基因總覽
SCML1（Scm polycomb group protein like 1）是蛋白質編碼基因，所產生的蛋白質屬於 SCM family。此蛋白被推定為 Polycomb group（PcG）蛋白；PcG 蛋白可組成多蛋白複合體，與維持發育期間 homeotic genes 的轉錄抑制狀態有關。現有資料未提供 SCML1 的其他基本分子性質或完整結構描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000380041 ★ | 17,737,493–17,754,985 | 8 |
| ENST00000918259 | 17,737,115–17,754,988 | 7 |
| ENST00000380043 | 17,737,444–17,754,988 | 7 |
| ENST00001006594 | 17,737,444–17,754,988 | 7 |
| ENST00001006595 | 17,737,444–17,754,988 | 8 |
| ENST00001136670 | 17,737,444–17,754,988 | 8 |
| ENST00000398080 | 17,737,449–17,754,988 | 6 |
| ENST00000380045 | 17,737,468–17,754,988 | 6 |
| ENST00000419185 | 17,737,725–17,750,114 | 5 |
| ENST00000895837 | 17,738,269–17,754,988 | 7 |
| ENST00000895838 | 17,738,269–17,754,988 | 8 |
| ENST00001083581 | 17,738,269–17,754,988 | 7 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SCML1 被註記為推定的 Polycomb group（PcG）蛋白。PcG 蛋白透過形成多蛋白複合體發揮作用；這些複合體是維持發育過程中 homeotic genes 轉錄抑制狀態所必需的。來源未進一步說明 SCML1 在複合體中的具體分工或作用機制，因此其功能描述應保留為推定性質，不能據此推演更細部的調控過程。
此外，SCML1 可能在性成熟期間的精子生成過程中有所參與，但此項描述標示為依相似性推定，並非在此來源中直接確立。資料未提供其作用階段、細胞或分子機制等細節。
Promoter 與基因調控
>SCML1 ENST00000380041 GRCh38 chrX:17736493-17737593 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTCTGATAATTACTCAGACTGTGTCTCCTTCCCAAGATGAGCAGCCTCGATATAAGTATGTAAGACTATA TGCCACTAGATGATGTCACATAGCCTTTATTACAATAGCAAAATTCTATGCCAGGTACTGTTCTAAGTGC TTTGCATACATTAACTCATGTAGTCCCCATATTATACCCATTTTACAGATGGGGAAACCGAAGCACAAAG CGGTTACTTGGCTTGCCTAAGGCCATAGGAGGACTGTGTTGGAGCTGGGGGTCCAATCCAGTAAATCTGC CTTCAAGGTCTGCGTTAGTTCCCCAGTCCAACTTGTGGGTGCTGGAGACTGGAAATATCTTGCCCGCCCC CCACCCTGGCCCCCCTCGCCCTTCCTACCAGACCTGGCTCAGGGCAACTGCTAAGGCCCCGCCCCTCTCC TCATTCCAAGTCAATCACTGGCGTGCGTCCAGGAAACCCAGTTTACGACGACGTCTCTGGTGCGTCACAG AGCGCGGGGGAGGGGCGGGATCACATTAAAAAAAAAAAAAAGCTTCGGACACCCCAACAACGAAGGGGGG ACACCACGTCCCTAACTACAACGCCACTAGAAGGGTTGCGCATGCGCGCCAGCCTCCTGCGCAGCCGCAG AAACCACTCAGCGCGCGAGTCTCTGAAAGGCCTAACGTCCATTTTCAATCCTGCGGGTCTTGCGAAGGAA AACCTGAGGTAAGAGGCCCCGCCCCACAGCCATCTCCTCAGCAAATTCCCGCCCTCGGCCCCGCCCCACA GCTATCTCCTCAGCAAATTCCCGCCCTCGGCCCCGCCCCACAGCCATCTCCTTAGCAAATTCCCGCCCTC ACCCAAGGACTGGGAGAGCACCCGCGGATTGGCCGATCAACGGTGACGCCTGTCAGTGGCCAGACTCCGA TTGGTCAGCGGGTAGTCCCGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCAACCGCGAGTGTGGGAATTCGGCG TCGCGGGAGCTCTCTGATCCACTCAGGGGTCAGGGCATCACTGGTCTCGCGTGCGCGTGACCAGGCCCGG TTTCCGGTGCCAGGACCTTTCCGAAGCGTCGAGTGGCCTAACGGTCACAGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SCML1_3 ↗ | X:17,737,128 | 正股 | 17,737,079–17,737,138 |
| SCML1_2 ↗ | X:17,737,455 | 正股 | 17,737,406–17,737,465 |
| SCML1_1 ↗ | X:17,737,559 | 正股 | 17,737,510–17,737,569 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSRX_B5J34 · enhancer · 17736495–17737069 · regulatory
