基因總覽
SEC24B（SEC24 homolog B, COPII component）是由蛋白質編碼基因 SEC24B 產生的蛋白質，屬於 SEC23/SEC24 家族中的 SEC24 亞家族。它是 COPII 外被複合體的組成成分；此複合體參與由內質網形成運輸囊泡，並負責選取要運送的貨物。SEC24B 的主要特色是位於 COPII 系統中，與囊泡形成及貨物分選相關；其具體分選作用與可能辨識的貨物特徵詳見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000265175 ★ | 109,433,815–109,540,896 | 24 |
| ENST00000504968 | 109,433,602–109,540,896 | 25 |
| ENST00000399100 | 109,433,602–109,540,896 | 23 |
| ENST00000898580 | 109,433,602–109,540,896 | 23 |
| ENST00000898581 | 109,433,602–109,540,896 | 24 |
| ENST00000898582 | 109,433,602–109,540,896 | 22 |
| ENST00000898583 | 109,433,602–109,540,896 | 25 |
| ENST00000898584 | 109,433,602–109,540,896 | 22 |
| ENST00000898585 | 109,433,602–109,540,896 | 22 |
| ENST00000898586 | 109,433,602–109,540,896 | 24 |
| ENST00000898587 | 109,433,602–109,540,896 | 24 |
| ENST00000898588 | 109,433,602–109,540,896 | 24 |
顯示 12/31 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SEC24B 是 COPII 外被複合體的組成成分，參與促進由內質網形成運輸囊泡。COPII 外被有兩項主要作用：使內質網膜產生形變並形成囊泡，以及挑選將運送至高基氏體的貨物分子。SEC24B 在複合體內的核心角色是貨物選擇，因而參與內質網至高基氏體運輸路徑中的貨物包裝。
SEC24B 可能偏好包裝帶有細胞質 DxE 或 LxxLE 基序的貨物，也可能辨識構形表位。來源以「可能」描述這些辨識特性，因此不能視為對所有貨物皆適用的確定規則。這些特性說明 SEC24B 的貨物選擇不僅涉及短序列基序，也可能與貨物的構形特徵有關。
SEC24B 與 SEC24A 可能具有相近的分選特異性；兩者的特異性可能不同於 SEC24C 與 SEC24D。此差異表示 SEC24 家族成員可能在所選貨物方面有所區別，但來源未進一步列出各成員所對應的特定貨物。SEC24B 的作用因此可概括為參與 COPII 囊泡形成過程中的貨物分選，而其貨物偏好與家族成員間的特異性仍帶有來源所述的不確定性。
Promoter 與基因調控
>SEC24B ENST00000265175 GRCh38 chr4:109432815-109433915 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCTCCAATACAGAGTGATGACATACTCAGGATTCCAAGACGGCAAAATGACTTGGGTAATGTAGTCTAGG GCCTGCCAGTGAGTATGCTGAGACAGACCAGAAAGACTTAAAGATTCCACTAATGTAGACAAAGCAAGCT GAGCCACAACTTCTCGGAACACCAACAGGATGCACCAACAATCGACAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGAT AAAGTTTAAAGTTTGTCTTCCAGCATTCCCTTACCCTATTTTCCCCTTCCTCTTCCCTACTTTATCAGTG GGAAAAGTTCTCAATAATGCAATTCTTACTGAGATTCTTGTGTTTATCAGAGAAATGTTTCCTCTTTCTT TGCCAAGGAATTATATATTCCCAACAGACATGGCGCTTGAATGCTATATTTCCTTTGGAATCAAGAAAGG GGAGGTGGGGGAATCAAAAATTAAAAACCAAACCCAAGCCATTGTTCCTCTTCGAGGAAGGGTGGGTGGT CAGTCGTCGCCTGAGCTCCGAACATCAACCCGCGGCTCTCAAGTTCCCCTCCCAGTAATGCTGGGCCCAG CCTCGCCGCGGCCGATCCAGCCTCTGCCCTAGGTGGAAGCGGGCCACCCGGTCCCTTCACCCACTGAGGC CCAGTCCTTTCGCCTCAACACGAAGGCACCTGGCCGGGCCGGAGCAGCAGCCGCGGGGCCGGCACTGGGG CCACGGAACCCCGGGCCAGACTCAGGCCTGGGCCAGCTCGGCTCCGGCCTGCAGGGGGCGCTGCGGCGGC ACCGGCGCGAGGCCCGCGCGTGCGGGGAGCGACCCCAGGTGTAAGTCCCGGGGCGTGGGGCGCGTGGGTC AAGGCGGAGCGACCCAGGATCCCCGCGCCCGCGGCGGCCGCCGAGTGGCAGCGCTGGACTCGCGGAGAAG