基因總覽
SCAF11 的正式名稱為 SR-related CTD associated factor 11，屬於蛋白質編碼基因。其產物與前體 mRNA 的選擇性剪接有關；現有資料指出，SCAF11 的作用涉及剪接體組裝調控。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000369367 ★ | 45,919,131–45,990,574 | 15 |
| ENST00000465950 | 45,919,131–45,929,965 | 5 |
| ENST00000884498 | 45,919,131–45,990,746 | 14 |
| ENST00000943612 | 45,919,131–45,990,746 | 15 |
| ENST00000943613 | 45,919,131–45,990,746 | 16 |
| ENST00000943614 | 45,919,131–45,990,746 | 15 |
| ENST00001134322 | 45,919,131–45,990,746 | 15 |
| ENST00000549162 | 45,922,048–45,934,510 | 9 |
| ENST00000550893 | 45,922,356–45,924,788 | 3 |
| ENST00000551391 | 45,945,084–45,948,530 | 2 |
| ENST00001004426 | 45,945,562–45,990,746 | 5 |
| ENST00000266589 | 45,948,530–45,990,565 | 6 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
SCAF11 參與前體 mRNA 的選擇性剪接。來源所述的功能方式，是透過調節剪接體的組裝來參與這項 RNA 加工過程。資料未進一步說明其調控的具體步驟、作用條件或對特定轉錄本剪接結果的影響，因此不宜據此推定更細部的分子機制。
Promoter 與基因調控
>SCAF11 ENST00000369367 GRCh38 chr12:45990474-45991574 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTTGTTGTTGTTTGAGACAGGGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGAACGATCTCGGCTCA CTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCCACCTCATCTTCCCGAGGAGCTGGGACCGCAGGT GCGCGCCACCACGGCCGGTTAATTTTATTTTTTGTAGAAACGAGATCTTAATACGTCGCTCAAGCTGGTC TCGAACTGCTGAGCTCAAGCGATCCGCCAGCCTCGGCCTCCCAAAGCGCTGGGATTACCGGCGTGAGCCA CCGCGCACCTGGCCCAAATTTAATTTTGTGATGTGGGGTTAAGACATGGGAAAGCCCCTAGGCTCGGGGA GTCAGGCGGGAAAGCTCTCCCCCTGGCATCTAAAAAAATGCCCACCAGAAAGGAGGAAAGGTGGGCTTCC AAATTGCCGACTCTTCACTCCACAGGCTGCATTTCAGGTGGGCAGCGCAGCCAGGTGAACACTCAATCCA CCGCAAACATGCGGACACTCTTTTCAATATCAGATTACCATAAAGATAAGGAGCACACCCTGCGCAAAAT CCTTCCTGTCCAGTTCCCTTAAAGCCTCTTTCATTGTCCTCCGCGACGCAGCCTGTAAAACTGCCAAAGG AGGGCAGAGGCCAAAGTCCACGCGCTGCGCATGCGCACCATCCGCAGTGTGGGCGAAGGGCGGTGCTGGA AGGACGTTTCCCAGAAGGCCCCTCCAGCGCAGCTGCCCTTCCTCCCGCTCACAGGCCGCGTGACGTGACT CCACCCACCACGCTTCTCGGTCTCAAACAGCAGTTTGCCAGCGCCCCCCTGCGGCCCAACTGGGTACTAC GAACATGCACTCAGGGCCAGAGCGAGCGAGTAAGCAGAATGTGGCGAGTCCGGCTGCCGCCGTCGTCACC TTAGCGCGCCGACAGCGAGGGAAGGGAGGAGGAGGGAGACGCGCAGGGAGGGGAGGGGAGGGAGGAGGCT AGACAAGGCGGGGGAAGGGGGAGTAGCGGTGGCTTAAGCCGCGCGGAGCAGCGCAACCTGGGTCGCTCCC TGCTTCGCCGCCGCCTCCGGACCGAGCCAGCGGAGTCAGTGTCCTAGAGAC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SCAF11_1 ↗ | 12:45,990,564 | 負股 | 45,990,554–45,990,613 |
| SCAF11_2 ↗ | 12:45,992,059 | 負股 | 45,992,049–45,992,108 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR12_BC5F7 · enhancer · 45986716–45987284 · regulatory
ENSR12_9N8SS · enhancer · 45988317–45988599 · regulatory
ENSR12_BC5FM · promoter · 45989511–45990269 · regulatory
ENSR12_5DS3RW · CTCF_binding_site · 45990045–45990066 · regulatory
ENSR12_9N8TF · enhancer · 45990270–45990563 · regulatory
ENSR12_9N8TH · promoter · 45990564–45990969 · regulatory
ENSR12_5DS3X6 · CTCF_binding_site · 45990747–45990768 · regulatory
ENSR12_C6K7X · enhancer · 45990970–45992644 · regulatory
· motif · 45986734–45986745 · motif
· motif · 45986796–45986807 · motif
· motif · 45986862–45986873 · motif
· motif · 45987188–45987200 · motif
· motif · 45987524–45987533 · motif
· motif · 45989285–45989296 · motif
· motif · 45989569–45989578 · motif
· motif · 45989732–45989745 · motif
