演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SCN7ANav2.1

sodium voltage-gated channel alpha subunit 7

SCN7A 編碼 sodium voltage-gated channel alpha subunit 7,雖屬鈉通道家族,卻不受電壓門控;它可感測滲透壓並讓鈉離子沿濃度梯度通過細胞膜。

Homo sapiens2q24.3UniProt Q01118
OFFICIAL SYMBOL
SCN7A
CHROMOSOME
2
UNIPROT
Q01118
PDB / ALPHAFOLD
7TJ8
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SCN7A 是蛋白質編碼基因,產物為 sodium voltage-gated channel alpha subunit 7,屬於 sodium channel 家族的 SCN7A subfamily。這是一種多次穿膜的鈉通道蛋白,具有大型膜內區域及分布於膜兩側的區段;其蛋白質序列長度為 1682 個胺基酸。雖然名稱中含有 voltage-gated,SCN7A 的通道並非電壓門控,而是以不同於多數鈉通道的方式運作。此蛋白質的基本特性,是作為可通透鈉離子的膜蛋白,並在多種組織與器官中參與鈉離子調節。

Official symbol
SCN7A
Gene name
sodium voltage-gated channel alpha subunit 7
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10594
UniProt
Q01118
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
Nav2.1Nav2.2NaGSCN6A

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22q24.3
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegSCN7Apq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr2:166,403,472–166,611,482
Gene span
208,011 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000643258 ★166,403,573–166,494,24926
ENST00000441411166,403,472–166,494,32625
ENST00000961721166,403,472–166,494,32626
ENST00000961722166,403,472–166,494,24925
ENST00000961723166,403,472–166,494,32625
ENST00001039755166,403,472–166,494,32626
ENST00001144841166,403,472–166,494,24926
ENST00000419992166,440,583–166,494,32615
ENST00000650747166,477,463–166,611,4825

顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

SCN7A 是一種鈉離子漏通道,也具有滲透壓感測功能,可參與多種組織與器官的鈉離子含量調節。與多數受電壓控制的鈉通道不同,SCN7A 不受電壓門控;鈉離子可沿著其濃度梯度穿過細胞膜。這項通透性使其能將鈉離子帶入細胞,並與局部鈉離子平衡的維持相關。

在中樞神經系統的膠細胞中,SCN7A 可感測體液中的鈉含量。依據相似性推定,這項感測與調節可能透過活化附近神經元,影響鹽分攝取行為及自主飲水,協助維持適當的體內鈉含量;這部分功能的證據屬於相似性推論。

SCN7A 也與皮膚屏障恆定有關。它介導鈉離子流入角質形成細胞,因而參與皮膚屏障的維持。此處所述的細胞作用,著重於鈉離子進入角質形成細胞,並未提供更進一步的屏障調節分子機制。

活性註解以 Na(+)(in) = Na(+)(out) 表示鈉離子在膜內與膜外的相關關係。整體而言,來源支持 SCN7A 兼具鈉離子通透與感測角色,其功能脈絡涵蓋體內鈉平衡、與神經元相關的攝鹽及飲水行為,以及皮膚屏障恆定;不同功能所依據的證據性質並不相同。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 166494249 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SCN7A ENST00000643258 GRCh38 chr2:166494149-166495249 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GTGTCAGACTGCTCTAAGGGAAGGTTTTATGCTCTAGAAAATTCATTTGCATCATCACCAGAGTGTGGAG
AAGAGAAGCCTGCAGTCAGTCAATTGTCCATTATAAAGAAATCAAGTGAATGTTTGATGCTACAAAATAA
TTATTGCTAATTATAGATGTGATCAGGGTATTGAGTTAAAATCTTAAGTTCTTACCATTCAGAGACATAT
GCTGATATATTTTTGAAGTAAGTGATGTGATGTGTGCATAAAATAGGGTTACAAAATGAAGGTTCTATGG
TGTGGCCTTTGGGAAGAAGGTGCAACCCCTCTGGCCTTCACTCCCAAACTACACTGTATTGCCGCAGTTT
TCTAAAATAAACATAATTTTTCCTCTGTCCCTCGTGTTTCAAATCACTAGAGTGGGAAACTGATCCAGAG
TAAAAGCCAGCTCCAGCTGACTCTTGACTCTCCTAAAAACAGCTACACACATACTCACACAACAACAGGA
TTACAAACTCTTAATTACAGCAATGTCCAGATTTGAATGCTGCAGGCTGACAATTGCCCCTCTAAGTTCT
GCTGGGGCACCTAGGCAAGGGGAGAGAGAATACAACTGGAGGTTAAAGAACCAGAGTTTTCTGTCTTCCT
CTCCTCTCCCTCATTTTCACTCTCCCTTCCCCCTCAGCTGCACCGCGCTGCTCCTTTTCCTCTCCTCCTT
GGATGTTCCCTAGCCCCTTCATTCCTTCACGCTCTGCAGGCCCTCTCCCCTCTACCCCTCCTCATCAGCC
CCCCGCTCCTCTTCCTCCCTCCCTTCCCGGCAGCTGCTGGAGGAGACGCCACAGCTGCTGCTGTTACTGC
ATCTGCAGCAGGTCTCTGTCAATATCACCCGCCCACGCCCGATCTGGATGCTGAAGTCGCTCACTGGCCT
GGAGATTAGGGCGGGGGAGAGAGTGGAGTGGCTGGGAGAGGGGAGGGAGGAGTGGAAAGGAGACAAAAAC
AGCTTCCAAGCAGCGGGCGCGGCTCCACTGGACATCTGGGTAGGAGGGGTCTCTGGGTCAGTGGCTGGAG
AGTCGCCCCAGTGAGTCGGTGTCTAACTGGCCATTTAGTGGGGCCCATTTA
SCN7A 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SCN7A_1 ↗2:166,494,249負股166,494,239–166,494,298

