演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SEC14L1PRELID4A

SEC14 like lipid binding 1

SEC14L1 編碼 SEC14-like protein 1,可能參與先天免疫調控,並與膽鹼能運輸蛋白 SLC18A3、SLC5A7 的調節相關。

Homo sapiens17q25.2-q25.3UniProt Q92503
OFFICIAL SYMBOL
SEC14L1
CHROMOSOME
17
UNIPROT
Q92503
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SEC14L1(SEC14 like lipid binding 1)是蛋白質編碼基因,產物為長 715 個胺基酸的 SEC14-like protein 1。其蛋白質序列包含 PRELI/MSF1、CRAL-TRIO 與 GOLD 三個結構域,呈現多個不同區域的結構組成。來源資料指出,SEC14L1 與先天免疫訊號調控及膽鹼能運輸蛋白調節有關;這些生物學作用的具體方式另於功能段落說明。

Official symbol
SEC14L1
Gene name
SEC14 like lipid binding 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10698
UniProt
Q92503
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
PRELID4ASEC14L

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1717q25.2-q25.3
chr17 · 83,257,441 bp · GRCh38chr17p13.3 · 1–3400000 · gnegchr17p13.2 · 3400001–6500000 · gpos50chr17p13.1 · 6500001–10800000 · gnegchr17p12 · 10800001–16100000 · gpos75chr17p11.2 · 16100001–22700000 · gnegchr17p11.1 · 22700001–25100000 · acenchr17q11.1 · 25100001–27400000 · acenchr17q11.2 · 27400001–33500000 · gnegchr17q12 · 33500001–39800000 · gpos50chr17q21.1 · 39800001–40200000 · gnegchr17q21.2 · 40200001–42800000 · gpos25chr17q21.31 · 42800001–46800000 · gnegchr17q21.32 · 46800001–49300000 · gpos25chr17q21.33 · 49300001–52100000 · gnegchr17q22 · 52100001–59500000 · gpos75chr17q23.1 · 59500001–60200000 · gnegchr17q23.2 · 60200001–63100000 · gpos75chr17q23.3 · 63100001–64600000 · gnegchr17q24.1 · 64600001–66200000 · gpos50chr17q24.2 · 66200001–69100000 · gnegchr17q24.3 · 69100001–72900000 · gpos75chr17q25.1 · 72900001–76800000 · gnegchr17q25.2 · 76800001–77200000 · gpos25chr17q25.3 · 77200001–83257441 · gnegSEC14L1pq1 bp83,257,441 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr17:77,088,749–77,217,101
Gene span
128,353 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000436233 ★77,140,969–77,217,10117
ENST0000056172177,088,749–77,143,6385
ENST0000058982777,088,749–77,206,39513
ENST0000039247677,088,749–77,217,10120
ENST0000043076777,089,155–77,216,80218
ENST0000087514877,125,593–77,214,10215
ENST0000087514677,127,840–77,217,10117
ENST0000095536677,127,840–77,214,33117
ENST0000058642977,127,873–77,190,9524
ENST0000087514777,127,873–77,217,10117
ENST0000087514977,130,104–77,214,10216
ENST0000095536777,132,881–77,214,41117

顯示 12/30 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SEC14L1 可能參與先天免疫,並在抗病毒 RIG-I 訊號路徑中扮演負向調節者。RIG-I 是位於細胞質、可感測病毒核酸的感受器;SEC14L1 會抑制此路徑中的 RIG-I 訊號。來源指出,SEC14L1 可阻止 RIG-I 與 MAVS/IPS1 互相作用,而這項互動是訊號傳遞的重要步驟。因此,SEC14L1 對此路徑的影響與限制訊號傳播相關;資料將其描述為可能具有此作用,並未將其表述為確定的普遍功能。

