基因總覽
SCAND3 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 SCAN domain containing 3。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 6p22.1。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000452236 ★ | 28,570,535–28,587,298 | 4 |
| ENST00000646382 | 28,570,535–28,598,030 | 5 |
| ENST00000927696 | 28,570,535–28,587,328 | 2 |
| ENST00001141618 | 28,570,535–28,587,328 | 4 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>SCAND3 ENST00000452236 GRCh38 chr6:28587198-28588298 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCCCTGATTGCAAAGGATAGTTAGGGGGGGAAACAAAAGATAAGTTCAGCACGTTAAAAGTGACTGGGAA AATGATCTTTTCAGGGTTGGATGACACAGGCACACAGACAAAAATTTTATACAGAATTTTACTCAAGACC ATTCACGGACTCTAAGCGTAAGATTTCTTTTTTATTTAGAGATTTCTAAAAGAGATGTTCTGATTATTCA AAGACTCTCTACTCAGAAATGCCAAAATGTGAGAAATCAACATGAGGACCACAGCAGAAGGAAACAGAGA ATGGAGAAGGGAACCAGGCAGCAATTCAACAAATATTCCTTGGGCATCTCTGCGCTACCAGAGGTATGGA GGAACCCAGTGACTGCTTGAAAAGAATGTTCTGGTTACTCCACTCCAGTGATTCGCTAGGCGCTGATCAG CCGTCCAGATTTTGTTAGATTTCTGGGACCAGTTTCCCACAGTTGTTTAGTCACGGCTCTGTGCTCCGTG ACTAAACAACTGAGGCTCATTCTCGGTGGTCTTGGTTTTCTAATCCGTAAAATGGAAACAATGGACTAAC TCTTACATTTCTTTTTAAGTCTGATTTAGGGTGAAAGGGAAAGGTGAAAGTGGCCCGAAATTAACGAGGA AAGGCGGGGGACGATCCTACAGATTCGCTGACGTGGTAGTCCTTAGGGATGCTCCTCTCCATTTTGTTTC AGGTCGCTGCGGTGAGCACCACGGGTCTGAGTGCCAGCGATGGTTTATCACGGTGACAGGAAAACACAGA CCAGCAGCATCTACTCCAGCACTACTCACACTGTGGAACTCTTTTCACCGTGATGCCAGATAACTAGGTA ATTCCGGAGTTAATTCTCCGTCGTTTCCAGAGTACTTGCCTCCCCAGAATTACTGGTACCGTAGGTGTTT GCACAACCAGTGAGAAGACGGCACCACCTGGAATCCTAGAGCGGACCGGAAGTGAGCGTGGCTCACCGGG CCCGGCCGGAACCTACGGGCACAGCTGCGGGTGTGTCTGCGGAACCTCCACCTGAGCTGTAGAGTGTTTC CCTCGACCCACTAGTCTGGGTTCCACAGGGTCTGAGCTCCTCAGAGGTGGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| ZBED9_1 ↗ | 6:28,587,298 | 負股 | 28,587,288–28,587,347 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_9FCC9 · enhancer · 28585397–28585685 · regulatory
ENSR6_73NDG7 · promoter · 28587288–28587388 · regulatory
ENSR6_B7N6X · enhancer · 28587389–28588057 · regulatory
ENSR6_C4SL5 · enhancer · 28588786–28590401 · regulatory
· motif · 28582442–28582456 · motif
· motif · 28585533–28585542 · motif
· motif · 28587195–28587217 · motif
· motif · 28587195–28587217 · motif
· motif · 28587335–28587344 · motif
· motif · 28587335–28587346 · motif
· motif · 28587335–28587346 · motif
· motif · 28587357–28587366 · motif
· motif · 28587637–28587648 · motif
· motif · 28589371–28589379 · motif
· motif · 28589516–28589527 · motif
· motif · 28589527–28589538 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1325 aa
SCAND3 蛋白質長 1,325 個胺基酸。序列註解標示兩個區域：第 52–134 位為 SCAN box，第 366–526 位為 Integrase catalytic 結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SCAND3 註記定位於細胞核。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | SCAND3 的細胞內定位註記為細胞核。此筆資料僅提供核定位資訊，未說明定位的條件、變化或實驗情境。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACAGCTGCGGGTGTGTCTGCGGAACCTCCACCTGAGCTGT40AGAGTGTTTCCCTCGACCCACTAGTCTGGGTTCCACAGGG80TCTGAGCTCCTCAGAGGTGGGAGCTGCGGCCGAGGGAAGG120GTGCATGTGCGCGGCGACAATCGGGCCTCTTCCCCAGGCA160GCTTGTGAGCCCCTCTCCCTCTCCGCCCTCGCCCAGGCTG200CTCCGATCTTCGTTTCCTTGCCTAGGCTCATACACCCAGG240CTTTATTTAGGGCCAAAGTATCCGTCATAACCTCGGTTTT280CTGTCTCGCAAGTATCTTGCCGCTCAATTTGTGACCCTGA320AGCTTTAGTGAGTCGCTCTGTGCTCACTATTTCTGGTCTT360TTCAGAGGATGGCTTCACTTTCAATGGAATTGCCCGAGTA400ACTGCCCTGTGTTGTCACGTAAACAAGTCCTTTTAAACTG440AGTCTGTAGTTGTCCTGTGTTGAGTGTTTTCTTATATCAA480AAACTTTCCTGACCAAGAACAAAAAAGGAGCTCAAGTAAA520ATCACCCATTTGCCTAGACCCCAACTGGAGAGAACCTTTG560CCTGAGCTGTCTAAGCTCGGGATGGAAGCAGTCTCTAGGG600TCTTCCCAGCCTTGGCTGGCCAGGCTCCAGAAGAACAAGG640GGAGATTATCAAAGTAAAGGTTAAAGAAGAAGACCACACT680TGGGATCAGGAATCAGCCCTACGTAGGAATTTGTCTTATA720CCAGGGAACTCTCTCGTCAGCGCTTCAGGCAGTTCTGCTA760TCAGGAGACACCTGGGCCCAGGGAGGCTCTGAGTCAACTG800CGGGAACTTTGCCGTCAGTGGCTGAACCCAGAGATACATA840CCAAGGAGCAGATCCTGGAATTGTTGGTGCTGGAGCAGTT880CCTGACCATCCTGCCTGAGGAGCTCCAGTCTTGGGTGCGG920GAGCATAATCCTGAGAGTGGAGAAGAGGTGGTGACTTTGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。