01 / GENE OVERVIEW
基因總覽
SAPCD1 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 suppressor APC domain containing 1。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 6p21.33。
Official symbol
SAPCD1
Gene name
suppressor APC domain containing 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13938
UniProt
Q5SSQ6
02 / NOMENCLATURE
基因異名與舊稱
Alternative gene names & synonyms
NG23C6orf26
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
03 / GENOMIC CONTEXT
染色體位置與基因結構
Chromosome 66p21.33
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr6:31,762,656–31,764,851
Gene span
2,196 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000415669 ★ | 31,762,656–31,764,850 | 5 |
| ENST00000425424 | 31,763,043–31,764,828 | 4 |
| ENST00001118968 | 31,763,043–31,764,845 | 5 |
| ENST00000927045 | 31,763,043–31,764,851 | 5 |
顯示 4/4 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
04 / BIOLOGICAL FUNCTION
分子功能與生物學過程
目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用；有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION
Promoter 與基因調控
依所選 TSS 來源，取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算；調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>SAPCD1 ENST00000415669 GRCh38 chr6:31761656-31762756 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGCATTTCCCAGAGGTGGGGATTGGCTCCTCTATCAGAACAAGGGCTCCCTCAGCACAGAGACCACATCC CTTCCCTTTTCTCCCTCCCCACAGGATTGGCCAAGGGTTTCAGGACAGGAAGGAGGTGATTGATGATACA CTGTCTTTTATTCTCTTTTAAGACCATGGAGACCTGTGAGGATGGCAACGATCTTGTCTTCTTCTATCAG GTTTGCGAAGGTGTTGCGAAGGCCAGCCATGCCTCCCACACAGCTGCCCAGGCTGGGCTTCCTGACAAGC TTGTGGCTCGTGGCAAGGAGGTGATGAGATCCAAATGTGCAACCACCTCCACATCAGAGCTCCCTTTCAT TCCTAGTCCTACTGGGCCTGGGTCTAGGTCCACAGGATTTCTGACCCTTATTTCCCCTTCTCTTCCCCAC TCCCCTTACTCCTCCCACCTTCTTGCTTGTTCCTAGGTCTCAGACTTGATCCGCAGTGGAAAACCCATCA AGCCTGTCAAGGATTTGCTAAAGAAGAACCAAATGGAAAAGTGCGTATATGGCCCCAGTGTCTTTACCCT CTCTGCATCTTCTCCTGCAACTCTTCTCCCCTTTTCAGGGACTCAGCCTTCCTCCAGCACTTTGCCCTTC AGAAACCCACCATTTCTTTCTGAAATCCCTAAATCTTCAAGATCCCAGGTTTTCTGTGCCACAGCCTCTC CCCTCTGCCCAGGGATTTGGTTGTCCATTCTGCCATAAATCTTGCGATTTTCTCTCTTCTTCAGTTGCCA GACATTAGTGGATAAGTTTATGAAACTGGATTTGGAAGATCCTAACCTGGACTTGAACGTTTTCATGAGC CAGGAAGTGCTGCCTGCTGCCACCAGCATCCTCTGAGAGTCCTTCCAGTGTCCTCCCCAGCCTCCTGAGA CTCCGGTGGGCTGCCATGCCCTCTTTGTTTCCTTATCTCCCTCAGACGCAGAGTTTTTAGTTTCTCTAGA AATTTTGTTTCATATTAGGAATAAAGTTTATTTTGAAGAAAGATATTGTTTCTTTAGTCTCAAAACAAGA GACTAGGAAAGATCCAAAACACAGAGCAGGAGTCCACAGGGGAACCTGCCC
SAPCD1 位於正股。上下游依轉錄方向計算，序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示；負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 5 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| SAPCD1_1 ↗ | 6:31,763,049 | 正股 | 31,763,000–31,763,059 |
| SAPCD1_4 ↗ | 6:31,763,528 | 正股 | 31,763,479–31,763,538 |
| SAPCD1_3 ↗ | 6:31,763,914 | 正股 | 31,763,865–31,763,924 |
| SAPCD1_2 ↗ | 6:31,764,161 | 正股 | 31,764,112–31,764,171 |
| SAPCD1_5 ↗ | 6:31,764,414 | 正股 | 31,764,365–31,764,424 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR6_59GP2J · CTCF_binding_site · 31761177–31761198 · regulatory
ENSR6_59GPG7 · CTCF_binding_site · 31763698–31763719 · regulatory
· motif · 31761179–31761195 · motif
· motif · 31763700–31763716 · motif
目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算；該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：148 aa
Suppressor APC domain-containing protein 1 長 148 個胺基酸。序列註解指出，第 120 至 148 位胺基酸屬於無序區域；此區域註解的證據來自 MobiDB-lite。
功能區域Disordered120–148 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY
蛋白質三維結構
自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q5SSQ6…
