基因總覽
SDHD 是蛋白質編碼基因，其產物 succinate dehydrogenase complex subunit D 屬於 CybS family。此蛋白質是粒線體內膜上的多次穿膜蛋白，具有粒線體運輸胜肽與多段螺旋型跨膜區域，並作為 succinate dehydrogenase（SDH）複合體的膜錨定次單元。它與其他 SDH 次單元共同構成複合體 II。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000375549 ★ | 112,086,873–112,095,794 | 4 |
| ENST00000528182 | 112,086,361–112,095,215 | 4 |
| ENST00000528048 | 112,086,361–112,095,505 | 3 |
| ENST00000528021 | 112,086,361–112,120,016 | 4 |
| ENST00000526592 | 112,086,361–112,095,212 | 5 |
| ENST00000525291 | 112,086,361–112,095,388 | 3 |
| ENST00000938877 | 112,086,361–112,095,776 | 4 |
| ENST00000975124 | 112,086,361–112,108,930 | 4 |
| ENST00001090784 | 112,086,361–112,095,803 | 4 |
| ENST00001090785 | 112,086,361–112,089,165 | 2 |
顯示 10/10 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SDHD 是 succinate dehydrogenase（SDH）複合體的膜錨定次單元，參與粒線體電子傳遞鏈的複合體 II。此複合體負責將電子由 succinate 傳遞至 ubiquinone（coenzyme Q），因此 SDHD 所在的複合體 II 連結 succinate 的氧化與電子傳遞過程。
SDH 也可氧化 malate，生成 oxaloacetate 的非典型烯醇形式 enol-oxaloacetate。此反應及後續轉化的敘述屬於相似性推定：enol-oxaloacetate 是 succinate dehydrogenase 活性的強效抑制劑，並可進一步異構化為 keto-oxaloacetate。來源未將這項作用標示為直接實驗證實。
功能註記亦將 SDH 列於碳水化合物代謝與三羧酸循環相關項目中。這些資料指出 SDHD 所屬複合體參與能量代謝相關過程；來源未提供更多關於 SDHD 個別作用機制或其對上述過程影響程度的說明。
Promoter 與基因調控
>SDHD ENST00000375549 GRCh38 chr11:112085873-112086973 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TAGAATGTTCAGGGCCCAAAGATTTCTAGCCAGGGTTCTTGCTGGTCATCCGAGCACCCTCTTCCTCCCA CCCAAAAGGAAAAAACCATTTTACCAAGAGCTTACTATTTGTGAGGCTGGGTACTAAGAAATCAGTTCTC TCTAAGGTCCTCAAGGATAGCTGTCATCACCTCCCATTTAAGAGGCGTGATTATGTAGTCCAAGGTCATG TAGCCAGCAAGAAGTCAGGCCGCGTTAGAACCATGTCCGAAGGGCTCCAAACCCTTGTTCTACATCCATA GTCTACAGCGACTACTTCAGAGTCCACCTTCCTCCGATAATGTTCTAGTCGTTTTCAAATACATTGTCGC ATATGATCCTCACAATCCAGTGAGGCAGTGGGGTGACGGCGACACCAAAACCCACAGTGGATGAGTATCT TTTCTACGGGCACGTGGCCTGCAAGGAGCAGAGGGAGGATGAGAACCCAGATCTTTCGAATGCCAGCCCA GTCATGTCGCCGGCTAACTAGTCTCCCGTACCCTTGCGTCGCCCAAATCTTCCCTGTTTTACACCTTTTC TTTTCTCCACGCTACGCTTATATACCTGGCACCTGAGCACTACCGGTCACCAGGGACAGGAGAGCCATAA CTTTGTCTTTCGTGAGGGGAATGGGATGCAGCCGGGATCGAGCACCAGTGAGCCGCCAGTGTACAGACCT CCGAGCGTGCCCAGGACCACCAAGGAAGGTGAAACTTCCTTTCCCTTCACCCTCCCCGTCCCCGCACCTG TGCAGTAAACTGCGCCTTCTGCTGCTCGGCGGCCACCAGGCGCTGCAACTCCGCTTCATCGGCTTCGCCC AGCTCCGCCATTGTTCGCCTCAGGCTCGCCACCTTCCGACAGCTGTGTTTGCGCATGCGCGACGGGTGTG CACCGCCTCTCGACTTCCGGTTCACCCAGCATTTCCTCTTCCCTGTTTTCTTTCGTCGTCGTGGGTGGGA ATTGTCGCCTAAGTGGTTCCGGGTTGGTGGATGACCTTGAGCCCTCAGGAACGAGATGGCGGTTCTCTGG AGGCTGAGTGCCGTTTGCGGTGCCCTAGGAGGCCGAGGTGAGGGGTCTTCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SDHD_1 ↗ | 11:112,086,899 | 正股 | 112,086,850–112,086,909 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_5ZCS8P · CTCF_binding_site · 112086651–112086672 · regulatory
ENSR11_5ZCS95 · CTCF_binding_site · 112086735–112086756 · regulatory
ENSR11_859ZF3 · promoter · 112086746–112086909 · regulatory
ENSR11_BS8LB · enhancer · 112086910–112087558 · regulatory
· motif · 112085936–112085947 · motif
· motif · 112086301–112086310 · motif
· motif · 112086301–112086310 · motif
· motif · 112086301–112086310 · motif
· motif · 112086417–112086429 · motif
· motif · 112086653–112086669 · motif
· motif · 112086715–112086725 · motif
· motif · 112086737–112086753 · motif
· motif · 112086762–112086773 · motif
