基因總覽
secretin 是由 SCT 編碼的蛋白質荷爾蒙。資料將它描述為參與多種生理過程的荷爾蒙,包括十二指腸內容物酸鹼值、食物攝取與水分恆定。其生物效應透過結合 secretin receptor(SCTR)發揮;SCTR 是一種 G 蛋白偶聯受體。這些基本特性界定了 secretin 作為訊號分子的角色;其具體作用情境與可能的證據限制,則依不同生理過程而異。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000176195 ★ | 626,309–627,181 | 4 |
| ENST00001139400 | 626,309–627,236 | 4 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
secretin 是重要的胃腸道荷爾蒙,與調節十二指腸內容物的酸鹼值有關。依相似性推定,它由十二指腸 Lieberkuhn 隱窩中的 S 細胞分泌,並透過兩項作用調節十二指腸環境:抑制胃壁細胞分泌胃酸,以及刺激胰臟導管細胞產生碳酸氫鈉(NaHCO₃)。碳酸氫鹽有助於中和酸性內容物,降低胃酸對小腸造成損傷的可能性;此項功能描述標示為依相似性推定。
secretin 透過結合 secretin receptor(SCTR)產生生物效應。SCTR 是 G 蛋白偶聯受體,在多種細胞的基底外側區域表現。進食後由腸道釋出的 secretin 可與棕色脂肪細胞上的 SCTR 結合,促進脂解並活化棕色脂肪產熱;產熱訊號被腦部感知後,可能促進飽足感。資料將 secretin 作為非交感神經性棕色脂肪活化因子、參與進食誘發產熱及飽足感的角色列為可能性;此外,它也被描述為能刺激白色脂肪細胞脂解,這些作用標示為依相似性推定。
在高滲透壓狀態下,secretin 會釋入全身循環,並在下視丘、腦下垂體及腎臟等不同層級參與水分恆定調節。這項描述同樣依相似性推定,指出其作用涉及多個器官,但未進一步界定各處的具體機制。
secretin 也可能以神經肽荷爾蒙的形式參與中樞神經系統功能。依相似性推定,它對海馬迴突觸功能及神經前驅細胞維持具有必要作用。這些資料呈現 secretin 涵蓋胃腸道、脂肪組織、水分調節與神經系統的多方面角色;各項功能的證據性質並不相同,不能一概視為已確立的機制。
Promoter 與基因調控
>SCT ENST00000176195 GRCh38 chr11:627081-628181 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCCCTGCGCGCAGTCCCTGGAAGCGCTGAATCCACAGACAGAAAGTGGACGGGGCGCCGGGGCTGAGGAG GGGAGGGGGCGTTTGATGGGGACAGAGCTTCATTCTGGGAGGACAGGAGAGTCTGAGAACGGATTTTGGG AGGACGGGAGCGTCTGTGAACGGATTTTGGGAGGACGGGAGCGTCTGTGAACGGATTTTGGGAGGACGGG AGCGTCTGTGAACAGATTTTGAGAGGACGGGAGAGTCTGAGAACGGATTTTGGGAGGACGGAAGAGTCTG AGAATGGATTTTTGGAGGACGGAAGAGTCTGAGAACGGATTTTGGGAGGACGGGAGCGTCTGTGAACGAT TTTGGGAGGACGGGAGCGTCTGTGAACGATTTTGGGAGGACGGGAGCGTCTGTGAACGATTTTGGGAGGA CGGGAGCGTCTGTGAACGGATTTTGGGAGGACGGGAGCGTCTGTGAACGGATTTTGGGAGGACGGGAGCG TCTGTGAACGGATTTTGGGAGGACGGGAAAGTCTGAGAACGGATGGTGGGGATGGATGCACCGAATGATC CTGAATCGCGCACTTCAAAGCAGATAAAATGGCAACACCGGCCCCCCAACAGTCACGCCACGCTGAAGCT GGAGACGAACTCGCCCCAGCAAGGTGCTCCAGGGGCCTCCGGAACTCCGGCCGCAGCCCCTTCCCCGGGG CCCCCCAGTCCCCCCCCAAACCCTCCCCCAAGCCCTCCGGCCCCTCCGCCCCCGCAGGCTCCGAGGCTTC GCGGTGCGGTTCCCTCTGCGGGTCCCAGGCCCGCGCTCCGTTCGCCCCCCAGGCCGGGACGTCCCCCTCC CCCAGCCGGCCGAGGGGCGCCAGCGCGGCGGAGGGGGCGGGAGGCCGGGCCGGGGCGACAGCTGGGGGGG CGGCCCTGACCTTCCCGGGATCGCTGGGCGCGGCCGGGCCGTCCCCTTTCCGGGCGCCGCCATAAAGGGG CCTTGCGGGGGCCCGGGGCCGTGGCCGCAGCGCTCAGCTCCTGCGCCCCGACCCCGCCATGGCCCCCCGG CCCCTCCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTCGGGGGCTCCGCCGCGCGCCCCGCG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_55XP6 · CTCF_binding_site · 622319–622340 · regulatory
ENSR11_B5CB · enhancer · 623958–624508 · regulatory
ENSR11_8HDN · promoter · 624914–625129 · regulatory
ENSR11_98NX · promoter · 625159–625620 · regulatory
ENSR11_98P4 · enhancer · 625733–626067 · regulatory
ENSR11_98P8 · promoter · 626068–626568 · regulatory
ENSR11_B5CX · enhancer · 628311–628935 · regulatory
ENSR11_98Q5 · enhancer · 629199–629555 · regulatory
ENSR11_55ZWX · CTCF_binding_site · 629401–629422 · regulatory
· motif · 622321–622337 · motif
· motif · 624975–624988 · motif
· motif · 625108–625121 · motif
· motif · 625108–625122 · motif
· motif · 628314–628331 · motif
· motif · 628643–628651 · motif
· motif · 628737–628747 · motif
· motif · 629369–629380 · motif
· motif · 629403–629419 · motif
· motif · 629412–629420 · motif
· motif · 629603–629625 · motif
· motif · 629603–629625 · motif
單次進食後,血清中的 secretin 濃度會升高;來源未提供更進一步的調控條件或機制。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:121 aa