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_94G49C · enhancer · 166493729–166494221 · regulatory

ENSR2_B3835Q · promoter · 166494222–166494807 · regulatory

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:1682 aa

1 aa1682 aa跨膜區拓樸區域
依 Q01118 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

SCN7A 蛋白質長 1682 個胺基酸,屬於 sodium channel 家族的 SCN7A subfamily。序列包含多個跨膜螺旋區段,按重複區標示為 S1 至 S6;此外也有細胞質側與細胞外側的拓樸區段。這些結構註解呈現其多次穿膜的通道架構。

拓樸區域Cytoplasmic1–117 aa
跨膜區Helical; Name=S1 of repeat I118–137 aa
拓樸區域Extracellular138–141 aa
跨膜區Helical; Name=S2 of repeat I142–167 aa
拓樸區域Cytoplasmic168–178 aa
跨膜區Helical; Name=S3 of repeat I179–196 aa
拓樸區域Extracellular197–200 aa
跨膜區Helical; Name=S4 of repeat I201–219 aa
拓樸區域Cytoplasmic220–237 aa
跨膜區Helical; Name=S5 of repeat I238–259 aa
拓樸區域Extracellular260–338 aa
拓樸區域Extracellular367–367 aa
跨膜區Helical; Name=S6 of repeat I368–407 aa
拓樸區域Cytoplasmic408–505 aa
跨膜區Helical; Name=S1 of repeat II506–521 aa
拓樸區域Extracellular522–530 aa
跨膜區Helical; Name=S2 of repeat II531–559 aa
拓樸區域Cytoplasmic560–568 aa
跨膜區Helical; Name=S3 of repeat II569–586 aa
拓樸區域Extracellular587–592 aa
跨膜區Helical; Name=S4 of repeat II593–609 aa
拓樸區域Cytoplasmic610–626 aa
跨膜區Helical; Name=S5 of repeat II627–655 aa
拓樸區域Extracellular656–673 aa
拓樸區域Extracellular701–701 aa
跨膜區Helical; Name=S6 of repeat II702–732 aa
拓樸區域Cytoplasmic733–934 aa
跨膜區Helical; Name=S1 of repeat III935–953 aa
拓樸區域Extracellular954–961 aa
跨膜區Helical; Name=S2 of repeat III962–990 aa
拓樸區域Cytoplasmic991–998 aa
跨膜區Helical; Name=S3 of repeat III999–1020 aa
拓樸區域Extracellular1021–1021 aa
跨膜區Helical; Name=S4 of repeat III1022–1040 aa
拓樸區域Cytoplasmic1041–1055 aa
跨膜區Helical; Name=S5 of repeat III1056–1080 aa
拓樸區域Extracellular1081–1127 aa
拓樸區域Extracellular1155–1167 aa
跨膜區Helical; Name=S6 of repeat III1168–1202 aa
拓樸區域Cytoplasmic1203–1250 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7TJ8…

PDB · 7TJ8

EM · 3.20 A · A=1-1682

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Cell membrane

SCN7A 位於細胞膜,是多次穿膜蛋白。 現有定位資料未指出其在特定細胞或條件下的定位改變,也未提供異構型間的定位差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 1 個夥伴 · 最多顯示 50 個
Nav2.1SCN7ASCN3B
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

