基因總覽
S100 calcium binding protein A13（S100A13）是由 S100A13 基因編碼的蛋白質，屬於 S-100 family。其蛋白質長 98 個胺基酸，含有一段 EF-hand 結構域。現有資料將它與不依賴訊號胜肽的蛋白質分泌途徑相關聯；其基本特色包括結合鈣離子與銅離子的能力。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000476133 ★ | 153,618,799–153,627,505 | 3 |
| ENST00000484413 | 153,618,612–153,634,442 | 6 |
| ENST00000440685 | 153,618,612–153,630,072 | 4 |
| ENST00000339556 | 153,618,612–153,630,072 | 3 |
| ENST00000497086 | 153,618,612–153,634,361 | 8 |
| ENST00000392622 | 153,618,612–153,627,378 | 3 |
| ENST00000392623 | 153,618,612–153,627,498 | 3 |
| ENST00000491177 | 153,618,612–153,631,709 | 5 |
| ENST00000883331 | 153,618,612–153,634,442 | 3 |
| ENST00000883332 | 153,618,612–153,634,442 | 5 |
| ENST00000883333 | 153,618,612–153,634,435 | 9 |
| ENST00000883334 | 153,618,612–153,634,442 | 5 |
顯示 12/48 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
S100A13 參與缺乏訊號胜肽的蛋白質經替代途徑輸出的過程。來源指出，這類輸出與細胞受壓及銅離子有關；S100A13 對 IL1A 和 FGF1 的銅依賴性、壓力誘導輸出是必要的。這些描述限定於特定輸出條件，並未表示所有缺乏訊號胜肽的蛋白質都依賴 S100A13。
每個 S100A13 次單元可結合兩個鈣離子，也可結合一個銅離子；銅離子的結合不會干擾鈣離子結合。來源另指出，無鈣狀態的蛋白質可結合含有 phosphatidylserine 的脂質囊泡，但不結合含有 phosphatidylcholine 的囊泡；此項描述標示為依相似性推定。
這些分子特性提供了 S100A13 參與分泌過程的相關資訊，但資料未進一步說明其如何將離子結合或囊泡結合轉化為蛋白質輸出，也未提供更廣泛生物學效應的描述。
Promoter 與基因調控
>S100A13 ENST00000476133 GRCh38 chr1:153627405-153628505 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGTACTCACGGTTGGCCTGGGCCTGAGGTGGGAGCAGGTTCTGGACAGATGGCCAAGGTTGCAAATGTGG CTGCTGGAGCTGTGTGTGGAGACCTGTCTTCAACAGTCCCTCCCCCGCTGACCCCCCCACCGACTCCACC CCTTCACAGACGAACACCCTGTGGGGCAAGGGGCCAGGAGCAGACAGAGGCGCCCTCTGTCTCCTGGGCT GGAACAGGCGGCCCTTGTCTCTTTCCCAGCCTTGCTTGCCCCGTTCCTTTCTCTCCAGGCAGCAGTGGAT GGTGCAGGGGAAAGAGGTGGGAAGGAGGTCCTGGGAGGGACACTGGATGTCTTACCCCAAGCTGGGCCTT GCAGTACCTGTGGCTGGCTGTGCTGGTTGAGCCCGGTAAGGGGGGAATTCTGCTGAGGGGGTCTTAGTCT GTGGCTCCTCCATGGGGCCTCACTGAGAGGACCCTCAGTGAGAAACTTAGTCTTGGGAGTCTGAGAACCC ACAGAGGGATTTCAATCCAGGACTCTTCTCTGGGGGTCTCAACCTGGATCCCCCTCTGTGTGTGGGGCCT CAGCCTGGGGTTCTCTGAGGGATCTTGGTCTGTAGCATCCTTTGTGGGATCTCATTCCAAGGGGCCTCTG TGTGTGTCTCAGATTGGGCCTCTCAGTGTTGAGCTCCCTTGATTGGTTGCCTCCCTCTTCCCCCCTCAGC ATACACACTCCTGATTAGACATGGGTATGGTGGCAGCAGCCCCCAGTATTGAGAGGACTAGGACCCTGGG ACCCCTGCCGAACGAGATCTGTCCAGGCAGCTCCTCTCCCTGACCAAGTGGGGGCGCTCGTGTGGCTGGC AGGGAGCCCGGGTCCAGACCTGAGGGCTCAGGGCAAGCGGCCTGATTGGGCTGTCTCTGGTCTTCAGAAT CGACCACGGAAATTTGACACCTCCGGGCTTGGAAGCAGCTCTCTCCTCCTTCCCCGCTGCTTATAAACCT CAGCCCTGAGGCTCCAGCTCACTCTACCCCATCTCCTTGCCGGGTGAGTCTCATGGCTGACCCTGGAGGG AGGCTGGAGATCATTTTTTCTTCCTGGGCTCCCAGGTCCCTCCCCCAGAGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| S100A13_1 ↗ | 1:153,627,505 | 負股 | 153,627,495–153,627,554 |
| S100A13_3 ↗ | 1:153,628,250 | 負股 | 153,628,240–153,628,299 |
| S100A13_2 ↗ | 1:153,634,361 | 負股 | 153,634,351–153,634,410 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_86HXND · enhancer · 153623234–153623400 · regulatory
ENSR1_B35H77 · promoter · 153627038–153627936 · regulatory
ENSR1_53C5M79 · CTCF_binding_site · 153627676–153627697 · regulatory
ENSR1_948ZDM · promoter · 153628170–153628444 · regulatory