09 / PROTEIN NETWORK
交互作用與訊號網絡
圖中 27 個夥伴 · 最多顯示 50 個
來源支持的結構／直接結合關係其他來源關係紀錄
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 27 個夥伴
27 個夥伴
- APBA1Q02410 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APBA2Q99767 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ARHGAP21Q5T5U3 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG1Q12959 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG2Q15700 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- DLG3Q92796 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DLG4P78352 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FRMPD2Q68DX3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRID2IPA4D2P6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- GRIP1Q9Y3R0 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GRIP2Q9C0E4 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- IL16Q14005 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MAGI1Q96QZ7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MAGI2Q86UL8 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- MPDZO75970 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NHERF4Q86UT5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- PATJQ8NI35 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- PDZK1Q5T2W1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TJP1Q07157 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- WHRNQ9P202 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- BANPQ8N9N5-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EFHC1Q5JVL4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HGSO14964 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HSF2BPO75031 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
第 1 頁
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX
Contextual Functional Evidence Matrix
功能證據與細胞情境矩陣
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
0 筆功能證據／註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預／量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」，空白實驗欄位不以推測補齊。
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 0 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀，不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識；未逐篇核對原始方法的紀錄，不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER
核酸與蛋白質序列
完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列，保留非編碼區。
1
ATAAAGTTTATTTTGAAGAAAGATATTGTTTCTTTAGTCT4041
CAAAACAAGAGACTAGGAAAGATCCAAAACACAGAGCAGG8081
AGTCCACAGGGGAACCTGCCCTGCCTCAGTAAAAATACAG120121
TGTTGTTGCTGTAGGAAGACTCCCGGATTCTACCCCAGGA160161
TACTTCATGAGAACGAACCCCTTCAGAGAGGCCCTACAAA200201
ACAGATTAGAGGGAAGACAGAGGGGTCCAAGGGAGATGGT240241
CTCTCTTCTCAAGTAGGAACACCCCAGCCTCAGACAGACA280281
CAGCAGGAAGGGGCCTGAGAGGCTGACAGAGGCAGGATGG320321
GTGCAAGGCAGGGGTGGAGGGGAGGGACCAGCCCGGGCTG360361
CACCAGTGGGAGTGGCTCCACCCTTCCCACCTCAGAGCCA400401
TGGGGAGCCAGGGCTCTGGCGGGGTGCCCTTGGTGCAGGC440441
TCCCTACACAGTCCTGCTGCTGCCGCTGGGGACAAGCCGC480481
CAAGACCCAGGGGCCCAGAGCTTCTTCCTTTGGCTACGCA520521
GGATGCAGGCTCTGGAGAGAGAACAGGATGCCCTGTGGCA560561
GGGTCTGGAGCTGCTACAGCATGGCCAGGCCTGGTTTGAA600601
GACCATCTGAGGGAGGCACAGCGACAGCAGCTGCATCTAG640641
GGGCCCTTGGTGAGAATTTTCTAACAGATTTACACTCAGA680681
GCCTGGTCGCCCCCCGTTAGCCCAGATTCAAAAGGTGAAC720721
ATCTGTTTGCAGAATCTGATTCATGAGAAGTTCTCCCCAA760761
GTCCACTGAACAAGGCTAGTTCCTGCACCACCCAGGATTC800801
AAAGGAAAGACGAAGGGAGCAGAACTTGTGGCAGCAACAG840841
GAGTTGTCAAGGCAGCAGAAAGGAGTCACCCAGCCAAAGG880881
AGGAGATGGCTCAGCGGGGCTGCACCAAGGGGCCAAGAGG920921
CCCTACCCGTGTCTAAACCCTCCTCTCACTCCCCTAAGCC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。
13 / DATA PROVENANCE