CTTGGGTACCTGAGCCGCGGTCCCGGGTGACACCCTCAGTGACGCCAGGCGCGTTCCTTCCTCTTCCTCT CTCCTCTCCGGCCCCGCCTTCCCTTCCCTCCGCCCACCTCCCTGAAGCGGAGCCGCCGTCGCCACCAGCG CCGTCATGTCGGCCCCCGCCGGGTCCTCTCACCCGGCCGCCAGCGCCCGGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SEC24B_1 ↗ | 4:109,433,826 | 正股 | 109,433,777–109,433,836 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR4_857TJ7 · enhancer · 109432723–109432963 · regulatory
ENSR4_93LFQN · promoter · 109432964–109433464 · regulatory
ENSR4_5XPZ86 · CTCF_binding_site · 109432972–109432993 · regulatory
ENSR4_BRPDG · promoter · 109433554–109434319 · regulatory
ENSR4_5XPZBW · CTCF_binding_site · 109433558–109433579 · regulatory
ENSR4_5XPZC5 · CTCF_binding_site · 109433610–109433631 · regulatory
· motif · 109432462–109432471 · motif
· motif · 109432974–109432990 · motif
· motif · 109433560–109433576 · motif
· motif · 109433590–109433606 · motif
· motif · 109433590–109433606 · motif
· motif · 109433612–109433628 · motif
· motif · 109433618–109433627 · motif
· motif · 109433779–109433792 · motif
· motif · 109433801–109433814 · motif
· motif · 109433873–109433886 · motif
· motif · 109433949–109433966 · motif
· motif · 109434138–109434151 · motif
· motif · 109434201–109434214 · motif
· motif · 109434223–109434236 · motif
· motif · 109434229–109434242 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1268 aa
SEC24B 蛋白質長 1268 個胺基酸，屬於 SEC23/SEC24 家族的 SEC24 亞家族。序列註解標示第 1141–1213 位有 Gelsolin-like 重複區，以及第 605–629 位的類鋅指區域；另有數段被註記為無序區，分布於第 1–71、216–263、303–345 與 362–451 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SEC24B 位於細胞質與細胞溶質，也可作為周邊膜蛋白位於內質網膜及 COPII 被覆囊泡膜的細胞質側。 來源未提供其定位隨條件或異構型改變的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- SEC23AQ15436 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
COPII 至少由五種蛋白質組成，包括 Sec23/24 複合體、Sec13/31 複合體與 SAR1；SEC24B 是其中 Sec23/24 複合體的一部分。另有互作紀錄指出，SEC24B 與 STING1、RNF139、TMED2、TMED10 及 CNIH4 互作。SEC24B 促進 STING1 轉位至 COPII 囊泡的作用依賴 STEEP1；這是功能關係描述，來源未將其等同於 SEC24B 與 STEEP1 的直接結合。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SEC24B 是 COPII 外被複合體的組成成分，參與促進內質網形成運輸囊泡。COPII 外被負責使內質網膜形變成囊泡，並挑選運送至高基氏體的貨物。SEC24B 在複合體中負責貨物選擇；它可能偏好帶有細胞質 DxE 或 LxxLE 基序的貨物，也可能辨識構形表位。SEC24B 與 SEC24A 的特異性可能不同於 SEC24C、SEC24D。