基因總覽
SCAMP1 的正式名稱為 secretory carrier membrane protein 1，屬於蛋白質編碼基因，產物屬 SCAMP 家族。其蛋白質具有多次穿膜拓撲，包含朝向細胞質的區域與位於膜腔側的短區域，並具有較長的細胞質區段。這些結構特徵構成其膜蛋白基本樣貌；其主要生物學角色與高基氏體後的回收運輸相關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000621999 ★ | 78,360,617–78,480,739 | 9 |
| ENST00000618166 | 78,360,101–78,480,739 | 8 |
| ENST00000878187 | 78,360,101–78,480,739 | 10 |
| ENST00000878188 | 78,360,101–78,480,739 | 9 |
| ENST00000920041 | 78,360,101–78,480,739 | 8 |
| ENST00000962697 | 78,360,101–78,480,739 | 9 |
| ENST00001109831 | 78,360,101–78,423,632 | 6 |
| ENST00001120899 | 78,360,101–78,480,739 | 8 |
| ENST00001122798 | 78,360,101–78,480,739 | 7 |
| ENST00001122799 | 78,360,101–78,361,850 | 2 |
| ENST00001130940 | 78,360,101–78,361,803 | 2 |
| ENST00001132453 | 78,360,101–78,480,739 | 9 |
顯示 12/15 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SCAMP1 參與高基氏體後的回收路徑，並可作為回收載體，將物質運送至細胞表面。這項功能將其定位於細胞內膜運輸與表面物質回收的脈絡中；來源未進一步指出其所運送物質的種類或更細部的分子步驟。
在此過程中，SCAMP1 的描述重點是載體角色：它與高基氏體之後的回收路徑相關，並將回收運輸的方向指向細胞表面。現有資料未提供特定貨物、運輸速率、調控條件或實驗系統，因此不宜將此功能延伸為對特定物質或細胞狀態的專一作用。
Promoter 與基因調控
>SCAMP1 ENST00000621999 GRCh38 chr5:78359617-78360717 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATGACCTTGTGATTCGCCCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGATTACAGGCGTAAGCCACCGCGCCCGG CCGGTACAAATTAATTTAACACATCTTTTGATAATCTCATCCTTGGTGTTGGAAAAGACGGGAAAATCCA AAAGTGTCTATTTTGTGCCCAAATGCTCAAGTTAATACTCGAGGGCCTTGATCTCTGGCCTCTTGCCATC CCTCTCCCCATTATTTCTGAAGAAGTAGCCATTTTGCAGATTCCGGAGGATGGGAGCCACGGCCGGCCCC TGGTACTGAATCTCATCTCCTTCTCAAGGCTCCTTGGATCAAGTTGGGACCGGCAGCGCCAAGGCTGCTC TCCGTGATTTAGCAGCAACCTAGAGTCAGAGAGACCGGAAGATGGGAGGCCGGGATTCTCAGGTGGGGTC AGGGGTATGCAAAAATCCTTAGCAGCGGCCGCGCCCCCGCCCCGGGGAGGTAATTTGCGGAGGGCGGTGC AGTAGCCTCTCCAGTGCCCGCGTCCCACGGTCTAACGGCACTGCTCCCGGGGTGCGCGGCCCACGACTCA GGCTGCCTCCCCCAACCTGACAAGTGTGCGTCCTTACCACAAAATGCCACCACTTCCCTAAGTGACGCTG GGCCCCGAGGACCTGATTTGAAATCGGTGTTCAGAAGACCGAGCCCGGCTGGACGCAGCTGGCCTCCGGC TGAGAGCGGAGGGGAAGGGTTCCATACTCTCCGAGGATCCCGCGGGCTCGTGGCGTGTGGAACGCTTTTC ATCGCTTTCAGTTCCCGTTTCCTTCGCCCCGACTGCCTACTCGGTCGCAGCTAAAGCCCGGAGCGTGGGA TCCGGGCCCGGAGGAACGGGATGGCGAACGCGAGCTGCGCCGCGGCCAGGAGCCCGCCGCACCGGGCATG CTCAGTGGCGCGGCCGGCTGGGTGGCCCGCGAGCTGCACCCGGATCTGCTCGGCGGCGGCGACGTGAGCG CGCAGGGGGGCGGCGGCCTCGCCTCGTCTCTCTCTCTGCGCCTGGGTCGGGTGGGTGACGCCGAGAGCCA GAGAGATGTCGGATTTCGACAGTAACCCGTTTGCCGACCCGGATCTCAACA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SCAMP1_1 ↗ | 5:78,360,617 | 正股 | 78,360,568–78,360,627 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR5_BKJTR · enhancer · 78359653–78360405 · regulatory
ENSR5_84B7JJ · promoter · 78360406–78360627 · regulatory
ENSR5_C9QXH · enhancer · 78360628–78362062 · regulatory
· motif · 78359699–78359711 · motif
· motif · 78359811–78359826 · motif
· motif · 78360000–78360009 · motif
· motif · 78360029–78360041 · motif
· motif · 78360031–78360038 · motif
· motif · 78360064–78360074 · motif
· motif · 78360066–78360079 · motif
· motif · 78360070–78360080 · motif
· motif · 78360210–78360225 · motif
· motif · 78360389–78360409 · motif
· motif · 78360395–78360408 · motif
· motif · 78360395–78360415 · motif
· motif · 78360519–78360530 · motif
· motif · 78360519–78360530 · motif
· motif · 78360860–78360870 · motif
· motif · 78361775–78361788 · motif
· motif · 78364213–78364224 · motif
· motif · 78364236–78364247 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：338 aa