ENSRX_9934B · promoter · 17737070–17737503 · regulatory
ENSRX_C3QJ5 · enhancer · 17737504–17738758 · regulatory
· motif · 17732703–17732712 · motif
· motif · 17736016–17736025 · motif
· motif · 17736016–17736025 · motif
· motif · 17737089–17737100 · motif
· motif · 17737089–17737100 · motif
· motif · 17737110–17737121 · motif
· motif · 17737110–17737121 · motif
· motif · 17737229–17737240 · motif
· motif · 17737271–17737282 · motif
· motif · 17737586–17737599 · motif
· motif · 17737586–17737599 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：329 aa
SCML1 蛋白長 329 個胺基酸，屬於 SCM family。其第 258–325 位胺基酸區段註記為 SAM domain；第 138–157 位則為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SCML1 的定位資料記載於細胞核；來源未提供其他定位條件或動態變化資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- ITGB2P05107 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RENBPP51606 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- SDCBPO00560 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SFMBT2Q5VUG0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SCML1 被推定為 Polycomb group（PcG）蛋白。PcG 蛋白會形成多蛋白複合體，這些複合體對於在發育期間維持 homeotic genes 的轉錄抑制狀態是必要的；SCML1 也可能依相似性推定參與性成熟期間的精子生成。 | 推論支持 | 證據與來源Putative Polycomb group (PcG) protein. PcG proteins act by forming multiprotein complexes, which are required to maintain the transcriptionally repressive state of homeotic genes throughout development. May be involved in spermatogenesis during sexual maturation (By similarity) |
| 細胞定位 | SCML1 的細胞內定位記載為細胞核；此項資料未描述其他定位條件或變化。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACTCAGGGGTCAGGGCATCACTGGTCTCGCGTGCGCGTGA40CCAGGCCCGGTTTCCGGTGCCAGGACCTTTCCGAAGCGTC80GAGTGGCCTAACGGTCACAGCTGTCGCCCATCGGAGAGGC120AGGACTACTGCGAGCAGTTTTACCGCGACCTCCGGAGGCC160GGCGTGACAGGCTCTGTCACTAAAATAGGAGTAGAGGTTT200ACCACTCTTAGGTGACTAAGCAGTATCACAAATAAACCCT240CCAGCAAGTTTAAAAATAATTAGGTCCAACTCAGAGGAAG280TGGAGTTTCTCCTGTTGCACAAAAATGATGTCTAACAGCT320CCAGTGAAATCGATGTGATAAAAACAAGAATACCTACTTA360CGATGAAGATGACAACACTATTCTTTATGCGTATGAAACA400AAACCTGAATTTGTCAATAAAGAACCGAATATTGTATCTG440ACGCATCCTGTAATACTGAAGAGCAACTGAAGACAGTTGA480TGATGTCCTTATTCATTGCCAGGTTATATATGATGCTCTG520CAAAACCTGGATAAGAAGATTGATGTGATTCGTAGAAAGG560TTTCAAAAATCCAACGTTTCCATGCGAGATCCCTGTGGAC600AAATCATAAGCGATATGGATATAAAAAGCATTCTTACCGG640CTTGTTAAAAAGCTTAAACTCCAGAAAATGAAGAAAAATG680AGGTTTACGAGACATTCTCCTACCCTGAAAGTTACAGCCC720CACTTTACCAGTGTCAAGGCGTGAGAATAATTCCCCGAGC760AACCTTCCAAGGCCATCCTTTTGCATGGAAGAATACCAGC800GAGCTGAGCTGGAGGAGGACCCGATCCTCAGCCGCACTCC840GAGTCCAGTGCATCCCTCAGATTTCTCTGAGCATAATTGT880CAGCCGTATTATGCATCTGATGGTGCAACGTATGGTTCTT920CTTCAGGGCTCTGCCTTGGCAACCCTCGGGCTGACAGCAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。