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the coat protein complex II (COPII) which promotes the formation of transport vesicles from the endoplasmic reticulum (ER). The coat has two main functions, the physical deformation of the endoplasmic reticulum membrane into vesicles and the selection of cargo molecules for their transport to the Golgi complex. Plays a central role in cargo selection within the COPII complex and together with SEC24A may have a different specificity compared to SEC24C and SEC24D. May package preferentially cargos with cytoplasmic DxE or LxxLE motifs and may also recognize conformational epitopes PMID 17499046 ↗ · PMID 18843296 ↗ · PMID 20427317 ↗ |
| 交互作用 | COPII 至少包含 Sec23/24 複合體、Sec13/31 複合體與 SAR1。SEC24B 與 STING1、RNF139、TMED2、TMED10 及 CNIH4 有互作紀錄；其中 SEC24B 促進 STING1 轉位至 COPII 囊泡的作用依賴 STEEP1。 | 含實驗來源 | 證據與來源COPII is composed of at least five proteins: the Sec23/24 complex, the Sec13/31 complex and SAR1. Interacts with STING1; promoting STING1 translocation to COPII vesicles in a STEEP1-dependent manner. Interacts with RNF139. Interacts with TMED2 and TMED10. Interacts with CNIH4 PMID 10075675 ↗ · PMID 17499046 ↗ · PMID 19706601 ↗ · PMID 20427317 ↗ · PMID 24405750 ↗ · PMID 32690950 ↗ |
| 細胞定位 | SEC24B 位於細胞質與細胞溶質，也定位於 COPII 被覆囊泡膜及內質網膜的細胞質側；在這兩種膜上均註記為周邊膜蛋白。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasmic vesicle, COPII-coated vesicle membrane / Peripheral membrane protein / Cytoplasmic side; Endoplasmic reticulum membrane / Peripheral membrane protein / Cytoplasmic side; Cytoplasm, cytosol PMID 10075675 ↗ |
核酸與蛋白質序列
CCCTTCCCTCCGCCCACCTCCCTGAAGCGGAGCCGCCGTC40GCCACCAGCGCCGTCATGTCGGCCCCCGCCGGGTCCTCTC80ACCCGGCCGCCAGCGCCCGGATCCCGCCCAAGTTCGGCGG120AGCGGCCGTCTCAGGAGCCGCAGCGCCCGCGGGCCCGGGT160GCGGGCCCGGCGCCGCACCAGCAGAACGGTCCAGCCCAGA200ATCAAATGCAGGTTCCATCTGGATATGGATTGCATCATCA240AAACTATATTGCTCCCTCAGGACATTACTCTCAAGGACCT280GGGAAAATGACCTCATTGCCATTGGATACCCAGTGTGGTG320ATTACTACTCTGCTCTCTATACAGTACCAACACAAAATGT360GACTCCTAACACAGTGAACCAGCAACCAGGAGCACAGCAG400TTGTACAGCAGGGGTCCTCCTGCCCCTCATATTGTGGGAT440CCACTCTAGGATCTTTCCAAGGTGCTGCATCGTCAGCATC480CCATTTGCATACGAGTGCCTCCCAACCATACTCCTCTTTT520GTGAATCACTACAATAGTCCAGCCATGTACTCTGCCAGCT560CTTCTGTTGCGTCTCAGGGATTTCCCTCTACTTGTGGTCA600TTATGCTATGTCAACTGTTTCTAATGCCGCGTATCCTAGT640GTTTCATATCCCTCTCTGCCTGCTGGTGATACATATGGGC680AAATGTTTACCTCACAGAATGCTCCGACTGTTAGGCCAGT720TAAAGATAATTCATTCTCTGGTCAAAATACAGCTATCAGC760CATCCATCGCCACTTCCACCTCTACCATCACAACAGCACC800ACCAGCAGCAAAGTCTTTCAGGATACAGTACTCTAACGTG840GTCATCTCCAGGCCTTCCATCGACTCAAGACAATCTCATC880CGAAACCACACAGGATCCCTGGCTGTAGCGAACAACAACC920CAACCATTACTGTTGCAGATTCTTTATCCTGTCCTGTTAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。