基因總覽
SCG5 是蛋白質編碼基因，正式名稱為 secretogranin V。其蛋白質屬於 7B2 family，長 212 個胺基酸，具有位於 N 端的訊號肽，並在 C 端帶有一段無序區域。這些特徵概述了其蛋白質家族與序列組成；其在分泌路徑中的具體作用見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000300175 ★ | 32,641,710–32,697,092 | 6 |
| ENST00000943780 | 32,641,385–32,697,097 | 6 |
| ENST00000413748 | 32,641,635–32,697,098 | 6 |
| ENST00000494364 | 32,641,635–32,697,088 | 5 |
| ENST00000497208 | 32,641,635–32,696,889 | 5 |
| ENST00000973051 | 32,641,635–32,697,092 | 5 |
| ENST00001075306 | 32,641,635–32,697,092 | 6 |
| ENST00001075308 | 32,641,635–32,692,433 | 5 |
| ENST00001095360 | 32,641,635–32,697,098 | 4 |
| ENST00001095361 | 32,641,635–32,697,098 | 4 |
| ENST00001125933 | 32,641,635–32,697,095 | 6 |
| ENST00001125934 | 32,641,635–32,697,097 | 3 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
secretogranin V 在受調控的分泌路徑中作為 PCSK2/PC2 的分子伴護蛋白，可避免 PCSK2 過早活化。它會在內質網結合尚未活化的 PCSK2，並促進其由內質網運送至分泌路徑較後段的區室；PCSK2 隨後在這些區室經蛋白水解成熟並活化。
secretogranin V 也有助於 PCSK2 的切割，但資料指出它似乎不參與 PCSK2 的摺疊。其 C 端胜肽在體外可抑制 PCSK2；這項結果描述的是體外作用，不應與細胞內分泌路徑中的伴護功能混為一談。
此外，secretogranin V 參與調節腦下垂體激素分泌，也能防止 IAPP（islet amyloid polypeptide）聚集。這些作用顯示其功能不僅涉及 PCSK2 的運送、成熟與活化，也涵蓋激素分泌調節及抑制 IAPP 聚集；現有資料未進一步界定這些作用的分子機制。
Promoter 與基因調控
>SCG5 ENST00000300175 GRCh38 chr15:32640710-32641810 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAAACAAGAAGCAAGAAGCAGATGAGCATCCGTGAAAGAAAAAGTACTGGGAAAGAGGCTTGGCTTCAAA ATGAAAGGCCATGTGTCTCATAAATGAATTTTGCCAGCCTCTATTTATTGCATAAAAATTGCTGTAGATG ATAATGGATTTGCTCTCTAGAGCTAAGATAAATAGATCTGGATTCTAACCTCATCAGGTTACTTGTTTTG AGACCCCCAGGTTCTTTACTCATCCTCCATCTTGATCAAATTTGTAGTGCCATATTTATTGTATGGCTTT ACATTTTGATTTTAGTATTTGAACAAATTTCAGTGTTCAAGATTGCACATAGTAGGTGCTCCATAAACCC TTATTTAAGAATCTGGGACTACCTGGACATACTTCTACAGTATGCTGGGAGTATGGTTTCTCTTCAGGCC AAAGTGGAATTTTACTTGATGGTTTGTGTGGACGTTTAGAAATAACACTCAGAGCTGATATTTCTACAGA TTTTCAAGTTTATCACTTTAATGGAAGTTTCTGGCTTCTTGTATTAAATATCCCCATAGTTTTCCTGATT AGTAAGAGGCCCCTCAGAGCAGGGTATACCTTATCATAGCCACCATTAAAAGTTCTTAGGACTTCATCTT TTGTCTCTCTACCATTCATTGCCTCTTCCCTCTTGAAGCTGAAAGGCTTTAGACACAAAAACAAAAAACA TATTCTAGAAGTTGACAAAATTAAAGGTGTGCTGTAGTGGTGATCTGGCACGTTGTAATTGAGACTGAGG AGGTGAATGACTTACATGGAGGTCGATGGAGCTGAAGAGGGTCTCTAGGAAATGTCATAGTCAAGAGGTT TGTATGCAGAATGTGGGGGTTGAAGAGCTGTGCGGCTCCTGGTGAGAGGCACACTTATCTGGGATGCAGT CTGGGGAGTCCTGGCGAGGCAGCTTCCACCTGCTGGAGGAGGGGCCGGGGCGGAGCTAAGATGCGGAGGA GGGTGACGCACTAGCTCTCCAGTTCGCCCGTTCCTGGCCTGACCCCCACCAAGGCCCATACCGCAGTAGG CTCCTCGGGCTGCCCCTCGGTGAGTACAGTTTTGATGTCGGCTCGGCCGCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SCG5_2 ↗ | 15:32,634,043 | 正股 | 32,633,994–32,634,053 |
| SCG5_1 ↗ | 15:32,641,747 | 正股 | 32,641,698–32,641,757 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR15_8XWLQ · enhancer · 32641435–32641604 · regulatory
ENSR15_73WS8N · promoter · 32641605–32641720 · regulatory
ENSR15_B8GWH · enhancer · 32641721–32642317 · regulatory
· motif · 32637389–32637405 · motif
