演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

S100A2CAN19

S100 calcium binding protein A2

S100A2(S100 calcium binding protein A2)是 S-100 家族的蛋白質,可能參與細胞鈣訊號調節,並可能有助於抑制腫瘤細胞生長。

Homo sapiens1q21.3UniProt P29034
OFFICIAL SYMBOL
S100A2
CHROMOSOME
1
UNIPROT
P29034
PDB / ALPHAFOLD
2RGI
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

S100A2(S100 calcium binding protein A2)是由蛋白質編碼基因產生的 S-100 家族成員。其蛋白質長 98 個胺基酸,具有兩個 EF-hand 結構域,這些結構特色與其可能具有的鈣感測及調節角色相符。現有資料將 S100A2 描述為可能參與細胞鈣訊號的蛋白質,也指出它可與其他蛋白質互動,間接關聯多種生理過程;此外,資料提及它可能參與抑制腫瘤細胞生長。這些功能描述保留「可能」的限定,並不代表所有作用方式或生理影響均已確立。

Official symbol
S100A2
Gene name
S100 calcium binding protein A2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:10492
UniProt
P29034
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CAN19S100L

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q21.3
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegS100A2pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr1:153,560,950–153,586,676
Gene span
25,727 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000368708 ★153,561,108–153,565,8443
ENST00000487430153,560,950–153,564,8532
ENST00000497140153,560,950–153,565,8663
ENST00000368710153,560,950–153,567,8903
ENST00000368709153,560,950–153,567,9343
ENST00000368707153,560,950–153,565,8664
ENST00000883392153,560,950–153,567,9343
ENST00000930957153,560,950–153,568,6683
ENST00000930958153,560,950–153,568,6743
ENST00000930959153,560,950–153,568,6684
ENST00000930960153,560,950–153,568,6683
ENST00000930962153,560,950–153,568,2683

顯示 12/28 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

S100A2 可能作為鈣感測器與調節因子,參與細胞內鈣訊號傳遞。這表示其可能藉由感知鈣相關變化,協助調節細胞訊號;然而,現有資料未進一步界定其感測條件或訊號傳遞的具體步驟,因此不宜將此描述延伸為特定的分子機制。

S100A2 也可能透過與其他蛋白質互動,間接影響多種生理過程。資料特別提及含 TPR 的蛋白質作為互動對象的例子,但未在此處詳述各項生理過程的內容,也未將這些作用限定於單一細胞途徑。因此,較合適的理解是:S100A2 可能藉由蛋白質間的互動,參與不同生理功能的調節。