ENSR1_B35H7D · enhancer · 153628445–153628973 · regulatory
· motif · 153626903–153626914 · motif
· motif · 153626948–153626960 · motif
· motif · 153626950–153626965 · motif
· motif · 153627015–153627028 · motif
· motif · 153627167–153627182 · motif
· motif · 153627678–153627694 · motif
· motif · 153630939–153630952 · motif
· motif · 153631244–153631258 · motif
· motif · 153631244–153631259 · motif
· motif · 153631282–153631296 · motif
· motif · 153631282–153631297 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：98 aa
S100A13 屬於 S-100 family，蛋白質長 98 個胺基酸。序列註解指出，其第 18 至 53 位胺基酸區段含有 EF-hand 結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
S100A13 位於細胞質，也可被分泌。 其分泌受細胞壓力誘導，且需要銅離子；資料未提供其他定位改變條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- PLEKHF2Q9H8W4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- S100A14Q9HCY8 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- TNFP01375 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
S100A13 可形成同源二聚體，並參與含有 S100A13、FGF1 與 SYT1 的銅依賴性多蛋白複合體。資料指出它與 FGF1、SYT1 互作，但此項描述標示為依相似性推定；與 IL1A 的互作則另有來源記載。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | S100A13 參與缺乏訊號胜肽的蛋白質經替代途徑輸出，並可結合鈣離子與銅離子；每個次單元結合兩個鈣離子及一個銅離子，銅結合不影響鈣結合。它是 IL1A 和 FGF1 銅依賴性壓力誘導輸出所必需；無鈣蛋白可結合含 phosphatidylserine、但不結合含 phosphatidylcholine 的脂質囊泡，此項為依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Plays a role in the export of proteins that lack a signal peptide and are secreted by an alternative pathway. Binds two calcium ions per subunit. Binds one copper ion. Binding of one copper ion does not interfere with calcium binding. Required for the copper-dependent stress-induced export of IL1A and FGF1. The calcium-free protein binds to lipid vesicles containing phosphatidylserine, but not to vesicles containing phosphatidylcholine (By similarity) PMID 12746488 ↗ · PMID 20863990 ↗ |
| 交互作用 | S100A13 可形成同源二聚體，並參與含有 S100A13、FGF1 與 SYT1 的銅依賴性多蛋白複合體。它與 FGF1 和 SYT1 的互作標示為依相似性推定；另有資料記載 S100A13 與 IL1A 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer. Part of a copper-dependent multiprotein complex containing S100A13, FGF1 and SYT1. Interacts with FGF1 and SYT1 (By similarity). Interacts with IL1A PMID 21270123 ↗ |
| 細胞定位 | S100A13 位於細胞質，也可被分泌；其分泌由細胞受壓所介導，且需要銅離子。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Cytoplasm; Secreted; Secretion is mediated by exposure to stress and requires copper ions |
核酸與蛋白質序列
ACTCTACCCCATCTCCTTGCCGGGTCAGCCCTGACAAAGG40TCAGCTAGCCCCTTGAGGACATCAGCTTTGGCCTCAGGGT80CCTAATGGCAGCAGAACCACTGACAGAGCTAGAGGAGTCC120ATTGAGACCGTGGTCACCACCTTCTTCACCTTTGCAAGGC160AGGAGGGCCGGAAGGATAGCCTCAGCGTCAACGAGTTCAA200AGAGCTGGTTACCCAGCAGTTGCCCCATCTGCTCAAGGAT240GTGGGCTCTCTTGATGAGAAGATGAAGAGCTTGGATGTGA280ATCAGGACTCGGAGCTCAAGTTCAATGAGTACTGGAGATT320GATTGGGGAGCTGGCCAAGGAAATCAGGAAGAAGAAAGAC360CTGAAGATCAGGAAGAAGTAAAGCCGCCTGGCTGAGATGG400GGTGGGCAGGGCAGAGCTGATCAGGGCCGAGCAGAACCGC440ACTCTTCCCAAATAAAGCTTCCTCCTTGAAACACAAA477cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。