在另一項功能關聯中,SEC14L1 也可能調節膽鹼能運輸蛋白 SLC18A3 與 SLC5A7。來源未進一步說明調節方向或具體分子機制,因此目前可確定的描述限於其可能參與這兩種運輸蛋白的調節。這些免疫訊號與運輸蛋白相關作用,構成來源所記載的 SEC14L1 功能範圍。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 77140969 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SEC14L1 ENST00000436233 GRCh38 chr17:77139969-77141069 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGTCCAAAAACGTTCTGTCCAATGGCAGCATGAAATGTACAGCCACTCAGGGTGACTAATGTGAACGGAA
CAACAGTGACTTTGACAGTGAAATTGCATGTTGGTTATAAAACCAGCTTTGCTGTGTGGGTGGGCATGCG
AGGTGCCCCTTTCTAGTCATGAGCTCCTCTTAAGGACCCCAAAATGTCTCAGTGGTACCGGATTGAAAAT
TGGGGCTGGACGGTGCTCTCCTGCTGAAATTCGGGAGCTACTTAGCAGCCCCACCTTGGCACCCTCGTTT
CCGAGGGGCAGGCCCTGGGCGCGCGTCTCAGTTTCAAGCCCGCGGCCCGACACTAGAGCCGTCTGGATGT
GTTGACAAGGATGCCGCTGGGCTCCACCCGGGCTCACCCGGGCCCTCCCGAGCCCTGGGCCGCGCAGCAC
CGGCGTCCGCCTCCTCCCCATTACTCGGCGAGAATGCGGTCGGGGCACTGGCGCGAGCAGCCTGGTGCTC
CTGAACAGTCAACAAGAAATGAGGAAGCACGGGGGCAGCCGCCAGGGCGACCAGAGGCAGGCCTCAGAGC
AGCAGCCATACGGGAGGGCCCCGGTGGTTTTGACCTCCCGCAAACTTCCCTTTTCCCGCTCAGCCGAACC
CCTCCCCTGCACGCCGGCAGCCCCTTGGGGCTTCACTCCGCCTCCGCCCGCTACTCGCGAAGCCCAGCCC
GGCCCCGCCCCCAACAAGTGACGCAAAACTGGGAGGGGCCACGAGGACCTCGGGCACATCCAGCAGTGCG
ACGGGGCCGGCGCCTTCTCCGAGCTCCTCCCACGCTCGCGGGTCGGAGCTCGCGCCTGCGCAGTTCGGGC
CCCGGGTGTCCTCCCCCCTCCCCTTTCTTAGCAACCATCGCCCGCTCCCGCCCCCGCTCCCTCGGCCGCG
GCCGCGCACGCGCGCCCCTCCCGGCGCCCGGCCCCGCCCACCCCGTCACCCGTAACAACCACAAGTGCCG
TCGCCGCGCCCCTTCCCCCTCCCGCCTCCCCGGCCCCCTCCCCGGAACCGGCGGTCGAGCTACGGTCGCG
GAGCAGTGGAACCGAGACTGCCCCGCGGAGCCGCCGGTATGAGCGCCCCTC
SEC14L1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SEC14L1_3 ↗17:77,088,753正股77,088,704–77,088,763
SEC14L1_2 ↗17:77,140,969正股77,140,920–77,140,979
SEC14L1_1 ↗17:77,141,023正股77,140,974–77,141,033

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR17_BKBC2 · enhancer · 77137823–77138365 · regulatory

ENSR17_BKBCF · promoter · 77140442–77141042 · regulatory

ENSR17_C9MN9 · enhancer · 77141043–77142404 · regulatory

ENSR17_935LPW · promoter · 77144295–77144656 · regulatory

ENSR17_C9MNK · enhancer · 77145280–77146523 · regulatory

· motif · 77136095–77136110 · motif

· motif · 77136100–77136112 · motif

· motif · 77136103–77136118 · motif

· motif · 77137766–77137780 · motif

· motif · 77137878–77137892 · motif

· motif · 77137878–77137892 · motif

· motif · 77138092–77138106 · motif

· motif · 77138092–77138106 · motif

· motif · 77140474–77140487 · motif

· motif · 77140476–77140487 · motif

· motif · 77140558–77140565 · motif

· motif · 77140571–77140584 · motif

· motif · 77140596–77140606 · motif

· motif · 77140617–77140630 · motif

· motif · 77140617–77140630 · motif

· motif · 77140635–77140648 · motif

· motif · 77140670–77140680 · motif

· motif · 77140763–77140776 · motif

· motif · 77140789–77140800 · motif

· motif · 77140789–77140800 · motif

· motif · 77140822–77140832 · motif

· motif · 77140855–77140868 · motif

· motif · 77140881–77140892 · motif

· motif · 77140881–77140892 · motif

· motif · 77140905–77140918 · motif

· motif · 77140911–77140924 · motif

· motif · 77140925–77140942 · motif

· motif · 77140934–77140942 · motif

· motif · 77140934–77140951 · motif

· motif · 77141385–77141396 · motif

· motif · 77141455–77141468 · motif

· motif · 77141455–77141468 · motif

· motif · 77142322–77142344 · motif

· motif · 77142322–77142344 · motif

· motif · 77142771–77142793 · motif

· motif · 77142771–77142793 · motif

· motif · 77142894–77142906 · motif

· motif · 77143459–77143467 · motif

· motif · 77143524–77143539 · motif

· motif · 77143531–77143539 · motif

· motif · 77143564–77143576 · motif

· motif · 77144470–77144481 · motif

· motif · 77144470–77144481 · motif

· motif · 77144484–77144493 · motif

· motif · 77144783–77144794 · motif

· motif · 77144910–77144921 · motif

· motif · 77144916–77144927 · motif

· motif · 77145360–77145372 · motif

· motif · 77145437–77145449 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:715 aa

