演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SCGB1A1CC10

secretoglobin family 1A member 1

SCGB1A1 編碼 secretoglobin family 1A member 1,屬於 secretoglobin 家族;其蛋白質可結合多種脂質與化合物,並能抑制 phospholipase A2。

Homo sapiens11q12.3UniProt P11684
OFFICIAL SYMBOL
SCGB1A1
CHROMOSOME
11
UNIPROT
P11684
PDB / ALPHAFOLD
7VF3
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SCGB1A1 是蛋白質編碼基因,產物 secretoglobin family 1A member 1 屬於 secretoglobin 家族。此蛋白質長 91 個胺基酸,具有位於 N 端的訊號肽,並被註記為分泌型蛋白質。來源所列的分子特性包括結合 phosphatidylcholine、phosphatidylinositol、polychlorinated biphenyls(PCB)及 progesterone;其對 progesterone 的結合較弱。這些特性提供了對此蛋白質家族成員的基本認識。

Official symbol
SCGB1A1
Gene name
secretoglobin family 1A member 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:12523
UniProt
P11684
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CC10CCSPCC16UGB

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111q12.3
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegSCGB1A1pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr11:62,405,103–62,423,195
Gene span
18,093 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000278282 ★62,419,033–62,423,1953
ENST0000053439762,405,103–62,423,1954
ENST0000087510762,419,033–62,423,1933
ENST0000109455462,419,033–62,423,1953

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

secretoglobin family 1A member 1 可與多種分子結合,包括 phosphatidylcholine、phosphatidylinositol 和 polychlorinated biphenyls(PCB)。它也能結合 progesterone,但來源將此結合描述為較弱;因此,不宜將 progesterone 與其他列出的分子視為具有相同結合強度。

此外,此蛋白質是 phospholipase A2 的強效抑制劑。來源沒有進一步說明抑制作用的分子機制,也未提供作用條件或實驗系統,因此功能描述限於其抑制效應及已列出的結合對象。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 62419033 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SCGB1A1 ENST00000278282 GRCh38 chr11:62418033-62419133 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GAAGATCATTCTGATGGCCTTTCAGAGGATGGCTGAGGAGAGCTAGCAGGGAGGCAGGGAGGTCGAGTCA
GGGGATTTTGACCAGGCCAGGTTAGGTGCTATGAGGCCCGGGCTTTGGAGAAGAACCAGGAAATGGCAAC
TGGAGGCAAGAAAGGGGAGAAGGCCAAAGCCTGGGAACCATCAACACTTAAGAACAGTAAAGAATAAACA
TCTAAAGAGAACAAGAAGGAATGGCCAGAAGAAGGAAAACAGGAAAGAACTGAGGCGTGGGAGCGCAAGA
GAGAGAATGGTTCGAGAAGGAAGCAGTCACAGGTGTCAAGGCCATTGGGAGGTCAAGTGAGATAAGGACT
GAAGGTCCCACCAATTGGGCCATCAGGAGCACAGGACTTGAGAGCACTTCTGGGTGGGAACAGACCCAGC
CTGGGGCAGGGCTCAGGTTTCTGATGGGAATTCTGGAAGGGTCCCTTTTATTCAACATGCTTCAATCCAG
GGGCCCCCGAAGTCTGACCACAGCAATGCTCCAAACCATGTGTCTTTCCTGGCTTAAGGTTCAGTCGCCC
TCCTCAGAGGGGAGCCTATGAAAGAGCCCAGTGGAGTGTCAGGGTCCTGAGTCCTAGTCCTAGTCCTGTC
CCTGCCACTTGTGAGGGAACTTGGGCCTCAGTTTCTCCAGGTGGGCTCCACAATTGCTTCTCTTGATCTG
GACTGCCCCAGTGCCCAGGTTCAGTGAGTGACACAGGCAGCTGGGTTTCCACATCCTCTGACTTGGGTTC
CCTTCACTGCCTCCAGGCAGGGCTCGGCCCTCCACCCCCAAGTGGCCCATTGTGTGAGCTCAGTTTCAGT
GGGGACAGAAACTGGGTTGAGAAAAGGGAATATTTACCTATCCCACCAAGCCAATGCCAAGTAAATAGTG
CAGTATCTTATGTAGAGCCCTTGCCCTGCCCTTCCCCATCTGGGTGCTGCTGCCTAGAGCATATAAAAGG
CACCTTGCTGGGCATGTCTCATACTAGCCCACCAGACTCAGAGACGGAACCAGAGACGGGCCAGAGCATC
CCCCTCCTCCACCATGAAACTCGCTGTCACCCTCACCCTGGTCACACTGGC
SCGB1A1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SCGB1A1_1 ↗11:62,419,033正股62,418,984–62,419,043

