基因總覽
SDC2 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 syndecan 2。其產物屬於 syndecan proteoglycan 家族，為細胞表面蛋白聚醣，具有單次穿膜的第一型膜蛋白拓樸：胞外區、跨膜區與胞質區分布於膜的兩側。來源指出它與樹突分枝形態調節有關；相關作用細節見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000302190 ★ | 96,493,813–96,611,790 | 5 |
| ENST00000932834 | 96,493,410–96,613,465 | 6 |
| ENST00000862192 | 96,493,640–96,611,767 | 5 |
| ENST00000862193 | 96,493,640–96,613,465 | 5 |
| ENST00001004397 | 96,493,640–96,613,465 | 6 |
| ENST00001004398 | 96,493,640–96,613,465 | 6 |
| ENST00001117618 | 96,493,640–96,610,634 | 5 |
| ENST00001136838 | 96,493,640–96,613,465 | 5 |
| ENST00000518385 | 96,493,813–96,613,465 | 4 |
| ENST00000522911 | 96,494,008–96,613,465 | 5 |
| ENST00000519914 | 96,580,349–96,613,465 | 5 |
| ENST00000521590 | 96,584,945–96,609,440 | 5 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
syndecan 2 是細胞表面蛋白聚醣，來源將其主要功能描述為調節樹突分枝形態。這項資訊指出其參與樹突分枝形態的調控，但未進一步說明作用機制、調控方向或具體涉及的分子步驟。
Promoter 與基因調控
>SDC2 ENST00000302190 GRCh38 chr8:96492813-96493913 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AATATGCCACAGACATTGTAACAAAATATTTCATGTCAGCTACTTCCATTTAGGAAATACATGTTCATTA TTTTCTTCAAACTAAGAATTACTTTATCCCTCTTTTCTTTGAAGTTATCTTAAATCTGTTATTATTCAGG GTCTCTATCCAACTTCTCATCAAATTACCCTATTTGTAGCTTCCAAACGTTAACACCTATCTGCTAAAAT GGAGCCTATAAAAAGCCTTAGTGGCATAAACTGTGTGTGAGGGAGAAATGGTATTTAAGCCCTTAATGAA GTTAGGAGCTTTCAAACTGTTGCACTTTGGGTTTACAGGATCCTTCCTCCATGTCCCTTTTTTGGGGGTG CGGAAGGATTTGGGAGAATGGGAAACACTCTCACTATATATTTATTACATTAATTATCTTCTCTTTTAAA ATGCAATTTTCATGAACTGGCGATTTATGAACACTTCACATTGCTTGAAAGCATCTTACACTTTTTTTTT CCCTCAACTCACAAAGCAGTTTCTTTCTACTGGTCGAATTCTCAAGGCAGAAAAGCTACATACGTCTCTC GTTTCTTCACTAATTGTTCTCTAGAAAAGGGAAAGTGAAGAAGGGAAAGAGAAAAGACAACGGGGAAGAA AAGAGCATAGAGGAGAGAGGAAAAGTGGGGAGAGAAAGGAAGAAAAGGACTGAGAAAACGCAGGAGCCCT GGCTTGCCGGTGAGCAGAGCCGGCGCAGCCACAGCGCGGAGCCGCGGCGCCCACTGGTCCTCGGAGCTGC CAATCGGCGTGTAATCCTGTAGGAATTTCTCCCGGGTTTATCTGGGAGTCACACTGCCGCCTCCTCTCCC CAGTCGCCCAGGGGAGCCCGGAGAAGCAGGCTCAGGAGGGAGGGAGCCAGAGGAAAAGAAGAGGAGGAGA AGGAGGAGGACCCGGGGAGGGAGGCGCGGCGCGGGAGGAGGAGGGGCGCAGCCGCGGAGCCAGTGGCCCC GCTTGGACGCGCTGCTCTCCAGATACCCCCGGAGCTCCAGCCGCGCGGATCGCGCGCTCCCGCCGCTCTG CCCCTAAACTTCTGCCGTAGCTCCCTTTCAAGCCAGCGAATTTATTCCTTA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SDC2_1 ↗ | 8:96,493,813 | 正股 | 96,493,764–96,493,823 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR8_BP63B · promoter · 96493323–96494018 · regulatory
ENSR8_D6R95 · enhancer · 96494019–96496222 · regulatory
ENSR8_5SNRSW · CTCF_binding_site · 96495374–96495395 · regulatory
ENSR8_BP63Q · enhancer · 96496328–96497207 · regulatory
· motif · 96493634–96493648 · motif
· motif · 96493742–96493752 · motif