· motif · 112086762–112086773 · motif
· motif · 112086794–112086803 · motif
· motif · 112086794–112086805 · motif
· motif · 112086794–112086805 · motif
· motif · 112086843–112086854 · motif
· motif · 112086854–112086871 · motif
· motif · 112086866–112086877 · motif
· motif · 112086883–112086898 · motif
· motif · 112086906–112086916 · motif
· motif · 112086930–112086945 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：159 aa
succinate dehydrogenase complex subunit D 長 159 個胺基酸，屬於 CybS family。其序列註解包括第 1–56 位的粒線體運輸胜肽；第 64–85、91–111 及 123–144 位為螺旋型跨膜區。第 57–63 與 112–122 位位於粒線體基質側，第 86–90 與 145–159 位位於膜間腔側。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SDHD 位於粒線體內膜，屬多次穿膜蛋白。 其序列註解顯示三段螺旋型跨膜區，並在粒線體基質側與膜間腔側各有拓樸區段；來源未描述定位隨條件或異構型而改變。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- RHBDD2Q6NTF9-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SDHD 是複合體 II 的組成次單元。此複合體由四個次單元構成：flavoprotein SDHA、iron-sulfur protein SDHB，以及由 SDHC 和 SDHD 組成的 cytochrome b560。來源指出其複合體成員關係，未另提供 SDHD 與個別次單元直接結合的細節。
疾病與遺傳關聯
影響 SDHD 的變異與多種疾病相關。Pheochromocytoma/paraganglioma syndrome 1（PPGL1）為常在成年期出現神經內分泌腫瘤的腫瘤易感症候群，遺傳模式為體染色體顯性。Paraganglioma and gastric stromal sarcoma（PGGSS）患者可同時有胃腸道基質瘤與副神經節瘤，腫瘤易感性呈表觀體染色體顯性遺傳且外顯率不完全。Mitochondrial complex II deficiency, nuclear type 3（MC2DN3）臨床表現不一，遺傳模式為體染色體隱性。這些資料描述變異與疾病的關聯，並非表示所有 SDHD 變異均會造成相同表現。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SDHD 是 succinate dehydrogenase（SDH）的膜錨定次單元，參與粒線體電子傳遞鏈複合體 II；SDH 負責將電子由 succinate 傳至 ubiquinone（coenzyme Q）。此外，SDH 可氧化 malate 形成 enol-oxaloacetate，該物質會強效抑制 succinate dehydrogenase 活性，並可進一步異構化為 keto-oxaloacetate；後述反應依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Membrane-anchoring subunit of succinate dehydrogenase (SDH) that is involved in complex II of the mitochondrial electron transport chain and is responsible for transferring electrons from succinate to ubiquinone (coenzyme Q). SDH also oxidizes malate to the non-canonical enol form of oxaloacetate, enol-oxaloacetate (By similarity). Enol-oxaloacetate, which is a potent inhibitor of the succinate dehydrogenase activity, is further isomerized into keto-oxaloacetate (By similarity) PMID 10482792 ↗ · PMID 9533030 ↗ |
| 分子活性 | SDH 的功能註記涵蓋碳水化合物代謝與三羧酸循環。 | 資料庫紀錄 | |
| 交互作用 | 複合體 II 由四個次單元組成：flavoprotein SDHA、iron-sulfur protein SDHB，以及由 SDHC 和 SDHD 組成的 cytochrome b560。此註記說明各蛋白質在複合體中的組成關係。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of complex II composed of four subunits: the flavoprotein (FP) SDHA, iron-sulfur protein (IP) SDHB, and a cytochrome b560 composed of SDHC and SDHD PMID 37098072 ↗ |
| 細胞定位 | SDHD 位於粒線體內膜，並註記為多次穿膜蛋白。 | 含實驗來源 | |
| 疾病關聯 | 影響 SDHD 的變異與 Pheochromocytoma/paraganglioma syndrome 1（PPGL1）相關。此腫瘤易感症候群通常在成年期發生神經內分泌腫瘤；腎上腺髓質嗜鉻細胞可形成分泌兒茶酚胺的嗜鉻細胞瘤，副神經節瘤則可出現在胸部、腹部、骨盆的交感副神經節，或頭頸部的副交感副神經節。遺傳模式為體染色體顯性。 | 含實驗來源 | 證據與來源Pheochromocytoma/paraganglioma syndrome 1 PPGL1 A form of pheochromocytoma/paraganglioma syndrome, a tumor predisposition syndrome characterized by the development of neuroendocrine tumors, usually in adulthood. Pheochromocytomas are catecholamine-producing tumors that arise from chromaffin cells in the adrenal medulla. Paragangliomas develop from sympathetic paraganglia in the thorax, abdomen, and pelvis, as well as from parasympathetic paraganglia in the head and neck. PPGL1 inheritance is autosomal dominant. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 168000 PMID 10657297 ↗ · PMID 11156372 ↗ · PMID 11343322 ↗ · PMID 11391796 ↗ · PMID 11391798 ↗ · PMID 12000816 ↗ · PMID 15328326 ↗ |
