基因總覽
SDF2L1 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 stromal cell derived factor 2 like 1。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 22q11.21。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000248958 ★ | 21,642,302–21,644,299 | 3 |
| ENST00000927919 | 21,642,261–21,644,299 | 3 |
| ENST00001093571 | 21,642,261–21,644,299 | 2 |
| ENST00001131685 | 21,642,261–21,644,299 | 3 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>SDF2L1 ENST00000248958 GRCh38 chr22:21641302-21642402 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCAACTACACCCTAGTCAGACTCTTGAGCCCAGAGCTATTTGCTCTGTGACCCCACAGGATCTGGAGTGA AGCTGCTGTAACAATGTCCCATGAATGAATAAATAAACAGAGGTGTAAGTTTTCCTCCCTTGAAGGTTGA GCTGACAACACTCTGAGAAGGCGGCAAGAAGGAGACCTACTCATGGCCAGGAGACCTGGGACACGGTCGC CCAGGCATGGTTCCCACAGCCCCTTGGTCTCCTTTGACTCTGGTTTCCTAAGACAGCTTTGGGACTTTCT GGTGAGAAGCTGCCATTATTCTCAACGCTACAGCTCCCTGCTGCCCTCTCCTGCCCGATGACCCAGTGAC CACGAGATTTAGCCACGAAAGGAGTCAAATGTATAAGTGGCCAGGGGAATTCAGAAACCCCAGGGTCTAG GGACTGTGGTGACCCAGTATCAGAGAGGGCCTAGGGCCGAATGACTGGAGGTTTCATTAATCCCGGGGTC CAGGGACTTAAGGACTGATCCCGATTCAGTGACCCCGGGATCTGTCGACTTTGTGACCACAAAATCTAGC GATCCAACAACCTCAAGACCCTGCAGCTGCGGGCCCAGGTTCTGAGGGGAGAGACTCATTACTGAGTGCC CAGGAGTCCAGGATCAAGGGGCGTCGTGAAAACGTGCCTGCAGGGTCCTAGGATCCTGAGCCGGTGTCCA GGGACTCACCGGCTGCGAGGAGCCGCGTCTTCACCAACTGTTCACGCTCACTCTCCGCGGCTCGGAGACT CAGCCGCCCTTCCCTGGGCACTCATTGGTAAGTCCTCGGAAGCGTGGACCAATCAAAACCCTCCTCGTGT CTCCAGTCCCCGCCCAGCTACGGCTCTCGCGAACCGGGGGCGGGCCCTCCCCGCGCTGACCCAGTGGCAG TGCAAGCGGAGTGCCGCGCGGGCCGACTATTGGCTGCCGCAAGCGGGCGCTGTCAGAACCGGATTGGGCC GCGGCGGGGACGGAAGCGGCCCCTGGGCCCGAGGGGCTGGAGCCGGGCCGGGGCGATGTGGAGCGCGGGC CGCGGCGGGGCTGCCTGGCCGGTGCTGTTGGGGCTGCTGCTGGCGCTGTTA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SDF2L1_1 ↗ | 22:21,642,320 | 正股 | 21,642,271–21,642,330 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR22_8M6RF · enhancer · 21638631–21638872 · regulatory
ENSR22_9BKX6 · promoter · 21641812–21642312 · regulatory
ENSR22_B69ZQ · enhancer · 21646308–21647194 · regulatory
ENSR22_574GQ4 · CTCF_binding_site · 21646883–21646904 · regulatory
· motif · 21642177–21642187 · motif
· motif · 21642772–21642785 · motif
· motif · 21642772–21642785 · motif
· motif · 21643349–21643369 · motif
· motif · 21646885–21646901 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：221 aa
Stromal cell-derived factor 2-like protein 1 長 221 個胺基酸，含有位於第 1–28 位的訊號序列，以及三個 MIR domain，分別位於第 33–87、95–150 與 151–205 位。第 218–221 位有一段註解為防止其自內質網分泌的 motif。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SDF2L1 位於內質網腔。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- SGTAO43765 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SGTBQ96EQ0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SDF2L1 是大型伴護蛋白多蛋白複合體的成員；該複合體包含 CABP1、DNAJB11、HSP90B1、HSPA5、HYOU、PDIA2、PDIA4、PPIB、UGGT1，並含極少量 ERP29。註解指出，CALR 與 CANX 不在此複合體中，或僅以極低量存在。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | SDF2L1 是大型伴護蛋白多蛋白複合體的成員。複合體包含 CABP1、DNAJB11、HSP90B1、HSPA5、HYOU、PDIA2、PDIA4、PPIB、SDF2L1 與 UGGT1，另有極少量 ERP29；CALR 與 CANX 則未被納入，或僅以極低量存在。 | 含實驗來源 | 證據與來源Part of a large chaperone multiprotein complex comprising CABP1, DNAJB11, HSP90B1, HSPA5, HYOU, PDIA2, PDIA4, PPIB, SDF2L1, UGGT1 and very small amounts of ERP29, but not, or at very low levels, CALR nor CANX PMID 12475965 ↗ |
| 細胞定位 | SDF2L1 位於內質網腔。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
CCCTGGGCCCGAGGGGCTGGAGCCGGGCCGGGGCGATGTG40GAGCGCGGGCCGCGGCGGGGCTGCCTGGCCGGTGCTGTTG80GGGCTGCTGCTGGCGCTGTTAGTGCCGGGCGGTGGTGCCG120CCAAGACCGGTGCGGAGCTCGTGACCTGCGGGTCGGTGCT160GAAGCTGCTCAATACGCACCACCGCGTGCGGCTGCACTCG200CACGACATCAAATACGGATCCGGCAGCGGCCAGCAATCGG240TGACCGGCGTAGAGGCGTCGGACGACGCCAATAGCTACTG280GCGGATCCGCGGCGGCTCGGAGGGCGGGTGCCCGCGCGGG320TCCCCGGTGCGCTGCGGGCAGGCGGTGAGGCTCACGCATG360TGCTTACGGGCAAGAACCTGCACACGCACCACTTCCCGTC400GCCGCTGTCCAACAACCAGGAGGTGAGTGCCTTTGGGGAA440GACGGCGAGGGCGACGACCTGGACCTATGGACAGTGCGCT480GCTCTGGACAGCACTGGGAGCGTGAGGCTGCTGTGCGCTT520CCAGCATGTGGGCACCTCTGTGTTCCTGTCAGTCACGGGT560GAGCAGTATGGAAGCCCCATCCGTGGGCAGCATGAGGTCC600ACGGCATGCCCAGTGCCAACACGCACAATACGTGGAAGGC640CATGGAAGGCATCTTCATCAAGCCTAGTGTGGAGCCCTCT680GCAGGTCACGATGAACTCTGAGTGTGTGGATGGATGGGTG720GATGGAGGGTGGCAGGTGGGGCGTCTGCAGGGCCACTCTT760GGCAGAGACTTTGGGTTTGTAGGGGTCCTCAAGTGCCTTT800GTGATTAAAGAATGTTGGTCTATGA825cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。