此外,S100A2 可能參與抑制腫瘤細胞生長。這是來源提出的可能角色,並未在此資料中說明其適用的腫瘤類型、作用條件或抑制生長的具體機制,故不能據此推論為已確立的普遍效應。整體來說,現有功能描述指出 S100A2 可能兼具鈣訊號調節與蛋白質互動相關作用,並可能與腫瘤細胞生長抑制有關;各項作用的條件與細節仍未由所提供資料完整界定。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 153565844 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>S100A2 ENST00000368708 GRCh38 chr1:153565744-153566844 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTGGGGTCTCTGTGCCAGTGCTTTCCCTGCCAGGCTGGGCTGGGGCTTCCACCTACTGCTCTGGGACTG
CTGCTGCCCTGGCCCTGGGGGAGGAGGGTGTGCCGCTGAGTCACTGCCTGGGCATCTGGGCCTGGAACCT
CGGGTGAGTCACTTAGGGCTGAGGTAGAGGGGCTGGGGGAGGGGAAGAAGCTACTCGACAGCTGGAGCAG
GGAGGGGAGCTGGGGCCACAGGAAGGGCGGTGCCCTGATGCCCAGACGGGCCGGGATAGACAAAGGGCCA
AGGAGGAAGGGGCCCTGGGAGGGGGCAGCCCTCCCTTGGGCTGGGCTCTGAATGGCCACAGTGTTTGCCT
TTCTCCGGGTCTGGGGAGGACATGTGTGTGGGGGGCAGTGAGAGAGGGCTGTGGCTGAGGGCTGTGCTTC
AGGCCTGGATTCTGGCTTGGGAAGCTGTCCAGCTGGTGTTTTCAGCCTTGGGTAGGGATGTACCCCTACC
CACCCACCCAGCCCTCAAGCTGGAGAAGAGGAGGCCAAAGTTTTCCTGTTCAGCCTTTAACTACTCGGGA
CTTCCTTATGCTCCCCACAGACTGTGGCCCAGCCCAACTGCGGCTGTGTGTAGAGCAACCCCATTTCTCA
CTGCTTCCCCATCCTTCCAGACACCTTCCTACACAGAGGGACCTTCCCAGGTATTTCTAAGCACACTTAG
TTACCTCATTACCTCATTAAGAGGTATTCTGGTGCTGGCCATTAAAAGTCACTCCACTTCATCCATGCCC
TGAAGTCAGTCCTGTCCTTCTCCTCCTGATGTCCCCCAGCTGCCTCCTCTGGCCCCCAGCTTCCTAAGGG
TGGCCCCAGGTTGCTTCTCTCTCACACACACGGGCGCATGTATGTACACGAGCACTGGACCATGAAGTCT
CAGCGTGTGCTCACAGCCTCTCACACAGGAGTGGGCTGTGACTCACAGGCATGTCATGAGAATGAGGCCT
GGCACCAGTCTCCAGGCCCCAGAGCAGGGGTTGCCTCCCCTCACCCCGGTCCAGGATGCCCAGTCCCCAC
GACACCTCCCACTTCCCACTGTGGCCTGGGTGGGCTCAGGGGCTGCCCTTG
S100A2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 4 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
S100A2_4 ↗1:153,564,247負股153,564,237–153,564,296
S100A2_2 ↗1:153,564,853負股153,564,843–153,564,902
S100A2_1 ↗1:153,565,803負股153,565,793–153,565,852
S100A2_3 ↗1:153,568,613負股153,568,603–153,568,662

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_948XPF · enhancer · 153565227–153565531 · regulatory

ENSR1_B35GT9 · promoter · 153565532–153566334 · regulatory

ENSR1_B35GTF · promoter · 153566561–153567245 · regulatory

ENSR1_948XQ4 · enhancer · 153567560–153567879 · regulatory

ENSR1_948XQ8 · promoter · 153567880–153568380 · regulatory

ENSR1_53C58XS · CTCF_binding_site · 153567963–153567984 · regulatory

ENSR1_53C5948 · CTCF_binding_site · 153568701–153568722 · regulatory

· motif · 153565454–153565467 · motif

· motif · 153565454–153565467 · motif

· motif · 153565889–153565897 · motif

· motif · 153565938–153565954 · motif

· motif · 153566660–153566670 · motif

· motif · 153566667–153566677 · motif

· motif · 153566693–153566701 · motif

· motif · 153566731–153566739 · motif

· motif · 153567922–153567944 · motif

· motif · 153567922–153567944 · motif

· motif · 153567965–153567981 · motif

· motif · 153567971–153567983 · motif

· motif · 153567973–153567980 · motif

· motif · 153568017–153568032 · motif

· motif · 153568017–153568032 · motif

· motif · 153568675–153568688 · motif

· motif · 153568675–153568688 · motif

· motif · 153568703–153568719 · motif

S100A2 的表現可能受生長因子調控,尤其是在細胞週期早期 G1 期;S 期的表現則可能受到細胞週期調節。另有資料指出,在腫瘤細胞中,DNA 甲基化可能直接抑制 S100L 基因表現。

序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:98 aa

1 aa98 aa結構域
依 P29034 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

S100A2 蛋白質長 98 個胺基酸,屬於 S-100 家族,並含有兩個 EF-hand 結構域:EF-hand 1 位於第 13 至 48 個胺基酸,EF-hand 2 位於第 51 至 86 個胺基酸。

結構域EF-hand 113–48 aa
結構域EF-hand 251–86 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 2RGI…

PDB · 2RGI

X-ray · 1.60 A · A/B=1-98

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 15 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CAN19S100A2ARL13BEZRFAM209AFKBP4KPNA2MDM2MDM4MYH9S100A1S100A3S100BTP53TRPM4Kpna2PPID
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 15 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

