基因總覽
SCG3 是蛋白質編碼基因，產物 secretogranin III 屬於 granin 蛋白家族。來源指出，此蛋白與分泌顆粒的生成調節有關，也可能參與血管新生；其具體作用方式與研究條件，見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000220478 ★ | 51,681,503–51,721,026 | 12 |
| ENST00000919607 | 51,681,439–51,721,026 | 12 |
| ENST00000919608 | 51,681,439–51,721,026 | 11 |
| ENST00000919609 | 51,681,439–51,721,026 | 11 |
| ENST00000919610 | 51,681,439–51,721,026 | 12 |
| ENST00001019750 | 51,681,439–51,721,026 | 12 |
| ENST00001019751 | 51,681,439–51,721,026 | 11 |
| ENST00001089824 | 51,681,439–51,721,026 | 12 |
| ENST00001089828 | 51,681,439–51,721,026 | 12 |
| ENST00001089829 | 51,681,439–51,721,026 | 12 |
| ENST00001133992 | 51,681,439–51,721,026 | 12 |
| ENST00000542355 | 51,681,492–51,721,026 | 11 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
secretogranin III 參與調節分泌顆粒的生成，並可作為分選受體，協助包括 chromogranin A（CHGA）在內的蛋白質進入顆粒內部。此分選受體作用是依相似性推定，來源未將其列為直接確立的結論。
此外，secretogranin III 可能參與血管新生。在相關研究中，它可透過 MEK/ERK 訊息傳遞路徑促進內皮細胞增殖、遷移及管狀結構形成。這些結果支持其與內皮細胞行為及血管新生相關，但來源未進一步說明此作用的條件或詳細分子機制。
Promoter 與基因調控
>SCG3 ENST00000220478 GRCh38 chr15:51680503-51681603 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCAGTCCAGAGGAAAAGGTCCAAGTTCTGTTTAAAAATCAGAGACTAAAGAGCTTACTCAGCATCCTGCT CACATTAATGTTGCTTGTTTTCATCATTTAAAGTCTTTTGATAGTTCCTTGTATACAATAACCTTAGGCT TCTGGGAATATTCTCAGAACATAGGAAGCACCTCCCTGACTTAGTAAAGATGAAAAATGCTTTTCATGAC TATCCCCTCTCTTGAAGGACCCCCTGGAACAGCCAGGTCTTTGGGCATAATTAAATTCTGGGCAAGATTT TACAGAAATGCAGCTTCTTTTTTCTAATTTAGTTGTGTGGTGTGTGTGTGTAAAGTGGGGGAGGTTCCAC TTGGTGGGGAAAGGAGAATTTGCCATTGCTGCTCGTCTACTCAGGACTGTTTCTGTTGTTGTTGTGTTTC AGCATCAGAGAGTGAGAGTGTATTGCAGCAATCTGACTATTTGGAAGACTGTTCCTTGAATTTCCCAATT CAAAAGCCTCGGTAGAGCTGAGGGATGCTTGATACGTCAACACAGACCACAAAAGGCAGGGCTTTTCTAA AGAGATTATAATTATATCTACCTTTTGGGTACAGGAGGTGAATGGAAGGAAGGGATTCTGGAGCAGATAT CCCAAAAGAAGAATCCCGAAGCAGAACTCCTCGCACAAGGTTATCTAAATCTCCTTGACAGGTGCACAGG CAGAGAAGGCATTTGGCCCTTGAAGTAACATTTACTTGAGAGGTTGGGACAATTCTGTCACGCTTAGGAC AAGCCAGCTGACCCTGAGCCCAGGAGCACCCTAGGACTGCAGCACAGAAAATACACCAGCTGGCCGGTCG CCCCTCCTTTGTTCCATTCCCGGGGGATTGGAGTAGCGTTGGAGTCACCGACGCCATCCCCTCCCGCCTC TGGCGTGCATGGAGCATGCGCTTCCTTCCTCACTTCCTCTGCAGGAGGGAGCGAGAGTAAAGCTACGCCC TGGCGCGCAGTCTCCGCGTCACAGGAACTTCAGCACCCACAGGGCGGACAGCGCTCCCCTCTACCTGGAG ACTTGACTCCCGCGCGCCCCAACCCTGCTTATCCCTTGACCGTCGAGTGTC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SCG3_1 ↗ | 15:51,681,503 | 正股 | 51,681,454–51,681,513 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR15_83J2P6 · enhancer · 51681172–51681418 · regulatory
ENSR15_7533FH · promoter · 51681419–51681513 · regulatory
· motif · 51680552–51680566 · motif
· motif · 51680552–51680566 · motif
· motif · 51681423–51681434 · motif
· motif · 51681423–51681434 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：468 aa
secretogranin III 全長為 468 個胺基酸。蛋白質序列註解標示第 1–19 位為訊號序列；第 23–69 位及第 353–406 位則分別標示為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
