基因總覽
SCTR 是蛋白質編碼基因,產物 secretin receptor 為 G protein-coupled receptor 2 family 成員。這是一種由 secretin(SCT)活化的多次穿膜受體,具有細胞外區域、跨膜螺旋及細胞質區域;蛋白質序列註解長度為 440 個胺基酸。作為配體活化型受體,它可將 secretin 結合訊號傳入細胞,並參與調節十二指腸內容物酸鹼值、攝食與水分恆定等過程。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000019103 ★ | 119,439,843–119,524,483 | 13 |
| ENST00000903273 | 119,439,839–119,524,582 | 13 |
| ENST00000971075 | 119,439,839–119,524,582 | 13 |
| ENST00000903274 | 119,439,840–119,524,582 | 15 |
| ENST00000903275 | 119,439,840–119,524,582 | 13 |
| ENST00000903276 | 119,439,840–119,524,582 | 11 |
| ENST00000971073 | 119,439,840–119,524,582 | 11 |
| ENST00000971074 | 119,439,840–119,524,582 | 12 |
| ENST00001053808 | 119,439,840–119,524,582 | 9 |
| ENST00001144894 | 119,439,840–119,524,582 | 13 |
| ENST00000630739 | 119,461,983–119,525,041 | 8 |
| ENST00000627145 | 119,461,983–119,525,301 | 8 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
secretin receptor 接受 secretin 刺激後會發生構形改變,進而透過 guanine nucleotide-binding proteins(G proteins)傳遞訊號並啟動 cAMP-dependent pathway。此訊號傳遞方式連結了配體辨識與細胞反應;來源指出,該受體參與十二指腸內容物酸鹼值、攝食及水分恆定等不同過程。
在消化道酸鹼調節方面,secretin receptor 與 secretin 結合後,可抑制胃壁細胞分泌胃酸,並刺激胰臟導管細胞產生碳酸氫鈉(NaHCO₃),共同調節十二指腸的酸鹼環境。這些作用依來源註記為相似性推論(By similarity)。
進食後,腸道釋出的 secretin 可結合棕色脂肪細胞中的 SCTR,刺激脂解並活化棕色脂肪產熱;產熱訊號被腦部感知後,會促進飽足感。來源將此受體描述為非交感神經性的棕色脂肪活化因子,並指出其參與飲食誘發產熱。SCTR 也能刺激白色脂肪細胞脂解。
此外,SCTR 透過調節腎臟水分再吸收參與細胞滲透壓調節;在中樞神經系統中,則被指出是突觸可塑性所需的因子,這項功能同樣標示為相似性推論。
Promoter 與基因調控
>SCTR ENST00000019103 GRCh38 chr2:119524383-119525483 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCAGACATGTAATGAATCCTCCTCCACCTCCAATGCCCTCCTCTGTCAAATGGACATCGTATCACCTAGG GGTGTGAGGGAGAATTAAATGAGCTGATGTACTTAAAGTGCCTGGGAGAAAGATCAAGAAAGGAGGAGAG AGAAGAAGGAAGGGAGTGGGCACCAGTGCAGACTAAGGAAAATTGAGTTTGCAAGACCCATCTAGTGCTG GGCCCAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGAGAGGATCTCTTGAGCCCAAG AGTTCAAGACCAGCCTGGGCAACATGGTGAGACTCTCTTTTTTATGTAACAGTAAAAAAGGGCCATCGCC CTGTACTAAGAGGCCAAAAGAGACGCCTTGTACTAAGAGGACGTCTTGTACTAAGAGACGCCTTGTACTA AGAGGCCAAAAGCAAACCTCCAGGATACACAGCACCGATGGAGAGGGCTACTGGGACTACCTGCCTGAGG CTTAAATAGCCTCCCAGGGGGTTCATCCTCAGGACGGTCCCCAGATGCCTGAGTGTACCACAGATCCTCC TTGGTCATCATCAAAGGAGGAGTTCATGGGAGTGAAACTTCATGGAATTAGCGCTAATGACTTCAATAAT GAAAAAATCGGAAATAAAGTGCAAGGTAGCTATCGGGGGGAATAGATGCAATGGGCCTCGACTGTGTGAC AACTTTCAGTCCGAGAGTGGGTATTATCAGACGTGTTGTTAGGGATGAGAAAGCCGAGGCTTACAAAGGT GACCTAAGTTGCCCACCGGCCCCCAGCGAGCTTGCGCTTTCTGTCCGTGGACTCCAGAGACAGTGCTCTT TCCGGACCCGGGGTTGGGCGGGATTGCCGCGTAGAAGGCTAAGCCAGCGTGCCCTCTCCTGGCCTCCTCC AGCTTGGGCCCAGCCTGCGGGAGCCGACTCCGGGTCCCCGCGCCCTCCCTCTGCCTCCTCCCCTGCCAGC CTCCGCGCCGACCCCGCGCCAGTCCCTGCCGGGTGGAGGAGGCGCGCCGGCAAAGCCGCGTCCTGATCAA TGGGGCGGGCGGCTTAGCGCGCGCGGCCACCTGGTCCGAGGAGGAGCAGTC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SCTR_1 ↗ | 2:119,524,564 | 負股 | 119,524,554–119,524,613 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_792QMK · promoter · 119524473–119524573 · regulatory
ENSR2_53353LK · CTCF_binding_site · 119524578–119524599 · regulatory
· motif · 119521307–119521321 · motif
· motif · 119521307–119521321 · motif
· motif · 119521314–119521325 · motif
· motif · 119524580–119524596 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:440 aa