S100A2 可形成同源二聚體,並與 FKBP4、PPP5C 及 TPPP 互動。它與 PPP5C 的互動經由 TPR repeats,且受鈣離子依賴;此互動會調節 PPP5C 活性。S100A2 與 TPPP 的互動則會抑制 TPPP 二聚化。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能S100A2 可能作為鈣感測器及調節因子參與細胞鈣訊號,也可能透過與其他蛋白質(例如含 TPR 的蛋白質)互動,間接參與多種生理過程;此外,它可能有助於抑制腫瘤細胞生長。含實驗來源
證據與來源

May function as calcium sensor and modulator, contributing to cellular calcium signaling. May function by interacting with other proteins, such as TPR-containing proteins, and indirectly play a role in many physiological processes. May also play a role in suppressing tumor cell growth

PMID 1372446 ↗ · PMID 22399290 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用S100A2 可形成同源二聚體,並與 FKBP4、PPP5C 和 TPPP 互動;與 PPP5C 的互動經由 TPR repeats 且受鈣離子依賴,並會調節 PPP5C 活性,而與 TPPP 的互動會抑制 TPPP 二聚化。含實驗來源
證據與來源

Homodimer. Interacts with FKBP4. Interacts with PPP5C (via TPR repeats); the interaction is calcium-dependent and modulates PPP5C activity. Interacts with TPPP; this interaction inhibits TPPP dimerization

PMID 18394645 ↗ · PMID 20188096 ↗ · PMID 22399290 ↗ · PMID 33831707 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

調控生長因子可能在細胞週期早期 G1 期調控相關表現,S 期則可能受細胞週期調節;在腫瘤細胞中,DNA 甲基化可能直接抑制 S100L 基因表現。含實驗來源
證據與來源

By growth factors in early G1 phase and probably by cell-cycle regulation in S phase. DNA methylation probably plays a direct negative role in suppressing S100L gene expression in tumor cells

PMID 1372446 ↗ · PMID 9481475 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000368708 · 977 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGAGCAGGGGTTGCCTCCCCTCACCCCGGTCCAGGATGCC40
41CAGTCCCCACGACACCTCCCACTTCCCACTGTGGCCTGGG80
81TGGGCTCAGGGGCTGCCCTTGACCTGGCCTAGAGCCCTCC120
121CCCAGCTGGTGGTGGAGCTGGCACTCTCTGGGAGGGAGGG160
161GGCTGGGAGGGAATGAGTGGGAATGGCAAGAGGCCAGGGT200
201TTGGTGGGATCAGGTTGAGGCAGGTTTGGTTTCCTTAAAA240
241TGCCAAGTTGGGGGCCAGTGGGGCCCACATATAAATCCTC280
281ACCCTGGGAGCCTGGCTGCCTTGCTCTCCTTCCTGGGTCT320
321GTCTCTGCCACCTGGTCTGCCACAGATCCATGATGTGCAG360
361TTCTCTGGAGCAGGCGCTGGCTGTGCTGGTCACTACCTTC400
401CACAAGTACTCCTGCCAAGAGGGCGACAAGTTCAAGCTGA440
441GTAAGGGGGAAATGAAGGAACTTCTGCACAAGGAGCTGCC480
481CAGCTTTGTGGGGGAGAAAGTGGATGAGGAGGGGCTGAAG520
521AAGCTGATGGGCAGCCTGGATGAGAACAGTGACCAGCAGG560
561TGGACTTCCAGGAGTATGCTGTTTTCCTGGCACTCATCAC600
601TGTCATGTGCAATGACTTCTTCCAGGGCTGCCCAGACCGA640
641CCCTGAAGCAGAACTCTTGACTTCCTGCCATGGATCTCTT680
681GGGCCCAGGACTGTTGATGCCTTTGAGTTTTGTATTCAAT720
721AAACTTTTTTTGTCTGTTGATAATATTTTAATTGCTCAGT760
761GATGTTCCATAACCCGGCTGGCTCAGCTGGAGTGCTGGGA800
801GATGAGGGCCTCCTGGATCCTGCTCCCTTCTGGGCTCTGA840
841CTCTCCTGGAAATCTCTCCAAGGCCAGAGCTATGCTTTAG880
881GTCTCAATTTTGGAATTTCAAACACCAGCAAAAAATTGGA920
921AATCGAGATAGGTTGCTGACTTTTATTTTGTCAAATAAAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。