· motif · 96493759–96493769 · motif
· motif · 96494096–96494110 · motif
· motif · 96494258–96494271 · motif
· motif · 96494258–96494271 · motif
· motif · 96494390–96494403 · motif
· motif · 96495376–96495392 · motif
· motif · 96495667–96495677 · motif
· motif · 96495951–96495966 · motif
· motif · 96495951–96495966 · motif
· motif · 96495952–96495966 · motif
· motif · 96495953–96495966 · motif
· motif · 96496692–96496707 · motif
· motif · 96496692–96496707 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：201 aa
syndecan 2 長 201 個胺基酸，屬於 syndecan proteoglycan 家族。其序列包含 1–18 的訊號胜肽、19–144 的胞外區、145–169 的螺旋跨膜區，以及 170–201 的胞質區。註解另將 42–70、90–130 與 178–201 區段標示為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
syndecan 2 被註解為膜蛋白，具有單次穿膜的第一型膜蛋白拓樸。
未繪示構造：Membrane。這些構造未在通用細胞圖中標點，仍保留來源定位名稱。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 38 個夥伴
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
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syndecan 2 經由胞質區與 SARM1 互作，此關係為相似性推定。另有資料指出 syndecan 2 與 SDCBP、PDCD6IP 形成複合體；此處未提供其他互作方式或功能關係的細節。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | syndecan 2 是細胞表面蛋白聚醣，來源指出它可調節樹突分枝形態；此項描述未提供調控方向或具體作用機制。 | 推論支持 | |
| 交互作用 | syndecan 2 經由胞質區與 SARM1 互作，這項互作為相似性推定；另有資料指出 syndecan 2 與 SDCBP、PDCD6IP 形成複合體。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts (via cytoplasmic domain) with SARM1 (By similarity). Forms a complex with SDCBP and PDCD6IP PMID 22660413 ↗ |
| 細胞定位 | syndecan 2 位於膜上，並具有單次穿膜的第一型膜蛋白拓樸；此定位描述未指出特定條件下的變化或異構型差異。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
AGATACCCCCGGAGCTCCAGCCGCGCGGATCGCGCGCTCC40CGCCGCTCTGCCCCTAAACTTCTGCCGTAGCTCCCTTTCA80AGCCAGCGAATTTATTCCTTAAAACCAGAAACTGAACCTC120GGCACGGGAAAGGAGTCCGCGGAGGAGCAAAACCACAGCA160GAGCAAGAAGAGCTTCAGAGAGCAGCCTTCCCGGAGCACC200AACTCCGTGTCGGGAGTGCAGAAACCAACAAGTGAGAGGG240CGCCGCGTTCCCGGGGCGCAGCTGCGGGCGGCGGGAGCAG280GCGCAGGAGGAGGAAGCGAGCGCCCCCGAGCCCCGAGCCC320GAGTCCCCGAGCCTGAGCCGCAATCGCTGCGGTACTCTGC360TCCGGATTCGTGTGCGCGGGCTGCGCCGAGCGCTGGGCAG400GAGGCTTCGTTTTGCCCTGGTTGCAAGCAGCGGCTGGGAG440CAGCCGGTCCCTGGGGAATATGCGGCGCGCGTGGATCCTG480CTCACCTTGGGCTTGGTGGCCTGCGTGTCGGCGGAGTCGA520GAGCAGAGCTGACATCTGATAAAGACATGTACCTTGACAA560CAGCTCCATTGAAGAAGCTTCAGGAGTGTATCCTATTGAT600GACGATGACTACGCTTCTGCGTCTGGCTCGGGAGCTGATG640AGGATGTAGAGAGTCCAGAGCTGACAACATCTCGACCACT680TCCAAAGATACTGTTGACTAGTGCTGCTCCAAAAGTGGAA720ACCACGACGCTGAATATACAGAACAAGATACCTGCTCAGA760CAAAGTCACCTGAAGAAACTGATAAAGAGAAAGTTCACCT800CTCTGACTCAGAAAGGAAAATGGACCCAGCCGAAGAGGAT840ACAAATGTGTATACTGAGAAACACTCAGACAGTCTGTTTA880AACGGACAGAAGTCCTAGCAGCTGTCATTGCTGGTGGAGT920TATTGGCTTTCTCTTTGCAATTTTTCTTATCCTGCTGTTG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。