SCN7A 形成的鈉通道可能是異寡聚複合體,由負責離子通透與形成孔道的 SCN7A alpha subunit,以及如 SCN3B 的調節性 beta subunits 組成;此複合體組成仍以可能性表述。SCN7A 另與 ATP1A1 互作,並可活化 ATP1A1;依據相似性推定,ATP1A1 活化後可間接向附近神經元傳遞訊號,參與鈉恆定調節。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能SCN7A 是鈉離子漏通道並可作為滲透壓感測器,參與多種組織與器官的鈉離子調節。不同於多數電壓門控鈉通道,它不受電壓門控,能讓鈉離子沿濃度梯度通過細胞膜。在中樞神經系統膠細胞中的體液鈉感測,依相似性推定可能藉由活化附近神經元影響攝鹽及自主飲水;此外,SCN7A 介導鈉離子流入角質形成細胞,參與皮膚屏障恆定。含實驗來源
證據與來源

Sodium leak channel functioning as an osmosensor regulating sodium ion levels in various tissues and organs. While most sodium channels are voltage-gated, SCN7A is not and lets sodium flow through membrane along its concentration gradient. In glial cells of the central nervous system, senses body-fluid sodium levels and controls salt intake behavior as well as voluntary water intake through activation of nearby neurons to maintain appropriate sodium levels in the body (By similarity). By mediating sodium influx into keratinocytes, also plays a role in skin barrier homeostasis

PMID 26537257 ↗ · PMID 35301303 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性Na(+)(in) = Na(+)(out)含實驗來源
證據與來源

Na(+)(in) = Na(+)(out)

PMID 26537257 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用SCN7A 形成的鈉通道可能是異寡聚複合體,由形成離子通道孔的 SCN7A alpha subunit 與 SCN3B 等調節性 beta subunits 組成。SCN7A 也與 ATP1A1 互作並活化 ATP1A1;依相似性推定,這可間接向附近神經元傳遞訊號,參與鈉恆定調節。含實驗來源
證據與來源

The sodium channel formed by SCN7A is probably a heterooligomeric complex consisting of the ion conducting pore forming alpha subunit SCN7A and regulatory beta subunits such as SCN3B. Interacts with ATP1A1; activates ATP1A1 and thereby indirectly signals to nearby neurons to regulate sodium homeostasis (By similarity)

PMID 35301303 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位SCN7A 位於細胞膜,屬於多次穿膜蛋白。推論支持
證據與來源

Cell membrane / Multi-pass membrane protein

PMID 35301303 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000643258 · 7,465 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GGCTCCACTGGACATCTGGGTAGGAGGGGTCTCTGGGTCA40
41GTGGCTGGAGAGTCGCCCCAGTGAGTCGGTGTCTAACTGG80
81CCATTTAGTGGGGCCCATTTACTGCAGAGCCACAGCTGGT120
121GAGGACAGACGCCAGCCTAACAGCAGCTTCTGTACAACTA160
161GAGCTCAGAAAACCCGAGAGATCCGTGGAGAAAGAGAAGC200
201CCAGGAGGAGGAAAGGGCTCCAAGGAGCCCTGCTCCTGAA240
241GGGTCCCTCAGGCACTGGTGGAGACCTGTCGCTTCGTAGC280
281AAGTCCTCCACCATGTGAATGCCAACATGGCCAGGTCATT320
321AGAGCTGAGGGAAAACTAGTGCCCAAAGATATGAAAAGAG360
361TGTGGATCTTCTGGAGAAGTGCTGTTGTTCAACAGGTACA400
401AAATTGGAAATGTTGGCTTCACCAGAACCTAAGGGCCTTG440
441TTCCCTTCACTAAAGAGTCTTTTGAACTTATAAAACAGCA480
481TATTGCTAAAACACATAATGAAGACCATGAAGAAGAAGAC520
521TTAAAGCCAACTCCTGATTTGGAAGTTGGCAAAAAGCTTC560
561CATTTATTTATGGAAACCTTTCTCAAGGAATGGTGTCAGA600
601GCCCTTGGAAGATGTGGACCCATATTACTACAAGAAAAAA640
641AATACTTTCATAGTATTAAATAAAAATAGAACAATCTTCA680
681GATTCAATGCGGCTTCCATCTTGTGTACATTGTCTCCTTT720
721CAATTGTATTAGAAGAACAACTATCAAGGTTTTGGTACAT760
761CCCTTTTTCCAACTGTTTATTCTAATTAGTGTCCTGATTG800
801ATTGCGTATTCATGTCCCTGACTAATTTGCCAAAATGGAG840
841ACCAGTATTAGAGAATACTTTGCTTGGAATTTACACATTT880
881GAAATACTTGTAAAACTCTTTGCAAGAGGTGTCTGGGCAG920
921GATCATTTTCCTTCCTCGGTGATCCATGGAACTGGCTCGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。