基因總覽
SDF2 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 stromal cell derived factor 2。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 17q11.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000247020 ★ | 28,648,346–28,661,906 | 3 |
| ENST00000893451 | 28,648,346–28,662,180 | 4 |
| ENST00000893452 | 28,648,346–28,662,180 | 4 |
| ENST00001074476 | 28,648,346–28,662,180 | 4 |
| ENST00001074478 | 28,648,346–28,662,180 | 3 |
| ENST00001101298 | 28,648,346–28,662,180 | 2 |
| ENST00001138005 | 28,648,346–28,662,180 | 3 |
| ENST00001074473 | 28,648,589–28,662,180 | 3 |
| ENST00001074474 | 28,648,589–28,662,180 | 3 |
| ENST00001074475 | 28,648,589–28,662,180 | 3 |
| ENST00000974401 | 28,648,592–28,662,180 | 3 |
| ENST00000587788 | 28,648,743–28,655,335 | 2 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>SDF2 ENST00000247020 GRCh38 chr17:28661806-28662906 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTTTGAGGAAATGAATCTATAGAGAATGGACGGGCTTTAGGACTTCTACAAGACCTTCGATCTTTAGAAA GGGATGAAGGATGCAACCATCTACAAAAAGTTCTATTTGTATTATTCAGCAATATGTAAAGAGCTGGAAT TTGGCATCGCCCTCTAGCCTGATGGCCGAGCTGCTGAAAGCTCCACAGGATTCATATCCCCAGAACAAAC AACTCGATCACCTGATCCTGGCTCAGAAGCCCCAGGTCCCTTCCATCCCCAATCCTTTTGCGTGGCCCAG TTTTAAAAACCTGCGGAGAGAAGGACGGGATGCCAGGAAGCCTGTTGATTCAACGTGCCACCCGATTCAC GGGTTCCGGGTGTCACTGGGCTGGGAAAAGCTTTCGGACTCTGAGCAACTACAGCGCTTTCCTCCCCCTT CCCCCCATAGAGCAGGGAAGGCCAGGCTCCCCCTTCTTCCCGCATACGGCTCCCCACTGCCTCTTCCCTT ACGTGACCAGGCCCTAGGAGCCCGGTTCCCCACCTGACTCCTGCGAGAAACACGCTCTCCAGTCGGAACT TTACCTGTCTGAAGCCCGCCGCTCCTCCAGTGCGCTAAGCCCCCACCGAGGAAAATGGAGTCGTCGAACC GAGACTGGGAAAAGATAGTACGGACCCACCGCACGGCCCCTCCGCCGCCACCGCCGCCGCTGCTGCGTCA ACGTGCTACGTCATTTCCGGCTCCCTGTCACCGGGAGTGGGCGGGCCATTTCTTGTTCTCTCTCCCGCTC TCGGAAGCTTTCGTCTCGTGGGTGCGAAAGGTAACCGAAGCGGCTCAGGAAGGCAGCTGTCACTGAGCCC CTGGAACAGAGCGAGAGTATCGTAAGTAACCAGGCTCAGCCGGTTTCTCAGGCCGCTCTAGTCAAATAAA CCATAAAGATCAGACTCGGGCTTCTTCACTTCCTTCTCTCCGTGGTTTCGCCATTAGCTTCCGGTTCCGG GGAGGGGCCGAGTTTTCTTCGAAGATTTGGGGCTCCGCGATACAGTTAGGATGGCTGTAGTACCTCTGCT GTTGTTGGGGGGTTTGTGGAGCGCTGTGGGAGCGTCCAGCCTGGGTGTCGT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SDF2_1 ↗ | 17:28,661,906 | 負股 | 28,661,896–28,661,955 |
| SDF2_2 ↗ | 17:28,662,152 | 負股 | 28,662,142–28,662,201 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_9FD6F · promoter · 28661896–28662215 · regulatory
ENSR17_B7NKR · enhancer · 28662216–28663036 · regulatory
· motif · 28661930–28661941 · motif
· motif · 28661932–28661941 · motif
· motif · 28661941–28661951 · motif
· motif · 28662074–28662087 · motif
· motif · 28662074–28662087 · motif
· motif · 28662094–28662114 · motif
· motif · 28662162–28662175 · motif
· motif · 28662184–28662195 · motif
· motif · 28662184–28662195 · motif
· motif · 28662186–28662195 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：211 aa
SDF2 蛋白質長 211 個胺基酸，序列第 1–18 位註解為訊號區。其後包含三個 MIR 結構域：MIR 1 位於第 21–75 位，MIR 2 位於第 83–138 位，MIR 3 位於第 139–193 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SDF2 的定位註解為分泌。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | Secreted | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GAAGATTTGGGGCTCCGCGATACAGTTAGGATGGCTGTAG40TACCTCTGCTGTTGTTGGGGGGTTTGTGGAGCGCTGTGGG80AGCGTCCAGCCTGGGTGTCGTTACTTGCGGCTCCGTGGTG120AAGCTACTCAATACGCGCCACAACGTCCGACTGCACTCAC160ACGACGTGCGCTATGGGTCAGGTAGTGGGCAGCAGTCAGT200GACAGGTGTAACCTCTGTGGATGACAGCAACAGTTACTGG240AGGATACGGGGGAAGAGTGCCACAGTGTGTGAGAGGGGAA280CCCCCATCAAGTGTGGCCAGCCCATCCGGCTGACACATGT320CAACACTGGCCGAAACCTCCATAGTCACCACTTCACTTCA360CCTCTTTCTGGAAACCAGGAAGTGAGTGCTTTTGGTGAGG400AAGGTGAAGGTGATTATCTGGATGACTGGACAGTGCTCTG440TAATGGACCCTACTGGGTGAGAGATGGTGAGGTGCGGTTC480AAACACTCTTCCACTGAGGTACTGCTGTCTGTCACAGGAG520AACAATATGGTCGACCTATCAGTGGGCAAAAAGAGGTGCA560TGGCATGGCCCAGCCAAGTCAGAACAACTACTGGAAAGCC600ATGGAAGGCATCTTCATGAAGCCCAGTGAGTTGTTGAAGG640CAGAAGCCCACCATGCAGAGCTGTGAATCTAGAGGCTCTG680AGCCACTGTTAACGCACAATGTTCACAGACATCTGTTGCT720GCCTCACCTTGGGATCCCTGCCACAAGTTCCTTGGGCAGT760GGCCATGTCACCATTGAGATGAAGATATACAACAGAAAAT800AGTGGCTGTGTTTGGAAGCTTCAGCCCTGCACATTTGAAC840TAGTCACTCTCCCAGACTTGCGTGGGTCAGTTCTTTCTGA880GTAGAGGACTTGCTGGTAAAGGGGCAGATGCTTTTTATTA920GTACTGATAAAACAAACTGAGGGAAACATCCCTCTTAGCT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。