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_9WQX8 · enhancer · 62419416–62419867 · regulatory

ENSR11_9WQZF · enhancer · 62423470–62423958 · regulatory

· motif · 62420096–62420109 · motif

· motif · 62420096–62420109 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:91 aa

1 aa91 aa訊號胜肽
依 P11684 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

secretoglobin family 1A member 1 長 91 個胺基酸,屬於 secretoglobin 家族。其序列第 1 至 21 位被註記為訊號肽;來源未提供其他功能區域或結構域的資訊。

訊號胜肽1–21 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7VF3…

PDB · 7VF3

X-ray · 2.29 A · B/D=20-91

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

secretoglobin family 1A member 1 被註記為分泌型蛋白質。 來源未描述其定位隨條件或異構型而變化的情形。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 8 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CC10SCGB1A1ACTA2AQP6FN1FOSGATMHSF1TMEM43TRIM32
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

secretoglobin family 1A member 1 可形成由二硫鍵連結的反平行同源二聚體。與 LMBR1L 的交互作用曾有觀察報告,但另一筆報告未觀察到此交互作用,因此證據並不一致。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能secretoglobin family 1A member 1 可結合 phosphatidylcholine、phosphatidylinositol 與 polychlorinated biphenyls(PCB),也能結合 progesterone,但對 progesterone 的結合較弱;此外,它是 phospholipase A2 的強效抑制劑。資料庫紀錄
證據與來源

Binds phosphatidylcholine, phosphatidylinositol, polychlorinated biphenyls (PCB) and weakly progesterone, potent inhibitor of phospholipase A2

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用secretoglobin family 1A member 1 可形成由二硫鍵連結的反平行同源二聚體。與 LMBR1L 的交互作用曾被觀察到,但另一項報告未觀察到此交互作用,顯示相關觀察並不一致。含實驗來源
證據與來源

Antiparallel homodimer; disulfide-linked. Interaction with LMBR1L has been observed in, but not in

PMID 16423471 ↗ · PMID 23964685 ↗ · PMID 7664082 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted資料庫紀錄
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000278282 · 443 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ATACTAGCCCACCAGACTCAGAGACGGAACCAGAGACGGG40
41CCAGAGCATCCCCCTCCTCCACCATGAAACTCGCTGTCAC80
81CCTCACCCTGGTCACACTGGCTCTCTGCTGCAGCTCCGCT120
121TCTGCAGAGATCTGCCCGAGCTTTCAGCGTGTCATCGAAA160
161CCCTCCTCATGGACACACCCTCCAGTTATGAGGCTGCCAT200
201GGAACTTTTCAGCCCTGATCAAGACATGAGGGAGGCAGGG240
241GCTCAGCTGAAGAAGCTGGTGGACACCCTCCCCCAAAAGC280
281CCAGAGAAAGCATCATTAAGCTCATGGAAAAAATAGCCCA320
321AAGCTCACTGTGTAATTAGCATTTAGAAGCTGAAGATCCC360
361CAACTGCTCCAGCCTCTGCCGCTGCCATGCTTTGAGTCCA400
401CGCCCACCAGCCTTGCTCTCTTCAATAAACCACAAGCATC440
441TCA443

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。