| 疾病關聯 | 影響 SDHD 的變異與 Paraganglioma and gastric stromal sarcoma（PGGSS）相關。胃腸道基質瘤可為散發或以體染色體顯性方式遺傳，也可單獨發生或屬於伴隨其他腫瘤的症候群；患者可同時有胃腸道基質瘤與副神經節瘤。腫瘤易感性呈表觀體染色體顯性遺傳，但外顯率不完全。 | 含實驗來源 | 證據與來源Paraganglioma and gastric stromal sarcoma PGGSS Gastrointestinal stromal tumors may be sporadic or inherited in an autosomal dominant manner, alone or as a component of a syndrome associated with other tumors, such as in the context of neurofibromatosis type 1 (NF1). Patients have both gastrointestinal stromal tumors and paragangliomas. Susceptibility to the tumors was inherited in an apparently autosomal dominant manner, with incomplete penetrance. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 606864 PMID 17804857 ↗ |
| 疾病關聯 | 影響 SDHD 的變異與 Mitochondrial complex II deficiency, nuclear type 3（MC2DN3）相關，此病遺傳模式為體染色體隱性且臨床表現異質。部分患者嬰兒期即有腦、心臟、肌肉、肝臟及腎臟多系統病變並可能死亡；另有患者成年後僅見心臟或肌肉受累且認知正常。描述的特徵包括發展退化、生長不良、痙攣性四肢癱瘓、白質腦病、肌無力、運動不耐、心肌病，部分病例有 Leigh syndrome 或 Kearns-Sayre syndrome。 | 含實驗來源 | 證據與來源Mitochondrial complex II deficiency, nuclear type 3 MC2DN3 A form of mitochondrial complex II deficiency, a disorder with heterogeneous clinical manifestations. Some patients have multisystem involvement of the brain, heart, muscle, liver, and kidneys resulting in death in infancy, whereas others have only isolated cardiac or muscle involvement with onset in adulthood and normal cognition. Clinical features include psychomotor regression in infants, poor growth with lack of speech development, severe spastic quadriplegia, dystonia, progressive leukoencephalopathy, muscle weakness, exercise intolerance, cardiomyopathy. Some patients manifest Leigh syndrome or Kearns-Sayre syndrome. MC2DN3 inheritance is autosomal recessive. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 619167 PMID 24367056 ↗ · PMID 26008905 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GGGTTGGTGGATGACCTTGAGCCCTCAGGAACGAGATGGC40GGTTCTCTGGAGGCTGAGTGCCGTTTGCGGTGCCCTAGGA80GGCCGAGCTCTGTTGCTTCGAACTCCAGTGGTCAGACCTG120CTCATATCTCAGCATTTCTTCAGGACCGACCTATCCCAGA160ATGGTGTGGAGTGCAGCACATACACTTGTCACCGAGCCAC200CATTCTGGCTCCAAGGCTGCATCTCTCCACTGGACTAGCG240AGAGGGTTGTCAGTGTTTTGCTCCTGGGTCTGCTTCCGGC280TGCTTATTTGAATCCTTGCTCTGCGATGGACTATTCCCTG320GCTGCAGCCCTCACTCTTCATGGTCACTGGGGCCTTGGAC360AAGTTGTTACTGACTATGTTCATGGGGATGCCTTGCAGAA400AGCTGCCAAGGCAGGGCTTTTGGCACTTTCAGCTTTAACC440TTTGCTGGGCTTTGCTATTTCAACTATCACGATGTGGGCA480TCTGCAAAGCTGTTGCCATGCTGTGGAAGCTCTGACCTTT520TTGACTTCATACTTTGAAGAATTGATGTATGCCTCTTTGC560CTCTGCTTTGTCATGCCATTAAGCTCACAATAAGGAAGAA600ATAACAGATAAGTCCATTGGTGGACAGCCTTCTTCTCTTA640ATCACAAGATTATTTTCAGAATTTAATCTTTGAGGAAAAG680GTTTGAGAGGAATTATATCTAAGTTGTGAGACTGAGTTCT720ATATTCTGGTGAGTTAATGGGGTTGCCTCCCAGCTTCTTA760TAAGACTCACAGTATAACTAAACATGATATATCAGCTTTT800GCCTTTCAATTTATCAATCTCTTAAAGAGAATCCAACTTT840ATTACGATTAGTATATGATCAAACTTCCATATTTGCCTTG880GGAATAATGGACAAAGGGAAATACTCTTAATTCATGAATA920AAAACTTTGCAGAAAATTAGACAGTGTTTAATTTTCGAAA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。