secretin 前體蛋白長 121 個胺基酸,N 端第 1 至 18 位被註記為訊號肽。它屬於 glucagon 家族。來源未提供其他結構域或功能區域的序列註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
secretin 被註記為分泌型蛋白質;來源未提供更詳細的細胞內定位或定位改變條件。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
- HGSO14964 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HOXA1P49639 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MEIS2O14770-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- USHBP1Q8N6Y0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | secretin 透過結合 G 蛋白偶聯受體 SCTR 發揮作用,並參與十二指腸酸鹼調節、進食誘發產熱與飽足感、脂解、水分恆定,以及海馬迴突觸功能和神經前驅細胞維持。多項作用標示為依相似性推定;產熱與飽足感的角色則標示為可能。 | 含實驗來源 | 證據與來源Hormone involved in different processes, such as regulation of the pH of the duodenal content, food intake and water homeostasis. Exerts its biological effects by binding to secretin receptor (SCTR), a G protein-coupled receptor expressed in the basolateral domain of several cells. Acts as a key gastrointestinal hormone by regulating the pH of the duodenal content (By similarity). Secreted by S cells of the duodenum in the crypts of Lieberkuehn and regulates the pH of the duodenum by (1) inhibiting the secretion of gastric acid from the parietal cells of the stomach and (2) stimulating the production of bicarbonate (NaHCO(3)) from the ductal cells of the pancreas (By similarity). Production of bicarbonate is essential to neutralize the pH and ensure no damage is done to the small intestine by the gastric acid (By similarity). In addition to regulating the pH of the duodenal content, plays a central role in diet induced thermogenesis: acts as a non-sympathetic brown fat (BAT) activator mediating prandial thermogenesis, which consequentially induces satiation (Probable). Mechanistically, secretin released by the gut after a meal binds to secretin receptor (SCTR) in brown adipocytes, activating brown fat thermogenesis by stimulating lipolysis, which is sensed in the brain and promotes satiation (By similarity). Also able to stimulate lipolysis in white adipocytes (By similarity). Also plays an important role in cellular osmoregulation: released into the systemic circulation in response to hyperosmolality and acts at different levels in the hypothalamus, pituitary and kidney to regulate water homeostasis (By similarity). Also plays a role in the central nervous system, possibly by acting as a neuropeptide hormone: required for hippocampal synaptic function and neural progenitor cells maintenance (By similarity) PMID 32811827 ↗ · PMID 33008599 ↗ · PMID 25332973 ↗ · PMID 30449620 ↗ |
| 細胞定位 | Secreted | 含實驗來源 | |
| 調控 | 單次進食後,血清中的 secretin 濃度升高。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GTGGCCGCAGCGCTCAGCTCCTGCGCCCCGACCCCGCCAT40GGCCCCCCGGCCCCTCCTGCTGCTGCTGCTGCTCCTCGGG80GGCTCCGCCGCGCGCCCCGCGCCCCCCAGGGCCCGGCGAC120ACTCAGACGGGACGTTCACCAGCGAGCTCAGCCGCCTGCG160GGAGGGCGCGCGGCTCCAGCGGCTGCTACAGGGCCTGGTG200GGGAAGCGCAGCGAGCAGGACGCAGAGAACAGCATGGCCT240GGACCAGGCTCAGCGCGGGTCTGCTCTGCCCGTCAGGGTC280CAACATGCCCATCCTGCAGGCCTGGATGCCCCTGGACGGG320ACCTGGTCTCCCTGGCTGCCCCCTGGGCCTATGGTTTCAG360AACCAGCTGGCGCTGCTGCAGAAGGAACCTTGCGGCCCAG400ATGAGGAAGGAACCCCCTCACCACCTGCCCGGCCCAGGAG440CGCAGCTGCATTTGGGGTGGGGGGCAGGATGGGGGAGAGG480GGGAGGGGTGGTACTTGGCACCAATAAAGGAGGAATCAGA520CCCAGA526cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。