· motif · 32638135–32638144 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：212 aa
secretogranin V 長 212 個胺基酸，屬於 7B2 family。其 N 端第 1–26 位為訊號肽；第 174–212 位則註解為無序區域。這些序列特徵描述蛋白質的基本組成，來源未提供其他結構域資訊。
蛋白質三維結構
細胞內定位
secretogranin V 為分泌型蛋白，定位於神經內分泌與內分泌分泌顆粒。 來源未提供其定位隨條件或異構型改變的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- MEOX2Q6FHY5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- UBQLN1Q9UMX0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- UBQLN2Q9UHD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
secretogranin V 在分泌路徑早期與 PCSK2/PC2 互作，並在較後階段分離。這描述的是兩者隨分泌路徑進程而變化的互作關係；來源未指出它們形成特定複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | secretogranin V 在受調控的分泌路徑中作為 PCSK2/PC2 的分子伴護蛋白，避免其過早活化；它於內質網結合未活化的 PCSK2，並促進其運送至分泌路徑後段，在該處 PCSK2 經蛋白水解成熟與活化。它也有助於 PCSK2 切割，但似乎不參與其摺疊；C 端胜肽在體外抑制 PCSK2，並能防止 IAPP 聚集，且參與調節腦下垂體激素分泌。 | 含實驗來源 | 證據與來源Acts as a molecular chaperone for PCSK2/PC2, preventing its premature activation in the regulated secretory pathway. Binds to inactive PCSK2 in the endoplasmic reticulum and facilitates its transport from there to later compartments of the secretory pathway where it is proteolytically matured and activated. Also required for cleavage of PCSK2 but does not appear to be involved in its folding. Plays a role in regulating pituitary hormone secretion. The C-terminal peptide inhibits PCSK2 in vitro. Also capable of preventing aggregation of IAPP/islet amyloid polypeptide PMID 24042052 ↗ · PMID 7913882 ↗ |
| 交互作用 | secretogranin V 在分泌路徑早期與 PCSK2/PC2 互作，到了分泌路徑較後階段則會分離。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with PCSK2/PC2 early in the secretory pathway. Dissociation occurs at later stages PMID 7913882 ↗ |
| 細胞定位 | secretogranin V 為分泌型蛋白，定位於神經內分泌與內分泌分泌顆粒。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGTTCGCCCGTTCCTGGCCTGACCCCCACCAAGGCCCATA40CCGCAGTAGGCTCCTCGGGCTGCCCCTCGGTTGACAATGG80TCTCCAGGATGGTCTCTACCATGCTATCTGGCCTACTGTT120TTGGCTGGCATCTGGATGGACTCCAGCATTTGCTTACAGC160CCCCGGACCCCTGACCGGGTCTCAGAAGCAGATATCCAGA200GGCTGCTTCATGGTGTTATGGAGCAATTGGGCATTGCCAG240GCCCCGAGTGGAATATCCAGCTCACCAGGCCATGAATCTT280GTGGGCCCCCAGAGCATTGAAGGTGGAGCTCATGAAGGAC320TTCAGCATTTGGGTCCTTTTGGCAACATCCCCAACATCGT360GGCAGAGTTGACTGGAGACAACATTCCTAAGGACTTTAGT400GAGGATCAGGGGTACCCAGACCCTCCAAATCCCTGTCCTG440TTGGAAAAACAGCAGATGATGGATGTCTAGAAAACACCCC480TGACACTGCAGAGTTCAGTCGAGAGTTCCAGTTGCACCAG520CATCTCTTTGATCCGGAACATGACTATCCAGGCTTGGGCA560AGTGGAACAAGAAACTCCTTTACGAGAAGATGAAGGGAGG600AGAGAGACGAAAGCGGAGGAGTGTCAATCCATATCTACAA640GGACAGAGACTGGATAATGTTGTTGCAAAGAAGTCTGTCC680CCCATTTTTCAGATGAGGATAAGGATCCAGAGTAAAGAGA720AGATGCTAGACGAAAACCCACATTACCTGTTAGGCCTCAG760CATGGCTTATGTGCACGTGTAAATGGAGTCCCTGTGAATG800ACAGCATGTTTCTTACATAGATAATTATGGATACAAAGCA840GCTGTATGTAGATAGTGTATTGTCTTCACACCGATGATTC880TGCTTTTTGCTAAATTAGAATAAGAGCTTTTTTGTTTCTT920GGGTTTTTAAAATGTGAATCTGCAATGATCATAAAAATTA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。