1 aa715 aa結構域功能區域
依 Q92503 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SEC14-like protein 1 長 715 個胺基酸,含有 PRELI/MSF1(第 1–175 位)、CRAL-TRIO(第 319–495 位)及 GOLD(第 521–674 位)結構域。第 1–510 位胺基酸區域被註記為 RIG-I 互動及抑制功能所需。

結構域PRELI/MSF11–175 aa
結構域CRAL-TRIO319–495 aa
結構域GOLD521–674 aa
功能區域Required for interaction and inhibitory function toward RIGI1–510 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q92503…

AlphaFold · Q92503

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cytoplasm;Golgi apparatus

來源未提供定位改變的條件、動態或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
PRELID4ASEC14L1CEP70
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SEC14L1 與 RIG-I 直接互動,涉及其 tandem CARD domain;也透過 GOLD domain 分別與 SLC18A3、SLC5A7 直接互動。這些資料支持蛋白質間的直接互動,未指出三者共同形成複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SEC14L1 可能參與先天免疫,並藉由抑制抗病毒 RIG-I 訊號路徑發揮作用。在此路徑中,它是細胞質病毒核酸感受器 RIG-I 的負向調節者,可阻止 RIG-I 與 MAVS/IPS1 互動;該互動是訊號傳遞的重要步驟。此外,SEC14L1 也可能調節膽鹼能運輸蛋白 SLC18A3 與 SLC5A7。含實驗來源
證據與來源

May play a role in innate immunity by inhibiting the antiviral RIG-I signaling pathway. In this pathway, functions as a negative regulator of RIGI, the cytoplasmic sensor of viral nucleic acids. Prevents the interaction of RIGI with MAVS/IPS1, an important step in signal propagation. May also regulate the SLC18A3 and SLC5A7 cholinergic transporters

PMID 17092608 ↗ · PMID 23843640 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SEC14L1 透過 tandem CARD domain 與 RIG-I 直接互動;此外,它透過 GOLD domain 分別與 SLC18A3 及 SLC5A7 直接互動。含實驗來源
證據與來源

Interacts with RIGI (via tandem CARD domain); the interaction is direct. Interacts (via GOLD domain) with SLC18A3; the interaction is direct. Interacts with SLC5A7 (via GOLD domain); the interaction is direct

PMID 17092608 ↗ · PMID 23843640 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SEC14L1 的定位包括細胞質與 Golgi apparatus。含實驗來源
證據與來源

Cytoplasm; Golgi apparatus

PMID 17092608 ↗ · PMID 23843640 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000436233 · 5,500 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1CCCGCCTCCCCGGCCCCCTCCCCGGAACCGGCGGTCGAGC40
41TACGGTCGCGGAGCAGTGGAACCGAGACTGCCCCGCGGAG80
81CCGCCGGTATGAGCGCCCCTCGCCACCCCGTGTCCCAGGC120
121CCGGCCTTTCTGACAAGAGCTAGACTTCGGGCTCCTTGAG160
161GATATTCAGTTTTGTATGTTTGAATATCCTCTCACCATGT200
201TCAGCATAAAGTACCATTCTTAATGATTATCCTCAACAAG240
241ACAGGTGTGAGAGGGTTGCTGTTGTATTGCAATCATGGTG280
281CAGAAATACCAGTCCCCAGTGAGGGTGTACAAATACCCCT320
321TTGAATTAATTATGGCTGCCTATGAAAGGAGGTTCCCTAC360
361ATGTCCTTTGATTCCGATGTTCGTGGGCAGTGACACTGTG400
401AATGAATTCAAGAGCGAAGATGGGGCTATTCATGTCATTG440
441AAAGGCGCTGCAAGCTGGATGTAGATGCACCCAGACTGCT480
481GAAGAAGATTGCAGGAGTTGATTATGTTTATTTTGTCCAG520
521AAAAACTCACTGAATTCTCGGGAACGTACTTTGCACATTG560
561AGGCTTATAATGAAACGTTTTCCAATCGGGTCATCATTAA600
601TGAGCATTGCTGCTACACCGTTCACCCTGAAAATGAAGAT640
641TGGACCTGTTTTGAACAGTCTGCAAGTTTAGATATTAAAT680
681CTTTCTTTGGTTTTGAAAGTACAGTGGAAAAAATTGCAAT720
721GAAACAATATACCAGCAACATTAAAAAAGGAAAGGAAATC760
761ATCGAATACTACCTTCGCCAATTAGAAGAAGAAGGCATAA800
801CCTTTGTGCCCCGTTGGAGTCCGCCTTCCATCACGACCTC840
841TTCAGAGACATCTTCATCATCCTCCAAGAAACAAGCAGCG880
881TCCATGGCCGTCGTCATCCCAGAAGCTGCCCTCAAGGAGG920
921GGCTGAGTGGTGATGCCCTCAGCAGCCCCAGCGCACCTGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。