演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

SCG2CHGC

secretogranin II

SCG2 編碼 secretogranin II,屬於 granin 家族的神經內分泌蛋白,可調節分泌顆粒的生合成。

Homo sapiens2q36.1UniProt P13521
OFFICIAL SYMBOL
SCG2
CHROMOSOME
2
UNIPROT
P13521
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

SCG2 是蛋白質編碼基因,其產物 secretogranin II 屬於 granin 家族,也歸於 chromogranin/secretogranin 蛋白質家族。此蛋白質具有神經內分泌性質,與分泌顆粒的生合成調節相關。現有資料未提供更詳細的基因表現、蛋白質結構或生理作用資訊。

Official symbol
SCG2
Gene name
secretogranin II
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10575
UniProt
P13521
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CHGCSgIISN

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22q36.1
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegSCG2pq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr2:223,596,092–223,602,773
Gene span
6,682 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000305409 ★223,596,940–223,602,3612
ENST00001144599223,596,092–223,602,7732
ENST00000421386223,598,851–223,602,2842
ENST00000433889223,598,906–223,602,3613

顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

secretogranin II 是 granin 家族的神經內分泌蛋白,其來源註解指出,它能調節分泌顆粒的生合成。這項功能將 SCG2 產物與細胞形成分泌顆粒的過程連結起來;現有資料未進一步說明其調節方式、作用步驟或涉及的分子機制,因此不能據此推定更具體的調控途徑。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 223602361 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SCG2 ENST00000305409 GRCh38 chr2:223602261-223603361 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCAGGTTATCTGGTAAGGCAGAGGAATGATTATGAATTATAAATCTGAGAGGTTGAAAGTTAATTGCTGT
ATTATTCCCTGGATTGTTCACATTCATGGAAGGTATTCAACTCATCTGATTCAACAGGAGAAGGGAAATA
TTTATAGTACAACTTCCTTTCGATTGCAAATGAATTCTAGTTACGTATGTGTCACATTTTTCCCAAACAG
TGAAAAGACTTTTTTTTTAAGTAGATGAAAGTATTTTCATCAGCACTCAACTTCTGAGCTTCCCTTTCTG
AGATCAGATATTGTGAAAGACAGTAACAGAGATATAAAGAATTATTAGCTACTAAGCTTGAAGTCTGATA
AATACCCATTTAAAAAACTATATAAGCTATTAAAGTTGGCTCTCATATAAAAGAGAGAGAACTCTCTGTT
TTATTCAAATAAATATGATTTTAAAAGAATGATGGCTGTGGTCATGATAAGAAATATGGCCTTTCATATT
TATAATGTGTCCTCCATTCATCTTGGTTATAACAGGAAATGGTAATGTAATTTCTTTGTGGGCAAAGATG
AAAAAATAATCCTTGTCTGTAAAACTTTCTTACAACGACGACAACAATTACAACAGTGACACCAAGAAAC
TATTATAACAAGTTGCTAGAACATAGATGAGATTGTCTTGCAATTAGCCATGTCTGTCTGACACACATTT
CTTTCTTTGTAAGAGAAATCGTGCAGAGCAGTTTATTCCGTCTCAAAGATTTTGATAAAAGAAAAAGGAA
AACTGCAATTTTTGCCACAAAAAGACAGGTGGCGTAAGCATGCAACTTTTTTTTCTTTTCTTTTCTTTCT
TTCTTTTTTTTTTTTTTTAAATATAAAGTGATTATTTTCTCTTGGTTCTTTGAAAAACCTCGCTTGTGCT
GGGGTTTGTGGCTGAACCCGGTGACGTCAGTGTGGCAGTGCGGAGTCAGGCGCAGCGGCTCCCTATAAGC
AGAGGAGCTGTCCGTGTGCTGAAACGGCCCGAGAAGCTCGCCCGGAGAACGGGGAGGAATATGCTGTGGA
GCTCCTCTGCCATATAAACAAAAAGAGGTAAGGCTGCTTTTCTCTTTGATT
SCG2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
SCG2_1 ↗2:223,602,360負股223,602,350–223,602,409