SCAMP1 蛋白質長 338 個胺基酸，屬於 SCAMP family。序列註解指出其具有四段螺旋型跨膜區，並在膜兩側分布細胞質區域及短的腔內區域。另有註解將第 1 至 64 位胺基酸標示為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
SCAMP1 位於高基氏體的反式高基氏網膜，以及回收內體膜；兩處皆標註為多次穿膜膜蛋白。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 20 個夥伴
- ARFIP1P53367 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARFIP2P53365 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CASP6P55212 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CFTRP13569 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- DNAJC13O75165 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GAD2Q05329 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LAMP2P13473-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MTERF3Q96E29 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NDRG4Q9ULP0-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PBX3Q96AL5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PCYT1AP49585 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRPF40AO75400-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PTPN9P43378 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SH3GLB1Q9Y371 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPG21Q9NZD8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TASOR2Q5VWN6-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TBRG4Q969Z0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- THAP4Q8WY91 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TTPAP49638 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZMIZ2Q8NF64-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
SCAMP1 與 SYNRG、ITSN1 的互作註記為依相似性推定；另有資料記載其與 SLC9A7 互作。來源未進一步說明這些關係是否形成特定複合體，亦未提供各互作的功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SCAMP1 參與高基氏體後的回收路徑，並作為回收載體，將物質運送至細胞表面。來源未說明所運送物質的種類，也未提供更細部的運輸機制或發生條件。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Functions in post-Golgi recycling pathways. Acts as a recycling carrier to the cell surface |
| 交互作用 | SCAMP1 與 SYNRG、ITSN1 的互作依相似性推定；此外，資料亦記載 SCAMP1 與 SLC9A7 互作。來源未說明後者互作的證據類型，也未指出這些互作是否組成複合體或具有何種功能影響。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | SCAMP1 被定位於高基氏體的反式高基氏網膜與回收內體膜，兩處均標註為多次穿膜膜蛋白。來源未提供定位變化的條件或不同異構型之間的差異。 | 含實驗來源 | 證據與來源Golgi apparatus, trans-Golgi network membrane / Multi-pass membrane protein; Recycling endosome membrane / Multi-pass membrane protein PMID 15840657 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCCTCGTCTCTCTCTCTGCGCCTGGGTCGGGTGGGTGACG40CCGAGAGCCAGAGAGATGTCGGATTTCGACAGTAACCCGT80TTGCCGACCCGGATCTCAACAATCCCTTCAAGGATCCATC120AGTTACACAAGTGACAAGAAATGTTCCACCAGGACTTGAT160GAATATAATCCATTCTCGGATTCTAGAACACCTCCACCAG200GCGGTGTGAAGATGCCTAATGTACCCAATACACAACCAGC240AATAATGAAACCAACAGAGGAACATCCAGCTTATACACAG280ATTGCAAAGGAACATGCATTGGCCCAAGCTGAACTTCTTA320AGCGCCAGGAAGAACTAGAAAGAAAAGCCGCAGAATTAGA360TCGTCGGGAACGAGAAATGCAAAACCTCAGTCAACATGGT400AGAAAAAATAATTGGCCACCTCTTCCTAGCAATTTTCCTG440TCGGACCTTGTTTCTATCAGGATTTTTCTGTAGACATTCC480TGTAGAATTCCAAAAGACAGTAAAGCTTATGTACTACTTG520TGGATGTTCCATGCAGTAACACTGTTTCTAAATATCTTCG560GATGCTTGGCTTGGTTTTGTGTTGATTCTGCAAGAGCGGT600TGATTTTGGATTGAGTATCCTGTGGTTCTTGCTTTTTACT640CCTTGTTCATTTGTCTGTTGGTACAGACCACTTTATGGAG680CTTTCAGGAGTGACAGTTCATTTAGATTCTTTGTATTCTT720CTTCGTCTATATTTGTCAGTTTGCTGTACATGTACTCCAA760GCTGCAGGATTTCATAACTGGGGCAATTGTGGTTGGATTT800CATCCCTTACTGGTCTCAACCAAAATATTCCTGTTGGAAT840CATGATGATAATCATAGCAGCACTTTTCACAGCATCAGCA880GTCATCTCACTAGTTATGTTCAAAAAAGTACATGGACTAT920ATCGCACAACAGGTGCTAGTTTTGAGAAGGCCCAACAGGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。