secretogranin III 位於分泌囊泡及其膜，也有分泌至細胞外的註解。 它可透過直接結合富含膽固醇的脂筏，與分泌顆粒膜相關聯；來源未提供定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- SCG2P13521 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SDCBPO00560 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
secretogranin III 與 CHGA 的互作依相似性推定；來源亦記載它與 secretogranin II（SCG2）互作。它可透過 C 端與 CPE 互作，這項關係同樣是依相似性推定。來源未將這些互作描述為特定複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | secretogranin III 是 granin 蛋白家族成員，可調節分泌顆粒的生成，並作為分選受體協助包括 CHGA 在內的蛋白質進入顆粒；此受體作用為依相似性推定。此外，它可能參與血管新生，並透過 MEK/ERK 訊息傳遞促進內皮細胞增殖、遷移及管狀結構形成。 | 含實驗來源 | 證據與來源Member of the granin protein family that regulates the biogenesis of secretory granules. Acts as a sorting receptor for intragranular proteins including chromogranin A/CHGA (By similarity). May also play a role in angiogenesis. Promotes endothelial proliferation, migration and tube formation through MEK/ERK signaling pathway PMID 19357184 ↗ · PMID 29154827 ↗ |
| 交互作用 | secretogranin III 與 CHGA 的互作依相似性推定，並與 secretogranin II（SCG2）互作；此外，它透過 C 端與 CPE 互作，這項互作也依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with CHGA (By similarity). Interacts with secretogranin II/SCG2. Interacts (via C-terminus) with CPE (By similarity) PMID 19357184 ↗ |
| 細胞定位 | secretogranin III 註解於細胞質囊泡中的分泌囊泡及其膜，也有分泌至細胞外的記載。它可直接結合富含膽固醇的脂筏，因而與分泌顆粒膜相關聯。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle; Cytoplasmic vesicle, secretory vesicle membrane / Peripheral membrane protein; Secreted; Associated with the secretory granule membrane through direct binding to cholesterol-enriched lipid rafts PMID 12098761 ↗ · PMID 25326458 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACAGGAACTTCAGCACCCACAGGGCGGACAGCGCTCCCCT40CTACCTGGAGACTTGACTCCCGCGCGCCCCAACCCTGCTT80ATCCCTTGACCGTCGAGTGTCAGAGATCCTGCAGCCGCCC120AGTCCCGGCCCCTCTCCCGCCCCACACCCACCCTCCTGGC160TCTTCCTGTTTTTACTCCTCCTTTTCATTCATAACAAAAG200CTACAGCTCCAGGAGCCCAGCGCCGGGCTGTGACCCAAGC240CGAGCGTGGAAGAATGGGGTTCCTCGGGACCGGCACTTGG280ATTCTGGTGTTAGTGCTCCCGATTCAAGCTTTCCCCAAAC320CTGGAGGAAGCCAAGACAAATCTCTACATAATAGAGAATT360AAGTGCAGAAAGACCTTTGAATGAACAGATTGCTGAAGCA400GAAGAAGACAAGATTAAAAAAACATATCCTCCAGAAAACA440AGCCAGGTCAGAGCAACTATTCTTTTGTTGATAACTTGAA480CCTGCTAAAGGCAATAACAGAAAAGGAAAAAATTGAGAAA520GAAAGACAATCTATAAGAAGCTCCCCACTTGATAATAAGT560TGAATGTGGAAGATGTTGATTCAACCAAGAATCGAAAACT600GATCGATGATTATGACTCTACTAAGAGTGGATTGGATCAT640AAATTTCAAGATGATCCAGATGGTCTTCATCAACTAGACG680GGACTCCTTTAACCGCTGAAGACATTGTCCATAAAATCGC720TGCCAGGATTTATGAAGAAAATGACAGAGCCGTGTTTGAC760AAGATTGTTTCTAAACTACTTAATCTCGGCCTTATCACAG800AAAGCCAAGCACATACACTGGAAGATGAAGTAGCAGAGGT840TTTACAAAAATTAATCTCAAAGGAAGCCAACAATTATGAG880GAGGATCCCAATAAGCCCACAAGCTGGACTGAGAATCAGG920CTGGAAAAATACCAGAGAAAGTGACTCCAATGGCAGCAAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。