基因總覽
SCAMP2（secretory carrier membrane protein 2）是由蛋白質編碼基因 SCAMP2 產生的蛋白質，屬於 SCAMP 家族。其結構包含多段穿膜區，並具有朝向細胞質與膜腔的區段，符合多次穿膜蛋白的拓樸特徵。SCAMP2 的基本角色與細胞內膜系統的物質回收有關，參與高基氏體後的回收路徑。其主要功能涉及回收載體前往細胞表面的運輸，具體作用方式見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000268099 ★ | 74,843,730–74,873,365 | 9 |
| ENST00000894365 | 74,843,728–74,873,374 | 10 |
| ENST00000894367 | 74,843,728–74,873,374 | 7 |
| ENST00000894366 | 74,843,728–74,873,374 | 9 |
| ENST00000894364 | 74,843,728–74,873,374 | 8 |
| ENST00000960462 | 74,843,728–74,873,374 | 9 |
| ENST00000894368 | 74,843,728–74,873,374 | 8 |
| ENST00000894369 | 74,843,728–74,873,374 | 9 |
| ENST00000894370 | 74,843,728–74,873,374 | 8 |
| ENST00001036730 | 74,843,728–74,873,374 | 9 |
| ENST00001063776 | 74,843,728–74,873,374 | 8 |
| ENST00001137160 | 74,843,728–74,873,374 | 9 |
顯示 12/17 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SCAMP2 參與高基氏體後的回收路徑，並作為回收載體將物質運送至細胞表面。這項功能描述了其在胞內膜運輸中的角色：來自高基氏體後區域的回收路徑，將貨物帶往細胞表面。現有資料未進一步說明所運送貨物的種類、運輸步驟或調控方式，因此不宜據此推定特定貨物或更細緻的分子機制。
Promoter 與基因調控
>SCAMP2 ENST00000268099 GRCh38 chr15:74873265-74874365 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCAGAGATGAATAATACCAGACAGATCCAAATAAATAAGGTGGATTTGGCCAGACAGTGGTTCATGAGTA TAATCCTAGCATTTTAGGAAGCCAAGGCGGGAGGATCACTTCAGCCCAGGTGTTTGAGACGAGCCTGGGC AATATAGTGAGATCCCCATCTCTACAAAAAATCCATAAATTAGCTGGGTATGGTGGTGACCAGCTGTAGT CCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGCTCGAGGCTGCAGTGAGCCATG ATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGCGACAGTGAGACCCTGTGGGGGGCGGGGGCGGGGGAAAGCGGAG CTGTGGAGAGTGAAGCAGCCACCTCCCCCATGATTGAGGCTGTGTTGCTGAATTCCGTGAGTCACTTCAT AAATGTTTGATGTCCAGGTTCAAGTCCCAACTCAGGTCCCAAAGCTGATGGGCCCAGGAACCCTCGTCCC TAAAACGATGAAACGACATCAGAGGGCGAGCAGCCCTAGAAGAAGCAGGCTCAGCTCGGGTGGAGGACTG CTGGATGGTCCTGGCACTTCTCTTTCCCCGAGCACGTTCTGCAGAAGAAGCGCTTTCCTAGTTCTCCCAA GGCCTCTGGCCTCACCTGTCACCCCTGTCCTTTGCCCAGGGATCAGTTTGGACTTCTTCCCAAACTTGGT CTACAGAGAAGTGAAGGGGCTGTTTCCTGTCCCACTTTTGAGAGTTTGCTTTAGAAACATAAAATTGGAA GGTGTCAGATTGATAGGCAGTTGGGAAGGACTCCGGCCACGCCTCTGGCTCCGTAGACGCTCCGCGCAGC CAAGACCCCTGAATCCCCAGCAGAGCGAAGATGTGGACGGAAGCCGAATGCCCACCCACCGCACTATTGT GGGCTGGGCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCGGAGCGACCCCGGTGCCGTCATAGGGCCACGCCCTCGGGG GAGGGCATCGCGCCTGCGCCAGAACCGCTGCCTCGCTCCCGGAAGTGGAGGGTCTACACGAAGCGCCGCT GGGTCTGGGTGCCCGGAGGCAGCAGCGTTCGCGGAGTTCGCCCGCTGGCCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SCAMP2_1 ↗ | 15:74,873,364 | 負股 | 74,873,354–74,873,413 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR15_BJT6L · enhancer · 74867669–74868468 · regulatory
ENSR15_C9FKZ · enhancer · 74869362–74871183 · regulatory
ENSR15_C9FL5 · enhancer · 74872307–74873354 · regulatory
ENSR15_5MLHBC · CTCF_binding_site · 74873012–74873033 · regulatory
ENSR15_934PDS · promoter · 74873355–74873855 · regulatory
ENSR15_5MLHG7 · CTCF_binding_site · 74873844–74873865 · regulatory
· motif · 74868819–74868831 · motif
· motif · 74868903–74868925 · motif
· motif · 74868903–74868925 · motif
· motif · 74869513–74869528 · motif
· motif · 74869807–74869819 · motif
· motif · 74869838–74869847 · motif
· motif · 74870218–74870231 · motif
· motif · 74870565–74870578 · motif
· motif · 74871018–74871029 · motif
· motif · 74871390–74871397 · motif
· motif · 74871405–74871412 · motif
· motif · 74871537–74871552 · motif
· motif · 74872832–74872845 · motif
· motif · 74872899–74872908 · motif
· motif · 74872899–74872910 · motif
· motif · 74872899–74872910 · motif
· motif · 74872998–74873008 · motif
· motif · 74873014–74873030 · motif
· motif · 74873017–74873026 · motif
· motif · 74873060–74873077 · motif