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:617 aa

1 aa617 aa功能區域訊號胜肽
依 P13521 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

secretogranin II 長 617 個胺基酸,屬於 chromogranin/secretogranin 蛋白質家族。其第 1–27 個胺基酸為訊號序列。資料另註記第 120–143、257–302 與 552–583 位胺基酸區段為無序區;第 182–200 位區段則標示一個 O-醣基化位點。

訊號胜肽1–27 aa
功能區域Disordered120–143 aa
功能區域O-glycosylated at one site182–200 aa
功能區域Disordered257–302 aa
功能區域Disordered552–583 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · P13521…

AlphaFold · P13521

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

secretogranin II 被註記為可分泌,並定位於神經內分泌與內分泌分泌顆粒。 現有資料未提供定位變化的條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 3 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CHGCSCG2ATRIPSCG3UBQLN1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

secretogranin II 與 Secretogranin III(SCG3)有交互作用。資料未進一步說明此關係是否代表直接實體結合,或是否涉及特定複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能secretogranin II 是 granin 家族的神經內分泌蛋白,並具有調節分泌顆粒生合成的功能。此註解未進一步指出調節的分子方式、作用步驟或相關條件。含實驗來源
證據與來源

Neuroendocrine protein of the granin family that regulates the biogenesis of secretory granules

PMID 19357184 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用secretogranin II 與 Secretogranin III(SCG3)有交互作用。此項敘述未說明交互作用的具體形式,也未指出是否涉及複合體。含實驗來源
證據與來源

Interacts with Secretogranin III/SCG3

PMID 19357184 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位secretogranin II 被註記為可分泌,並位於神經內分泌與內分泌分泌顆粒。此項定位資料未提供發生條件或異構型差異。資料庫紀錄
證據與來源

Secreted; Neuroendocrine and endocrine secretory granules

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000305409 · 2,434 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAAACGGCCCGAGAAGCTCGCCCGGAGAACGGGGAGGAAT40
41ATGCTGTGGAGCTCCTCTGCCATATAAACAAAAAGAGGAA80
81ATCTTTCAAACATGGCTGAAGCAAAGACCCACTGGCTTGG120
121AGCAGCCCTGTCTCTTATCCCTTTAATTTTCCTCATCTCT160
161GGGGCTGAAGCAGCTTCATTTCAGAGAAACCAGCTGCTTC200
201AGAAAGAACCAGACCTCAGGTTGGAAAATGTCCAAAAGTT240
241TCCCAGTCCTGAAATGATCAGGGCTTTGGAGTACATAGAA280
281AACCTCCGACAACAAGCTCATAAGGAAGAAAGCAGCCCAG320
321ATTATAATCCCTACCAAGGTGTCTCTGTCCCCCTTCAGCA360
361AAAAGAAAATGGCGATGAAAGCCACTTGCCCGAGAGGGAT400
401TCACTGAGTGAAGAAGACTGGATGAGAATAATACTCGAAG440
441CTTTGAGACAGGCTGAAAATGAGCCTCAGTCTGCACCAAA480
481AGAAAATAAGCCCTATGCCTTGAATTCAGAAAAGAACTTT520
521CCAATGGACATGAGTGATGATTATGAGACACAGCAGTGGC560
561CAGAAAGAAAGCTTAAGCACATGCAATTCCCTCCTATGTA600
601TGAAGAGAATTCCAGGGATAACCCCTTTAAACGCACAAAT640
641GAAATAGTGGAGGAACAATATACTCCTCAAAGCCTTGCTA680
681CATTGGAATCTGTCTTCCAAGAGCTGGGGAAACTGACAGG720
721ACCAAACAACCAGAAACGTGAGAGGATGGATGAGGAGCAA760
761AAACTTTATACGGATGATGAAGATGATATCTACAAGGCTA800
801ATAACATTGCCTATGAAGATGTGGTCGGGGGAGAAGACTG840
841GAACCCAGTAGAGGAGAAAATAGAGAGTCAAACCCAGGAA880
881GAGGTGAGAGACAGCAAAGAGAATATAGAAAAAAATGAAC920
921AAATCAACGATGAGATGAAACGCTCAGGGCAGCTTGGCAT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。