· motif · 45989732–45989746 · motif
· motif · 45989732–45989747 · motif
· motif · 45989785–45989798 · motif
· motif · 45989806–45989818 · motif
· motif · 45989902–45989911 · motif
· motif · 45989987–45990002 · motif
· motif · 45990047–45990063 · motif
· motif · 45990349–45990364 · motif
· motif · 45990452–45990467 · motif
· motif · 45990749–45990765 · motif
· motif · 45990803–45990818 · motif
· motif · 45990908–45990919 · motif
· motif · 45990908–45990919 · motif
· motif · 45990910–45990926 · motif
· motif · 45990910–45990926 · motif
· motif · 45990923–45990938 · motif
· motif · 45990924–45990938 · motif
· motif · 45990925–45990938 · motif
· motif · 45990930–45990945 · motif
· motif · 45990932–45990945 · motif
· motif · 45991212–45991223 · motif
· motif · 45991602–45991617 · motif
· motif · 45991609–45991617 · motif
· motif · 45991756–45991765 · motif
· motif · 45991756–45991767 · motif
· motif · 45991798–45991810 · motif
· motif · 45991813–45991826 · motif
· motif · 45991817–45991830 · motif
· motif · 45992226–45992236 · motif
· motif · 45993827–45993842 · motif
· motif · 45993827–45993842 · motif
· motif · 45993832–45993844 · motif
· motif · 45993834–45993856 · motif
· motif · 45993834–45993856 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1463 aa
Protein SCAF11 長 1,463 個胺基酸。序列第 41–82 位註解為退化型 RING-type zinc finger；另有多段區域被註解為無序區，分布於第 291–428、457–478、750–1,146、1,161–1,197、1,269–1,350 及 1,444–1,463 位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
資料將 SCAF11 的細胞內定位標示為細胞核，未提供定位變化條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- U2AF2P26368 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
SCAF11 與 SRSF2/SFRS2、U2AF2 及 SNRNP70 有互作記錄。資料未說明這些互作是否代表同一複合體，也未提供各互作的具體條件或功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | SCAF11 參與前體 mRNA 的選擇性剪接，並透過調節剪接體組裝發揮作用；這項描述未進一步指出調節的具體步驟或對特定剪接產物的影響。 | 含實驗來源 | |
| 交互作用 | SCAF11 與 SRSF2/SFRS2、U2AF2 及 SNRNP70 有互作記錄；此敘述未交代互作發生的條件、是否共同組成複合體，或互作所造成的功能結果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | SCAF11 的細胞內定位標示為細胞核；此項資訊未說明定位是否會隨條件改變，也未提供異構型之間的定位差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GAGTAGCGGTGGCTTAAGCCGCGCGGAGCAGCGCAACCTG40GGTCGCTCCCTGCTTCGCCGCCGCCTCCGGACCGAGCCAG80CGGAGTCAGTGTCCTAGAGACCCTGTAACACCACAAAGCG120GACGAAGGAGTCCATGTTGGGGAACTTGGCAGCGGAGTGA160CTGGGACCTGGGAACCTACTGTGGGGCCGCGGCCGGACCG200AGCGCCTCGACCTCGGTCTGAGGAAACCCTTTTCCAAAGA240GAAATGAAGAAGAAAACTGTATGTACCCTAAATATGGGAG280ATAAGAAGTATGAAGACATGGAAGGTGAAGAAAACGGAGA320TAATACTATTTCCACTGGTCTGTTGTACAGTGAGGCTGAC360AGATGCCCAATATGTCTTAATTGTCTATTAGAAAAGGAAG400TTGGTTTTCCAGAAAGCTGTAATCATGTCTTCTGTATGAC440TTGTATTCTTAAATGGGCAGAGACACTGGCTTCATGTCCT480ATTGACCGTAAACCTTTTCAGGCAGTGTTTAAATTCAGTG520CATTGGAAGGTTATGTTAAGGTTCAAGTAAAAAAACAGCT560GAGAGAAACAAAAGACAAGAAAAATGAAAACTCATTTGAG600AAACAGGTCTCCTGTCATGAAAATTCTAAAAGCTGTATAA640GAAGAAAAGCCATCGTAAGAGAAGATCTATTAAGTGCAAA680AGTTTGTGACTTGAAGTGGATACATAGAAACTCTTTATAC720AGTGAAACAGGAGGAAAGAAAAATGCAGCAATAAAGATAA760ATAAGCCTCAGAGATCAAATTGGAGTACAAATCAGTGCTT800CAGAAATTTTTTCTCCAATATGTTTTCTTCTGTTAGCCAC840TCTGGAGAATCTTCCTTTACCTATAGAGCTTATTGTACAG880AATTTATAGAAGCCAGTGAAATCAGTGCATTGATTAGGCA920GAAGAGACATGAACTGGAATTGTCATGGTTTCCTGATACA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。