCCTTGGGACCCTCCTGTTTTTGGCTGCCTCCTTGAGT200
201GCTCAGAATGAAGGCTGGGACAGCCCCATCTGCACAGAGG240
241GGGTAGTCTCTGTGTCTTGGGGCGAGAACACCGTCATGTC280
281CTGCAACATCTCCAACGCCTTCTCCCATGTCAACATCAAG320
321CTGCGTGCCCACGGGCAGGAGAGCGCCATCTTCAATGAGG360
361TGGCTCCAGGCTACTTCTCCCGGGACGGCTGGCAGCTCCA400
401GGTTCAGGGAGGCGTGGCACAGCTGGTGATCAAAGGCGCC440
441CGGGACTCCCATGCTGGGCTGTACATGTGGCACCTCGTGG480
481GACACCAGAGAAATAACAGACAAGTCACGCTGGAGGTTTC520
521AGGTGCAGAACCCCAGTCCGCCCCCGACACTGGGTTCTGG560
561CCTGTGCCAGCGGTGGTCACTGCTGTCTTCATCCTCTTGG600
601TCGCTCTGGTCATGTTCGCCTGGTACAGGTGCCGCTGTTC640
641CCAGCAACGCCGGGAGAAGAAGTTCTTCCTCCTAGAACCC680
681CAGATGAAGGTCGCAGCCCTCAGAGCGGGAGCCCAGCAGG720
721GCCTGAGCAGAGCCTCCGCTGAACTGTGGACCCCAGACTC760
761CGAGCCCACCCCAAGGCCGCTGGCACTGGTGTTCAAACCC800
801TCACCACTTGGAGCCCTGGAGCTGCTGTCCCCCCAACCCT840
841TGTTTCCATATGCCGCAGACCCATAGCCGCCTGCAAGGCA880
881GAGAGGACACAGGAGAGCCAGCCCTGAGTGCCGACCTTGG920
921GTGGCGGGGCCTGGGTCTCTCGTCCCACCCGGAGGGCACA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。