secretin receptor 的序列註解長度為 440 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 2 family。其 N 端具有訊號序列,並由七段跨膜螺旋構成穿膜區域;跨膜區之間分布於細胞外側與細胞質側的區段,C 端位於細胞質側。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SCTR 被註記位於細胞膜,並具有多次穿膜蛋白特徵;另有基底外側細胞膜定位的註記。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SCTR 是由 secretin(SCT)活化的 G protein-coupled receptor,參與十二指腸內容物酸鹼值、攝食與水分恆定。配體結合引發構形改變,透過 G proteins 傳訊並活化 cAMP-dependent pathway;另涉及胃酸抑制、胰臟碳酸氫鈉生成、脂肪脂解與產熱、腎臟水分再吸收及突觸可塑性,其中部分作用標示為相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源G protein-coupled receptor activated by secretin (SCT), which is involved in different processes such as regulation of the pH of the duodenal content, food intake and water homeostasis. Ligand binding causes a conformation change that triggers signaling via guanine nucleotide-binding proteins (G proteins) and activates cAMP-dependent pathway. Upon binding to secretin, regulates the pH of the duodenum by (1) inhibiting the secretion of gastric acid from the parietal cells of the stomach and (2) stimulating the production of bicarbonate (NaHCO(3)) from the ductal cells of the pancreas (By similarity). In addition to regulating the pH of the duodenal content, plays a central role in diet induced thermogenesis: acts as a non-sympathetic brown fat (BAT) activator mediating prandial thermogenesis, which consequentially induces satiation. Mechanistically, secretin released by the gut after a meal binds to secretin receptor (SCTR) in brown adipocytes, activating brown fat thermogenesis by stimulating lipolysis, which is sensed in the brain and promotes satiation. Also able to stimulate lipolysis in white adipocytes. Also plays an important role in cellular osmoregulation by regulating renal water reabsorption. Also plays a role in the central nervous system: required for synaptic plasticity (By similarity) PMID 32811827 ↗ · PMID 33008599 ↗ · PMID 7612008 ↗ · PMID 25332973 ↗ |
| 細胞定位 | SCTR 被註記位於細胞膜,並具有多次穿膜蛋白特徵;此外也有基底外側細胞膜定位的註記。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Basolateral cell membrane / Multi-pass membrane protein PMID 32811827 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTCCCTGCCGGGTGGAGGAGGCGCGCCGGCAAAGCCGCG40TCCTGATCAATGGGGCGGGCGGCTTAGCGCGCGCGGCCAC80CTGGTCCGAGGAGGAGCAGTCCCGGGGCCCGCCGCAGGTC120GGGTGGCTCAGCCATGGCTCCTCGGGGCGCAGCGGCCGGC160CGGAGCCCGGGACCCTGCGCGGGGCGCTGAGCTCCCGAGC200GGGCAGAGGGCACGGGCAGGCGGACGTCGGGGCGCCCTCG240GGGAACGTGCGGGCACCATGCGTCCCCACCTGTCGCCGCC280GCTGCAGCAGCTACTACTGCCGGTGCTGCTCGCCTGCGCC320GCGCACTCGACTGGAGCCCTTCCCCGACTATGTGACGTGC360TACAAGTGCTGTGGGAAGAGCAAGACCAGTGCCTGCAGGA400ACTCTCCAGAGAGCAGACAGGAGACCTGGGCACGGAGCAG440CCAGTGCCAGGTTGTGAGGGGATGTGGGACAACATAAGCT480GCTGGCCCTCTTCTGTGCCGGGCCGGATGGTGGAGGTGGA520ATGCCCGAGATTCCTCCGGATGCTCACCAGCAGAAATGGT560TCCTTGTTCCGAAACTGCACACAGGATGGCTGGTCAGAAA600CCTTCCCCAGGCCTAATCTGGCCTGTGGCGTTAATGTGAA640CGACTCTTCCAACGAGAAGCGGCACTCCTACCTGCTGAAG680CTGAAAGTCATGTACACCGTGGGCTACAGCTCCTCCCTGG720TCATGCTCCTGGTCGCCCTTGGCATCCTCTGTGCTTTCCG760GAGGCTCCACTGCACTCGCAACTACATCCACATGCACCTG800TTCGTGTCCTTCATCCTTCGTGCCCTGTCCAACTTCATCA840AGGACGCCGTGCTCTTCTCCTCAGATGATGTCACCTACTG880CGATGCCCACAGGGCGGGCTGCAAGCTGGTCATGGTGCTG920TTCCAGTACTGCATCATGGCCAACTACTCCTGGCTGCTGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。