· motif · 74873152–74873165 · motif
· motif · 74873339–74873348 · motif
· motif · 74873339–74873350 · motif
· motif · 74873339–74873350 · motif
· motif · 74873366–74873377 · motif
· motif · 74873366–74873377 · motif
· motif · 74873390–74873400 · motif
· motif · 74873402–74873415 · motif
· motif · 74873402–74873415 · motif
· motif · 74873421–74873431 · motif
· motif · 74873423–74873436 · motif
· motif · 74873426–74873436 · motif
· motif · 74873427–74873437 · motif
· motif · 74873428–74873438 · motif
· motif · 74873429–74873439 · motif
· motif · 74873430–74873440 · motif
· motif · 74873431–74873441 · motif
· motif · 74873432–74873442 · motif
· motif · 74873433–74873443 · motif
· motif · 74873434–74873444 · motif
· motif · 74873435–74873445 · motif
· motif · 74873436–74873446 · motif
· motif · 74873438–74873451 · motif
· motif · 74873447–74873457 · motif
· motif · 74873466–74873479 · motif
· motif · 74873550–74873560 · motif
· motif · 74873714–74873727 · motif
· motif · 74873846–74873862 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：329 aa
SCAMP2 為 329 個胺基酸的蛋白質，屬於 SCAMP family。序列註解指出其含有四段螺旋型穿膜區，並在膜腔側與細胞質側分布不同長度的拓樸區段；N 端與部分細胞質區域則被註解為無序區。第 203–218 位胺基酸區段另有與 SLC9A7 互作的註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SCAMP2 定位於高基氏體反式網絡膜與回收內體膜，兩處均註記為多次穿膜蛋白。 來源未提供定位變化的條件或不同異構型之間的定位差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- FLNAP21333-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SLC41A1Q8IVJ1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SLC9A7Q96T83 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
SCAMP2 與 SLC6A4、SLC9A7 及 SLC9A5 有互作紀錄。對 SLC9A5 而言，這項互作與其細胞表面定位及活性調節相關；來源未進一步說明 SCAMP2 與 SLC6A4 或 SLC9A7 互作所產生的功能結果，也未將這些關係描述為特定複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SCAMP2 參與高基氏體後的回收路徑，並作為回收載體將物質運送至細胞表面。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Functions in post-Golgi recycling pathways. Acts as a recycling carrier to the cell surface |
| 交互作用 | SCAMP2 與 SLC6A4、SLC9A7 及 SLC9A5 有互作紀錄。與 SLC9A5 的互作會調節 SLC9A5 的細胞表面定位與活性；來源未說明前兩項互作的功能結果。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts with SLC6A4 and SLC9A7. Interacts with SLC9A5; this interaction regulates SLC9A5 cell-surface targeting and SLC9A5 activity PMID 15840657 ↗ · PMID 16870614 ↗ · PMID 19276089 ↗ |
| 細胞定位 | SCAMP2 是多次穿膜蛋白，定位於高基氏體反式網絡膜與回收內體膜。 | 含實驗來源 | 證據與來源Golgi apparatus, trans-Golgi network membrane / Multi-pass membrane protein; Recycling endosome membrane / Multi-pass membrane protein PMID 15840657 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGAACCGCTGCCTCGCTCCCGGAAGTGGAGGGTCTACACG40AAGCGCCGCTGGGTCTGGGTGCCCGGAGGCAGCAGCGTTC80GCGGAGTTCGCCCGCTGGCCCCCGATCACCATGTCGGCTT120TCGACACCAACCCCTTCGCGGACCCAGTGGATGTAAACCC160CTTCCAGGATCCCTCTGTGACCCAGCTGACCAACGCCCCG200CAGGGCGGCCTGGCGGAATTCAACCCCTTCTCAGAGACAA240ATGCAGCGACAACAGTTCCTGTCACCCAACTCCCTGGGTC280CTCACAGCCAGCGGTTCTCCAGCCATCAGTGGAACCAACC320CAGCCGACCCCCCAGGCCGTGGTGTCTGCAGCCCAGGCAG360GCCTGCTCCGGCAGCAGGAAGAACTGGACAGGAAAGCTGC400CGAGCTGGAACGCAAGGAGCGGGAGCTGCAGAACACTGTA440GCCAACTTGCATGTGAGACAGAACAACTGGCCCCCTCTGC480CCTCGTGGTGCCCTGTGAAGCCCTGCTTCTATCAGGATTT520CTCCACAGAGATCCCTGCCGACTACCAGCGGATATGCAAG560ATGCTCTACTATCTGTGGATGTTGCATTCAGTGACTCTGT600TTCTGAACCTGCTTGCCTGCCTGGCCTGGTTCTCGGGCAA640CAGCTCCAAGGGAGTGGACTTTGGCCTCTCCATCCTGTGG680TTTCTGATCTTCACTCCCTGTGCCTTCCTTTGTTGGTACC720GACCCATCTATAAGGCCTTTAGGTCCGACAACTCTTTCAG760CTTCTTTGTGTTCTTCTTTGTATTTTTTTGTCAAATAGGG800ATCTACATCATCCAGTTGGTTGGCATCCCTGGCCTGGGGG840ACAGCGGTTGGATTGCAGCCCTGTCTACACTGGATAATCA880TTCCCTGGCCATATCAGTCATCATGATGGTGGTGGCTGGC920TTCTTCACCCTCTGTGCCGTGCTCTCAGTCTTCCTCCTGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。