基因總覽
SEC62 基因是蛋白質編碼基因，其產物為 SEC62 preprotein translocation factor，屬於 SEC62 family。此蛋白質是內質網轉位體的輔助組成之一，參與前驅多肽的轉運。蛋白質具有多段膜拓樸：N 端一段細胞質區域之後，依序為兩段跨膜螺旋與一段短腔內區域，C 端則位於細胞質側。資料亦將部分細胞質區域註記為無序區。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000337002 ★ | 169,966,807–169,998,373 | 8 |
| ENST00000480708 | 169,966,797–169,993,831 | 9 |
| ENST00000870858 | 169,966,797–169,998,373 | 4 |
| ENST00000870859 | 169,966,797–169,998,373 | 9 |
| ENST00000870860 | 169,966,797–169,998,373 | 8 |
| ENST00000870861 | 169,966,797–169,998,373 | 3 |
| ENST00000870862 | 169,966,797–169,998,373 | 8 |
| ENST00000870863 | 169,966,797–169,998,373 | 7 |
| ENST00000870864 | 169,966,797–169,998,373 | 5 |
| ENST00000870865 | 169,966,797–169,998,373 | 9 |
| ENST00000932400 | 169,966,797–169,998,373 | 8 |
| ENST00000932401 | 169,966,797–169,994,178 | 5 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SEC62 參與前驅多肽由細胞質側跨越內質網膜的轉運，所述運送發生於蛋白質合成之後。對小型分泌前蛋白，SEC62 被提出可能充當標的受體；這類蛋白質具有短且非極性的訊號肽，因此其受體角色仍屬提出的作用模型。
在轉運過程中，SEC62 將新合成的分泌前蛋白引導至 SEC61 通道形成型轉位體複合體，並使其適當定位。這項定位接續促發通道開啟，使多肽得以轉運至內質網腔。資料支持的功能描述聚焦於蛋白質標的與定位，以及 SEC61 通道開啟後的跨膜運送；未提供其他下游作用或細胞情境。
Promoter 與基因調控
>SEC62 ENST00000337002 GRCh38 chr3:169965807-169966907 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGTGAGCCGAGACTGCGCCACTGCACTCCAGCTTGGGCAATATAGAGCGAAACTCAGCATCAAAAAAAAA AGAACATCTTTCTATTCTGAATTTTCCCAATTTTCTACAATTAAAAACGCTTTAAAGATCTCTATAAAGT CAGTCAAGGGAATTTCTATCTAAGCACTTACCAGCAATTTGAGCTCCTTCTCTTTTGGTCTAGGTGGCTC TAAAATAACAATAAAGGCTACAGTGATTGAAATTCACCAGACTTGAAATAGACTGCAGCCTTCTTCCTTC CCACCTTCTTAGAATCTTTGTCCTATTCATCTTCCTTACGCTTCCCCGGGTTCTCTTACTTCTGGATTCT AACAGTGAGTTGTGAGAAGCAACGCGGAAAACGGAATGGAGACTCCAGCTTGTTTTAAACGAGCTGTATT ACCCCGCACAGTGCAGGAGAAAAGATAATTGGCTCAGGTCTCGGCTCTGCCATCTACCACCTGTGGAGCC TTAGATAAGTCAGTTCTTATCTCTGTCACTCAACGGTCTCGGTCTTGTCATCTTTTACATGGAATGTCAT GAAATATACAGTACATTGCAGGAACTGCCTCAGGTAAAGACTTCTAGGGTTCAGTAGGTCTCAGTCGATC CCTCTGAGAAAGGCCGCACCCTAAATGCACAGACTCTGACTCTAAGGGGATGGGGTCGGGGAATCTGCAT TTTAGTAGCTTCTCAGGTGATTCAGATGCTCAGTCAGGATTGAGAAACCAGGACTCTTCCCAGCCCTCCT GTTCTCTGATCCACTTCTCTGCTTCCTCCACGTCCTAACGATTCTCCAGTTCCCGCACAGCAGGAGCGGA GGGAAGAGGGGAGAGAAGGCACCGCTAAGGACCGCTGGCCCCGCCAGGCGGCCGACCTCCCCATTCCAGG GGCGCCAGCCGGCGGATTACATAACGGGCCTCGGGGCGCGTTCTCGCGAGGTTTCCACCGCCCCCTCCTC GCTCCACGTCAGAGGGAACCGGGCGGAGCGGCCAACATGGCGGAACGCAGGAGACACAAGAAGCGGATCC AGGTAGCAAAGCCGAGCTCTGGGCAGGGGGCTTCGGCGCGCTGGATAGTGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SEC62_1 ↗ | 3:169,966,811 | 正股 | 169,966,762–169,966,821 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR3_86ZWX2 · enhancer · 169964258–169964499 · regulatory
ENSR3_CLTD2 · enhancer · 169965613–169966661 · regulatory
ENSR3_86ZWZD · promoter · 169966662–169966818 · regulatory
ENSR3_B38PQ6 · enhancer · 169966819–169967818 · regulatory
ENSR3_53GZDTN · CTCF_binding_site · 169967082–169967103 · regulatory
ENSR3_53GZDWM · CTCF_binding_site · 169967288–169967309 · regulatory
· motif · 169966299–169966305 · motif
· motif · 169966312–169966318 · motif
· motif · 169966675–169966692 · motif
· motif · 169966773–169966786 · motif
· motif · 169966821–169966831 · motif
· motif · 169967084–169967100 · motif
· motif · 169967138–169967155 · motif
· motif · 169967290–169967306 · motif
· motif · 169967504–169967512 · motif
· motif · 169969373–169969386 · motif
· motif · 169971706–169971715 · motif
· motif · 169971706–169971715 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：399 aa
SEC62 preprotein translocation factor 長 399 個胺基酸，屬於 SEC62 family。其第 1–196 與 256–399 位胺基酸區段位於細胞質側；第 197–217 與 235–255 位胺基酸區段為跨膜螺旋，中間第 218–234 位胺基酸區段位於腔內。第 108–167 及 289–399 位胺基酸區段被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SEC62 是內質網膜上的多次跨膜蛋白。 資料未提供其定位隨條件或異構型改變的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- GABARAPO95166 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SEC62 是內質網轉位體的輔助組成之一；此複合體的通道核心由 SEC61A1、SEC61B 與 SEC61G 構成，並可包含 SEC62、SEC63 等輔助組成。另有資料指出 SEC62 與 SEC61B 互作。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SEC62 介導前驅多肽在蛋白質合成後跨越內質網膜的轉運。它被提出可能作為標的受體，辨識帶有短且非極性訊號肽的小型分泌前蛋白，並將新合成的分泌前蛋白引導及適當定位至 SEC61 通道形成型轉位體，促使通道開啟，使多肽進入內質網腔。 | 含實驗來源 | 證據與來源Mediates post-translational transport of precursor polypeptides across endoplasmic reticulum (ER). Proposed to act as a targeting receptor for small presecretory proteins containing short and apolar signal peptides. Targets and properly positions newly synthesized presecretory proteins into the SEC61 channel-forming translocon complex, triggering channel opening for polypeptide translocation to the ER lumen PMID 22375059 ↗ · PMID 29719251 ↗ |
| 交互作用 | 內質網轉位體的通道核心組成包括 SEC61A1、SEC61B 與 SEC61G，並可含有 SEC62、SEC63 等不同輔助組成。SEC62 與 SEC61B 互作。 | 推論支持 | 證據與來源The ER translocon complex that consists of channel-forming core components SEC61A1, SEC61B and SEC61G and different auxiliary components such as SEC62 and SEC63. Interacts with SEC61B |
| 細胞定位 | SEC62 位於內質網膜，屬於多次跨膜蛋白。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GGGCGGAGCGGCCAACATGGCGGAACGCAGGAGACACAAG40AAGCGGATCCAGGAAGTTGGTGAACCATCTAAAGAAGAGA80AGGCTGTGGCCAAGTATCTTCGATTCAACTGTCCAACAAA120GTCCACCAATATGATGGGTCACCGGGTTGATTATTTTATT160GCTTCAAAAGCAGTGGACTGTCTTTTGGATTCAAAGTGGG200CAAAGGCCAAGAAAGGAGAGGAAGCTTTATTTACAACCAG240GGAGTCTGTGGTTGACTACTGCAACAGGCTTTTAAAGAAG280CAGTTTTTTCACCGAGCCCTAAAAGTAATGAAAATGAAAT320ATGATAAAGACATAAAGAAAGAAAAAGATAAAGGAAAAGC360TGAAAGTGGAAAAGAAGAAGATAAAAAGAGCAAGAAAGAA400AATATAAAGGATGAGAAGACAAAAAAAGAAAAAGAGAAAA440AAAAAGATGGTGAAAAGGAAGAATCCAAAAAGGAGGAAAC480TCCAGGAACTCCTAAAAAGAAGGAAACTAAGAAAAAATTC520AAACTTGAGCCACATGATGATCAGGTTTTTCTGGATGGAA560ATGAGGTGTATGTATGGATCTATGACCCAGTTCACTTTAA600AACATTTGTCATGGGATTAATTCTTGTGATTGCAGTAATA640GCGGCCACCCTCTTCCCCCTTTGGCCAGCAGAAATGAGAG680TAGGTGTTTATTACCTCAGTGTGGGTGCAGGCTGTTTTGT720AGCCAGTATTCTTCTCCTTGCTGTTGCTCGATGCATTCTA760TTTCTCATCATTTGGCTCATAACTGGAGGAAGGCACCACT800TTTGGTTCTTGCCAAATCTGACTGCTGATGTGGGCTTCAT840TGACTCCTTCAGGCCTCTGTACACACATGAATACAAAGGA880CCAAAAGCAGACTTAAAGAAAGATGAGAAGTCTGAAACCA920AAAAGCAACAGAAGTCCGACAGTGAGGAAAAGTCAGACAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。